Method Article
Here, we introduce a method, cocem3D, to unveil the ultrastructure of a specific cell in its native tissue by bridging confocal and serial block-face scanning electron microscopy.
ترسيم التركيب الدقيق للخلية مهم لفهم وظيفتها. يمكن أن يكون هذا المشروع شاقة لأنواع الخلايا نادرة تنتشر في جميع أنحاء الأنسجة المصنوعة من أنواع الخلايا المختلفة، مثل الخلايا enteroendocrine من ظهارة الأمعاء. وكانت هذه المجسات الجهاز الهضمي من الطعام والبكتيريا من الصعب دراسة لأنها فرقت بين الخلايا الظهارية الأخرى بنسبة 1: 1000. مؤخرا، تم إنشاؤها الفئران المعدلة وراثيا مراسل لتحديد الخلايا enteroendocrine عن طريق مضان. واحد من هؤلاء هو الببتيد YY-GFP الماوس. باستخدام هذا الفأر، قمنا بتطوير طريقة لربط متحد البؤر والمسلسل كتلة وجه المجهر الإلكتروني. أطلقنا على هذه الطريقة cocem3D وتطبيقه لتحديد خلية enteroendocrine محددة في الأنسجة وكشف النقاب عن التركيب الدقيق للخلية في 3D. حل cocem3D غير كافية لتحديد عضيات صغيرة مثل الحويصلات الإفرازية وللتمييز أغشية الخلايا لحجم إعادةndering. Cocem3D يمكن تكييفها بسهولة لدراسة التركيب الدقيق 3D من أنواع معينة من الخلايا الأخرى في الأنسجة وطنهم.
الحياة داخل خلية تحدث في الزمان والمكان. وغالبا ما تتم دراسة التغيرات على مر الزمن باستخدام المجهر مرور الزمن جنبا إلى جنب مع تقنيات التصوير مضان، مثل فائقة الدقة المجهر. الفضاء، ولا سيما ترتيب عضيات داخل الخلية أو الخلية الى خلية التفاعلات، لا يمكن إلا أن تستمد من خلال حساب كامل للبنية الخلية على ما يرام. يمكن حساب شامل لهيكل الخلية غرامة أيضا يجلب الوضوح الى وظيفة الجينوم في الحالات التي يكون فيها الجينوم هو متاح، مثل C. ايليجانس الخيطية 1 أو placozoa tricoplax شقة الملتصقة 2. المسلسل المجهر باجتزاء الإلكترون هو الآن استنساخه وفعالة وقت، وذلك بفضل مهمة أقل تكلفة لتطوير تكنولوجيات المجهر الإلكتروني 3D الآلي، مثل المسلسل كتلة وجه المسح الإلكترون المجهري 3 (SBEM).
الحاجة إلى المعلومات الهيكلية لتوضيح وظيفة واضحة جدا في سل معينأنواع لتر حيث تعتمد الدالة على المادية الخلية الى خلية التفاعلات، مثل الخلايا العصبية، الدبقية، أو الخلايا الظهارية الحسية. نحن مهتمون بشكل خاص في توضيح كيفية transduced إشارات حسية من المواد الغذائية في تجويف الأمعاء إلى إشارة كهربائية أن ينظم في نهاية المطاف السلوكيات مشهي. والدائرة هي معقدة ولكنها تبدأ في جدار الأمعاء حيث تأتي المواد الغذائية في اتصال مع الخلايا الظهارية الحسية، تسمى خلايا enteroendocrine. على عكس الخلايا الظهارية الحسية الأخرى، مثل الخلايا الذوقية، وفرقت الخلايا enteroendocrine في جميع أنحاء ظهارة الأمعاء في نسبة 1-1000 4-7. ونتيجة لذلك، فقد كان من الصعب تحديد ودراسة، ومنذ فترة طويلة أنها كان ينظر فقط كمصدر للهرمونات القناة الهضمية. ولكن مع تطور الفئران مراسل مضان خلية محددة، وظيفة حسية معقدة من هذه الخلايا في الظهور. باستخدام أحد هذه الفئران المراسل، الببتيد YY-GFP (PyyGFP) الماوس، وجدنا أن enteroendocrالمعهد الوطني للإحصاء الخلايا لها ذيل حشوية البارز الذي نحن اسمه neuropod. ظهور neuropods اقترح وظيفة الحفظ في خلية الاتصال إلى الخلية. وبالتالي، فإننا معللة ذلك من خلال توثيق التركيب الدقيق للخلية enteroendocrine، ويمكن أن تستمد وظيفة neuropods.
