Method Article
التحليل تجميع تاو الموصوفة في هذه المخطوطة يحاكي الميزات المتوقعة في فيفو ميسفولدينج تاو والتجميع.
تجميع البروتين تاو وتشكيل خيوط حلزونية المزدوجة السمة مميزة لمرض الزهايمر وغيرها تاوباثيس. بالمقارنة مع غيرها من البروتينات المرتبطة بأمراض الأعصاب، حركية تجميع المبلغ عنها في المختبر للبروتين تاو أقل اتساقا تقديمه تقلب عالية نسبيا. هنا يصف لنا وضع في المختبر تجميع الإنزيم الذي يحاكي الخطوات المتوقعة المرتبطة مع تاو ميسفولدينج والتجميع في فيفو. ويستخدم المقايسة isoform تاو أطول (huTau441) الذي يحتوي على كلا من الطرفي ن إدراج الحمضية فضلا عن أربعة مجالات ملزمة ميكروتوبولي (مليون برميل يوميا). التجميع في المختبر هو سببها إضافة الهيبارين وتليها الأسفار ثيوفلافين تي في شكل 96 ميكروسكوبية جيدا باستمرار. التحليل تجميع تاو استنساخه عاليا بين آبار مختلفة وتشغيل تجريبي ودفعات من البروتين. التجميع يؤدي إلى تاو مورفولوجيا هوكي الشبيهة التي فعالة جداً في بذر تشكيل هياكل نوفو دي فيبريلار. بالإضافة إلى تطبيقه في دراسة إليه misfolding تاو والتجميع، التحليل الحالي هو أداة قوية لفحص المخدرات التي يمكن أن تتداخل مع إمراضية تاو.
مرض الزهايمر هو اضطراب الأعصاب مدمرة هيستوباثولوجيكالي المعرف بواسطة تراكم لويحات خرف خارج الخلية من مجمعة اميلويد بيتا1 والتشابك نيوروفيبريلاري داخل الخلايا التي تحتوي على تجميع هايبرفوسفوريلاتيد تاو البروتين2. تاو الفسيولوجية أحادي وتقديمها ستة isoforms الفريدة التي تحتوي على 0-2 إدراج الطرفي ن والربط ميكروتوبولي 3 أو 4 المجالات3،4 الناجمة عن الربط بديلة ومتوسط فوسفوريليشنز 2-3. ويعتقد أن هايبرفوسفوريليشن وميسفولدينج والتجميع الذاتي في الهياكل فيبريلاري تشكل العناصر الرئيسية في تاو المرضية، مرضية المقررة في الأفراد الجنونية5،6.
التشابك تاو neurofibrillary المجمعة السمة مميزة للإعلان ليس فقط بل أيضا لسائر تاوباثيس، بما في ذلك انحطاط فصي فرونتوتيمبورال (فتلد) لاختيار المرض والشلل التدريجي supranuclear (PSP)، الخرف فرونتو الزمانية (FTD) والابتدائية تاوباثي المتعلقة بالعمر (الجزء)2. من وجهة نظر الكيمياء الحيوية، فهم إليه misfolding تاو والتجميع يمكن إلقاء الضوء على العمليات المرضية المرتبطة بالإعلانات وأخرى تاوباثيس. بالإضافة إلى الجانب العلمي، قوية في المختبر فحوصات تجميع أدوات قيمة لفحص المخدرات المرشحين7،،من89،10. ويعتقد أن تراكم تاو يتبع التنو بلمرة تعتمد عملية (الحزب الوطني)11،12،،من1314. حركية الحزب الوطني سيجمويدال ويبدأ بخطوة التنو نشاط غير مواتية تليها عملية انحدار سريع نشاط تجميع.
