1. بناء HaDV2 خالية القطن دودة اللوز مستعمرة
- القطن الخلفية دودة اللوز اليرقات (H. armigera) على النظام الغذائي الاصطناعي 32 في غرفة النمو تسيطر عليها أو غرفة المناخ الاصطناعي في 25 ± 1 ° C، مع 14 ساعة ضوء / 10 ساعة الظلام والرطوبة النسبية 60٪.
- مساعدة-زوج واحد التزاوج من العث eclosed حديثا باستخدام قفص البلاستيك لكل زوج (10 سم ارتفاع، 5 سم القطر) مغطاة بشاش القطن لضمان التهوية الجيدة ولتكون بمثابة الركيزة وضع البيض. لزيادة احتمال الحصول على مستعمرة خالية من الفيروسات، واستخدام لا يقل عن 30 زوجا من التزاوج بين زوج واحد. العث تغذية الكبار مع 10٪ من السكر و 2٪ فيتامين حل 32 غارقة على كرة القطن وتتجدد يوميا.
- كما الإناث البالغين تضع بيضها على الشاش القطن حوالي 2 يوما بعد التزاوج، تغيير الشاش يوميا. جمع والحفاظ على الشاش التي تحتوي على البيض في غرفة النمو نفسها (أو الاصطناعي شام المناخالبر) مثل العث الكبار حتى يفقس البيض.
- على الفور نقل اليرقات حديثة الفقس إلى 24 لوحات جيدا جديدة، مع فرد واحد لكل بئر.
- بعد خمسة أيام من تاريخ أول وضع البيض، وجمع الفراشات الأم وتخزينها في النيتروجين السائل.
ملاحظة: جمع الفراشات بعد 5 أيام من تاريخ أول وضع البيض يضمن أن الآباء والأمهات على قيد الحياة عند نقطة جمع، وبالتالي يتجنب أي آثار المحتملة لاستخدام العث الميت على دقة استخراج الحمض النووي. - عزل الحمض النووي الجيني من هذه العينات باستخدام مجموعة استخراج الحمض النووي وفقا لتعليمات الشركة الصانعة.
- تضخيم شظية 574-BP من الجين الأكتين مع الاشعال الأكتين F / R الأكتين (الأكتين F: 5 CATCTACGAGGGTTACGC-3 و الأكتين R: 5 CATCTGTTGGAAGGTGGA-3). تصور سلسلة تفاعل البلمرة (PCR) المنتجات التي تستخدم الاغاروز الكهربائي للهلام وفقا لبروتوكولات موحدة. التضخيم ناجحة من الجينات الأكتين يضمن أن الحمض النووي هو من نوعية جيدة.
- تقييم رانه جود HaDV2 في العث الأم باستخدام PCR مع الاشعال محددة: DVVPF (GGATTGGCCTGGGAAATGAC) وDVVPR (CGTTGTTTTTATATCCGAGG) 31.
- مرة واحدة وقد تم التعرف على زوج نظيفة، ذرية الخلفي من هذا الزوج تربية المعافين HaDV2-واحد لخمسة أجيال على الأقل والحفاظ على هذا كمستعمرة خالية من HaDV2 (NONINF سلالة)؛ يتم تعريف مستعمرة المصابين HaDV2-كما INF سلالة.
- لتأكيد حالة الإصابة HaDV2 في NONINF سلالة (واستبعاد تأثير البكتيريا المعروفة أو فيروسات على التنمية المضيف)، وتقييم حالة عدوى لHaDV2، الولبخية، وH. armigera nucleopolyhedrovirus (HaNPV) في ثمانية أفراد اليرقات تم اختيارها عشوائيا من NONINF سلالة باستخدام PCR (مع الاشعال محددة: DVVPF / DVVPR لHaDV2، NPVF / NPVR لHaNPV، و81F / 691R لالولبخية 31، 33).
ملاحظة: من المعروف أن بعض الفيروسات يمكن أن يكون في وقت متأخرالإقليم الشمالي في المضيف المصاب، مع مستوى لا يمكن الكشف عنها حتى عند استخدام تقنية PCR القائم. ويمكن استخدام تقنيات NGS لتأكيد أنه لا يوجد تسلسل الفيروسية موجودة في عينات من الحمض النووي الجيني.
2. إعداد HaDV2 التي تحتوي على السائل السوائل
ملاحظة: لقد أظهرنا أن حاول تنقية جزيئات الفيروس HaDV2 يمنع العدوى والنشاط 31؛ وبالتالي، يتم تنفيذ البروتوكول التالي لتحقيق حل HaDV2 عدوى من خلال تصفية الأفراد المصابين HaDV2.
- جمع الفراشات الكبار بشكل فردي وعلى الفور تخزينها في النيتروجين السائل.
- طحن تماما العث الفردية التي تم جمعها في النيتروجين السائل باستخدام هاون ومدقة تعقيمها. نقل حوالي 10 ميكروغرام من الحطام إلى أنبوب 1.5 مل نظيف. نقل الحطام المتبقي لأنبوب جديد وتخزينها على الفور في -80 ° C.
- استخراج الحمض النووي من ميكروغرام 10 من الحطام، واتباعهجناح البروتوكولات المقدمة من قبل الشركة المصنعة. مرة واحدة وقد تم عزل DNA العثة، تحقق من HaDV2 باستخدام بروتوكول، كما هو موضح في الخطوة 1.6.
- ووفقا لنتائج التي تم الحصول عليها في الخطوة 2.3، تقسيم الحطام المتبقي إلى مجموعتين: HaDV2 إيجابية وHaDV2 سلبية، وهذا يتوقف على حالة الإصابة بها. إضافة 1 مل من الفوسفات مخزنة المالحة (PBS، 137 مم كلوريد الصوديوم، و 2.7 ملي بوكل، 8 ملي نا 2 هبو 4، و 1.5 ملي KH 2 PO 4، ودرجة الحموضة 7.5) لكل فرد أن يحل تماما الحطام اليرقات المتبقية.
- الطرد المركزي جناسة (من الخطوة 2.4) في 6500 × ز لمدة 15 دقيقة على 4 درجات مئوية. تصفية طاف السائل مع فلتر الغشاء 0.22 ميكرون. جمع السوائل التي تمت تصفيتها (200 ميكرولتر في أنبوب) وتخزينها على الفور في -80 ° C.
ملاحظة: سوف مرشح غشاء 0.22 ميكرون تصفية معظم الجسيمات غير مرغوب فيه، والبكتيريا، والفطريات. precool أول أجهزة الطرد المركزي إلى 4 درجات مئوية. تنفيذ كافة البروتوكولات involviنانوغرام تشغيل السائل التي تمت تصفيتها على الجليد لمنع جناسة من تحول البني والتخثر.
3. بناء المصابين HaDV2 القطن دودة اللوز مستعمرة
- قدرة نقل الأفقية HaDV2
- توليد منحنى القياسية HaDV2.
- تضخيم أجزاء تحتوي على الاشعال (VPF: CTGGTGAGGCGATGGACATG، VPR: TGACAAGATCCAGCGTAGACATC) والتحقيق (VP-التحقيق: GCCACCACTAGAGGACCCACCAGATG)، والتي تستخدم لتقدير حجم الفيروس HaDV2، مع دي نوفو الاشعال (PF: GGACAATGCTGGTGAGGC، PR: AATCCTCTTTGTCCGTTATCTATG). استخدام البرنامج التالي: 30 ثانية في 94 درجة مئوية، 30 ثانية في 53 ° C، و60 ثانية عند 72 درجة مئوية لمدة 40 دورة على جهاز PCR 31. إضافة 1 ميكرولتر من الحمض النووي الجيني الذي يحتوي على جينوم HaDV2 (الخطوة 2.3) إلى رد فعل 25 ميكرولتر PCR كما DNA القالب. استنساخ شظايا تضخيم الى ناقلات الاستنساخ وفقا لبروتوكولات الشركة المصنعة.
- حساب عدد نسخة منالبلازميدات مع المعادلة التالية: نسخ / ميكرولتر = (N A × C) / (ن × M × 10 9)، حيث N (أ) هو عدد أفوجادرو (6.02 × 10 23 جزيئات / مول)؛ C هو تركيز كتلة من البلازميدات (نانوغرام / ميكرولتر)، والتي يمكن قياسها باستخدام microspectrophotometry. ن هو طول البلازميد المؤتلف الذي يحتوي على المنتج PCR (5195 سنة مضت). وM هو الوزن الجزيئي للمتوسط الزوج قاعدة DNA المزدوج تقطعت بهم السبل (660 جم / مول).
- إعداد ستة التخفيفات المسلسل 10 أضعاف في أنابيب microcentrifuge 1.5 مل، مع تركيزات 1.5 × 10 9، 1.5 × 10 8، 1.5 × 10 7 و 1.5 × 10 6، 1.5 × 10 5، و 1.5 × 10 4 عدد نسخ / ميكرولتر.
- أداء في الوقت الحقيقي البلمرة المتسلسل الكمي رد فعل (QPCR) باستخدام بادئات محددة (VPF / VPR) والتحقيق (VP-التحقيق) لتوليد دورة ثلاث،شولد (CT) قيم البلازميدات هو موضح في الخطوة 3.1.1.3. تنفيذ ثلاث مكررات فنية مستقلة والمتوسط لهم لمزيد من العمليات الحسابية.
- استخدام النتائج المذكورة أعلاه، وتوليد منحنى القياسية ربط تركيزات HaDV2-تحولت log2 إلى القيم CT المتوسط ذات الصلة.
- تحديد HaDV2 في السوائل السائلة التي تمت تصفيتها.
- الماصة اختبار العينة 100 ميكرولتر من السائل السائل المصفى (الخطوة 2.6) تحتوي على HaDV2 لاستخراج الحمض النووي.
- استخدام الحقيقي الوقت QPCR للحصول على القيم CT للسوائل السائلة وحساب عدد النسخ باستخدام المنحنى القياسي في الخطوة 3.1.1.
- تحديد كفاءة العدوى عن طريق الفم مع السوائل التي تمت تصفيتها المصابين HaDV2 من تركيزات مختلفة.
- تمييع السائل السائل يحتوي على HaDV2 إلى التركيزات التالية: 10 8، 10 7، 10 6، العدد 10 5، 10 4، و0 نسخ / ميكرولتر.
- نشر دي الاصطناعيوآخرون بالتساوي على 9 سم القطر طبق بيتري قبل التصلب. موزعة بالتساوي السائل تحتوي على HaDV2 تصفيتها (200 ميكرولتر) لكل تركيز على السطح من النظام الغذائي الاصطناعي الصلبة. القيام بذلك في غطاء الدخان.
- نقل 100 اليرقات الطازجة إلى النظام الغذائي الاصطناعي HaDV2 التي تحتوي في طبق بتري. ضرب بلطف الشاش القطن (بما في ذلك اليرقات طازجة) لنقل اليرقات من الشاش لورقة بيضاء. تغلب على الورق برفق بحيث الحرير اليرقات تدور و "البالون" قبالة الورق. استخدام ملقط معقم للمس الحرير ونقل اليرقات إلى طبق بيتري.
- بعد 48 ساعة، ونقل اليرقات على النظام الغذائي الاصطناعي إلى 24 لوحات جيدا (فرد واحد لكل بئر).
- الخلفي اليرقات الملقحة مع HaDV2 في تركيزات أعلاه إلى مرحلة البلوغ.
- جمع الفراشات الكبار، استخراج DNA، وكشف HaDV2 باستخدام PCR، كما هو موضح في الخطوة 1.5.
ملاحظة: هنا، للحصول على 100٪ HaDV2 معدل إصابة المشتركدودة tton باستخدام 10 8 نسخة رقم / ميكرولتر وبالتالي تأسيس مستعمرة المصابين HaDV2 (INF سلالة).
- القدرة الانتقال الرأسي من HaDV2
- اختر العث الكبار من NONINF وINF-سلالات لتوليد أزواج واحدة من ♀- / ♂-، ♀ + / ♂-، ♀- / ♂ + و♀ + / ♂ + (+: إيجابية للعدوى HaDV2؛ -: سلبية ل HaDV2 العدوى).
- نقل ذرية من أزواج أعلاه إلى 24 لوحات جيدا خالية من الفيروسات. الخلفي اليرقات إلى الطور الثالث.
- استخراج الحمض النووي من جمع يرقات العمر الثالث لاستخدام القالب لتحديد وجود HaDV2، كما هو موضح في الخطوة 1.5.
4. توزيع الأنسجة من HaDV2
- لمنع التلوث من الفيروسات والبكتيريا وتعقيم ملقط ومقص في 75٪ من الإيثانول ثلاث مرات ثم تسخينها في لهيب مصباح الكحول.
ملاحظة: sterilizatio ملقطn غير الضروري عندما يحدث التلوث. - باستخدام ميزان تحليلي، وزن الأنابيب الفارغة التي سيتم استخدامها لتخزين الأنسجة.
- وضع اليرقات والكبار العث من INF سلالة على الجليد لمدة حوالي 5 دقائق.
- تشريح الأنسجة التالية تحت مجهر تشريحي في اليرقات، الإناث الكبار، والذكور البالغين في طبق بيتري نظيفة تحتوي على العازلة في برنامج تلفزيوني.
- ليرقات، الدملمف الماصة وتشريح المعى الأمامي، المعي المتوسط، المعى المؤخر، والدهون الجسم، والأنابيب المالبيغية (الشكل 1A). على الفور نقل كل الأنسجة للأنابيب في النيتروجين السائل.
- إصلاح اليرقات المجمدة على cystosepiment باستخدام اثنين من المسامير الحشرات (200 ميكرون في القطر، و 20 ملم في الطول)، إدراج في الأغشية بين القطع بالقرب من الرأس وآخر قطعة البطن (الشكل 1A).
- قطع proleg في البطن الخلفي من اليرقات بحيث يتدفق الدملمف اليرقات خارج. ماصة الدملمف اليرقات داخل 10 ثانية باستخدام micropipette لمنع الاحمرار والتخثر من الدملمف.
ملاحظة: الفنيل (50 ميكروغرام / مل) يمكن أن تكون مختلطة في 1:20 المجلد نسبة / المجلد مع الدملمف لمنع التصبغ. - باستخدام زوج من مقص، وجعل شق في إهاب تتراوح بين الغشاء بين القطع الماضي في الرأس. تشريح جميع الأنسجة المتبقية تحت مجهر تشريحي باستخدام اثنين من ملقط. ويظهر في الصورة لكل الأنسجة في الشكل 1A.
- مزيج عينات الأنسجة من ثلاثة أشخاص معا في تكرار واحد.
- لمنع التلوث من الأنسجة المتبقية مع الدملمف أثناء تشريح، وغسل الأنسجة تشريح في برنامج تلفزيوني العازلة ثلاث مرات. ثم، اختبار حالة HaDV2 العدوى من PBS تستخدم لغسل. إذا كان المخزن المؤقت غسل النهائي هو HaDV2 خالية، ينبغي أن الأنسجة تكون نظيفة من التلوث مع الدملمف.
- لالإناث البالغات، تشريح الرأس (الدماغ)، والعضلات، والدهون الجسم، القناة الهضمية، الأنابيب المالبيغية، والمبيض (الشكل 1B) تحت مجهر تشريحي في العازلة في برنامج تلفزيوني. للذكور البالغين، تشريح الرأس (الدماغ)، والعضلات، والدهون الجسم، القناة الهضمية، الأنابيب المالبيغية، والخصيتين (الشكل 1C) تحت مجهر تشريحي في العازلة في برنامج تلفزيوني. على الفور نقل كل الأنسجة للأنابيب في النيتروجين السائل.
- باستخدام ملقط ومقص، وإزالة أجنحة الفراشات الكبار وغسل الجسم المتبقي ثلاث مرات لمسح المقاييس.
- فصل الرأس والصدر، والبطن باستخدام مقص.
- إزالة هيكل داخلي من القفص الصدري وجمع العضلات.
- باستخدام ملقط، إزالة بشرة البطن وتشريح الأنسجة الأخرى التالية أرقام 1B و1C.
- مزيج من عينات الأنسجة من ثلاثة أشخاص معا في تكرار واحد. غسل الأنسجة تشريح في برنامج تلفزيوني العازلة ثلاث مرات.
- وزن الأنابيب والأنسجة المذكورة أعلاه عندما جمدت والتأكد من أن مالحمير من الأنسجة المختلفة متساوية تقريبا.
كتلة (الأنسجة) = كتلة (أنابيب / عينة الأنسجة) - كتلة (أنبوب فقط) - استخراج الحمض النووي من هذه الأنسجة وأداء QPCR، كما هو موضح في الخطوة 3.1.2.
- حساب عدد نسخة لكل ملغ من كل الأنسجة باستخدام المنحنى القياسي إنشاؤه في الخطوة 3.1.1. استخدام عيار الفيروس لكل وحدة كتلة لتصحيح التحيز عينة الناجمة عن أي اختلاف في كمية الأنسجة المستخدمة لاستخراج الحمض النووي.
- حساب النسبة المئوية من HaDV2 في الأنسجة محددة على النحو التالي: النسبة المئوية للHaDV2 لكل الأنسجة = HaDV2 نسخ العدد لكل ملغ من اختبار النسيج / (مجموع عدد نسخة لكل ملغ من جميع الأنسجة).
5. اختبارات بيولوجية اختبار تأثير من HaDV2 للتنمية المضيف
- مكان لا يقل عن 100 الشرانق أو العث الكبار ظهرت حديثا المستمدة من NONINF سلالة في، قفص مغطى القطن الشاش-5-L، سلك شبكة. بعد 2 يوما، وسوف الإناث البالغات تزاوج تبدأ في وضع البيض على الشاش القطن. جمع وصيانةالشاش القطن التي تحتوي على البيض. سوف يفقس البيض في حوالي ثلاثة أيام.
- تلقيح اليرقات الوليد مع HaDV2.
- نقل اليرقات الوليد من NONINF سلالة إلى النظام الغذائي الاصطناعي تحتوي على HaDV2 (10 8 نسخة رقم / ميكرولتر) لإنشاء INF سلالة.
- وبالمثل، نقل حديثي الولادة يرقات إلى النظام الغذائي الاصطناعي مغطاة السائل المصفى HaDV2 خالية (الخطوة 2.4) لإنشاء مجموعات المراقبة (NONINF سلالة). تشمل ما لا يقل عن 240 اليرقات في كل معاملة (الشكل 2A).
ملاحظة: اليرقات التي تستخدم لبناء NONINF- وINF-سلالات مستمدة من نفس الفوج الأم ويفقس في نفس الوقت، وضمان نفس الخلفية الوراثية. تأكد من أن يتم الاحتفاظ NONINF- وINF-السلالات في نفس الغرفة المناخ (عند 25 ± 1 ° C، مع 14 ساعة ضوء / 10 ساعة الظلام و 60٪ الرطوبة النسبية) لمعدل متزامن للتنمية؛ معدل يمكن أن تختلف تبعا لدرجة الحرارة والرطوبة. التعامل مع ديليتشأكل يرقات بلطف.
- بعد 48 ساعة، ونقل اليرقات بشكل فردي إلى 24 لوحات جيدا (فرد واحد لكل بئر) (الشكل 2B).
- عدد بالتتابع كل يرقة في كل بئر وتسجل مرحلة الطور ووضع البقاء على قيد الحياة اليومية.
- بعد حوالي 5 أيام، عندما تدهور النظام الغذائي الاصطناعي، ونقل في وقت واحد هؤلاء الأفراد إلى 24 لوحة جيدا جديدة تحتوي على نظام غذائي الاصطناعي الطازجة (الشكل 2C).
- وزن اليرقات من يوم 7 إلى 11 بعد فتحة باستخدام الميزان التحليلي لدقة 0.0001 ز. بعد وزنها، والعودة بشكل فردي اليرقات إلى 24 لوحة جيدا.
- على طرح الريش إلى الطور الخامس بعد انسلاخ الرابع (حوالي عشرة أيام بعد الفقس)، ونقل اليرقات إلى أنابيب زجاجية (10 سم ارتفاع، 2 سم القطر) (الشكل 2D). ويمكن أيضا الكشف عن هويته الخامسة يرقات العمر قبل عرض الكبسولة الرأس (حوالي 2.6 مم).
ملاحظة: نقل الأفرادإلى أنبوب زجاجي في نفس الوقت كل يوم. - الرمز في كل يرقة مع رقمه المرجعي الأصلي على أنبوب الزجاج باستخدام الطلاء أو علامات. تسجيل حالة اليرقات يوميا؛ في أنابيب زجاجية، فإن اليرقات تخدر تصبح خادرة بعد حوالي خمسة أيام مرحلة الشرانق تستغرق حوالي 11 يوما.
- تسجيل الشرانق وeclosion تاريخ لكل فرد في أنبوب زجاجي. تسجيل كتلة الشرانق القديم لمدة 3 أيام.
- بعد eclosion، وضعت امرأة واحدة ورجل واحد في قفص واحد مع 10٪ سكروز وحل فيتامين 2٪ (الشكل 2E). تجديد محلول السكروز كل يوم. تسجيل تاريخ وفاة لكل العثة.
- عندما وضعت البيض، وتغيير الشاش القطن يوميا. حساب عدد البيض على الفور. عدد الأبناء فقست حديثا في حين تفقس.
- خلال اختبارات بيولوجية، باختيار عشوائي ثمانية أفراد لكل معاملة لتأكيد حالة إصابة HaDV2. استخراج الحمض النووي الريبي مجموع هذه العينات باستخدام كاشف التربسين التجاريبعد بروتوكول الشركة المصنعة. توليف [كدنا أول حبلا التالية بروتوكول الشركة المصنعة واستخدامه كنموذج لاختبار ما إذا كان يتم نسخه الفيروسات بنجاح.