وكانت الحاجة إلى فهم هيكل ذيلا في زنزانة فرقت التي من الصعب تحديد المبرر الرئيسي لتطوير طريقة للجمع بين المجهري متحد البؤر وSBEM. تم التعرف على خلية ذات الاهتمام باستخدام PyyGFP enteroendocrine خلية محددة الفئران مراسل. سمح لنا طريقة لتوثيق التركيب الدقيق الكامل للخلية enteroendocrine وneuropod لها. ضمن neuropods، وجدنا السمات الهيكلية من المحاور العصبية، وخارج neuropods، وجدنا علاقة جسدية لالدبقية المعوية 8. في الواقع، neuropods تحتوي على حوالي 70٪ من جميع الحويصلات الإفرازية يشير دورا أساسيا في وظيفة إفرازية من هذه الخلايا. بناء علىالبيانات الهيكلية، وفي الآونة الأخيرة وجدنا أنه من خلال هذه neuropods، خلايا enteroendocrine والخلايا العصبية التعصيب الأمعاء تشكيل الدائرة الظهارية العصبية، مماثلة لتلك التي من خلايا الذوق في اللسان 8،9.
كشف مثل هذه السمات آليات حسي كيميائي الجهاز الهضمي تنبع من البيانات الهيكلية التي تم جمعها باستخدام هذا الأسلوب المجهري مترابط. ونعتقد أن هذا الأسلوب يمكن أن تكون مفيدة في مناطق أخرى من بيولوجيا الخلايا، لا سيما عندما فرقت الخلايا داخل الأنسجة في نسبة منخفضة جدا. أشرنا إلى الأسلوب كما متحد البؤر مترابط ومتسلسل كتلة وجه المجهر الإلكتروني في 3D (Cocem3D). يتكون أسلوب الخطوات الرئيسية التالية: تشريح الأنسجة، والفحص المجهري متحد البؤر، والتصوير SBEM، SBEM ومتحد البؤر ارتباط الصورة، وتجزئة اليدوية. بالمقارنة مع الطرق المترابطة أخرى، فإن مفهوم بسيط إلى حد ما لأن الإرتباط المادي بدلا من المواد الكيميائية.
وقد فعلت كل رعاية الحيوان والتجارب وفقا للبروتوكول الذي وافقت عليه لجنة رعاية الحيوان المؤسسية واستخدم جامعة ديوك.
تنبع Cocem3D من مجموعة من البروتوكولات التي تم نشرها مسبقا 10،11 وكان يطبق هنا لدراسة الخلية enteroendocrine محددة باستخدام الماوس مراسل PyyGFP 12. يمكن بسهولة هذه الطريقة يمكن تطبيقها على الخلايا الأخرى ذات الاهتمام باستخدام المتاحة تجاريا الفئران المعدلة وراثيا مراسل. يوصف الأسلوب في ثلاثة أقسام: المتلازم المجهري متحد البؤر، المسلسل كتلة وجه المجهر الإلكتروني (SBEM)، والبيانات جعلها في 3D.
متلازم متحد البؤر المجهر
والهدف من هذا القسم هو حصاد جزء من أنسجة القولون البعيدة من الأبعاد التي تسمح متحد البؤر مترابط وSBEM التصوير. البروتوكول هو على النحو التالي:
1. حصاد الأنسجة
2. تشريح وتحديد قطاعات الأنسجة
3. كتل الأنسجة تشريح مايكرو
4. متحد البؤر التصوير
5. تضمين كتل في الاغاروز
كتلة وجه التسلسلي المجهر الإلكتروني (SBEM)
في هذا القسم، يتم إعداد كتلة الأنسجة وتصويرها مع SBEM في انخفاض التكبير. ثم يرتبط الصورة مسح وجهه كتلة مع البيانات مبائر لتحديد المنطقة التي تحتوي على الخلايا في المصالح. مرة واحدة في المنطقةوالتي تم تحديدها، وتصوير الأنسجة في القرار 7 نانومتر / بكسل وشرائح من 70 نانومتر. وكان هذا كافيا للحل والتمييز الحويصلات الإفرازية الأساسية كبيرة كثيفة من العضيات الأخرى. في الخلايا enteroendocrine، وهذا النوع من الحويصلات يتراوح بين 100 و 150 نانومتر في القطر 13. البروتوكول هو على النحو التالي:
