Engineering Adherent Bacteria by Creating a Single Synthetic Curli Operon

The  method described here consists in redesigning E. coli adherence properties by assembling the minimum number of  curli genes under the control of a ...

Université de Lyon

&#x6240;&#x6709;&#x590D;&#x5236;&#x4E3B;&#x7BA1;&#x9006;&#x8F6C;&#x5F55;&#x75C5;&#x6BD2;&#x90FD;&#x5305;&#x542B;&#x4E09;&#x4E2A;&#x4E3B;&#x8981;&#x9605;&#x8BFB;&#x6846;&#x67B6;&#x3001; gag&#x3001; pol &#x548C; env&#xFF0C;&#x5B83;&#x4EEC;&#x5206;&#x522B;&#x7528;&#x4E8E;&#x7ED3;&#x6784;&#x86CB;&#x767D;&#x3001; &#x9176;&#x548C;&#x819C;&#x86CB;&#x767D;&#x7684;&#x5408;&#x6210;&#x3002;&#x590D;&#x6742;&#x7684;&#x9006;&#x8F6C;&#x5F55;&#x75C5;&#x6BD2;&#xFF0C;&#x5982;&#x6162;&#xFF0C;&#x8FD8;&#x4EE3;&#x7801;&#x7684;&#x89C4;&#x7BA1;&#x548C;&#x914D;&#x4EF6;&#x86CB;&#x767D;&#x5728;&#x75C5;&#x6BD2;&#x590D;&#x5236;&#x4E2D;&#x5177;&#x6709;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x534F;&#x540C;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x53EF;&#x786E;&#x4FDD;&#x9AD8;&#x6548;&#x7684;&#x591A;&#x80BD;&#x751F;&#x4EA7;&#x6240;&#x9700;&#x7684;&#x7A0B;&#x5E8F;&#x96C6;&#x548C;&#x91CA;&#x653E;&#x7684;&#x65B0;&#x4F20;&#x67D3;&#x75C5;&#x7684;&#x540E;&#x4EE3; virions&#x3002;&#x53CD;&#x8F6C;&#x5F55;&#x75C5;&#x6BD2;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x5408;&#x6210;&#x53D1;&#x751F;&#x5728;&#x7EC6;&#x80DE;&#x8D28;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x5E76;&#x5B8C;&#x5168;&#x53D6;&#x51B3;&#x4E8E;&#x611F;&#x67D3;&#x7684;&#x5BBF;&#x4E3B;&#x7EC6;&#x80DE;&#x8F6C;&#x5316;&#x673A;&#x5236;&#x3002;&#x56E0;&#x6B64;&#xFF0C;&#x6BEB;&#x4E0D;&#x5947;&#x602A;&#xFF0C;&#x9006;&#x8F6C;&#x5F55;&#x75C5;&#x6BD2;&#x5F00;&#x53D1; RNA &#x7ED3;&#x6784;&#x548C;&#x6218;&#x7565;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x4FC3;&#x8FDB;&#x7A33;&#x5065;&#x9AD8;&#x6548;&#x86CB;&#x767D;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x75C5;&#x6BD2;&#x6027;&#x8702;&#x7A9D;&#x7684;&#x7ADE;&#x4E89;&#x73AF;&#x5883;&#x3002;

&#x5E73;&#x79FB;&#x63A7;&#x5236;&#x7684;&#x9006;&#x8F6C;&#x5F55;&#x75C5;&#x6BD2;&#x3002;

All replication-competent retroviruses contain three main reading frames, gag, pol and env, which are used for the synthesis of structural proteins, enzymes and envelope proteins respectively. Complex retroviruses, such as lentiviruses, also code for regulatory and accessory proteins that have essential roles in viral replication. The concerted expression of these genes ensures the efficient polypeptide production required for the assembly and release of new infectious progeny virions. Retroviral protein synthesis takes place in the cytoplasm and depends exclusively on the translational machinery of the host infected cell. Therefore, not surprisingly, retroviruses have developed RNA structures and strategies to promote robust and efficient expression of viral proteins in a competitive cellular environment.

Translational control of retroviruses.

Tous les r&eacute;trovirus aptes &agrave; la r&eacute;plication contient trois cadres de lecture principale, gag, pol et env, qui sont respectivement utilis&eacute;s pour la synth&egrave;se des prot&eacute;ines structurales, des enzymes et des prot&eacute;ines de l&#39;enveloppe. R&eacute;trovirus complexes, tels que les lentivirus, &eacute;galement coder pour des prot&eacute;ines r&eacute;gulatrices et accessoires qui ont un r&ocirc;le essentiel dans la r&eacute;plication virale. L&#39;expression concert&eacute;e de ces g&egrave;nes assure la production de polypeptide efficace n&eacute;cessaire pour le montage et la sortie de nouveaux virions infectieux de la prog&eacute;niture. La synth&egrave;se des prot&eacute;ines r&eacute;trovirale a lieu dans le cytoplasme et d&eacute;pend exclusivement de la machinerie translationnelle de la cellule h&ocirc;te infect&eacute;e. Par cons&eacute;quent, il n&#39;est pas surprenant, r&eacute;trovirus ont d&eacute;velopp&eacute; structures d&#39;ARN et de strat&eacute;gies visant &agrave; promouvoir l&#39;expression robuste et efficace des prot&eacute;ines virales dans un environnement concurrentiel cellulaire.

Contr&ocirc;le de la traduction des r&eacute;trovirus.

Alle Replikations-zust&auml;ndige Retroviren enthalten drei wichtigsten Lesung Frames, Gag, Pol und Env, die f&uuml;r die Synthese von Strukturproteinen, Enzymen und Proteinen Umschlag bzw. verwendet werden. Komplexe Retroviren, wie Lentiviruses, code auch f&uuml;r Regelungs- und Zubeh&ouml;r-Proteine, die wesentliche Rollen in Virusreplikation haben. Der aufeinander abgestimmten Ausdruck dieser Gene gew&auml;hrleistet die effiziente Polypeptid-Produktion f&uuml;r die Versammlung und Freigabe von neuen infekti&ouml;ser Nachkommen Virionen erforderlich. Retroviren Proteinsynthese findet im Zytoplasma und richtet sich ausschlie&szlig;lich auf die translatorischen Maschinerie der Wirtszelle infiziert. Daher nicht &uuml;berraschend, dass entwickelten Retroviren RNA-Strukturen und Strategien zur F&ouml;rderung der robuste und effiziente Ausdruck der viralen Proteine in einem Wettbewerbsumfeld zellul&auml;re.

Translational Steuerung der Retroviren.

Tutti i retrovirus replica-competenti contengono tre fotogrammi lettura principale, gag, pol ed env, che vengono utilizzati rispettivamente per la sintesi di proteine strutturali, gli enzimi e proteine di busta. Retrovirus complesse, come ad esempio lentiviruses, anche codice per regolamentare e accessorie proteine che hanno ruoli essenziali nella replicazione virale. L&#39;espressione di questi geni concordata assicura la produzione efficiente polipeptide necessaria per il montaggio e il rilascio di nuovi virions della progenie infettiva. Sintesi delle proteine retrovirali avviene nel citoplasma e dipende esclusivamente il macchinario translational della cellula ospite infettato. Pertanto, non sorprendentemente, retrovirus hanno sviluppato RNA strutture e strategie per promuovere il robusto ed efficace espressione di proteine virali in un ambiente concorrenziale cellulare.

Controllo traslazionale dei retrovirus.

&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x30EC;&#x30D7;&#x30EA;&#x30B1;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x4E3B;&#x52D9;&#x30EC;&#x30C8;&#x30ED; &#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306B;&#x306F;&#x3001;3 &#x3064;&#x306E;&#x4E3B;&#x306A;&#x8AAD;&#x307F;&#x3082;&#x306E;&#x30D5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30E0; &#x30AE;&#x30E3;&#x30B0;&#x3001;pol&#x3001;env &#x69CB;&#x9020;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3001;&#x9175;&#x7D20;&#x3001;&#x30A8;&#x30F3;&#x30D9;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D7;&#x86CB;&#x767D;&#x306E;&#x5408;&#x6210;&#x304C;&#x305D;&#x308C;&#x305E;&#x308C;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x304C;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C8;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D7;&#x30EC;&#x306A;&#x3069;&#x306E;&#x8907;&#x96D1;&#x306A;&#x30EC;&#x30C8;&#x30ED; &#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306F;&#x3001;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x8907;&#x88FD;&#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x5F79;&#x5272;&#x304C;&#x3042;&#x308B;&#x898F;&#x5236;&#x3084;&#x30A2;&#x30AF;&#x30BB;&#x30B5;&#x30EA;&#x30FC;&#x306E;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x307E;&#x305F;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x5354;&#x8ABF;&#x5F0F;&#x30A2;&#x30BB;&#x30F3;&#x30D6;&#x30EA;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x611F;&#x67D3;&#x5B50;&#x5B6B;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x7C92;&#x5B50;&#x306E;&#x30EA;&#x30EA;&#x30FC;&#x30B9;&#x306B;&#x5FC5;&#x8981;&#x306A;&#x52B9;&#x7387;&#x7684;&#x306A;&#x30DD;&#x30EA;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x751F;&#x7523;&#x3092;&#x4FDD;&#x8A3C;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30EC;&#x30C8;&#x30ED; &#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x86CB;&#x767D;&#x5408;&#x6210;&#x306F;&#x7D30;&#x80DE;&#x8CEA;&#x3067;&#x8D77;&#x3053;&#x308B;&#x3001;&#x611F;&#x67D3;&#x5BBF;&#x4E3B;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x4E26;&#x9032;&#x306E;&#x6A5F;&#x68B0;&#x306B;&#x5C02;&#x3089;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x7570;&#x306A;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x3001;&#x5F53;&#x7136;&#x306E;&#x3053;&#x3068;&#x306A;&#x304C;&#x3089;&#x3001;&#x30EC;&#x30C8;&#x30ED; &#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306F; RNA &#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x3068;&#x7AF6;&#x4E89;&#x529B;&#x306E;&#x3042;&#x308B;&#x643A;&#x5E2F;&#x96FB;&#x8A71;&#x74B0;&#x5883;&#x3067;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x5805;&#x7262;&#x3067;&#x52B9;&#x7387;&#x7684;&#x306A;&#x8868;&#x73FE;&#x3092;&#x4FC3;&#x9032;&#x3059;&#x308B;&#x6226;&#x7565;&#x958B;&#x767A;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

&#x30EC;&#x30C8;&#x30ED; &#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x4E26;&#x9032;&#x904B;&#x52D5;&#x306E;&#x5236;&#x5FA1;&#x3002;

&#xBAA8;&#xB4E0; &#xBCF5;&#xC81C; &#xC720;&#xB2A5;&#xD55C; retroviruses &#xD3EC;&#xD568; 3 &#xC8FC; &#xB3C5;&#xC11C;, &#xAC1C; &#xADF8;, pol &#xD504;&#xB808;&#xC784;&#xACFC; &#xD658;&#xACBD;&#xC744;, &#xAC01;&#xAC01; &#xAD6C;&#xC870; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;, &#xD6A8;&#xC18C; &#xBC0F; &#xBD09;&#xD22C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xD569;&#xC131;&#xC5D0; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xB418;&#xB294;. Lentiviruses, &#xAC19;&#xC740; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C; retroviruses &#xB610;&#xD55C; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xBCF5;&#xC81C;&#xC5D0; &#xD544;&#xC218;&#xC801;&#xC778; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xADDC;&#xC815; &#xD558; &#xACE0; &#xC561;&#xC138;&#xC11C;&#xB9AC; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xCF54;&#xB4DC;. &#xC774; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xACF5;&#xB3D9;&#xB41C; &#xC2DD; &#xC5B4;&#xC148;&#xBE14;&#xB9AC; &#xBC0F; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xC804;&#xC5FC; &#xC131; &#xC790;&#xC190; virions&#xC758; &#xCD9C;&#xC2DC;&#xC5D0; &#xD544;&#xC694;&#xD55C; &#xD6A8;&#xC728;&#xC801;&#xC778; polypeptide &#xC0DD;&#xC0B0;&#xC744; &#xBCF4;&#xC7A5; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. Retroviral &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xD569;&#xC131;&#xACFC; &#xC138;&#xD3EC;&#xC9C8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC77C;&#xC5B4;&#xB09C; &#xAC10;&#xC5FC; &#xD638;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xC140;&#xC758; &#xBCC0;&#xD658; &#xAE30;&#xACC4;&#xC5D0; &#xB530;&#xB77C; &#xB2EC;&#xB77C; &#xC9D1;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C;, &#xB2F9;&#xC5F0;&#xD55C; &#xC77C;&#xB85C;, retroviruses &#xAC1C;&#xBC1C;&#xD55C; RNA &#xAD6C;&#xC870;&#xC640; &#xACBD;&#xC7C1;&#xB825; &#xC788;&#xB294; &#xC140;&#xB8F0;&#xB7EC; &#xD658;&#xACBD;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xC131; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xAC15;&#xB825; &#xD558; &#xACE0; &#xD6A8;&#xC728;&#xC801;&#xC778; &#xC2DD; &#xD64D;&#xBCF4; &#xC804;&#xB7B5;.

Retroviruses &#xBCC0;&#xD658; &#xC81C;&#xC5B4;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Retrovirus r&eacute;plica-competentes todos contienen tres marcos de lectura principal, gag, pol y env, que se utilizan para la s&iacute;ntesis de prote&iacute;nas estructurales, enzimas y prote&iacute;nas de la envoltura respectivamente. Retrovirus complejos, como los lentivirus, tambi&eacute;n codifican prote&iacute;nas reguladoras y accesorias que tienen un papel esencial en la replicaci&oacute;n viral. La expresi&oacute;n concertada de estos genes garantiza la producci&oacute;n de polip&eacute;ptido eficiente necesaria para el montaje y la liberaci&oacute;n de nuevos viriones progenie infecciosa. S&iacute;ntesis de la prote&iacute;na retroviral lleva a cabo en el citoplasma y depende exclusivamente de la maquinaria traduccional de la c&eacute;lula hu&eacute;sped infectado. Por lo tanto, no es de extra&ntilde;ar que retrovirus han desarrollado estructuras de ARN y estrategias para promover la expresi&oacute;n robusta y eficiente de prote&iacute;nas virales en un entorno competitivo de celular.

Control traduccional de los retrovirus.

&#x5185;&#x90E8;&#x6838;&#x7CD6;&#x4F53;&#x8FDB;&#x5165;&#x7F51;&#x7AD9; (IRESs) &#x5728;&#x51E0;&#x4E4E;&#x6240;&#x6709;&#x7684;&#x6162;&#x75C5;&#x6BD2;&#x7684;&#x8868;&#x5F81;&#x4FC3;&#x4F7F;&#x6211;&#x4EEC;&#x8C03;&#x67E5;&#x732B;&#x514D;&#x75AB;&#x7F3A;&#x9677;&#x75C5;&#x6BD2; &#xFF08;&#x5B89;&#xFF09; &#x7528;&#x4E8E;&#x751F;&#x4EA7;&#x75C5;&#x6BD2;&#x86CB;&#x767D;&#x7684;&#x673A;&#x5236;&#x3002;&#x5404;&#x79CD;&#x4F53;&#x5916;&#x7FFB;&#x8BD1;&#x68C0;&#x6D4B;&#x4E0E;&#x5355;&#x548C;&#x53CC;&#x987A;&#x53CD;&#x5B50;&#x6784;&#x9020;&#x63ED;&#x793A;&#x4E86;&#x7FFB;&#x8BD1;&#x5B89;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4; RNA &#x53D1;&#x751F;&#x7531;&#x7AE0;&#x4F9D;&#x8D56;&#x7684;&#x673A;&#x5236;&#x548C;&#x7531;&#x5F31;&#x7684;&#x6838;&#x86CB;&#x767D;&#x4F53;&#x7684;&#x5185;&#x90E8;&#x5165;&#x53E3;&#x3002;&#x8FD9;&#x79CD;&#x5F31; IRES &#x6D3B;&#x52A8;&#x8BC1;&#x5B9E;&#x5728;&#x732B;&#x7EC6;&#x80DE;&#x8868;&#x8FBE;&#x987A; RNAs &#x542B;&#x5B89; 5&#39; &#x975E;&#x7FFB;&#x8BD1;&#x7684;&#x533A; &#xFF08;&#x7F16;&#x7801;&#xFF09;&#x3002;&#x5947;&#x602A;&#x7684;&#x662F;&#xFF0C;&#x611F;&#x67D3;&#x732B;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4E0E;&#x5B89;&#xFF0C;&#x4F46;&#x4E0D;&#x662F;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x514D;&#x75AB;&#x7F3A;&#x9677;&#x75C5;&#x6BD2;&#x7C7B;&#x578B; 1&#xFF0C;&#x5B89;&#x7FFB;&#x8BD1;&#x4E2D;&#x589E;&#x52A0;&#x4E86;&#x5F88;&#x5927;&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;&#x6311;&#x8D77;&#x7684;&#x70ED;&#x5E94;&#x6FC0;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x751F;&#x7406;&#x6761;&#x4EF6;&#x7684;&#x53D8;&#x5316;&#x5BFC;&#x81F4;&#x7279;&#x5B9A;&#x523A;&#x6FC0;&#xFF0C;&#x8868;&#x8FBE;&#x5F0F;&#x7531;&#x5B89; 5&#39; UTR&#xFF0C;&#x867D;&#x7136;&#x7AE0;&#x4F9D;&#x8D56;&#x5F00;&#x59CB;&#x906D;&#x5230;&#x4E25;&#x5389;&#x9547;&#x538B;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7ED3;&#x679C;&#x63ED;&#x793A;&#x7684;&quot;&#x4F11;&#x7720;&quot;IRES &#x6210;&#x4E3A;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x7684;&#x75C5;&#x6BD2;&#x611F;&#x67D3;&#x4E0E;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5E94;&#x6FC0;&#x7684;&#x5B58;&#x5728;&#x3002;

&#x4F11;&#x7720;&#x5185;&#x90E8;&#x6838;&#x7CD6;&#x4F53;&#x8FDB;&#x5165;&#x4F4D;&#x70B9;&#x63A7;&#x5236;&#x732B;&#x514D;&#x75AB;&#x7F3A;&#x9677;&#x75C5;&#x6BD2;&#x7684;&#x7FFB;&#x8BD1;&#x3002;

The characterization of internal ribosome entry sites (IRESs) in virtually all lentiviruses prompted us to investigate the mechanism used by the feline immunodeficiency virus (FIV) to produce viral proteins. Various in vitro translation assays with mono- and bicistronic constructs revealed that translation of the FIV genomic RNA occurred both by a cap-dependent mechanism and by weak internal entry of the ribosomes. This weak IRES activity was confirmed in feline cells expressing bicistronic RNAs containing the FIV 5' untranslated region (UTR). Surprisingly, infection of feline cells with FIV, but not human immunodeficiency virus type 1, resulted in a great increase in FIV translation. Moreover, a change in the cellular physiological condition provoked by heat stress resulted in the specific stimulation of expression driven by the FIV 5' UTR while cap-dependent initiation was severely repressed. These results reveal the presence of a "dormant" IRES that becomes activated by viral infection and cellular stress.

A dormant internal ribosome entry site controls translation of feline immunodeficiency virus.

La caract&eacute;risation des sites d&#39;entr&eacute;e des ribosomes interne (IRESs) dans pratiquement tous les lentivirus nous a incit&eacute; &agrave; &eacute;tudier le m&eacute;canisme utilis&eacute; par le virus de l&#39;immunod&eacute;ficience f&eacute;line (FIV) pour produire des prot&eacute;ines virales. Traduction in vitro divers dosages avec mono - et des constructions bicistronique a r&eacute;v&eacute;l&eacute; que la traduction de l&#39;ARN g&eacute;nomique de la FIV s&#39;est produite par un m&eacute;canisme d&eacute;pendant du cap et faible entr&eacute;e interne des ribosomes. Cette faible activit&eacute; IRES fut confirm&eacute;e en f&eacute;lins cellules exprimant RNAs bicistronique contenant la FIV r&eacute;gion 5&#39; non traduite (UTR). &Eacute;tonnamment, infection des cellules f&eacute;lines avec la FIV, mais pas les virus de l&#39;immunod&eacute;ficience humaine de type 1, a donn&eacute; lieu &agrave; une grande augmentation dans la traduction de la FIV. Par ailleurs, une modification de la condition physiologique cellulaire provoqu&eacute;e par le stress de chaleur a entra&icirc;n&eacute; la stimulation sp&eacute;cifique d&#39;expression entra&icirc;n&eacute;e par la FIV 5&#39; UTR, tandis que l&#39;initiation PAC-d&eacute;pendante a &eacute;t&eacute; s&eacute;v&egrave;rement r&eacute;prim&eacute;e. Ces r&eacute;sultats r&eacute;v&egrave;lent la pr&eacute;sence d&#39;un IRES &laquo; dormant &raquo; qui est activ&eacute;e par une infection virale et cellulaire au stress.

Un site d&#39;entr&eacute;e de dormance ribosome interne contr&ocirc;le traduction du virus de l&#39;immunod&eacute;ficience f&eacute;line.

Die Charakterisierung der internen Ribosom Eintrag Websites (IRESs) in praktisch allen Lentiviruses aufgefordert wir untersuchen den Mechanismus verwendet durch das feline Immundefizienz-Virus (FIV), um virale Proteine zu produzieren. Verschiedene in-vitro-&Uuml;bersetzung-Proben mit Mono - und Bicistronic-Konstrukte ergab, dass &Uuml;bersetzung der FIV genomische RNA sowohl von GAP-abh&auml;ngige Mechanismus schwache interne Eintrag von den Ribosomen aufgetreten ist. Diese schwache IRES-Aktivit&auml;t best&auml;tigte Katzenartige Zellen Bicistronic RNAs, enth&auml;lt den FIV 5&#39; Untranslatierter Bereich (UTR) zum Ausdruck zu bringen. &Uuml;berraschend, Infektion der katzenartigen Zellen mit FIV, aber nicht humanen Immundefizienz-Virustyp 1, f&uuml;hrte zu eine gro&szlig;e Zunahme der FIV-&Uuml;bersetzung. Dar&uuml;ber hinaus f&uuml;hrte eine &Auml;nderung in der zellul&auml;ren physiologischen W&auml;rmebelastung verursachten die spezifische Stimulation des Ausdrucks durch die FIV 5&#39; UTR angetrieben, w&auml;hrend GAP-abh&auml;ngige Einleitung stark unterdr&uuml;ckt wurde. Diese Ergebnisse zeigen das Vorhandensein von einem &quot;ruhenden&quot; IRES, das durch virale Infektion und zellul&auml;ren Stress aktiviert wird.

Eine ruhende interne Ribosom Eintrag Website steuert die &Uuml;bersetzung von feline Immunodeficiency Virus.

La caratterizzazione dei siti di internal ribosome entry (IRESs) in praticamente tutti i lentiviruses ci ha spinti a indagare il meccanismo utilizzato dal virus dell&#39;immunodeficienza felina (FIV) per produrre proteine virali. Traduzione in vitro vari dosaggi con mono - e bicistronic costrutti ha rivelato che traduzione del RNA genomico FIV si &egrave; verificato da un meccanismo dipendente dal tappo e dalla debole voce interna dei ribosomi. Questa debole attivit&agrave; IRES &egrave; stata confermata in feline cellule che esprimono bicistronic RNAs contenente la FIV 5&#39; untranslated region (UTR). Sorprendentemente, infezione delle cellule feline con FIV, ma non virus dell&#39;immunodeficienza umana di tipo 1, ha provocato un grande aumento nella traduzione di FIV. Inoltre, un cambiamento nella condizione fisiologica cellulare provocata da stress da calore provocato lo stimolo specifico di espressione guidato da FIV 5&#39; UTR, mentre cap-dependent iniziazione fu severamente repressi. Questi risultati rivelano la presenza di un &quot;dormiente&quot; IRES che diventa attivata da infezione virale e stress cellulare.

Una dormiente internal ribosome entry site controlla la traduzione del virus dell&#39;immunodeficienza felina.

&#x5185;&#x90E8;&#x30EA;&#x30DC;&#x30BD;&#x30FC;&#x30E0;&#x306E;&#x30A8;&#x30F3;&#x30C8;&#x30EA;&#x306E;&#x30B5;&#x30A4;&#x30C8; (IRESs) &#x5B9F;&#x8CEA;&#x7684;&#x306B;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C8;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D7;&#x30EC;&#x3067;&#x306E;&#x30AD;&#x30E3;&#x30E9;&#x30AF;&#x30BF;&#x30EA;&#x30BC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x79C1;&#x305F;&#x3061;&#x306F;&#x732B;&#x514D;&#x75AB;&#x4E0D;&#x5168;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9; (FIV) &#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x3092;&#x751F;&#x6210;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x3092;&#x8ABF;&#x67FB;&#x3059;&#x308B;&#x3088;&#x3046;&#x6C42;&#x3081;&#x3002;&#x69D8;&#x3005; &#x306A; in vitro &#x7FFB;&#x8A33;&#x30E2;&#x30CE;-&#x8A66;&#x91D1;&#x3057;&#x3001;bicistronic &#x30B3;&#x30F3;&#x30B9;&#x30C8;&#x30E9;&#x30AF;&#x30C8; FIV &#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0; RNA &#x306E;&#x7FFB;&#x8A33;&#x304C;&#x30AD;&#x30E3;&#x30C3;&#x30D7;&#x306B;&#x4F9D;&#x5B58;&#x3059;&#x308B;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x3068;&#x3001;&#x30EA;&#x30DC;&#x30BE;&#x30FC;&#x30E0;&#x306E;&#x5F31;&#x3044;&#x5185;&#x90E8;&#x30A8;&#x30F3;&#x30C8;&#x30EA;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x304C;&#x767A;&#x751F;&#x3057;&#x305F;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x5F31;&#x3044; IRES &#x6D3B;&#x6027; FIV 5&#39; &#x975E;&#x7FFB;&#x8A33;&#x9818;&#x57DF; (UTR) &#x3092;&#x542B;&#x3080; bicistronic Rna &#x767A;&#x73FE;&#x30CD;&#x30B3;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x3067;&#x78BA;&#x8A8D;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x9A5A;&#x3044;&#x305F;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3001;&#x611F;&#x67D3;&#x30CD;&#x30B3;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE; FIV &#x304C;&#x306A;&#x3044;&#x3072;&#x3068;&#x514D;&#x75AB;&#x4E0D;&#x5168;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9; &#x30BF;&#x30A4;&#x30D7; 1, FIV &#x7FFB;&#x8A33;&#x5927;&#x5E45;&#x306A;&#x5897;&#x52A0;&#x3067;&#x8D77;&#x56E0;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x307E;&#x305F;&#x3001;&#x71B1;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30B9;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x8A98;&#x767A;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x751F;&#x7406;&#x72B6;&#x614B;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x306F;&#x30AD;&#x30E3;&#x30C3;&#x30D7;&#x4F9D;&#x5B58;&#x578B;&#x958B;&#x59CB;&#x6DF1;&#x523B;&#x306A;&#x6291;&#x5727;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x4E00;&#x65B9;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066; FIV 5&#39; UTR &#x99C6;&#x52D5;&#x5F0F;&#x306E;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;&#x523A;&#x6FC0;&#x306B;&#x8D77;&#x56E0;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x306F;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x611F;&#x67D3;&#x3068;&#x7D30;&#x80DE;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30B9;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x3068;&#x306A;&#x308B;&#x300C;&#x4F11;&#x7720;&#x300D;IRES &#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x4F11;&#x7720;&#x5185;&#x90E8;&#x30EA;&#x30DC;&#x30BD;&#x30FC;&#x30E0;&#x306E;&#x30A8;&#x30F3;&#x30C8;&#x30EA; &#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x7FFB;&#x8A33;&#x732B;&#x514D;&#x75AB;&#x4E0D;&#x5168;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x5236;&#x5FA1;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#xAC70;&#xC758; &#xBAA8;&#xB4E0; lentiviruses&#xC5D0; &#xB0B4;&#xBD80; &#xB9AC;&#xBCF4;&#xC19C; &#xD56D;&#xBAA9; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8; (IRESs)&#xC758; &#xD2B9;&#xC131;&#xD654; &#xACE0;&#xC591;&#xC774; &#xBA74;&#xC5ED; &#xBD80;&#xC804; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; (FIV) &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xC131; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC744; &#xC0DD;&#xC0B0; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558;&#xB294; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC744; &#xC870;&#xC0AC; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB97C; &#xBB3B;&#xB294; &#xBA54;&#xC2DC;&#xC9C0;&#xAC00;. &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xC0DD;&#xCCB4; &#xC678; &#xBC88;&#xC5ED; &#xB41C; &#xBAA8;&#xB178;-&#xBD84;&#xC11D; &#xC2E4;&#xD5D8; &#xBC0F; bicistronic &#xAD6C;&#xBB38;&#xC744; &#xBC1D;&#xD600; FIV &#xAC8C;&#xB188; RNA&#xC758; &#xBC88;&#xC5ED; &#xBAA8;&#xC790; &#xC885;&#xC18D; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xACE0;&#xB294; &#xB9AC;&#xBCF4;&#xC19C;&#xC758; &#xC57D;&#xD55C; &#xB0B4;&#xBD80; &#xD56D;&#xBAA9;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xBC1C;&#xC0DD;. &#xC774; &#xC57D;&#xD55C; IRES &#xD65C;&#xB3D9; &#xACE0;&#xC591;&#xC774; &#xC140; bicistronic RNAs FIV 5&#39; &#xB9DE;&#xC774; &#xC9C0;&#xC5ED; (UTR)&#xC774; &#xD3EC;&#xD568; &#xB41C; &#xD45C;&#xD604;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD655;&#xC778; &#xB410;&#xB2E4;. &#xB180;&#xB78D;&#xAC8C;&#xB3C4;, FIV, &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xD558;&#xC9C0; &#xC778;&#xAC04; &#xBA74;&#xC5ED; &#xACB0;&#xD54D; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xD0C0;&#xC785; 1, FIV &#xBC88;&#xC5ED;&#xC758; &#xD070; &#xC99D;&#xAC00; &#xACB0;&#xACFC; &#xACE0;&#xC591;&#xC774; &#xC138;&#xD3EC;&#xC758; &#xAC10;&#xC5FC;. &#xB610;&#xD55C;, &#xC5F4; &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC2A4;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC790;&#xADF9;&#xB41C; &#xC138;&#xD3EC; &#xC0DD;&#xB9AC; &#xC801; &#xC870;&#xAC74;&#xC5D0; &#xBCC0;&#xD654;&#xAC00; &#xBAA8;&#xC790; &#xC885;&#xC18D; &#xAC1C;&#xC2DC;&#xB97C; &#xC2EC;&#xAC01; &#xD558; &#xAC8C; &#xC5B5;&#xC555; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; FIV 5&#39; UTR&#xC5D0; &#xD798;&#xC785;&#xC5B4; &#xD45C;&#xD604;&#xC758; &#xD2B9;&#xC815; &#xC790;&#xADF9;&#xC5D0; &#xACB0;&#xACFC;. &#xC774; &#xACB0;&#xACFC; &#xACF5;&#xAC1C; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xAC10;&#xC5FC; &#xBC0F; &#xC138;&#xD3EC; &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC2A4;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xB418;&#xB294; &quot;&#xD734;&#xBA74;&quot; IRES &#xC874;&#xC7AC;.

&#xD734;&#xBA74; &#xB0B4;&#xBD80; &#xB9AC;&#xBCF4;&#xC19C; &#xD56D;&#xBAA9; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8; &#xACE0;&#xC591;&#xC774; &#xBA74;&#xC5ED; &#xACB0;&#xD54D; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xC758; &#xBCC0;&#xD658;&#xC744; &#xC81C;&#xC5B4; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

La caracterizaci&oacute;n de los sitios de entrada interna del ribosoma (IRESs) en lentiviruses pr&aacute;cticamente todos nos impuls&oacute; a investigar el mecanismo utilizado por el virus de la inmunodeficiencia felina (FIV) para producir prote&iacute;nas virales. Traducci&oacute;n in vitro varios ensayos con mono - y bicistronic construcciones revelaron que la traducci&oacute;n del ARN gen&oacute;mico FIV producido por un mecanismo dependiente de tapa y por entrada interna d&eacute;bil de los ribosomas. Esta d&eacute;bil actividad IRES fue confirmada en felinas c&eacute;lulas que expresaban RNAs bicistronic que contiene el FIV 5&#39; regi&oacute;n sin traducir (UTR). Sorprendentemente, infecci&oacute;n de c&eacute;lulas felinas con FIV, pero no el virus de inmunodeficiencia humana tipo 1, dio lugar a un gran aumento en la traducci&oacute;n de la FIV. Por otra parte, un cambio en la condici&oacute;n fisiol&oacute;gica celular provocada por el estr&eacute;s de calor dio lugar a la exigencia espec&iacute;fica de expresi&oacute;n impulsado por la FIV 5&#39; UTR mientras tapa dependiente iniciaci&oacute;n fue severamente reprimido. Estos resultados revelan la presencia de un IRES &quot;durmiente&quot; que se activa por la infecci&oacute;n viral y estr&eacute;s celular.

Un sitio de entrada del ribosoma interno latente controla la traducci&oacute;n de virus de la inmunodeficiencia felina.

20 &#x5E74;&#x524D;&#xFF0C;picornaviral RNA &#x7FFB;&#x8BD1;&#x7814;&#x7A76;&#x5BFC;&#x81F4;&#x7531;&#x6838;&#x7CD6;&#x4F53;&#x76F4;&#x63A5;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x5230; 5&#39; UTR &#x542F;&#x52A8;&#x7684;&#x4E00;&#x79CD;&#x66FF;&#x4EE3;&#x673A;&#x5236;&#x7684;&#x8868;&#x5F81;&#x3002;&#x901A;&#x8FC7;&#x4F7F;&#x7528;&#x987A;&#x77E2;&#x91CF;&#xFF0C;&#x5B83;&#x8868;&#x660E; 5&#39; UTR &#x7684;&#x810A;&#x9AD3;&#x7070;&#x8D28;&#x708E;&#x75C5;&#x6BD2; &#xFF08;PV&#xFF09; &#x6216;&#x8111;&#x810A;&#x9AD3;&#x708E;&#x75C5;&#x6BD2; (EMCV) &#x5DF2;&#x7ED1;&#x5B9A; 43S preinitiation &#x5728; 5&#39; &#x590D;&#x6742;&#x548C;&#x7AE0;&#x72EC;&#x7ACB;&#x80FD;&#x529B;&#x7684;&#x65B9;&#x5F0F;&#x3002;&#x8FD9;&#x88AB;&#x5448;&#x73B0;&#x53EF;&#x80FD;&#x7531;&#x5185;&#x90E8;&#x6838;&#x7CD6;&#x4F53;&#x8FDB;&#x5165;&#x4F4D;&#x70B9;&#xFF0C;&#x4F7F;&#x6709;&#x6548;&#x7684; mRNA &#x7684;&#x7FFB;&#x8BD1;&#x8981;&#x6C42; IRES RNA &#x57DF;&#x7F3A;&#x4E4F; 5&#39; &#x7AE0;&#x7ED3;&#x6784;&#x3002;IRES &#x5143;&#x7D20;&#x5DF2;&#x88AB;&#x53D1;&#x73B0;&#x5728;&#x8BB8;&#x591A;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x75C5;&#x6BD2;&#x6027;&#x5BB6;&#x5EAD;&#xFF0C;&#x4ED6;&#x4EEC;&#x5F80;&#x5F80;&#x8D4B;&#x4E88;&#x9009;&#x62E9;&#x6027;&#x7684;&#x4F18;&#x52BF;&#xFF0C;&#x4F7F;&#x6838;&#x7CD6;&#x4F53;&#x62DB;&#x8058;&#x6761;&#x4EF6;&#x4E0B;&#x7684;&#x7AE0;&#x4F9D;&#x8D56;&#x86CB;&#x767D;&#x5408;&#x6210;&#x4E25;&#x91CD;&#x7684;&#x538B;&#x6291;&#x3002;&#x8FD9;&#x9879;&#x5BA1;&#x67E5;&#xFF0C;&#x5728;&#x6211;&#x4EEC;&#x8FDB;&#x884C;&#x6BD4;&#x8F83;&#x548C;&#x5BF9;&#x6BD4;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x548C;&#x529F;&#x80FD;&#x7684; IRESes &#x7684; RNA &#x79EF;&#x6781;&#x6401;&#x6D45;&#x75C5;&#x6BD2;&#x662F; (i) &#x75C5;&#x75C7; &#xFF1B; 4 &#x4E0D;&#x540C;&#x5BB6;&#x5EAD;&#x5185;&#x53D1;&#x73B0;&#x7684;(&#x4E8C;) &#x9EC4;&#x70ED;&#x75C5;&#x6BD2; &#xFF1B;(iii) Dicistroviruses;&#x53CA; (iv) &#x6162;&#x3002;

&#x75C5;&#x6BD2;&#x6027; IRESes &#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x548C;&#x529F;&#x80FD;&#x7684;&#x591A;&#x6837;&#x6027;&#x3002;

Some 20 years ago, the study of picornaviral RNA translation led to the characterization of an alternative mechanism of initiation by direct ribosome binding to the 5' UTR. By using a bicistronic vector, it was shown that the 5' UTR of the poliovirus (PV) or the Encephalomyelitis virus (EMCV) had the ability to bind the 43S preinitiation complex in a 5' and cap-independent manner. This is rendered possible by an RNA domain called IRES for Internal Ribosome Entry Site which enables efficient translation of an mRNA lacking a 5' cap structure. IRES elements have now been found in many different viral families where they often confer a selective advantage to allow ribosome recruitment under conditions where cap-dependent protein synthesis is severely repressed. In this review, we compare and contrast the structure and function of IRESes that are found within 4 distinct family of RNA positive stranded viruses which are the (i) Picornaviruses; (ii) Flaviviruses; (iii) Dicistroviruses; and (iv) Lentiviruses.

Structural and functional diversity of viral IRESes.

Il y a une vingtaine d&#39;ann&eacute;es, l&#39;&eacute;tude de la traduction du RNA picornaviral conduit &agrave; la caract&eacute;risation d&#39;un autre m&eacute;canisme d&#39;initiation par liaison directe de ribosome &agrave; la 5&#39; UTR. En utilisant un vecteur bicistronique, il a &eacute;t&eacute; d&eacute;montr&eacute; que la 5&#39; UTR du poliovirus (PV) ou le virus de l&#39;enc&eacute;phalomy&eacute;lite (EMCV) avait le pouvoir de lier la pr&eacute;-initiation 43 s complexe dans un 5&#39; et chapeau-ind&eacute;pendante mani&egrave;re. Cela est rendu possible par un domaine de RNA appel&eacute; IRES pour Site d&#39;entr&eacute;e Ribosome interne qui permet la traduction efficace d&#39;un ARNm manque d&#39;une structure de cap 5&#39;. &Eacute;l&eacute;ments IRES ont &eacute;t&eacute; trouv&eacute;s dans de nombreuses familles virales diff&eacute;rentes o&ugrave; ils conf&egrave;rent souvent un avantage s&eacute;lectif pour permettre le recrutement du ribosome dans des conditions o&ugrave; la synth&egrave;se des prot&eacute;ines de la PAC-d&eacute;pendante est s&eacute;v&egrave;rement r&eacute;prim&eacute;e. Dans cette revue, nous comparer et contraster la structure et la fonction de IRESes qui se trouvent &agrave; 4 famille de virus &agrave; brin positifs ARN qui sont le (i) picornavirus ; (ii) flavivirus ; (iii) Dicistroviruses ; et (iv) lentivirus.

Diversit&eacute; structurale et fonctionnelle de IRESes virale.

Vor 20 Jahren f&uuml;hrte die Studie der picornaviral RNA-&Uuml;bersetzung auf die Charakterisierung eines alternativen Mechanismus zur Einleitung von direkten Ribosom binden an den 5&#39; UTR. Mit einen Bicistronic-Vektor, es wurde gezeigt, dass 5&#39; UTR des Poliovirus (PV) oder das Enzephalomyelitis-Virus (EMCV) hatte die 43S Preinitiation Komplex in 5&#39; und GAP-unabh&auml;ngige binden Weise. Dies ist m&ouml;glich durch gerendert einer RNA-Dom&auml;ne namens IRES f&uuml;r interne Ribosom-Eintrag-Site erm&ouml;glicht effiziente &Uuml;bersetzung einer mRNA fehlt eine 5&#39;-Cap-Struktur. IRES Elemente nun in viele verschiedene virale Familien gefunden wo sie oft einen selektiven Vorteil verleihen um Ribosom Rekrutierung unter Bedingungen zu erm&ouml;glichen, wo ist GAP-abh&auml;ngige Proteinsynthese stark unterdr&uuml;ckt. In diesem Bericht wir vergleichen und die Struktur und Funktion des IRESes, die in 4 verschiedene Familie der RNA positiven angeschwemmte Viren gefunden werden, sind die (i) Picornaviren; (Ii) Flaviviren; (Iii) Dicistroviruses; und (iv) Lentiviruses.

Strukturelle und funktionelle Vielfalt der viralen IRESes.

Circa 20 anni fa, lo studio della traduzione RNA picornaviral ha portato alla caratterizzazione di un meccanismo alternativo di iniziazione dal legame diretto ribosoma con 5&#39; UTR. Utilizzando un vettore di bicistronic, &egrave; stato dimostrato che il 5&#39; UTR del poliovirus (PV) o virus dell&#39;encefalomielite (EMCV) ha avuto la capacit&agrave; di legare il 43S preinitiation cap-indipendente e complesso in 5&#39; modo. Questo &egrave; reso possibile da un dominio RNA chiamato IRES per Internal Ribosome Entry Site che consente la traduzione efficiente di un mRNA manca una struttura cap 5&#39;. Elementi IRES ora sono stati trovati in molte diverse famiglie virali dove spesso conferiscono un vantaggio selettivo per consentire assunzioni di Ribosoma in condizioni dove sintesi della proteina cap-dipendente sono severamente repressi. In questa recensione, abbiamo confrontare e contrapporre la struttura e la funzione di IRESes che si trovano all&#39;interno della famiglia 4 distinti di virus filamento positivo di RNA che sono picornavirus; (i) (ii) flavivirus; (iii) Dicistroviruses; e (iv) Lentiviruses.

Diversit&agrave; strutturale e funzionale di IRESes virale.

&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B; 20 &#x5E74;&#x524D;&#x3001;picornaviral RNA &#x306E;&#x7FFB;&#x8A33;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x958B;&#x59CB; 5&#39; UTR &#x306B;&#x76F4;&#x63A5;&#x30EA;&#x30DC;&#x30BD;&#x30FC;&#x30E0;&#x7D50;&#x5408;&#x306E;&#x4EE3;&#x66FF;&#x6A5F;&#x69CB;&#x306E;&#x7279;&#x6027;&#x8A55;&#x4FA1;&#x306B;&#x3064;&#x306A;&#x304C;&#x3063;&#x305F;&#x3002;Bicistronic &#x30D9;&#x30AF;&#x30C8;&#x30EB;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3059;&#x308B;&#x3068;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x306F;&#x3001;5&#39; UTR &#x30DD;&#x30EA;&#x30AA; &#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9; &#xFF08;PV&#xFF09; &#x306E;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x8133;&#x810A;&#x9AC4;&#x708E;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9; (EMCV) 43S &#x8EE2;&#x5199;&#x958B;&#x59CB;&#x524D;&#x3067; 5&#39; &#x8907;&#x96D1;&#x3068;&#x30AD;&#x30E3;&#x30C3;&#x30D7;&#x72EC;&#x7ACB;&#x3092;&#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;&#x3059;&#x308B;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3092;&#x6301;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x52B9;&#x7387;&#x7684;&#x306A;&#x7FFB;&#x8A33;&#x306E; mRNA &#x306E;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x5185;&#x90E8;&#x306E;&#x30EA;&#x30DC;&#x30BD;&#x30FC;&#x30E0; &#x30A8;&#x30F3;&#x30C8;&#x30EA; &#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x306E; IRES &#x3068;&#x547C;&#x3070;&#x308C;&#x308B; RNA &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3; 5&#39; &#x30AD;&#x30E3;&#x30C3;&#x30D7;&#x69CB;&#x9020;&#x3092;&#x6B20;&#x3044;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x53EF;&#x80FD;&#x306A;&#x30EC;&#x30F3;&#x30C0;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;IRES &#x8981;&#x7D20;&#x306F;&#x3001;&#x4ECA;&#x5F7C;&#x3089;&#x306F;&#x3057;&#x3070;&#x3057;&#x3070;&#x30AD;&#x30E3;&#x30C3;&#x30D7;&#x4F9D;&#x5B58;&#x578B;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x5408;&#x6210;&#x304C;&#x53B3;&#x3057;&#x304F;&#x6291;&#x5727;&#x3055;&#x308C;&#x30EA;&#x30DC;&#x30BD;&#x30FC;&#x30E0;&#x52DF;&#x96C6;&#x6761;&#x4EF6;&#x306E;&#x4E0B;&#x3067;&#x8A31;&#x53EF;&#x3059;&#x308B;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x9078;&#x629E;&#x7684;&#x5229;&#x76CA;&#x3092;&#x4E0E;&#x3048;&#x308B;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x5BB6;&#x65CF;&#x3067;&#x767A;&#x898B;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x30EC;&#x30D3;&#x30E5;&#x30FC;&#x3092;&#x6BD4;&#x8F03;&#x3057;&#x3001;&#x69CB;&#x9020;&#x3068;&#x6A5F;&#x80FD; (i) &#x30D4;&#x30B3;&#x30EB;&#x30CA;; &#x306E; RNA &#x80AF;&#x5B9A;&#x7684;&#x306A;&#x5B64;&#x7ACB;&#x3057;&#x305F;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E; 4 &#x306E;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x5BB6;&#x65CF;&#x5185;&#x3067;&#x898B;&#x3064;&#x304B;&#x3063;&#x305F;&#x6CA2;&#x306E;&#x30AB;&#x30AD;&#x30C4;&#x30D0;&#x30BF;&#x306E;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C8;&#x30E9;&#x30B9;&#x30C8;(ii) &#x306B;&#x304A;&#x3044;&#x3066;;(iii) Dicistroviruses;(iv) &#x30D7;&#x30ED;&#x30C8;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D7;&#x30EC;&#x3002;

&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x6CA2;&#x306E;&#x30AB;&#x30AD;&#x30C4;&#x30D0;&#x30BF;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x7684;&#x30FB;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x591A;&#x69D8;&#x6027;

20 &#xB144; &#xC804;, &#xC77C;&#xBD80; picornaviral RNA &#xBC88;&#xC5ED; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xAC1C;&#xC2DC; &#xD558; &#xC5EC; 5&#39; UTR &#xC9C1;&#xC811; &#xB9AC;&#xBCF4;&#xC19C; &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB300;&#xCCB4; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC758; &#xD2B9;&#xC131;&#xD654;&#xB97C; &#xC774;&#xB04C;&#xC5C8;&#xB2E4;. Bicistronic &#xBCA1;&#xD130;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xADF8;&#xAC83;&#xC744; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC92C;&#xB358;&#xC740; 5&#39; UTR &#xC18C;&#xC544;&#xB9C8;&#xBE44; (&#xD0DC;&#xC591;&#xAD11; &#xBC1C;&#xC804;) &#xB610;&#xB294; Encephalomyelitis &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; (EMCV) &#xD588;&#xB2E4; 43S preinitiation&#xC5D0; 5&#39; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD558; &#xACE0; &#xBAA8;&#xC790;&#xC5D0; &#xAD00;&#xACC4; &#xC5C6;&#xC774; &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xD560; &#xC218; &#xBC29;&#xC2DD;&#xC73C;&#xB85C;. &#xC774;&#xAC83;&#xC740; &#xB80C;&#xB354;&#xB9C1; &#xAC00;&#xB2A5;&#xD55C; IRES&#xB294; Mrna&#xC758; &#xD6A8;&#xC728;&#xC801;&#xC778; &#xBC88;&#xC5ED; &#xC218; &#xC788;&#xB294; &#xB0B4;&#xBD80; &#xB9AC;&#xBCF4;&#xC19C; &#xD56D;&#xBAA9; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8; &#xB77C;&#xB294; RNA &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; 5&#39; &#xCEA1; &#xAD6C;&#xC870; &#xBD80;&#xC871;. IRES &#xC694;&#xC18C; &#xC9C0;&#xAE08; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC740; &#xC885;&#xC885; &#xBAA8;&#xC790; &#xC885;&#xC18D; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xD569;&#xC131;&#xC740; &#xC2EC;&#xAC01; &#xD558; &#xAC8C; &#xC5B5;&#xC555; &#xB41C; &#xC870;&#xAC74; &#xD558;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB9AC;&#xBCF4;&#xC19C; &#xBAA8;&#xC9D1; &#xC218; &#xC788;&#xB3C4;&#xB85D; &#xC120;&#xD0DD;&#xC801; &#xC774;&#xC6A9;&#xC744; &#xBD80;&#xC5EC; &#xB9CE;&#xC740; &#xB2E4;&#xB978; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xC131; &#xAC00;&#xC871;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xACAC; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xB9AC;&#xBDF0;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xBE44;&#xAD50; &#xD558; &#xACE0; &#xB300;&#xC870; &#xAD6C;&#xC870;&#xC640; &#xAE30;&#xB2A5; (i) &#x611F;; &#xD558;&#xB294; RNA &#xAE0D;&#xC815;&#xC801;&#xC778; &#xC88C;&#xCD08; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xC758; 4 &#xAC00;&#xC9C0; &#xC81C;&#xD488;&#xAD70; &#xB0B4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xACAC; &#xB418;&#xB294; Ireses&#xC758; (ii) Flaviviruses; (iii) Dicistroviruses; &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; (iv) Lentiviruses&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xC131; Ireses&#xC758; &#xAD6C;&#xC870;&#xC801; &#xBC0F; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC801; &#xB2E4;&#xC591;&#xC131;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Unos 20 a&ntilde;os atr&aacute;s, el estudio de la traducci&oacute;n de RNA picornaviral condujo a la caracterizaci&oacute;n de un mecanismo alternativo de iniciaci&oacute;n atando ribosoma directo a los 5&#39; UTR. Usando un vector de bicistronic, se demostr&oacute; que la 5&#39; UTR de poliovirus (PV) o el virus de la encefalomielitis (EMCV) ten&iacute;a la capacidad de enlazar la preiniciaci&oacute;n 43S tapa independiente y compleja en un 5&#39; manera. Esto se procesa posible por un dominio de RNA llamado IRES para sitio de entrada del ribosoma interno que permite la traducci&oacute;n eficaz de un mRNA que carece de una estructura del casquillo 5&#39;. Elementos IRES ahora se han encontrado en muchas familias virales diferentes donde a menudo confiere una ventaja selectiva para permitir la contrataci&oacute;n de ribosoma en condiciones donde la s&iacute;ntesis de prote&iacute;nas dependiente de tapa es severamente reprimida. En esta revisi&oacute;n, compara y contrastan la estructura y funci&oacute;n de IRESes que se encuentran dentro de la familia 4 distintos de virus trenzados positivos de ARN que son la (i) picornavirus; (ii) Flaviviruses; (iii) Dicistroviruses; y (iv) lentivirus.

Laurent Balvay

INSERM U758,
Ecole Normale Supérieure de Lyon,
INSERM U758, Ecole Normale Supérieure de Lyon

Université de Lyon

Engineering Adherent Bacteria by Creating a Single Synthetic Curli Operon

Laurent Balvay

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Université de Lyon

Engineering Adherent Bacteria by Creating a Single Synthetic Curli Operon

INSERM U758,
Ecole Normale Supérieure de Lyon,
INSERM U758, Ecole Normale Supérieure de Lyon