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9.8 : RNA Polymerase II Accessory Proteins

调节转录的蛋白质可以通过与 RNA 聚合酶的直接接触或通过接头蛋白、介质、组蛋白修饰蛋白和核小体重塑剂促进的间接相互作用来实现转录。在细菌以及一些真核基因中可以看到激活转录的直接相互作用。在这些情况下,上游激活序列与启动子相邻,激活蛋白直接与转录机制相互作用。例如,在原核生物中,分解代谢物激活蛋白或 CAP 直接与 RNA 聚合酶 α 亚基的 C 端结构域相互作用以调节基因表达。直接相互作用的有力证据是蛋白质激活结构域中功能突变的丧失,导致转录活性受到抑制。

然而,在一些真核基因中,可以通过远端激活进行调节。因此,调节元件可能不靠近启动子,或者可能不会直接与转录机制相互作用。这种相互作用可以通过以下方法检测:(a) 在存在或不存在调节蛋白的情况下的转录速率 (b) 调节蛋白结合位点的突变会破坏基因表达 (c) 测量调节蛋白和启动子之间的结合亲和力。

此外,转录机制还需要核小体重塑剂来访问染色质内的 DNA。因此,这些核小体重塑剂也参与调节基因表达。

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