6. أقسام الأنسجة تلطيخ
7. التسلل وتضمينها أقسام الأنسجة في الراتنج
8. تركيب والتشذيب كتلة الأنسجة للتصوير
9. SBEM
10. الأمثل SBEM صور لتقسيم السطح
التقديم البيانات في 3D
11. متحد البؤر المجهر
12. المسلسل بلوك وجه SEM
ملاحظة: دليل تجزئة البيانات هو الوقت ذاته إجراء طويلا واعتمادا على الميزات التي ستقدم هذا الإجراء يمكن أن يستغرق عدة أسابيع. وقد تم تقسيم لأشرطة الفيديو والأرقام الواردة في Bohórquez وآخرون 2014 8 يدويا واستغرق حوالي 500 ساعة من العمل. فمن المستحسن لتحديد أولويات الميزات الأساسية التي تحتاج إلى جعل قبل البدء في عملية تجزئة. هذا الإجراء هو على النحو التالي:
تم استخدام أسلوب المقدمة هنا لدراسة التركيب الدقيق للخلية معينة داخل طبقة من ظهارة. الخلية من الفائدة في هذه الحالة هي الخلية enteroendocrine بعيد المنال. وقد تم التعرف عليهم في الموقع ممكنا إلا في السنوات القليلة الماضية مع تطور الفئران مراسل مضان خلية محددة. في عام 2011، وضعنا ماوس التي المروج من هرمون PYY يدفع التعبير عن بروتين الفلورية الخضراء 17. في هذا PyyGFP الماوس، وتتميز الخلايا enteroendocrine في الجزء الأقصى من الأمعاء الدقيقة والقولون بسهولة تحت ضوء الأشعة فوق البنفسجية. كان هذا نموذج الفأر أساسا لتحديد كتلة الأنسجة التي تحتوي على خلية enteroendocrine وبمعالجة ذلك SBEM. يشار طريقة ارتباط هنا كما cocem3D وبنيت على البروتوكولات التي تم نشرها مسبقا 10،11.
الاستفادة المثلى من أبعاد كتلة الأنسجة هو أمر حاسم لالارتباط. في التجارب الأولية،تقرر أن في كتلة الأنسجة 300 ميكرون طويل × 50 ميكرون سميكة يتم تقليل عدد الصور SBEM إلى أدنى حد ممكن في حين تغطي الجسم كله من الخلايا في المصالح. ويبين الشكل 1A يتجاهل من تشريح باستخدام تهتز شفرة microtrome ل الحصول على كتلة الأنسجة مع الأبعاد الصحيحة. ويتم الحصول على ما لا يقل عن 100 الكتل قبل الفرز من خلال لهم لاختيار تلك مع خلايا سليمة من الفائدة. يتم تصوير كتل اختيارها بواسطة المجهر متحد البؤر وصورة ض مداخن متباعدة بصريا كل 1 ميكرون (الشكل 1B و C). 1D الشكل يبين وجهة نظر المقدمة حجم خلية enteroendocrine في الدقاق من الفأرة. في neuropod بارزة تمتد تحت الخلايا الظهارية لل~ 60 ميكرون.
تم العثور على خلية من الفائدة عن طريق الربط بين مبائر ض المداخن مع صورة SBEM من الوجه كتلة بأكمله. ويقدم مثالا هنا كتلة من القولون البعيدة من PyyGFPالماوس. بعد الحصول متحد البؤر Z-مداخن (الشكل 2A)، وجزءا لا يتجزأ من كتلة في طبقة رقيقة من الاسعار المنخفضة للذوبان الاغاروز (الشكل 2B). وهذا أمر ضروري للتلاعب لاحق من الكتلة. فمن المهم للحفاظ على التوجه للكتلة شقة ممكن لتتناسب مع شرائح الضوئية مع شرائح SBEM. في الشكل 2C، يظهر صورة ممثل من وجهه كله من كتلة الأنسجة. أجزاء من هذا الرقم وقد نشرت سابقا في Bohorquez وآخرون، 2014 (8). وكان ذلك مترابطا في وقت لاحق مع صورة مبائر مع الأخذ في الاعتبار معالم الأنسجة والأبعاد. ويبين الشكل 2D تراكب من متحد البؤر وSBEM صورة كتلة، وكشف عن الموقع الدقيق لدينا خلية من الفائدة.
مرة واحدة وقد تم التعرف على الخلية، ويتم التصوير SBEM في قرار عالية بما فيه الكفاية لتحديد الحويصلات الإفرازية وعضيات الخلايا الأخرى. مجموعة البيانات قدم سعادةتم تصويرها في إعادة 7 نانومتر لكل بكسل كما تم التقاط صور من كتلة كل 70 نانومتر. مجموعة البيانات الواردة 643 الصور التي تمتد 45 ميكرون من عمق الأنسجة. وحلق بضعة ميكرونات أثناء التصوير الأولي من الوجه كتلة بأكمله في التكبير المنخفض. وقد اكتسب الخام مجموعة البيانات SBEM في .dm3 شكل وتحويلها إلى .tiff لمعالجة لاحقة. تم اقتصاص كومة SBEM باستخدام برنامج فيجي المساعد "المحاصيل (3D)" كتلة لتحتوي فقط على المنطقة من اهتمام. هذا يقلل من كمية الذاكرة RAM اللازمة لجعل حجم. تم التعرف على الخلية موقفها وحويصلات إفرازية، ومجزأة باستخدام برنامج Imaris الشكل 3 يحتوي على التقديم في 3D الخلية enteroendocrine.
الشكل 1: المتلازم متحد البؤر المجهري (A) سير العمل لتشريح قطعة منالأنسجة المعوية في منديل كتلة 300 × 50 ميكرون سميكة. (B) كتلة النسيج التمثيلي للأبعاد الصحيحة. لاحظ أن كتلة الأنسجة من هذه الأبعاد من الأمعاء الدقيقة الماوس يمتد حوالي 3 الزغب أو، في حالة القولون حوالي 8 الخبايا. (C) وزغابة في الأمعاء الدقيقة تحتوي على خلية من الفائدة. (D) A متحد البؤر ض المكدس المقدمة في 3D باستخدام برنامج Imaris يظهر خلية enteroendocrine مع neuropod بارزة تعمل تحت ظهارة الأمعاء. الأزرق = دابي وصمة عار النووية. الحانات = 10 ميكرون. يرجى النقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل 2: كتلة وجه المسلسل المجهر الإلكتروني (A) صورة متحد البؤر من سيلي.المديرية كتلة من أنسجة القولون تحتوي على خلايا PyyGFP enteroendocrine (الأخضر) من الفائدة. (B) حالما يتم تصويرها الكتلة عن طريق الفحص المجهري متحد البؤر، وجزءا لا يتجزأ من ذلك، ثم شقة في انخفاض ذوبان الاغاروز باستخدام الشرائح الزجاجية. تضمين كتلة الأنسجة في الاغاروز يسهل التلاعب لاحق، والشق في الزاوية اليسرى يساعد على جبل كتلة داخل SBEM في الاتجاه الصحيح. (C) SBEM صورة وجه الكتلة. (D) ارتباط البيانات مبائر مع SBEM لتحديد خلية من الفائدة (السهم الأبيض). يتم تعديل الصور في ج، د من هذا الرقم من Bohorquez وآخرون، 2014 8. الأزرق = دابي وصمة عار النووية. الحانات = 10 ميكرون. يرجى النقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل 3: بيانات جعلها في 3D (A) حجم جعل من خلية enteroendocrine باستخدام برنامج Imaris. تحتوي الخلية على neuropod محملة حويصلات إفرازية. للحصول على وصف كامل للالتركيب الدقيق للخلية enteroendocrine، يرجى الرجوع إلى Bohórquez وآخرون، 2014 8. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم.
chemosensation الهضمي يبرز بوصفه مجالا جديدا ومثيرا في مجال البحوث الطبية الحيوية. هذا هو في جانب كبير منه بسبب اكتشاف مستقبلات الذوق وظيفية في الخلايا enteroendocrine 18. وقد أظهرت الدراسات اللاحقة أن الخلايا enteroendocrine تعبر عن مستقبلات معينة على المواد الغذائية، بما في ذلك الكربوهيدرات، والدهون، والأحماض الأمينية 5،6،19،20. وكان العامل المحفز لهذه الاكتشافات تطوير الفئران المراسل، في الخلايا التي enteroendocrine وfluorescently المسمى 20. وضعنا واحد من هذه الفئران، والفأر PyyGFP، لدراسة الخلايا enteroendocrine من الأمعاء الدقيقة القاصي والقولون 17،21. هذه الخلايا هي التي تهم لأنها تفرز PYY ومثل الجلوكاجون الببتيد 1، وكلاهما المحرضات بالشبع 22،23. في ذلك الوقت، كان حساب فائقة الهيكلي الكامل لهذه الخلايا في عداد المفقودين، والتي كنا نعتقد أمر أساسي لفهم آليات يشير الخاصة بهم.
ontent "> هنا، وصفنا على طريقة بصريا لسد متحد البؤر المجهري مع SBEM. ويشار إلى الأسلوب كما Cocem3D، الأمر الذي سمح لنا لتوثيق التركيب الدقيق الكامل للخلايا enteroendocrine. لقد ذكرت أن هذه الخلايا لديها neuropod يحتوي على ثلاثة أرباع كل من الحويصلات الإفرازية 8. وفي neuropod، هناك neurofilaments ومثل الكثير من المحاور العصبية، ورعايتها من قبل neuropods الخلايا الدبقية المعوية 8. والأهم من ذلك، هو على الرغم من هذه neuropods أن enteroendocrine خلايا الاتصال فعليا إلى الخلايا العصبية التعصيب الأمعاء و القولون 9.واحدة من نقاط القوة في cocem3D هو بساطته. الحد من عينة الأنسجة في كتلة التي يمكن تصويرها من قبل مبائر وSBEM يسهل التعرف على خلية معينة داخل الأنسجة. ويمكن تحديد الحويصلات الإفرازية وعضيات أخرى بكل سهولة في القرار 7 نانومتر / بكسل. لأنه يتم التخلص منها المقاطع في SBEM، المزيد من بروسسالغناء من الأنسجة لتحديد بروتينات معينة ليس خيارا في هذه المرحلة. ومع ذلك، وتطوير أساليب مثل آتوم 24، التي يتم الاحتفاظ المقاطع من كتلة الأنسجة، ومن المرجح أن تمكين من التعرف على بروتينات معينة في الخلية. تحديد موقع محدد من المستقبلات حسي كيميائي على خلايا enteroendocrine هي المعلومات الأساسية لتطوير علاجات العقاقير لعلاج السمنة، لأن الخلايا enteroendocrine هي واجهة الحسية بين الطعام في القناة الهضمية والشبع في الدماغ.
الدكتور ساتيش Medicetty هو موظف من ويحصل على 100٪ من الراتب Renovo العصبية شركة. ولكن هذا لا يغير التزام مقدم البلاغ إلى سياسات إن الرب على البيانات والمواد المشاركة. يعلن أي تضارب في المصالح للمؤلفين المتبقية.
Our sincere appreciation is expressed to the following people: Drs. Sam Johnson and Benjamin Carlson of the Duke Light Microscopy Core Facility for their assistance with data visualization software, and Ms. Valerie Lapham and Dr. John M. Mackenzie, Jr. of the Center for Electron Microscopy at North Carolina State University for their advice on electron microscopy. We thank Dr. Elaine B. Bohórquez for her editorial assistance. Authors contributed in the following manner: DVB, SM, and RAL designed experiments and analyzed data. DVB performed experiments and FH performed manual rendering of data. SM is director of Renovo Neural, where SBEM data was acquired. DVB wrote the manuscript and all authors reviewed and edited the final manuscript. This work was supported by NIH grants R01DK091946 and Veterans Affairs grant I01BX002230 to RAL, and F32DK094704, to DVB.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Phosphate buffered saline | Life technologies | 10010023 | |
Heparin sodium salt | Sigma | H4784 | |
Paraformaldehyde | Sigma | 158127 | 4%, freshly made in PBS, final pH 7.4 |
Glutaraldehyde | Sigma | G5882 | |
Dental wax | Electron Microscopy Sciences | 72660 | |
Low-melting agarose | Life technologies | 16520-100 | 5%, freshly made in PBS |
Standard Tissue-Tek Cryomold | Electron Microscopy Sciences | 62534-25 | |
DAPI nuclear stain | Life technologies | D1306 | |
Postively charged glass slides and coverslips | |||
Fine art paintbrush #1 | |||
Cacodylate buffer | Electron Microscopy Sciences | 11650 | |
Tannic acid | Electron Microscopy Sciences | 21700 | |
EMbed 812 kit | Electron Microscopy Sciences | 14120 | |
Liquid releasing agent | Electron Microscopy Sciences | 70880 | |
Liquid silver colloidal | Electron Microscopy Sciences | 12630 | |
CircuitWorks conductive epoxy | ITW Chemtronics | CW2400 | |
Variable flow peristaltic pump | VWR | 70730-064 | |
VT1200S Vibrating blade microtome | Leica | ||
Zeiss 780i confocal microscope | Carl Zeiss | ||
Sigma VP Scanning Electron Microscope | Carl Zeiss | ||
3view system | Gatan | ||
Renovo Neural Inc (Cleveland, OH) | http://www.renovoneural.com | Renovo provides 3d EM services | |
Fiji software | Open access software | ||
Computer station with 16 GB of RAM or more | |||
Data visualization software Imaris 7.5 | Bitplane |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved