Bone Mask Generation from 3D Slicer Generated File and Statistical Analysis of Identified Bone Erosion in Rheumatoid Arthritis Patients

للبدء ، قم بتشغيل برنامج 3D Slicer. لإدخال صورة لمواقع تآكل العظام المحددة ، انقر فوق الزر المسمى البيانات في نافذة 3D Slicer. ثم اضغط على اختر الملفات لإضافة صور فردية وتحديد موقعها لإضافة الملفات.

لاستيراد دليل كامل من الصور مرة واحدة ، اضغط على خيار اختيار دليل لإضافته ، ثم ابحث عن الدليل المفضل وأدرجه. بعد ذلك ، انقر فوق القائمة المنسدلة لشريط أدوات 3D Slicer. مرر المؤشر فوق وحدات تحليل العظام وانقر على قناع تلقائي.

ضمن علامة التبويب الخطوة 2 قناع تلقائي، اختر وحدة تخزين إدخال من القائمة المنسدلة لحجم الإدخال. حدد إنشاء حجم خريطة تسمية جديد في القائمة المنسدلة تجزئة الإخراج. إذا كان يفضل تسمية إخراج أخرى ، فانقر فوق إنشاء مجلد خريطة تسمية جديد باسم وقدم التسمية المطلوبة.

أدخل عدد العظام المراد إخفاؤها في مربع النص المحدد ، ثم حدد ORMR أو Dual Threshold من القائمة المنسدلة للخوارزمية. انقر فوق Get Mask لتشغيل الخوارزمية وإخراج نتيجة في دليل الصور المقابل. إذا كانت الصورة تحتوي على عظام متعددة ، حفظ قناع منفصل لكل عظمة.

لاستيراد قناع ثنائي إلى 3D Slicer ، انسخ ملفات القناع إلى دليل أقنعة التحميل الموجود في مجلد BAM. ارجع إلى نافذة 3D Slicer وانقر فوق علامة التبويب الخطوة 3 التصحيح اليدوي. لتحميل ملفات القناع وتحويلها تلقائيا إلى تقسيمات مقسم طريقة العرض ، انقر فوق تحميل.

لإجراء تغييرات على القناع، استخدم الأدوات المتوفرة في علامة تبويب التصحيح اليدوي. لبدء التحليل الإحصائي ، انقر فوق وحدة حجم التآكل من القائمة المنسدلة على شريط الأدوات. قم بتحميل صورة والقناع المقابل لها.

حدد صورة الإدخال والقناع ، وقم بإنشاء تجزئة مخرجات ، وضع نقاط البذور على التآكل. انقر فوق الزر "الحصول على تآكل" لبدء خوارزمية قياس التآكل. إذا كان حجم وشكل أحجام التآكل المكتشفة تلقائيا غير مرضيين ، فقم بتحريرها يدويا ضمن علامة التبويب الخطوة 5 تصحيح يدوي.

انقر الآن على علامة التبويب المسماة Step 6 Statistics لتصدير بيانات الكمبيوتر إلى ملف جدول بيانات. بعد ذلك ، أدخل حجم التآكل في القائمة المنسدلة المسماة تآكل المدخلات. الآن قم بتوفير صورة المقياس الرمادي وعرض voxel بالمليمترات في مربع النص ضمن قائمة مستوى الصوت الرئيسي.

انقر فوق الحصول على إحصائيات لإنشاء ملف جدول بيانات في دليل بيانات مخرجات التآكل الموجود في مجلد BAM.