转录延伸是一个动态过程,根据被转录 DNA 的序列异质性而变化。因此,在转录基因时,延伸复合物的组成也随途变化也就不足为奇了。
转录延伸通过在转录过程中多次暂停 RNA 聚合酶来调节。在细菌中,这些停止是必要的,因为 DNA 转录成 mRNA 与将 mRNA 翻译成蛋白质耦合。然而,在真核生物中,转录与 mRNA 加工相结合。因此,在外显子-内含子连接周围暂停 RNA 聚合酶对于提高 mRNA 剪接的效率是必要的。
RNA 聚合酶活性的这些停止可能是可逆的或不可逆的。在可逆暂停的情况下,TFIIF、elongins、ELL 等蛋白质可确保 RNA 聚合酶在短暂暂停后恢复延伸。然而,如果 RNA 聚合酶活性的停止是不可逆的,则变为转录停滞。如果转录被阻止,则酶无法自行恢复延伸。在这种情况下,TFIIS 和 pTEFb 等延伸因子使 RNA 聚合酶 II 能够在转录阻滞位点读取 DNA 模板。
此外,ATP 依赖性染色质重塑因子和组蛋白伴侣也参与转录延伸的调节。它们可以一起改变核小体沿 DNA 的位置,使其转录机制能够接近或无法接近。
因此,RNA 聚合酶需要几个因素的帮助才能穿过干扰转录的染色质和特定序列。
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