خلافا لغيرها من البروتينات أميلويدوجينيك، بما في ذلك بروتين بريون، وبيتا اميلويد و α-سينوكلين، وتاو لا تجميع عفويا في ظل الظروف الفسيولوجية وتتمثل حتى المتطرفة أو درجات حرارة عالية غير مواتية لتجميع15. وهذا على الأرجح بسبب التفاعلات هيدروفيليك موجودة في واجهة تجميع تاو. ومع ذلك، تاو المجاميع كفاءة عند التركيزات الفسيولوجية عندما تستخدم الحمام مثل الهيبارين16 أو17،بوليانيونس أخرى18 .
الجهود السابقة لإعداد في المختبر فحوصات التجميع تاو قد يلقي بعض الضوء على تفاصيل misfolding تاو والتجميع، ولكن جاءت قصيرة لمحاكاة ما يعتقد أن حركية التجميع تاو في فيفو . في معظم الحالات، كانت تفتقر إلى حركية التجميع تاو في المرحلة الأولى تأخر المرتبطة مع نويات تاو. وهذا قد يكون نتيجة لاستخدام تركيزات البروتين تاو عالية جداً، وجود المجاميع في البروتين تاو انطلاق الأعمال التحضيرية و/أو استخدام أجزاء تاو مع كثير الميل تجميع أعلى مما تاو كامل طول الفسيولوجية أكثر بروتين19،،من2021،،من2223. وعلاوة على ذلك، لم تتناول الدراسات السابقة بإمكانية تكرار نتائج وجوانب قوة تاو التجميع حركية.
وهنا يصف لنا قوية في المختبر تاو تجميع الإنزيم الذي يحاكي الخصائص الرئيسية البلمرة تعتمد التنو مع مرحلة متخلفة أولية المقابلة إلى نويات تاو تليها مرحلة نمو المتسارع. وعلاوة على ذلك، المجاميع تاو المؤتلف الذي تم إنشاؤه فيبريلار في الطبيعة ولها فاعلية بذر مرتفعة للغاية. المقايسة استنساخه بشدة أيضا بين دفعات تاو ويمثل أداة قيمة الشاشة لمثبطات التجميع.
1-كاشف إعداد
2-مواصلة وضع تي إتش تي تجميع المقايسة على قارئ الميكروسكوبية الوضع المتعدد
ملاحظة: يتم إضافة صبغة تي إتش تي لرد الفعل على رصد حركية تجميع huTau441 في وضع مستمر (القياسات التلقائية). على الرغم من أن رد فعل يمكن أن تتبعها فلوروميتير عادية باستخدام ومبومو تقليدية، الطابع اليدوي للعملية يحد من تكرار القياسات وينال من دقة منحنيات الحركية المسجلة. ولهذا السبب، يستخدم قارئ تلقائي وضع متعدد ميكروسكوبية.
HuTau441 التوليفية التي تحتوي على الطفرات C291A و C322A والطرفي ن كان أعرب له والمحطة الطرفية ج ج-العلامات وتنقيتها كما سبق وصف24. دفعات huTau441 نقية جداً كتصور في الحزب الديمقراطي الصربي صفحة وتقريبا 100% أحادي كما يقيمها S-مالس (الشكل 1). حملت تجميع 15 ميكرون huTau441 بإضافة 8 ميكرومتر حمو الهيبارين ورد فعل أعقب باستمرار الأسفار تي إتش تي باستخدام قارئ ميكروسكوبية المتعدد. الطول الموجي الإثارة كان 440 نانومتر (عرض النطاق الترددي 20 nm) في حين تم قياس الانبعاثات في 485 نانومتر (عرض النطاق الترددي 20 nm). المقايسة يتم استنساخه بدرجة عالية، مع النتائج من 10 آبار الفردية التي لا يمكن تمييزها تقريبا (الشكل 2A). تم تقييم مورفولوجيس للمجاميع الإيجابية huTau441 تي إتش تي بعد ح 50 قبل فؤاد. Hutau441 المجمعة من خليط متجانس من هياكل فيبريلار ذات أطوال مختلفة مشابهة للإبلاغ عن السابقين فيفو مورفولوجيس (الشكل 2). وعلاوة على ذلك، لا يحتوي المخلوط الرد النهائي على مونومر، مما يوحي تحويل كامل إلى المجاميع كما يتضح من قياسات مالس S (الشكل 2). الحركية تجميع huTau441 في تشغيل تجريبي المستقلة متشابهة جداً كما أكد منحنيات سيجمويدال مماثلة ومراحل متخلفة والنمو لا يمكن تمييزها (الشكل 3). هو الحفاظ على المستوى العالي في إمكانية تكرار نتائج عندما يتم استخدام مجموعات مختلفة من البروتين (الشكل 4). وعلاوة على ذلك، huTau441 بريفورميد والمجاميع فعالة جداً في تجنيد مونومر تاو، وحفز تشكيل المجاميع تاو حيثياته . كميات منخفضة قدر 0.0025% (v/v) من المجاميع تاو بريفورميد قادرون على تجاوز التنو وتوليد الزناد ييفات دي نوفو (الشكل 5).
رقم 1: huTau441 المؤتلف أحادي ونقية جداً- A) تقييم النقاء تحت يشوه الأوضاع في جل صحيفة بيانات السلامة-صفحة 4-12% بما في ذلك سلم البروتين معيار الوزن الجزيئي (في كاتشين) (لين 1)؛ تتدفق من الخطوة تنقية تقارب ج-العلامة النهائية (لين 2)؛ كسر أغسل العمود (3 لين)، التيد huTau441 البروتين الذروة، قبل (لين 4) وبعد المخزن المؤقت تبادل (ممر 5)، على التوالي). ب) تحليل S-مالس huTau441. يظهر أن يكون أحادي مع كتلة مولى من كاتشين 51 > 99.9% البروتين ولا تحتوي على أجزاء أو مجموعات. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
رقم 2: تجميع المؤتلف huTau441 تم استنساخه بدرجة عالية، ويؤدي كمياً للهياكل فيبريلار. A) حركية الهيبارين الناجمة عن تجميع huTau441 يراقبها باستمرار في 96 الميكروسكوبية جيدا شكل الأسفار تي إتش تي. تركيزات huTau441 والهيبارين هي 15 ميكرون و 8 ميكرومتر، على التوالي. منحنيات الفردية 10 تتوافق مع التحويل لنفس الدفعة البروتين في عشرة آبار الميكروسكوبية نفسه وتتميز بمرحلة تأخر متوسط (بالتنمية المستدامة) من 14.2 ± ح 0.38 و t50 ± 18.8 0.40 h. البيانات الحركية كانت مزودة لوجيستي 5-معلمة ج المنحنى مع انخفاض خطي في الخط المقارب العلوي. تأخر مرحلة و t50 حسبت بالتداخل بين القيم المتوقعة بالانحدار الخطي. مرحلة انتقالية يحسب على أساس الزيادة 3% من الإشارات الأسفار تي إتش تي. المنحنى المناسب وموجز إحصاءات يتم الحصول عليها باستخدام أي بي أم الإحصائي للعلوم الاجتماعية الإحصاءات الإصدار 20.0.0.2. ب)-إظهار المجاميع تاو مورفولوجيس مثل هوكي كما هو مبين بتصوير فؤاد في ح 50؛ ج). تحليل أحادي huTau441 مالس S (t = 0 ح) والمادة طافية في خليط رد الفعل عند الانتهاء من رد فعل (t = ح 50). في النقطة الزمنية ح 50 كان فصل الخليط رد فعل ح 1 000 20 شخص × ز و 4 ˚C والمادة طافية أدى حقن في S-مالس. ويؤكد اختفاء ذروة مونومر تجميع كاملة من تاو. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
الشكل 3: مقايسة التجميع تاو يبين إمكانية تكرار نتائج عالية بين تشغيلات تجريبية مستقلة. عرض الفريقان أربعة آثار حركية فردية لتجميع huTau441 العفوية التي جمعت في تجربتين مستقلة باستخدام نفس الدفعة من البروتين huTau441. تركيزات huTau441 والهيبارين هي 15 ميكرون و 8 ميكرومتر، على التوالي. حركية تتميز بمرحلة تأخر متوسط (بالتنمية المستدامة) من 12.2 ± 0.18 ح و ر50 من 17.8 ± 0.8 ح (تشغيل 1) و 11.6 ± 0,52 ح و تي50 من 17.8 ± ح 0.23 (تشغيل 2)، على التوالي. كانت مزودة البيانات الحركية مع منحنى سوقي 5-المعلمة مع انخفاض خطي في الخط المقارب العلوي. تي50 حسبت بالتداخل بين القيم المتوقعة بالانحدار الخطي. مرحلة انتقالية يحسب على أساس الزيادة 3% من الإشارات الأسفار تي إتش تي. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
الشكل 4: مقايسة التجميع تاو يبين إمكانية تكرار نتائج عالية بين مجموعات مختلفة من البروتين huTau441. ويبين كل فريق أربعة يتطابق المقابلة لدفعة huTau441 محددة. وأعقب بتجميع كل دفعة في تجارب مستقلة. تركيزات huTau441 والهيبارين هي 15 ميكرون و 8 ميكرومتر، على التوالي. تجميع حركية تناظر تاو الفردية أربع دفعات تتميز بمرحلة تأخر متوسط (بالتنمية المستدامة) من 15.3 ± ح 0.38 و تي50 من 21.1 ± 0.46 ح (المجموعة 1)؛ المرحلة الفاصلة 12.5 ± 0.07 ح و ر50 من 19.8 ± ح 0.34 (المجموعة 2)؛ متخلفة عن المرحلة من 15.1 ± ح 0.34 و تي50 ± 21.9 ح 0.86 (المجموعة 3) وتأخر المرحلة من 11.5 ± ح 0.29 و تي50 من 17.8 ± ح 0.29 (دفعة 4)، على التوالي. كانت مزودة البيانات الحركية مع منحنى سوقي 5-المعلمة مع انخفاض خطي في الخط المقارب العلوي. تأخر مرحلة و t50 حسبت بالتداخل بين القيم المتوقعة بالانحدار الخطي. مرحلة انتقالية يحسب على أساس الزيادة 3% من الإشارات الأسفار تي إتش تي. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
الرقم 5: المجاميع hutau441 بريفورميد قد بذر عالية النشاط. للشروع في زرع البذور، أضيفت المجاميع تاو سونيكاتيد إلى hutau441 مونومر. من اللون الأحمر إلى اللون الأزرق، يمثل كل لون منحنيات الحركية المختلفة مقدار مختلفة من البذور وأضاف: 1.25% 0.63 في المائة و 0.31 في المائة، 0.16 في المائة، 0.08 في المائة، 0.04%، 0.02 في المائة، 0.01 ٪، 0.005 في المائة و 0.0025% (v/v)، على التوالي. يتم تمثيل التحويل التلقائي من hutau441 باللون الأسود. تم اختبار كافة الشروط في البيلوروسية. Replicates الحركية الأربعة المرتبطة بتركيز معين من البذور يتم استنساخه بدرجة عالية، وفي معظم الحالات لا يمكن تمييزها. تركيزات hutau441 والهيبارين هي 15 ميكرون و 8 ميكرومتر، على التوالي. إضافة كميات صغيرة من قبل تشكيل هياكل فيبريلار سونيكاتيد يلغي المرحلة الفاصلة الأولى لوحظ في تحويل عفوية والأثر غير متناسب مع كمية بذور. من اللون الأحمر إلى اللون الأزرق، الفرق في تي50 لاحظ (50 تي تي spont.conv البذر50 ) 18.9، 18.40، 17.8، 17.3، 16.6، 16.1، 15.4، 14.7، 14.2 و 13.7 ساعة، على التوالي. التحويل التلقائي ل hutau441 يتسم تي متوسط50 (بالتنمية المستدامة) من 19.85 ± h. 0.54 البيانات الحركية كانت مزودة بمنحنى سوقي 5-المعلمة مع انخفاض خطي في الخط المقارب العلوي. تي50 حسبت بالتداخل بين القيم المتوقعة بالانحدار الخطي. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
وعلى الرغم من الجهود العديدة، أفادت حركية التجميع تاو في الأدب التاريخ الافتقار إلى المستوى المطلوب في إمكانية تكرار نتائج و/أو بعض الميزات من نويات البلمرة تعتمد19،،من2021 , 22 , 23 , 25-وهذا كثيرا ما شددت على عدم وجود مرحلة انتقالية وبذر عدم كفاءة والطبيعة غير فيبريلار تاو المجاميع. وسبب هذه العيوب يمكن أن تختلف، ويشمل تاو دون المستوى الأمثل نوعية البروتين (التجزؤ، وجود المجاميع، ونقاء منخفضة، إلخ.)، اختيار البروتين وحمل الكواشف واو الظروف التجريبية. عامل تعقيد آخر بقايا سيستين اثنين تقع حول واجهة تجميع تاو التي يمكن أن تشكل داخل أو جملة-ثنائي كبريتيد الجزيئية الجسور تبعاً للبيئة الأكسدة ويؤثر على كفاءة التجميع تاو. في معظم نهج الحد من الكواشف مثل DTT أو تسيب استخدمت للحفاظ على بقايا سيستين في أشكال أقل وبالتالي زيادة مستويات من إمكانية تكرار نتائج25. وعلاوة على ذلك، معامل الانقراض تاو منخفضة جداً مما يؤدي إلى صعوبات في قياسات دقيقة لتركيز البروتين.
نحن تركز خصوصا على عدد قليل من المعلمات والسمات النوعية التي نحن تعتبر حاسمة بالنسبة لملف تجميع قوية واستنساخه والممثل للبروتين تاو: القضاء على إمكانية داخلها-وجملة-تشكيل ثنائي كبريتيد الجزيئية، توليد من مونومر تاو نقية جداً وتحسين دقة تحديد تركيز. كل كاشف هذه المتصلة بمسائل هي نقاط الاهتمام المحتملة التي نحن تعتبر حاسمة بالنسبة للتنمية المثلى بالانزيم. وأعرب huTau441 طول كامل لمعالجة هذه القضايا، مع الطفرات اثنين، C291A، و C322A، والعلامات الطرفي ن وج. طفرة مخلفات سيستين له الحد الأدنى من التأثير على البروتين تاو حين القضاء على خلاف ذلك الصعوبة بمكان السيطرة على سد ثنائي كبريتيد. التعبير عن البروتين مع العلامات الطرفي ن وج قصيرة نسبيا سمح لنا بمتابعة بروتوكول تنقية تقارب خطوتين مما أدى إلى درجة نقاء عالية جداً، والسلامة ومركب المحتوى. وعلاوة على ذلك، قدمنا طفرة F8W زاد معامل الانقراض من البروتين، ويسمح بتركيز أكثر دقة القياسات24.
بالإضافة إلى استخدام كواشف جودة عالية البروتين، كانت أيضا الأمثل المعلمات مقايسة الأخرى. تاو الأمثل: تم تحديد نسبة الهيبارين حوالي 0.5 (M/M) وما يتماشى مع الدراسات المنشورة سابقا26. وعلاوة على ذلك، الإعدادات الآلي الميكانيكية والبصرية حاسمة لضمان إمكانية تكرار نتائج والمعلمات الأمثل قد تختلف إلى حد ما حسب الشركة المصنعة.
تجميع تاو الموصوفة في هذا التحليل يبين الخصائص التي ترتبط مع تاو المرضية في الإعلان والمتعلقة تاوباثيس. العملية تبدأ بمرحلة تأخر أولية المقابلة لتشكيل نواة ذات الطاقة العالية وتبعتها مرحلة نمو سريع الذي يتوافق مع النمو فيبريل. وقت تأخير طويلة بما يكفي لفتح نافذة واسعة للدراسة بالتفصيل عملية البذر تغطي طائفة واسعة من البذور تركيزات (الشكل 5) في حين لا يزال ليس وقتاً طويلاً حتى يتم تفادي تدهور البروتين و/أو التجميع غير محددة (الشكل 2). يمكن أن يحدث هذه الأحداث الثانوية وبخاصة عندما يتعرض بروتين اضطرابه ارتباطاً وثيقا مثل huTau441 لفترات طويلة من الوقت للظروف الفسيولوجية. عرض المجاميع تاو حصل على مورفولوجية ففس معزولة عن أدمغة المرضى الإعلانية، وهي فعالة جداً في توظيف تاو أحادي وتحويله إلى حيثياته إنشاء المجاميع، هي عملية يشار إليها كالبذر. المقايسة يتم استنساخه بدرجة عالية، المنحنيات الحركية التي لا يمكن تمييزها تقريبا بين الآبار وتشغيل تجريبي ودفعات البروتين. على الرغم من أن الفحص الحالي يركز فقط على isoform تاو أطول، huTau441، التطبيق يمكن تكييفها لدراسة تحويل أشكال أخرى من تاو (أمييجدي et al., Acta نيوروباثولوجيكا الاتصالات، في الصحافة) علاوة على ذلك، فإنه تمكن الدراسات الميكانيكية تركز على التفاعل بين إيسوفورمس تاو وربما يلقي الضوء على الاختلافات بين تاو المرضية في الإعلان حيث isoforms 3R و 4R موجودة في ففس وانتقاء للمرض أو العته فرونتوتيمبورال حيث يحتوي على أمراض تاو أساسا 3R و 4R تاو isoforms، على التوالي27.
إمكانية تكرار نتائج عالية جداً للمقايسة ينبغي السماح للقراء بتنفيذ ذلك بسهولة نسبية في إعداداتها معمل محددة. المقايسة يحاكي ما يعتقد أن في فيفو ميسفولدينج وتجميع تاو، تمكين الدراسات الميكانيكية التي سوف تسلط الضوء على تاو المرضية وأنه يشكل أداة قيمة لفرز المرشحين المخدرات وتقييم تدخلها مع الخطوات المختلفة لعملية المرضية.
الكتاب ليس لها علاقة بالكشف عن.
الكتاب يود أن يشكر "هيكتور كويرانتي" للتعبير وتنقية huTau441، Inganäs حنا ومارغو van فينسن للدعم الفني الممتاز ومارتن كولديجك لتحليل البيانات.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Thioflavin T | Sigma-Aldrich | T3516-5G | dry powder (Mw = 318.86 g/mol) |
Heparin | Sigma-Aldrich | H3393-50KU | dry powder (Mw = 17-19 kDa) |
TCEP | Sigma-Aldrich | 75259-1G | dry powder (MW= 286.65 g/mol) |
PBS | Gibco-Life Technologies | 10010-015 | Sterile, pH 7.4 (1X) |
0.22 μm sterile filter | Corning | 431160 | PES membrane |
0.20 μm sterile serynge filter | Corning | 431229 | PES membrane |
96-well microplates | Thermo Scientific | 9502867 | Black, flat botton |
Microplate sealers | R&D Systems | DY992 | Adhesive strips |
Synergy Neo2 Multi-Mode Microplate Reader | Biotek | Synergy Neo2 | Hybrid Technology, Gen5 Software |
Eppendorf Tubes | Eppendorf | 0030 120.086 | 1,5 ml tubes |
Ultrasonics-Branson SFX250 | Branson | 101-063-966R | 1/2" Solid Horn and 1/8" microtip |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved