Method Article
* These authors contributed equally
يصف هذا البروتوكول استخدام مجموعات تعبير البروتين التجارية الخالية من الخلايا لإنتاج بروتينات غشائية مدعومة في القرص النانوي يمكن استخدامها كمستضدات في لقاحات الوحدات الفرعية.
توفر لقاحات الوحدات الفرعية مزايا على اللقاحات التقليدية المعطلة أو الموهنة المشتقة من الخلايا الكاملة في السلامة والاستقرار والتصنيع القياسي. لتحقيق لقاح فعال قائم على البروتين ، غالبا ما يحتاج مستضد البروتين إلى تبني شكل يشبه الأصلي. وهذا مهم بشكل خاص لمولدات الضد السطحية المسببة للأمراض التي هي بروتينات محاطة بغشاء. تم استخدام الطرق الخالية من الخلايا بنجاح لإنتاج بروتين غشاء وظيفي مطوي بشكل صحيح من خلال الترجمة المشتركة لجزيئات البروتين الدهني النانوي (NLPs) ، والمعروفة باسم الأقراص النانوية.
يمكن استخدام هذه الاستراتيجية لإنتاج لقاحات الوحدة الفرعية التي تتكون من بروتينات غشائية في بيئة مرتبطة بالدهون. ومع ذلك ، غالبا ما يقتصر إنتاج البروتين الخالي من الخلايا على نطاق صغير (<1 مل). عادة ما تكون كمية البروتين المنتجة في عمليات الإنتاج على نطاق صغير كافية للدراسات البيوكيميائية والفيزيائية الحيوية. ومع ذلك ، يجب توسيع نطاق العملية الخالية من الخلايا وتحسينها واختبارها بعناية للحصول على ما يكفي من البروتين لدراسات اللقاح في النماذج الحيوانية. يجب تحسين العمليات الأخرى التي ينطوي عليها إنتاج اللقاح ، مثل التنقية وإضافة المواد المساعدة والتجفيد ، بالتوازي. تشير هذه الورقة إلى تطوير بروتوكول موسع للتعبير عن لقاح الوحدة الفرعية للبروتين المرتبط بالغشاء وتنقيته وصياغته.
تتطلب التفاعلات الخالية من الخلايا الموسعة تحسين تركيزات ونسب البلازميد عند استخدام ناقلات تعبير البلازميد المتعددة ، واختيار الدهون ، وإضافة المواد المساعدة لإنتاج عالي المستوى لجزيئات البروتين الدهني النانوي المصاغة. يتم توضيح الطريقة هنا مع التعبير عن بروتين الغشاء الخارجي الرئيسي الكلاميديا (MOMP) ولكن يمكن تطبيقه على نطاق واسع على مستضدات البروتين الغشائي الأخرى. يمكن تقييم فعالية المستضد في الجسم الحي من خلال دراسات التحصين لقياس إنتاج الأجسام المضادة ، كما هو موضح هنا.
تتوفر محللات بدائية النواة أو حقيقية النواة للتعبير الخالي من الخلايا للبروتينات بسهولة كمنتجات تجارية لتوليف البروتينات ذات الأهمية (للحصول على مراجعة كاملة ، انظر 1). تتوفر أنظمة التعبير هذه على مستويات مختلفة وتستخدم المحللات من الكائنات الحية المختلفة ، بما في ذلك الإشريكية القولونية ونباتات التبغ ومزارع الثدييات. تقدم المحللات الخالية من الخلايا فوائد متعددة مقارنة بأساليب إنتاج البروتين المؤتلف التقليدية ، بما في ذلك سهولة الاستخدام وإنتاج البروتين القوي والسريع. في حين أن هذه الأساليب تستخدم في المقام الأول لإنتاج البروتينات القابلة للذوبان ، فقد كانت هذه المجموعة رائدة في نهج لاستخدامها للتعبير عن البروتينات الغشائية.
يقوم هذا النهج الجديد بإجراء تعديلات طفيفة على أنظمة التعبير الخالية من الخلايا الحالية من خلال تضمين الحمض النووي الذي يشفر منتجين بروتينيين للتعبير ، والبروتين الشحمي والبروتين الغشائي محل الاهتمام. يتفاعل البروتين الشحمي المعبر عنه (مشتقات إما ApoA1 أو ApoE4) مع الدهون المضافة إلى المحللة الخالية من الخلايا لتجميع NLPs تلقائيا (~ 20 نانومتر). عند ترجمته مع بروتين غشاء مهم ، يشكل NLP والبروتين الغشائي مركب جسيمات نانوية قابلة للذوبان حيث يتم تضمين بروتين الغشاء داخل طبقة الدهون المزدوجة NLP. وبالتالي ، فإن البروتين الغشائي يمكن الوصول إليه بشكل أكبر للتطبيقات النهائية ، حيث يتم احتواؤه داخل جزيئات منفصلة قابلة للذوبان. يمكن أن ينتج هذا النهج معقدات بروتين قليل القسيمات وظيفية داخل الطبقة الثنائية من البرمجة اللغويةالعصبية 2 ويمكن أن ينتج مكون المستضد للقاح الوحدة الفرعية ، والذي يتم خلطه لاحقا مع المواد المساعدة المحبة للدهون لتشكيل لقاح للجسيمات النانوية يتميز بمستضد موضعي مشترك ومساعد مناسب للتقييم في الجسم الحي .
تم تعديل هذه الطريقة الحالية من بروتوكول3 تم نشره مسبقا. تركز التعديلات الرئيسية على توسيع نطاق التفاعل الخالي من الخلايا والتنقية اللاحقة لمركب البروتين - البرمجة اللغوية العصبية. يتضمن التعديل الآخر إضافة بوليمر برمائي يعرف باسم telodendrimer ، والذي يتم خلطه أولا مع الدهون قبل إضافته إلى التفاعل الخالي من الخلايا. الترجمة المشتركة للبلازميدات في وجود telodendrimer والدهون تنتج telodendrimer NLP (tNLP). تساعد إضافة telodendrimer أيضا على تعديل حجم وتشتت الجسيمات النانوية tNLP الناتجة4. تم تحسين هذا البروتوكول خصيصا لدراسات اللقاحات واسعة النطاق لإنتاج بروتين مستضد وحدة فرعية مرتبطة بالغشاء ، الكلاميديا MOMP 5,6. تنتج الطريقة MOMP المؤتلف المرتبط ب tNLP لتشكيل مركب MOMP-tNLP عالي الذوبان الذي يحتفظ بقلة MOMP. ينتج إنتاج نموذجي من 3 مل >1.5 مجم من MOMP المنقى. إن MOMP-tNLP المنتج الخالي من الخلايا قابل للإضافة المساعدة السريعة لاختبار المناعة في الجسم الحي.
تم إجراء جميع الدراسات على الحيوانات في جامعة كاليفورنيا ، إيرفين ، في مرافق مضمونة لخدمة الصحة العامة (PHS) وفقا للمبادئ التوجيهية التي وضعتها لجنة رعاية واستخدام الحيوان المؤسسية.
1. إعداد الأواني الزجاجية
ملاحظة: جميع المواد المستخدمة في إنتاج تركيبات من فئة اللقاحات للحيوانات خالية من السموم الداخلية.
2. إعداد العازلة
3. إعداد رد الفعل
4. إنتاج خال من الخلايا من MOMP-tNLPs لتركيبات لقاح الوحدات الفرعية
5. تنقية MOMP-tNLP
6. التحليل بواسطة SDS-PAGE
ملاحظة: يجب تحليل جميع كسور الشطف بواسطة SDS-PAGE لفحص كمية ونقاء البروتين محل الاهتمام.
7. البقع الغربية والنقاط والتخزين
8. تقييم السموم الداخلية
9. التجفيد
10. إضافة مساعد
ملاحظة: يمكن لهذه التركيبات وغيرها من تركيبات اللقاح الفرعية القائمة على البرمجة اللغوية العصبية أن تتضمن بسهولة مواد مساعدة محبة للدهون مثل CpG-ODN1826 و FSL-1. CpG-ODN1826 عبارة عن قليل النوكليوتيد المعدل من الفئة B CpG (5'-tccatgacgttcctgacgtt-3') مع العمود الفقري للفوسفورثيوات الكامل الذي يتميز بجزء من الكوليسترول 5 بوصات (5'-chol-C6). يتم التوسط في اقتران CpG-ODN1826 إلى tNLPs من خلال التفاعلات الكارهة للماء بين جزء الكوليسترول وطبقة الفوسفوليبيد المزدوجة في tNLP وقد تم إثباتها وتوصيفها بشكل جيد ، كما تم الإبلاغ عنه سابقا 9,10.
11. اختبار المصل
يظهر ملف تعريف SDS-PAGE لتنقية تقارب Ni ل MOMP-tNLP من تفاعل خال من الخلايا سعة 1 مل في الشكل 1B. أدى التفاعل إلى مستويات عالية من التعبير لكل من MOMP وبروتين Δ49ApoA1. أظهرت النتائج السابقة أن التعبير الخالي من الخلايا ل Δ49ApoA1 في وجود DMPC و telodendrimer أدى إلى تكوين جزيئات البروتين الدهني النانوي telodendrimer (tNLPs)4. أشار الشطف المشترك ل MOMP مع Δ49ApoA1 إلى أن MOMP مرتبط ب tNLPs ، حيث أن علامة His-tag موجودة فقط على سقالة tNLP Δ49ApoA1 وليس على MOMP. MOMP هو بروتين غير قابل للذوبان بدرجة عالية لا يمكن استخلاصه إلا من خلال التعقيد مع tNLPs ، والتي ثبت أنها تسهل إذابة البروتينات الغشائية.
تم تجميع أجزاء الشطف التي تحتوي على MOMP-tNLPs وتحديد تركيز البروتين الكلي باستخدام جهاز تكميم قائم على التألق ، أو جهاز يقيس التركيز من خلال الامتصاص عند 280 نانومتر ، باتباع تعليمات الشركة المصنعة لكمية البروتين. للسماح بجرعات دقيقة من لقاح MOMP ، من المهم أيضا تحديد تركيز MOMP في المجمعات المنقى. لقد طورنا طريقة لقياس MOMP بناء على قياس كثافة الهلام (الشكل 2) حيث تم استخدام MOMP المنقى المؤتلف بتركيز معروف كمعيار. من خلال إنشاء المنحنى القياسي ومقارنته بعينة MOMP-tNLP ، يمكن قياس تركيز MOMP بدقة. مكن تحديد تركيز MOMP في العينة المنقاة من تقدير عائد MOMP في تفاعلات خالية من الخلايا على مستويات مختلفة ، وهو أمر مهم لتخطيط إعداد التفاعل المناسب للدراسات النهائية (الجدول 3).
يحتاج MOMP إلى تكوين oligomers لاستنباط استجابة مناعية قوية11. لاختبار حالة oligomeric من MOMP ، تم تحليل MOMP-tNLP في وجود وغياب كل من الحرارة وعامل الاختزال dithiothreitol (DTT ، 50 mM ، الشكل 3A). تم تحديد الأوليغومرات ذات الترتيب الأعلى من MOMP من خلال SDS-PAGE عندما لم تتم معالجة العينات بالحرارة و DTT. وبالمقارنة ، أظهرت العينات المعالجة بالحرارة في وجود DTT في المقام الأول شريطين متميزين على الهلام ، يقابلان MOMP و Δ49ApoA1 (حوالي 40 كيلو دالتون و 22 كيلو دالتون ، على التوالي). تشبه هذه النتائج إلى حد كبير نمط ربط الهلام المنسوب إلى تكوين oligomer ل MOMP ، وهو أمر بالغ الأهمية لفعاليته.
أظهر تحليل اللطخة الغربية الإضافي باستخدام MAb40 ، وهو جسم مضاد ضد الخاتم الخطي على المجال المتغير لبروتين MOMP ، نمطا مشابها للنطاقات ، مما يؤكد تكوين oligomer بواسطة بروتين MOMP في حالته غير المشوهة (الشكل 3B). أحد العوامل المهمة التي تؤثر على تكوين أوليغومر MOMP هو النسبة بين بلازميد MOMP وبلازميد Δ49ApoA1 أثناء إعداد التفاعل الخالي من الخلايا. يسرد الجدول 4 نسبة البلازميدات ومعدل إدخال MOMP الناتج في tNLPs. أشارت الدراسات السابقة إلى أن الكلاميديا MOMP وبروتينات الغشاء الخارجي الأخرى قد توجد في المقام الأول كقادين12. لتعظيم تكوين أداة التشذيب في التفاعل الخالي من الخلايا ، من المستحسن أن يكون معدل الإدخال قريبا من ثلاثة بروتينات MOMP لكل برمجة عصبية ، وهو ما يتوافق مع نسبة البلازميد ~ 25: 1 MOMP إلى Δ49ApoA1.
تم استخدام مقايسة اللطخة النقطية كطريقة أكثر بساطة للكشف عن وجود MOMP و tNLP. تم استخدام الجسم المضاد MAb40 للكشف عن MOMP الكلي. تم استخدام الجسم المضاد MAbHIS المستهدف لعلامة His-tag على سقالة Δ49ApoA1 من tNLP لتقييم وجود tNLP. أشارت الإشارات المشتركة للأجسام المضادة MAb40 و MAbHIS إلى تكوين MOMP-tNLP. أنتج تفاعل التحكم tNLP فارغا ، والذي أظهر فقط إشارة إيجابية من MAbHIS (الشكل 3C). لاختبار مناعة MOMP-tNLPs المنتجة في التفاعل الخالي من الخلايا ، قمنا بمساعدة MOMP-tNLP مع CpG + FSL-1 وحقننا في العضل (i.m) في الفئران في نظام التعزيز الأولي كما هو موضح أعلاه. تم جمع الأمصال من الفئران المحصنة ، وتم قياس الجسم المضاد IgG الخاص ب MOMP باستخدام مقايسة اللطخة الغربية (الشكل 4). أظهرت الأمصال المأخوذة من الفئران المحقونة ب MOMP-tNLP المساعد ارتباطا قويا ب MOMP ، مما يشير إلى أن MOMP-tNLP يمكن أن يثير استجابة مناعية في الجسم الحي.
الشكل 1: التعبير عن MOMP-tNLP وتنقيته. (أ) صورة لأنابيب تحتوي على قسومات صغيرة من تفاعل خال من الخلايا يعبر بنجاح عن عناصر تحكم GFP في الإضاءة تحت مصدر ضوء الأشعة فوق البنفسجية (يمين) مقارنة بالمحللين بدون بلازميد GFP (يسار). (ب) جل البروتين الملون ب SYPRO Ruby بعد أن يظهر SDS-PAGE ملف تنقية MOMP-tNLP. يهاجر MOMP عند 40 كيلو دالتون ويهاجر 49ApoA1 عند 22 كيلو دالتون. الاختصارات: MOMP = بروتين الغشاء الخارجي الرئيسي الكلاميدي. tNLP = جسيم البروتين الدهني النانوي تيلوديندريمر ؛ MOMP-tNLP = مجمع MOMP-tNLP ؛ GFP = بلازميد ترميز البروتين الفلوري الأخضر ؛ MW = علامة الوزن الجزيئي ؛ T = إجمالي المحللة الخالية من الخلايا ؛ FT = التدفق من خلال ؛ R1-R3 = حصص التفاعل الخالية من الخلايا ؛ W1 ، W6 = يغسل 1 و 6 ؛ E1-E7 = Elutions من 1 إلى 7 ؛ Δ49ApoA1 = مشتق ApoA1 للماوس الموسوم. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل 2: القياس الكمي ل MOMP في عينات MOMP-tNLP . (أ) جل SDS-PAGE ملطخ ب SYPRO Ruby لتحديد كمية MOMP. تم تحميل MOMP المؤتلف بتركيز معروف على الجل للحصول على المنحنى القياسي. يحتوي كل ممر على 0.1 ميكروغرام و 0.5 ميكروغرام و 1.0 ميكروغرام و 2.0 ميكروغرام و 4.0 ميكروغرام من MOMP. تم تحميل عينات MOMP-tNLP التي تم قياسها كميا على نفس الجل. (ب) تم إنشاء منحنى معيار تركيز MOMP باستخدام قياس الكثافة. تم إنشاء معادلة تربط كثافة النطاق الطبيعي ومقدار MOMP. تم استخدام المعادلة لحساب محتوى MOMP في العينات غير المعروفة. الاختصارات: MOMP = بروتين الغشاء الخارجي الرئيسي الكلاميدي. tNLP = جسيم البروتين الدهني النانوي تيلوديندريمر ؛ MOMP-tNLP = مجمع MOMP-tNLP ؛ SDS-PAGE = الصوديوم دوديسيل سلفات بولي أكريلاميد هلام الكهربائي. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل 3: تسمح MOMP-tNLP المنتجة بدون خلايا ل MOMP بتكوين هياكل أعلى مرتبة. (أ) جل SDS-PAGE من MOMP-tNLP مع وبدون معالجة الحرارة وعامل الاختزال DTT ، ملطخ ب SYPRO Ruby. مع الحرارة و DTT ، ظهر MOMP بشكل أساسي كنطاق مونومر عند ~ 40 كيلو دالتون ، حيث كسرت الحرارة وعامل الاختزال غالبية بنية MOMP ذات الترتيب الأعلى. في غياب الحرارة و DTT ، كانت النطاقات ذات الترتيب الأعلى موجودة ، مما يشير إلى تشكل oligomer MOMP. (ب) اللطخة الغربية من MOMP-tNLP و MOMP وحدها ، غير معالجة ومعالجة بالحرارة و DTT. بعد النقل ، تم فحص الغشاء باستخدام MAb40 (تخفيف 1: 1000). لوحظ نمط ربط مشابه للهلام المصبوغ بالياقوت SYPRO ، مما يؤكد أن نطاقات الوزن الجزيئي الأعلى كانت بالفعل أوليغومرات MOMP. (C) بقعة بقعة من MOMP-tNLP وعينات tNLP فارغة (في نسختين) تم فحصها باستخدام MAb40 و MAbHIS. الاختصارات: MOMP = بروتين الغشاء الخارجي الرئيسي الكلاميدي. tNLP = جسيم البروتين الدهني النانوي تيلوديندريمر ؛ MOMP-tNLP = مجمع MOMP-tNLP ؛ SDS-PAGE = الصوديوم دوديسيل سلفات بولي أكريلاميد هلام الكهربائي. DTT = ديثيوثريتول. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل 4: MOMP-tNLP المنتج بدون خلايا مناعي للغاية. أظهر المصل من الفئران المحصنة إشارة قوية مضادة ل MOMP IgG. تم استخدام MOMP-tNLP المساعد مع CpG + FSL-1 لتحصين الفئران. تم جمع الأمصال من ستة فئران محصنة وتجميعها واستخدامها لفحص MOMP-tNLP. كان المصل قادرا على الارتباط ب MOMP في مقايسة النشاف الغربية وأظهر إشارة IgG قوية (يسار). أظهرت اللطخة الغربية التي تستخدم MAb40 كجسم مضاد أساسي (يمين) نطاقات مماثلة ، مما يشير إلى أن المصل يحتوي على IgG خاص ب MOMP. الاختصارات: MOMP = بروتين الغشاء الخارجي الرئيسي الكلاميدي. tNLP = جسيم البروتين الدهني النانوي تيلوديندريمر ؛ MOMP-tNLP = مجمع MOMP-tNLP ؛ CpG = مساعد CpG المعدل للكوليسترول ؛ FSL-1 = مساعد محبة للدهون. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
اسم المخزن المؤقت | NaH2PO4 | كلوريد الصوديوم | إيميدازول | الرقم الهيدروجيني |
عازلة ملزمة | 50 مللي متر | 300 مللي متر | 10 مللي متر | 8.0 |
غسل العازلة | 50 مللي متر | 300 مللي متر | 20 مللي متر | 8.0 |
العازلة للشطف 1 | 50 مللي متر | 300 مللي متر | 250 مللي متر | 8.0 |
العازلة للشطف 2 | 50 مللي متر | 300 مللي متر | 500 مللي متر | 8.0 |
الجدول 1: قائمة المخازن المؤقتة اللازمة لتنقية تقارب النيكل مع تفصيل تركيزات كل مكون ودرجة الحموضة.
وقت التشغيل | 50 دقيقة |
معدل التدفق | 6.0 مل / دقيقة |
نوع التدرج | ثنائي |
المخزن المؤقت أ | 10 مللي متر TEAA في H20 |
المخزن المؤقت ب | مكن |
التدرج | ٪ المخزن المؤقت ب |
0 دقيقة | 25% |
30 دقيقة | 60% |
30.5 دقيقة | 100% |
40 دقيقة | 100% |
40.5 دقيقة | 25% |
50 دقيقة | 25% |
الجدول 2: شروط المرحلة العكسية HPLC تنقية CpG المعدلة للكوليسترول. الاختصارات: TEAA = أسيتات ثلاثي إيثيل الأمونيوم. MeCN = الأسيتونيتريل.
محللة خالية من الخلايا (مل) | DMPC الدهون (ملغ) | تيلوديندريمر (ملغ) | بلازميد MOMP (ميكروغرام) | العائد المنقى MOMP (ملغ) |
1 | 4 | 0.4 | 15 | 0.5 |
2 | 8 | 0.8 | 30 | 1.1 |
3 | 12 | 1.2 | 45 | 1.6 |
5 | 20 | 2 | 75 | 2.7 |
الجدول 3: كمية الليبيدات والتيلوديندريمر والبلازميدات المستخدمة في التفاعلات الخالية من الخلايا ذات القشور المختلفة والعوائد المقابلة. الاختصارات: MOMP = بروتين الغشاء الخارجي الرئيسي الكلاميدي. DMPC = 1،2-ديميريستويل-sn-غليسيرو-3-فوسفوكولين.
نسب مدخلات البلازميد ، MOMP: Δ49ApoA1 | 1:1 | 5:1 | 10:1 | 25:1 | 50:1 | 100:1 | |
نسب كمية البروتين المنتجة ، MOMP: Δ49ApoA1 | 0.02 | 0.32 | 0.64 | 3.46 | 6.55 | 20.04 | |
العدد المقدر لإدخال MOMP لكل tNLP | 0.03 | 0.37 | 0.75 | 4.04 | 7.65 | 23.39 |
الجدول 4: نسب البلازميد في تفاعل خال من الخلايا ومعدلات إدخال MOMP الناتجة. الاختصارات: MOMP = بروتين الغشاء الخارجي الرئيسي الكلاميدي. tNLP = جسيم البروتين الدهني النانوي تيلوديندريمر ؛ Δ49ApoA1 = مشتق ApoA1 للماوس الموسوم.
الكلاميديا هي العدوى المنقولة جنسيا الأكثر شيوعا والتي تؤثر على كل من الرجال والنساء. على الرغم من أن أبحاث اللقاح على الكلاميديا تمتد لعقود ، إلا أن اللقاح الآمن والفعال الذي يمكن توسيع نطاقه إلى الإنتاج الضخم ظل بعيد المنال13. يعتبر الكلاميديا MOMP المرشح الرئيسي كمستضد لقاح وقائي. ومع ذلك ، فإن MOMP شديد الكارهة للماء وعرضة للطي غير الصحيح14,15. كشفت دراسة أخرى أن MOMP موجود في حالات قليلة القسيمات الضرورية لمناعته11. بالتفصيل هنا هو طريقة التعبير المشترك التي تم التحقق من صحتها والخالية من الخلايا والتي تنتج MOMP قليلة القسيمات المتكونة داخل الجسيمات النانوية tNLP كلقاح ، مع غلة تبلغ حوالي 1.5 ملغ من MOMP المنقى لكل 3 مل من المحللات. ويمكن توسيع نطاق هذا الإجراء المقارن بالكامل ليشمل الإنتاج الصناعي، مما يزيد من آفاقه كنهج مفيد لتوليد اللقاحات.
لقد نشرنا سابقا عن استخدام التعبير الخالي من الخلايا لإنتاج بروتينات غشائية مضمنة في البرمجة اللغوية العصبية3،16 ، بالإضافة إلى التعبير في الأقراص المستقرة بالتيلوديندريمر . ومع ذلك ، أنتجت هذه التقنية الأخيرة جزيئات غشاء البروتين مع عدم تجانس أكبر وقابلية ذوبان أقل. 4 بالإضافة إلى ذلك ، فإن الاستمناع لجسيمات MOMP-telodendrimer غير واضح مقارنة بجسيمات MOMP-tNLP6.
يمكن تكييف هذا الإجراء لتوسيع نطاق التعبير عن بروتينات الغشاء البكتيري المرشحة الواعدة كمستضدات للاستخدام في لقاحات الوحدات الفرعية. لا ينتج هذا الإجراء بروتين غشاء بكتيري قابل للذوبان فحسب ، بل إن بنية الجسيمات النانوية الشاملة قابلة لمزيد من التعديل باستخدام مجموعة متنوعة من المواد المساعدة للقاح المحبة للدهون بما في ذلك ، على سبيل المثال لا الحصر ، CpG المترافق مع جزء الكوليسترول أو FSL-1. يعد التعبير عن المستضدات المرشحة الأخرى من البكتيريا أمرا ممكنا ، على الرغم من أن المعلمات مثل درجة حرارة التعبير واختيار الدهون ونوع نظام التعبير قد تحتاج إلى استكشاف لتحقيق الغلة المثلى.
بالإضافة إلى ذلك ، يعد اختيار البلازميد ونسبته أمرا بالغ الأهمية في هذه العملية. يجب بناء كل من البلازميدات المستخدمة من نفس العمود الفقري. إذا كانت الإدخالات بنفس الطول تقريبا ، فيمكن أن تستند النسب إلى كتلة البلازميد المضافة ، كما هو موضح هنا. ومع ذلك ، فإن النسب على أساس الشامات سيعطي نتائج أكثر قابلية للتكرار ، خاصة عند قياس التفاعلات. قد لا تنطبق النسب التي تعمل بشكل جيد في تفاعلات مقياس الشاشة (< 0.5 مل) على التفاعلات الأكبر وقد تتطلب تحسينا إضافيا. لا يزال من الممكن التعبير عن البروتينات غير الغشائية باستخدام مجموعات خالية من الخلايا ولكنها قد لا تتطلب الجسيمات النانوية الدهنية (التعبير المشترك) لإنتاج منتج قابل للذوبان. بالإضافة إلى ذلك ، بينما يصف هذا البروتوكول المساعدة باستخدام CpG و FSL-1 ، فإن هذا النظام قابل للصياغة مع المواد المساعدة الأخرى المحبة للدهون أو الاختلاط مع المواد المساعدة القابلة للذوبان حسب الرغبة.
من الضروري تجنب التلوث عند إعداد تفاعل التعبير الخالي من الخلايا لأن ذلك يمكن أن يؤثر على الغلة. يجب أن تكون أي إضافات للتفاعل ، بما في ذلك البلازميدات نفسها ، نقية للغاية. بالإضافة إلى ذلك ، يجب أن تكون البروتينات المعبر عنها على اتصال فقط بالمواد والمحاليل الخالية من تلوث السموم الداخلية. يمكن أن يؤدي تلوث السموم الداخلية في التركيبات المرشحة إلى نتائج غير متسقة وزائفة للمقايسات المناعية ويمكن أن يكون ضارا بكميات كافية. على الرغم من عدم وصفها هنا ، فقد يكون من الضروري إجراء تنقية إضافية بعد كروماتوغرافيا تقارب النيكل إذا لوحظت العديد من الملوثات في خطوات التحليل اللاحقة مثل من خلال SDS-PAGE. ويمكن تحقيق ذلك مع لجنة الأوراق المالية والبورصات، على الرغم من أن الظروف قد تتطلب التحسين على أساس كل صياغة على حدة.
يعلن المؤلفون أنه ليس لديهم مصالح مالية متنافسة معروفة أو علاقات شخصية يمكن أن يبدو أنها تؤثر على العمل المذكور في هذه الورقة.
تم دعم هذا العمل من خلال منحة خدمة الصحة العامة R21 AI20925 و U19 AI144184 من المعهد الوطني للحساسية والأمراض المعدية. تم تنفيذ هذا العمل تحت رعاية وزارة الطاقة الأمريكية من قبل مختبر لورانس ليفرمور الوطني بموجب العقد DE-AC52-07NA27344 [LLNL-JRNL-822525 ، LLNL-VIDEO-832788].
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1,2-dimyristoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DMPC) as powder | Avanti Polar Lipids | 850345 | |
1.5 mL endotoxin-free centrifuge tubes | Eppendorf | 2600028 | |
1 M Trizma hydrochloride solution | Millipore Sigma | T2194 | |
Acetic acid, glacial, ACS reagent, ≥99.7% | Millipore Sigma | 695092 | |
Bio-Dot apparatus | Bio-Rad | 1706545 | |
Buffer Dam for XCell SureLock | Life Technologies | EI0012 | |
C24 Incubator shaker | New Brunswick Scientific | ||
Cell-Free Expression System: RTS 500 ProteoMaster E. coli HY Kit | BiotechRabbit | BR1400201 | |
cOmplete His-Tag Purification Resin | Roche Molecular Diagnostics | 5893682001 | |
cOmplete, EDTA-free Protease Inhibitor Cocktail | Roche Molecular Diagnostics | 4693132001 | |
CpG-ODN1826 | Biosearch Technologies | T9449 | |
D-(+)-Trehalose dihydrate | Millipore Sigma | 71509 | |
Dialysis tubes D-Tube Dialyzer Maxi | Millipore Sigma | 71508-3 | |
Disposable, polypropylene fritted columns 10 mL capacity | Bio-Rad | 7311550EDU | |
Dulbecco’s Phosphate-buffered Saline (PBS) | Millipore Sigma | D8537 | |
Electrophoresis Power Supply | |||
Endosafe PTS cartridge | Thermo Fisher Scientific | NC9594798 | |
Endosafe-PTS Testing System | Charles River | ||
Gel wash solution: 10% methanol, 7% acetic acid | |||
HCl and NaOH solutions for pH adjustment | |||
HPLC with UV-vis diode array detector | Shimadzu | ||
HyClone HyPure culture-grade water | VWR | 82007-328 | |
iBlot 2 Dry Blotting System | Life Technologies | ||
iBlot 2 Transfer Stacks, PVDF | Life Technologies | IB24001 | |
Image Studio V2.0 software | Li-COR Biiosciences | ||
Imidazole | Millipore Sigma | I5513 | |
Immun-Blot PVDF Membrane | Bio-Rad | 1620177 | |
LI-COR Odyssey Fc imager | Li-COR Biiosciences | ||
Lyophilizer | Labconco | ||
Methanol (≥99.9%) | Millipore Sigma | 34860 | |
Microcentrifuge | |||
Microwave oven | |||
NanoDrop One/OneC Microvolume UV-Vis Spectrophotometer | Thermo Fisher Scientific | ND-ONE-W | |
NuPAGE 4 to 12%, Bis-Tris, 1.0 mm | Life Technologies | NP0321 | |
NuPAGE LDS Sample Buffer (4x) | Life Technologies | NP0007 | |
NuPAGE MES SDS Running Buffer (20x) | Life Technologies | NP000202 | |
NuPAGE Sample Reducing Agent (10x) | Life Technologies | NP0009 | |
Odyssey Blocking Buffer in TBS containing 0.2% Tween 20 | Li-COR Biosciences | 927-50000 | |
Orbital Shaker | |||
PBS-T (1x PBS, 0.2% Tween 20, pH 7.4) | |||
PEG5K-CA8 Telodendrimer (custom synthesis product) | |||
pIVEX2.4d vector | Roche Molecular Diagnostics | ||
Plasmid Maxi Kit | Qiagen | 12162 | |
Primary antibody: MAb40 (monoclonal antibody to the variable domain 1 (VD1) of C. muridarum MOMP, de la Maza laboratory)4 | |||
Primary antibody: MAbHIS, Penta-His antibody | Qiagen | 34660 | |
Probe sonicator | |||
Qubit 3.0 Fluorometer | Life Technologies | Q33216 | |
Qubit Protein Assay Kit | Life Technologies | Q33212 | |
Rainin Pipette tips: LTS 1000 µL | Rainin | 17002428 | |
Rainin Pipette tips: LTS 20 µL | Rainin | 17002429 | |
Rainin Pipette tips: LTS 200 µL | Rainin | 17002426 | |
Rainin Pipettes | Rainin | ||
Secondary antibody: IRDye 800CW goat (polyclonal) anti-mouse IgG (heavy and light) | Li-COR Biosciences | 926-32210 | |
SeeBlue Plus2 Pre-stained Protein Standard | Life Technologies | LC5925 | |
Sodium chloride NaCl | Millipore Sigma | S7653 | |
Sodium phosphate monobasic NaH2PO4 | Millipore Sigma | S0751 | |
Superdex 200, 5/150 GL column | Cytiva | GE28-9909-45 | |
Synthetic diacylated lipoprotein-TLR2/6 FSL-1 | Invivogen | tlrl-fsl | |
SYPRO Ruby Protein Gel Stain | Life Technologies | S12001 | |
TWEEN 20 | Millipore Sigma | P1379 | |
UV light source | |||
Vacufuge Bench Top Centrifuge | Eppendorf | ||
Vortexer | |||
VWR 15 mL conicals (89039-666) | VWR | ||
VWR 50 mL conicals (89039-656) | VWR | ||
XCell SureLock Mini-Cell (Life Technologies ) | Life Technologies | EI0001 |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved