Sequencing Analysis of Non-Squamous Non-Small Cell Lung Cancer Using Integrated Genomic Viewer Software

Please note that all translations are AI generated. Click here for the English version.

73 Views

•

02:11 min

•

September 8th, 2023

DOI :

10.3791/200726-v

September 8th, 2023

•

Christophe Bontoux¹^,²^,³^,⁴^,⁵, Virginie Lespinet-Fabre¹^,²^,³^,⁴, Olivier Bordone¹^,²^,³^,⁴, Virginie Tanga¹^,²^,³^,⁴, Maryline Allegra¹^,²^,³^,⁴, Myriam Salah¹^,²^,³^,⁴, Salomé Lalvée¹^,²^,³^,⁴, Samantha Goffinet¹^,²^,³^,⁴, Jonathan Benzaquen³^,⁴^,⁵^,⁶, Charles-Hugo Marquette³^,⁴^,⁵^,⁶, Marius Ilié¹^,²^,³^,⁴^,⁵, Véronique Hofman¹^,²^,³^,⁴^,⁵, Paul Hofman¹^,²^,³^,⁴^,⁵

¹Laboratory of Clinical and Experimental Pathology, Centre Hospitalier Universitaire de Nice, Université Côte d’Azur, CHU de Nice, ²Hospital-Integrated Biobank (BB-0033-00025), Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, ³Institut Hospitalo-Universitaire (IHU), RespirERA, Université Côte d'Azur, Hôpital Pasteur, CHU de Nice, ⁴FHU OncoAge, Université Côte d'Azur, ⁵Team 4, Institute of Research on Cancer and Aging (IRCAN), CNRS INSERM, Centre Antoine-Lacassagne, Université Côte d'Azur, ⁶Department of Pulmonary Medicine and Thoracic Oncology, Centre Hospitalier Universitaire de Nice, Université Côte d'Azur

Transcript

للبدء ، افتح برنامج عارض الجينوم المتكامل. في قائمة النتائج، انقر فوق نتائج نموذجية. ثم انقر فوق اسم عينة الاهتمام من عمود اسم العينة لعرض نتائج التسلسل.

لمراجعة نتائج المكون الإضافي لتحليل التغطية الجزيئية، انقر على تنزيل الملفات في أعلى يسار الصفحة. بعد ذلك في ملخص التشغيل، انقر فوق علامة التبويب تشغيل التقرير لعرض مقاييس الفحص وتشغيل التقرير. لعرض نتيجة SNV وINDEL، انقر على علامة التبويب التباين، ثم انقر على SNVs وINDELs.

انقر على تحرير الفلاتر وحدد بلا فلتر. بعد ذلك ، انقر فوق علامة التبويب التباين ، ثم الانصهار لعرض نتائج الاندماج في متغيرات إكسون الحمض النووي الريبي. في أعلى يسار الصفحة، انقر على المرئيات ومتغير إكسون الحمض النووي الريبي.

ثم راجع مخطط تباين إكسون الحمض النووي الريبي. انقر على علامة التبويب التباين، ثم حدد عمليات الدمج لعرض اختلال توازن اندماج تجانب إكسون الحمض النووي الريبي. في أعلى يسار الصفحة، انقر على المرئيات، ثم على اختلال توازن دمج بلاط إكسون من الحمض النووي الريبي وراجع مخططات اختلال توازن اندماج بلاط إكسون الحمض النووي الريبي.

في علامة التبويب التباين، انقر فوق CNVs لعرض نتائج CNV. أخيرا ، قم بإنشاء تقرير متغير بالنقر فوق الارتباط لتنزيل ملف PDF. تمثل هذه الدراسة التحليل الجزيئي الذي تم إجراؤه في 259 مريضا يعانون من NS-NSCLC بما في ذلك أنواع الخزعة المختلفة والعينات الجراحية.

كما لوحظت الجينات الطافرة الدافعة واندماج الجينات في تحليل الحمض النووي الريبي. كانت حساسية طريقة الكشف عن عمليات إدخال وحذف تباين النوكليوتيدات المفردة وتباين عدد النسخ والانصهار عالية تتراوح بين 91.67٪ إلى 100٪

Explore More Videos

Sequencing Analysis

Non squamous Non small Cell Lung Cancer

Integrated Genomic Viewer Software

Molecular Coverage Analysis