تحليل<em&gt; في فيفو</em&gt; الهجرة الخلية باستخدام الزرع خلية والتصوير الوقت الفاصل في الزرد الأجنة

Summary

Combining cell transplantation, cytoskeletal labeling and loss/gain of function approaches, this protocol describes how the migrating zebrafish prospective prechordal plate can be used to analyze the function of a candidate gene in in vivo cell migration.

Abstract

Cell migration is key to many physiological and pathological conditions, including cancer metastasis. The cellular and molecular bases of cell migration have been thoroughly analyzed in vitro. However, in vivo cell migration somehow differs from in vitro migration, and has proven more difficult to analyze, being less accessible to direct observation and manipulation. This protocol uses the migration of the prospective prechordal plate in the early zebrafish embryo as a model system to study the function of candidate genes in cell migration. Prechordal plate progenitors form a group of cells which, during gastrulation, undergoes a directed migration from the embryonic organizer to the animal pole of the embryo. The proposed protocol uses cell transplantation to create mosaic embryos. This offers the combined advantages of labeling isolated cells, which is key to good imaging, and of limiting gain/loss of function effects to the observed cells, hence ensuring cell-autonomous effects. We describe here how we assessed the function of the TORC2 component Sin1 in cell migration, but the protocol can be used to analyze the function of any candidate gene in controlling cell migration in vivo.

Introduction

في الكائنات متعددة الخلايا، والهجرة الخلية الأساسية سواء بالنسبة للتطور الجنين حيث أنه يضمن تنظيم الخلايا في الأنسجة والأعضاء، ولحياة البالغين، حيث يشارك في توازن الأنسجة (التئام الجروح) والحصانة. وبالإضافة إلى هذه الوظائف الفسيولوجية، والهجرة الخلية هي أيضا متورطة في حالات المرضية المختلفة، بما في ذلك، على وجه الخصوص، الانبثاث السرطان.

وقد تم تحليل هجرة الخلايا في المختبر لعقود من الزمن، وتوفير فهم شامل من الآليات الجزيئية ضمان الحركات خلية على الأسطح المستوية. في الجسم الحي ومع ذلك، تواجه الخلايا عن طريق بيئة أكثر تعقيدا. ويبدو واضحا في السنوات الماضية أن الهجرة داخل كائن حي قد يتأثر بعوامل خارجية مثل المصفوفة خارج الخلية، وخلايا أو كيموكينات يفرز الهجرة توجيه المجاورة، وأن آليات القيادة الهجرة الخلية قد تختلف من ما تم وصفه في المختبر ^1،2. وقد تلقى آليات ضمان في هجرة الخلايا المجراة اهتماما أقل حتى الآن، وذلك أساسا بسبب صعوبة التقنية وزيادة، مقارنة مع الدراسات في المختبر وفي الجسم الحي يتطلب تحليل هجرة الخلايا على وجه الخصوص وصول البصرية مباشرة إلى الخلايا المهاجرة، وتقنيات لتسمية الخلايا فريدة من نوعها في لمعرفة ديناميتها والتشكل، وكذلك ربح أو خسارة وظيفة النهج لاختبار دور الجينات المرشحة. حتى الآن، وقد استخدمت سوى عدد قليل من النظم نموذج إيواء هذه الخصائص لتشريح الجسم الحي في خلية الهجرة ^3.

كنا مؤخرا هجرة لوحة القردودية المقدمة المحتملين في الأجنة الزرد الأولى كنظام نموذج مناسب الجديد لتقييم وظيفة الجينات مرشح في السيطرة في الجسم الحي خلية الهجرة ^4،5. لوحة القردودية المقدمة المحتملين (المعروف أيضا باسم mesendoderm الأمامي) هي مجموعة من الخلايا التي تشكل في بداية جاستrulation على الجانب الظهري للجنين. خلال المعيدة هذه المجموعة تهاجر بشكل جماعي نحو القطب الحيواني من الجنين ^6-8، لتشكل لوحة القردودية المقدمة، سماكة mesendodermal، الأمامي إلى الحبل الظهري، والكامنة لوحة العصبية. والجزء الأمامي من لوحة القردودية المقدمة تؤدي إلى الغدة الفقس، بينما الجزء الخلفي لها من المرجح أن يساهم لرئاسة الأديم المتوسط ^​​9. بفضل التطور الخارجية والوضوح البصري للجنين الأسماك وهجرة الخلايا ويمكن ملاحظة مباشرة وبسهولة في هذا الهيكل.

زرع الخلايا هي تقنية قوية جدا التي تسمح لخلق السريع والسهل للأجنة الفسيفساء ^10. معربا عن علامات هيكل الخلية الفلورسنت في الخلايا المزروعة النتائج في وضع العلامات على الخلايا المعزولة، والتشكل وديناميكية والتي يمكن ملاحظتها بسهولة. الجمع بين هذا إلى الخسارة أو الربح من وظيفة النهج تصاريح تحليل وظائف خلايا مستقلة من علبةالجينات didate.

يصف بروتوكول المعروضة كيف يمكننا تقييم وظيفة Sin1 عنصر TORC2 في السيطرة على الهجرة الخلية وأكتين ديناميكية في الجسم الحي ^5. ولكن، كما هو مذكور في النتائج ومناقشتها أبعد من ذلك، يمكن استخدامها لتحليل الآثار المحتملة من أي الجينات مرشح في السيطرة على الهجرة خلية في الجسم الحي.

Protocol

ملاحظة: يعرض الشكل 1 الخطوط العريضة للبروتوكول.

1. إعداد إبر للحقن وزرع

ملاحظة: الإبر يمكن أن تكون مستعدة في أي وقت وتخزينها. الاحتفاظ بها في طبق بيتري، على عصابة من الصلصال. ختم الطبق مع بارافيلم للحماية من الغبار.

1. لإبر الحقن، وسحب الزجاج الشعرية (خارج القطر 1.0 ملم، داخل القطر 0.58 مم، من دون خيوط (انظر قائمة المواد)) مع مجتذب micropipette (انظر قائمة المواد). تفضل الإبر قصيرة ورقيقة (جزء مدبب من حوالي 5 ملم) لأنها أكثر كفاءة لاختراق المشيمه.
   ملاحظة: إبر الحقن ذات الاستخدام الواحد.
2. إبرة لزرع الخلايا
   1. سحب الزجاج الشعرية (خارج القطر 1.0 ملم، داخل القطر 0.78 مم، من دون خيوط (انظر قائمة المواد)) مع مجتذب micropipette.
   2. Uالغناء microforge (انظر قائمة المواد)، وقطع رأس الإبرة عند نقطة حيث القطر الداخلي 35 ميكرون (أكثر قليلا من قطر الخلايا المراد زرعها).
   3. شطبة قطع أقصى الشعرية مع microgrinder (انظر قائمة المواد) مع زاوية 45 درجة.
   4. اختياريا، وسحب شوكة في نهاية الإبرة باستخدام microforge. لهذا، المس خيوط الساخن مع غيض من شطبة وسحب بسرعة بعيدا، وخلق الشائكة التي يمكن أن تساعد اختراق الجنين.
   5. جبل الإبرة على حامل إبرة تعلق على حقنة. باستخدام حقنة، وشطف الداخل من ثلاث مرات إبرة مع حمض الهيدروفلوريك 2٪ للقضاء على مخلفات الزجاج، ثم شطف ثلاث مرات مع الأسيتون.
      تحذير: حمض الهيدروفلوريك سام، التلاعب تحت غطاء محرك السيارة، مع قفازات.
      ملاحظة: الإبر زرع الخلايا يمكن استخدامها عدة مرات.

2. إعدادأطباق للحقن وزرع الخلايا

1. الحرارة 50 مل من الجنين المتوسطة ¹¹ تحتوي على 0.5 غرام من الاغاروز في الميكروويف لمدة 1 دقيقة في السلطة الكاملة للحصول على 1٪ الاغاروز في المتوسط ​​الجنين. تبريد هلام الاغاروز إلى حوالي 60 درجة مئوية، وصب 50 مل في 90 مم طبق بيتري. وضع على السطح من هلام قالب المصممة خصيصا (انظر قائمة المواد)، إما مع خطوط لطبق حقن أو مع الآبار للطبق زرع الخلايا.
   1. مراقبة تعويم العفن على الاغاروز، إذا كان الاغاروز ليست ساخنة جدا. بعد تعيين agarose هلام، وإزالة القالب مع ملقط (الشكل 2A - B).
      ملاحظة: يمكن تخزين الأطباق في 4 درجات مئوية، وتصل إلى بضعة أسابيع. الاحتفاظ بها في صندوق الرطب مغلقة، لتجنب الجفاف.
2. وضع الطبق في 28 درجة مئوية الحاضنة 30 دقيقة قبل الاستخدام.

3. جمع الأجنة وحقن

1. إعداد الحل الحقن
   ملاحظة: نطاق ملزم أكتينمن الأكتين الخميرة البروتين 140 (ABP-140) مثل Lifeact بد أن mCherry ملزمة (ويشار إلى ABP140-mCherry) يستخدم لتصور الأكتين بلمرة داخل الخلية، وذلك لتحليل النشاط تبارزي. إضافة مركب آخر لاختبار وظيفة الجين مرشح (على سبيل المثال مرنا من المهيمن بناء سلبي أو نشط بشكل جوهري، أو [أليغنوكليوتيد Morpholino). لتقييم وظائف Sin1 كما هو موضح في النتائج (الشكل 3)، استخدمنا أليغنوكليوتيد Morpholino. كعنصر تحكم، استخدمنا morpholino مطابق لmorpholino sin1 ولكن لمدة 5 النيوكليوتيدات موزعة على طول تسلسل بحيث هذه السيطرة morpholino لا تطابق الحمض النووي الريبي الهدف.
   1. sin1 ذوبان وmorpholinos السيطرة 5-عدم تطابق (2 الحلول الأسهم ملم)، وABP140-mCherry من mRNAs على الجليد. إضافة 375 نانوغرام من من mRNAs (75 نانوغرام / ميكرولتر النهائي) و 0.75 ميكرولتر من أي sin1 أو 5-عدم تطابق morpholino التحكم (0.3 ملي النهائي) في المخزن Danieau (58 ملي كلوريد الصوديوم، 0.7 مليMgSO بوكل، 0.4 مم _4، 0.6 ملي كا (NO _{3) 2،} 5.0 ملي HEPES الرقم الهيدروجيني 7.6)، للوصول إلى الحجم الكلي لل5 ميكرولتر.
2. مجموعة الجنين
   ملاحظة: لتعيين هذه التجريبية حتى كلا المانحة والمضيفة الأجنة المعدلة وراثيا، معربا عن GFP تحت سيطرة goosecoid (GSC) المروج من أجل رؤية لوحة القردودية المقدمة المحتملين ^11.
   1. جمع تيراغرام (GSC: GFP) البيض. وضع حوالي 80 البيض في صحن 90 ملم بيتري مليئة المتوسطة الجنين واحتضان عند 28 درجة مئوية.
3. حقن الأجنة المانحة
   1. تحت مجهر تشريحي، والضغط بلطف الأجنة التي تم جمعها مع ملقط في خطوط طبق حقن مليئة المتوسطة الجنين. باستخدام ملقط، توجيه الأجنة مع الخلايا نحو الأعلى. وضع طبق حقن في الحاضنة عند 28 درجة مئوية حتى وصلت إلى الأجنة في مرحلة 4 خلايا (1 ساعة بعد الإخصاب).
   2. تحميل إبرة الحقن مع 2 ميكرولتر منحل الحقن. ادخال الإبرة في حامل إبرة (انظر قائمة المواد) التي يتم وضعها في تتلاعب الصغير (انظر قائمة المواد) ومتصلة مع تترافلوروإيثيلين (PTFE) أنابيب (انظر قائمة المواد) إلى transjector الهواء (انظر قائمة المواد ).
   3. فتح الشعيرات الدموية عن طريق لمس بلطف غيض مع ملقط غرامة. إذا لزم الأمر، وقطع شعري مفتوح من قبل معسر أقصى لها.
   4. أدخل إحدى الخلايا الأربع مع الإبرة وحقن محلول داخل الخلية وذلك لملء 70٪ من حجم الخلية (2 NL). ضخ 30 الأجنة.
      ملاحظة: الحصول على إبرة في الخلية قد يكون صعبا، لأن غشاء البلازما هي لينة. تهدف إلى تقاطع بين الخلية وصفار البيض يسهل اختراق الإبرة.
   5. وضع الأجنة في 28 درجة مئوية الحاضنة حتى وصلت إلى مرحلة المجال (4 ساعات بعد الإخصاب).

4. إعداد الأجنة لخلية: زرعأيون

1. إعداد 20 مل من المتوسط ​​الجنين مع 200 ميكرولتر البنسلين / الستربتومايسين (انظر قائمة المواد) (القلم / بكتيريا EM).
2. Dechorionation من الأجنة في مرحلة المجال (4 ساعات بعد الإخصاب)
   ملاحظة: الأجنة Dechorionated هشة للغاية وسوف تنفجر في حالة ملامسة الهواء أو البلاستيك. وبالتالي فإنها تحتاج إلى أن توضع في أطباق المغلفة الاغاروز، ونقل مع ماصات باستور الزجاج المصقول النار.
   1. باستخدام البلاستيك ماصة باستير، ونقل الأجنة المضيفة التي تم جمعها في الخطوة 3.2 و الأجنة المانحة حقن في خطوة 3.3 إلى اثنين 35 مم أطباق بتري المغلفة مع 1٪ الاغاروز في وسط جنين ومليئة القلم / بكتيريا EM. إبقاء الأجنة المضيفة والمانحة الأجنة في طبقين منفصلين.
   2. يدويا استخراج الأجنة من chorions مع ملاقط غرامة (انظر قائمة المواد).
   3. وضع الأجنة في 28 درجة مئوية الحاضنة حتى وصلت إلى مرحلة درع (6 ساعات بعد الإخصاب).

زراعة 5. خلية

1. ترتيب الأجنة لزرع الخلايا.
   1. تحت مجهر تشريحي الفلورسنت، حدد الأجنة المانحة عبرت عن ABP140-mCherry (أحمر) داخل درع (الخضراء).
   2. باستخدام ماصة باستير النار مصقول، ونقل الأجنة في آبار طبق زرع الخلايا مليئة القلم / بكتيريا EM. وضع الأجنة المضيفة في صف واحد والأجنة المانحة في الصف المجاورة.
   3. باستخدام رمش، توجيه بعناية الأجنة مع درع يصل.
      ملاحظة: موقف الدرع يمكن تقييم من قبل التعبير GFP أو تشريحيا.
2. زرع نظام مجموعة المتابعة.
   ملاحظة: يتكون نظام زرع حامل الإبرة (انظر قائمة المواد) متصلة مع أنابيب PTFE (انظر قائمة المواد) وموصل أنبوب (انظر قائمة المواد) إلى حقنة هاملتون مجهزة مع محرك الصغير (انظر قائمة من المواد). حامل إبرةهي التي شنت على 3 في اتجاه micromanipulator (انظر قائمة المواد).
   1. استخدام حامل إبرة تعلق على حقنة، وشطف إبرة لزرع الخلايا مع 70٪ من الإيثانول. قبل جاف امتصاص الهواء إلى إبرة. لا تجف التي تهب، لأن هذا قد يؤدي في الغبار يعلقوا في الجزء مدبب من الإبرة.
   2. ادخال الإبرة في حامل إبرة متصلة حقنة هاميلتون، مع شطبة صعودا.
3. درع إلى درع زرع الخلايا
   1. أدخل درع الجنين المانحة مع الإبرة زرع ووضع حوالي 10-20 الخلايا المسمى مع ABP140-mCherry. بعناية تجنب لفت الصفار.
   2. زرع الخلايا في درع الجنين المضيف. كرر حتى تم زرع الأجنة المضيفة.
   3. إزالة أي أجنة التالفة مع ماصة باستير النار مصقول. وضع الأجنة المزروعة في الحاضنة عند 28 درجة مئوية والسماح لهم استعادة لحوالي 30 دقيقة.
   4. باستخدام إبرةحامل تعلق على حقنة، شطف إبرة زرع الخلايا بالماء ووضعه مرة أخرى في طبق بيتري على عصابة من الصلصال. ختم الطبق مع parafilm.

6. (اختياري) واحد زرع الخلايا

ملاحظة: في الجنين، والخلايا تلتصق مع بعضها البعض، بحيث من الصعب استخلاص خلية واحدة فقط في إبرة الزرع. قمنا بتطوير بروتوكول تعديل لزرع خلايا بسهولة لوحة السلف واحدة القردودية المقدمة. والفكرة هي لفصل الخلايا قبل الزرع. لأن معزولة خلايا لوحة السلف القردودية المقدمة تميل الى فقدان هويتهم، ونحن نفرض وراثيا لهم المحتملين هوية لوحة القردودية المقدمة، من خلال تفعيل مسار الإشارات العقدية، في غياب عامل النسخ Sox32. لقد تحققنا من أن هذه الخلايا التي يسببها تتصرف مثل خلايا الذاتية القردودية المقدمة لوحة السلف ^8. وفيما يلي الخطوات المحددة لإجراء عمليات زرع خلية واحدة. dissocia خليةويتحقق نشوئها عن طريق وضع الأجنة في خالية من الكالسيوم قارع الأجراس ^11، تشريح ويزدرع وميكانيكيا التحريك.

1. في خطوة 2.1، وإعداد طبق زرع 1٪ الاغاروز في قارع الأجراس خالية من الكالسيوم بدلا من الجنين المتوسطة.
2. في خطوة 3.1، بالإضافة إلى ABP140-mCherry RNA وmorpholino sin1، إضافة 3 نانوغرام من الرنا ترميز شكل نشط من مستقبلات العقدية Taram-A (0.6 نانوغرام / نهائي ميكرولتر) و 1.25 ميكرولتر من morpholino ضد sox32 (حل الأوراق المالية في 2 ملي، وبالتالي 0.5 ملي النهائي).
3. بعد الخطوة 4، ونقل ثلاثة أجنة المانحة المختارة في طبق لزرع الخلايا مليئة القلم / بكتيريا قارع الأجراس خالية من الكالسيوم باستخدام ماصة باستير النار مصقول. مع ملاقط غرامة، تشريح ويزدرع التي تحتوي على حقن الخلايا (ABP140-mCherry الخلايا المسمى). بسرعة تجاهل بقية الأجنة.
4. مع رمش، وإثارة بلطف يزدرع حتى تنفصل الخلايا.
5. وضع زنزانة انفرادية واحدة في الإبرة زرعوغرسها في درع الجنين المضيف.
6. باستخدام ماصة باستير النار مصقول، ونقل الأجنة في طبق المغلفة الاغاروز مليئة القلم / بكتيريا EM. وضع الأجنة في الحاضنة عند 28 درجة مئوية لمدة 30 دقيقة.

7. الأجنة تركيب

1. غرفة التصوير
   1. الأسلوب 1: استخدام غرفة التصوير تتألف من شريحة بلاستيكية (75 * 25 * 0.5 مم) وتتخللها ثقوب 4 (5.5 مم)، مع 3 مم حواف عالية على جانب واحد (الشكل 2C - D). الغراء ساترة الزجاج على الجانب الخلفي، مع cyanoacrylate الغراء (سوبر الغراء).
      ملاحظة: في نهاية التجربة، وضع الغرفة في الماء لمدة ليلة واحدة لإزالة ساترة والتخلص من بقايا الغراء مع الرمل ورقة.
   2. الطريقة 2: استخدام 35 ملم ماتيك الزجاج أطباق السفلية (انظر قائمة المواد) مع وجود ثقب 10 ملم.
2. جنين تركيب
   1. ملء قارورة زجاجية مع 1 مل من الملفات الساخنة 0.2٪ الاغاروز في المتوسط ​​الجنين.يبقيه في 42 درجة مئوية في حرارة كتلة.
   2. تحت مجهر تشريحي الفلورسنت، حدد الجنين الذي أحمر الخلايا المزروعة هي جزء من لوحة القردودية المقدمة المحتملين المسمى باللون الأخضر (أي الخلايا المزروعة الحمراء هي ضمن لوحة القردودية المقدمة المحتملين الخضراء، وبدأت الهجرة نحو القطب الحيواني).
   3. نقل الجنين المحددة في الحل الاغاروز مع ماصة باستير النار مصقول. تجاهل تتجاوز المتوسطة الجنين من ماصة. رسم الجنين في ماصة مع الاغاروز، ونقل الأجنة في غرفة التصوير، إيداع قطرة الاغاروز. قبل تعيين الاغاروز، توجيه الجنين مع رمش. وضع لوحة القردودية المقدمة المحتملين صعودا للتصوير مع المجهر تستقيم، أو على الجزء السفلي من الزجاج للتصوير مع مجهر مقلوب. انتظر حتى يتم تعيين الاغاروز (حوالي 1 دقيقة، اعتمادا على درجة حرارة الغرفة) قبل التركيب جنين أخر في البئر المقبل للغرفة.
      ملاحظة: لتشا التصويرmber تحتوي على 4 آبار يسمح متزايدة تصل إلى 4 أجنة.
   4. عندما يتم تعيين الاغاروز، وملء الغرفة مع القلم / بكتيريا EM لتجنب الجفاف.

8. تصوير لايف

1. استخدام 40X الغمر بالمياه عدسة طويلة المدى. استخدام مجموعات مرشح المناسبة لصورة GFP وmCherry (لGFP: الإثارة BP 470/40، شعاع الخائن FT 510، والانبعاثات BP 540/50، لmCherry: الإثارة BP 578/21، شعاع الخائن FT 596، وليرة لبنانية انبعاث 641 / 75). ضبط مدة التعرض من أجل تحسين ديناميكيات الصورة.
2. لصورة كل الخلايا في لوحة، والحصول على مداخن ض، وبدأ عدد قليل من ميكرون فوق لوحة القردودية المقدمة المحتملين (في الأديم الظاهر) وتنتهي بضعة ميكرون تحت لوحة القردودية المقدمة المحتملين (في صفار البيض). استخدام خطوة ض 2 ميكرون. لتحسين سرعة الاستحواذ، تبديل الألوان بين ض مداخن وليس بين الإطارات.
   ملاحظة: هذا قد يؤدي إلى اختلافات طفيفة بين الصور الخضراء والحمراء، ولكن ليست مشكلة لأنه لا شارك دقيقةمطلوب -localization بين الإشارات الخضراء والحمراء. للحد من المزيد من الوقت التصوير والتعرض للضوء، ويمكن الحصول الأخضر مرة واحدة فقط كل نقطة زمنية 5، وهو ما يكفي لتحديد الخلايا لوحة السلف القردودية المقدمة.
3. استخدام هذه الإعدادات، صورة تصل إلى 4 أجنة ضمن الفاصل الزمني لمدة دقيقتين وهو أمر ضروري لتحليل الترددات نتوء والتوجه. لتحليل مدى الحياة نتوء، والحد الفاصل الزمني إلى 30 ثانية للحصول على دقة أعلى الوقت. صورة من 60٪ إلى 80٪ اكتفار اكتفار.

تحليل 9. حيوية الخلية

1. تحميل الصور 4D في ImageJ
   ملاحظة: اعتمادا على البرمجيات المستخدمة للحصول على، يتم تخزين الصور في أشكال مختلفة (ملف واحد لكل صورة، ملف واحد لكل ض المكدس، ملف واحد للتجربة الكاملة). ويمكن الاطلاع على لفتح مداخن 4D بعض الإضافات يماغيج. يتم تخزين البيانات على النحو ملف واحد لكل ض المكدس. لأن مجموعة البيانات يمكن أن تكون كبيرة، قد يكون مناسب لفتح الجزء الوحيد من ذلك (بعض تيمنقاط الإلكترونية، أو الفرعي للض المكدس، أو 8 بت تحويل الصور ...). ونحن نستخدم يماغيج المساعد مصنوعة خصيصا للقيام بذلك، ونحن سوف نكون سعداء لتوزيع عند الطلب.
2. تحليل التوجيه والتردد من النتوءات خلية
   1. استخدام الصور GFP لتحديد الاتجاه الرئيسي للالمحتملين الهجرة لوحة القردودية المقدمة. أغتنم هذه كمرجع لقياس نتوءات خلية زاوية. تدوير المكدس، بحيث هذا الاتجاه إشارة موازية إلى جانب واحد من الصورة.
   2. اتبع خلية واحدة. أداة تحديد زاوية. لكل إطار وكل نتوء، استخدم أداة زاوية لقياس الزاوية بين نتوء واتجاه إشارة (الشكل 3A). استخدام تحليل / قياس الأوامر لتخزين القيمة (أو اضغط على المفتاح M على لوحة المفاتيح). حفظ النتائج كملف النص. كرر مع الخلية التالية.
   3. استيراد البيانات إلى R وزاوية المؤامرة التوزيع ورسوم بيانية. استخدام اختبار كولموجوروف-سميرنوف (ks.test في R) للمقارنة بين ظروف مختلفة.
      ملاحظة: توفر هذه الأداة زاوية القيم تضم بين 0 درجة و 180 درجة، مما يتيح استخدام الاختبارات الإحصائية الكلاسيكية والاختبارات لا دائرية.
   4. مع هذه المجموعة البيانات، وحساب تردد الانبعاثات حيث بلغ عدد نتوءات لكل خلية في الدقيقة الواحدة. استخدام الطلاب T-اختبار (t.test في R) للمقارنة بين ظروف مختلفة.
3. تحليل الخلية النتوءات مدى الحياة
   1. لكل خلية وكل نتوء وقياس مدة بروز (عدد الإطارات خلالها بروز موجودا س الوقت الفاصل الزمني بين الإطارات).
   2. استيراد البيانات إلى R. استخدام الطلاب T-اختبار (t.test في R) للمقارنة بين ظروف مختلفة.
      ملاحظة: ميزات الهجرة أخرى يمكن أن تكون مثيرة للاهتمام لتحليل من أجل توصيف الهجرة الخلية. وتشمل هذه المسارات الخلية، لسرعة والتوجيه والقياسات استمرار، أو مورفولوجيا الخلايا. تتوفر لقياس هذه الميزات بعض تطبيقات البرمجيات التجارية، ولكن عددا كبيرا من تطبيق صحيفة البرمجيات مفتوحة المصدرالكاتيونات والإضافات يماغيج وتتوفر أيضا، وعلى سبيل المثال التكيف مع تحليل morphodynamics ^12، DiPer للنظر في مسارات الخلية واستمرار الاتجاه ^13، CellTrack لتتبع حدود الخلية أثناء الترحيل ^14.

النتائج

وقد استخدمت هذه التقنية المقدمة إلى تحليل دور Sin1، واحدة من المكونات الأساسية للتور معقدة 2 (TORC2)، في السيطرة على الهجرة خلية الجسم الحي. استخدام زرع الخلايا يسمح بوضع العلامات على الخلايا المعزولة وتحليل الآثار خلية مستقلة. يظهر الفيلم S1 هج...

Discussion

ويعرض هذا البروتوكول وسيلة سهلة لدراسة دور الجينات مرشح في الهجرة خلية في الجسم الحي، من خلال الجمع بين خلق أجنة خيالية باستخدام زراعة الخلايا مع التصوير الحي.

خلق الأجنة الفسيفساء

دراس...

Materials

Name	Company	Catalog Number	Comments
Glass capillaries (outside diameter 1.0 mm, inside diameter 0.58 mm)	Harvard Apparatus	300085	standard thickness
Glass capillaries (outside diameter 1.0 mm, inside diameter 0.78 mm)	Harvard Apparatus	300085	thin-walled
Penicillin-Streptomycin	Sigma-Aldrich	P4333	10 000 units penicillin and 10 mg streptomycin per ml
fine tweezers	Dumont Fine Science Tools	11254-20	5F
glass bottom dishes	MatTek	P35G-0-10-C
Air transjector	Eppendorf	5246
Micro-forge	Narishige	MF-900
Microgrinder	Narishige	EG-44
Micromanipulator (for injection)	Narishige	MN-151
Micromanipulator (for cell transplantation)	Leica	Leica Micromanipulator
Hammilton Syringe	Narishige	IM-9B
Micropipette puller	David Kopf Instruments	Model 720
Transplantation mold	Adapative Science Tools	PT-1
Needle holder	Narishige	HI-7
Tube connector	Narishige	CI-1
PTFE tubing	Narishige	CT-1