للبدء ، قم بتوصيل جهاز تصوير فغر محمول بجهاز كمبيوتر مزود ببرنامج الحصول على الصور. استخدم قطعة من الورق لإزالة قطرات الماء بعناية من الأوراق الملقحة بحقنة Pseudomonas لنبات Arabidopsis thaliana. افتح الآن الغطاء العلوي للجهاز ، ضع الورقة على المسرح ، وأغلق الغطاء.
اضبط التركيز باستخدام برغي الضبط وانقر فوق حفظ الصورة على الكمبيوتر لالتقاط الصورة. لإجراء قياس تلقائي لفتحة الثغور ، افتح دفتر ملاحظات Google Colab. انقر فوق ملف متبوعا بحفظ نسخة في محرك الأقراص لعمل نسخة محلية في Google Drive.
عند فتح علامة تبويب جديدة، أغلق علامة تبويب دفتر الملاحظات الأصلي. اضغط على الزر تنفيذ ضمن قسم الإعداد البيئي في دفتر الملاحظات لاستيراد المكتبات المطلوبة دون فتح كتل الخلايا. في قسم إعدادات الدليل ، أنشئ ثلاثة مجلدات في Google Drive للتحليل.
انقل الصور التي تم الحصول عليها إلى مجلد example_result ، وقم بتصنيفها حسب المعالجة أو العينة لإنشاء الرسم البياني النهائي. انقر فوق تنزيل النماذج المدربة لتنزيل ملفات ONNX للنماذج المدربة من Zenodo. ضع الملفات التي تم تنزيلها في دليل النموذج.
قم بتشغيل الاستدلال وقياس جزء فتحة الثغور من دفتر الملاحظات لتحديد فتحة الثغور من الصور الفردية. الصور الناتجة مع الاستدلال المتراكب و example_result. سيتم تصدير ملف CSV إلى دليل inference_results.
قم بتنفيذ قسم إنشاء الرسم البياني لإنشاء رسم بياني حول نسبة فتحة الثغور. تصدير هذا الرسم البياني إلى دليل inference_results. لوحظ انخفاض في فتحة الثغور في النباتات الملقحة ب Pto مقارنة بالنباتات الملقحة بالوهمية في ساعة واحدة بعد التلقيح.
في ثلاث ساعات بعد الإصابة ، كانت فتحة الثغور في كل من النباتات الملقحة ب Pto والنباتات الملقحة الوهمية هي نفسها تقريبا. استغرق القياس الآلي لفتحة الثغور حوالي خمس ثوان لمعالجة صورة واحدة ، مما أدى إلى تقليل وقت القياس بنسبة 95٪.
