生态扰动是非生物、生物或人为因素造成的环境暂时破坏，导致生态系统发生明显变化。生态扰动的影响取决于其强度、频率和空间分布，在形成生态系统内的物种多样性方面起着重要作用。
生态扰动可能由像森林火灾或洪水那样小而小的踩踏到范围广泛的事件造成的。火山和飓风等自然事件、放牧和虫害爆发等生物干扰以及森林砍伐等人类活动都可能导致生态扰动。
生态系统中种群中的关键生物过程，如死亡率、生殖、运动和社会行为，都可能受到干扰的影响。如果人口恢复时间和移民率在事件发生后，导致高死亡率的严重干扰会减少人口数量，导致遗传多样性的丧失。干扰还通过影响遗传漂移和迁移来影响种群内的遗传分化。
生态扰动导致自然选择的强度和方向变化，导致不可预知的进化模式。因此，干扰后的选择过程可以改变群落的植物遗传组成。
中间扰动假说指出，当扰动既不罕见也不频繁时，生态扰动会导致物种多样性最大。最高多样性发生在中度干扰水平，其特点是中等强度和频率水平。
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