小RNA转染原代人Th17细胞通过下一代电穿孔

摘要

Next generation electroporation is an efficient method for transfecting human Th17 cells with small RNAs to alter gene expression and cell behavior.

摘要

CD4⁺ T cells can differentiate into several subsets of effector T helper cells depending on the surrounding cytokine milieu. Th17 cells can be generated from naïve CD4⁺ T cells in vitro by activating them in the presence of the polarizing cytokines IL-1β, IL-6, IL-23, and TGFβ. Th17 cells orchestrate immunity against extracellular bacteria and fungi, but their aberrant activity has also been associated with several autoimmune and inflammatory diseases. Th17 cells are identified by the chemokine receptor CCR6 and defined by their master transcription factor, RORγt, and characteristic effector cytokine, IL-17A. Optimized culture conditions for Th17 cell differentiation facilitate mechanistic studies of human T cell biology in a controlled environment. They also provide a setting for studying the importance of specific genes and gene expression programs through RNA interference or the introduction of microRNA (miRNA) mimics or inhibitors. This protocol provides an easy to use, reproducible, and highly efficient method for transient transfection of differentiating primary human Th17 cells with small RNAs using a next generation electroporation device.

引言

CD4 ⁺ T细胞是适应性免疫应答的关键协调器。幼稚CD4 ⁺ T细胞是能够发育成几个不同的效应T细胞（ 例如 TH1，TH2，Th17细胞， 等 ），每个具有自己的一套特性的细胞因子和转录因子，取决于局部微环境^1。血统决定T细胞使对于两个保护性免疫和容忍，自我批评。 Th17细胞是公知的，以打击胞外细菌和真菌的T细胞的一个子集，但它们的不当响应也牵涉在多种自身免疫疾病和炎性疾病的发病机理，例如多发性硬化和牛皮癣^2,3。人Th17细胞可以从幼稚的CD4 ⁺ T细胞在体外通过提供一个适当的偏振环境⁴来生成。 VARIO我们的细胞因子的组合IL-1β，IL-23，TGFβ，和IL-6已被用于人Th17细胞的发展。人Th17细胞表达CCR6，即通常用于识别该细胞群，并通过它们的主要转录因子，RORγt（由RORC编码^）5,6的表达被定义趋化因子受体。 Th17细胞具有表达多种细胞因子的能力，但IL-17A是由这些细胞产生的细胞谱系限定的效应细胞因子。我们检查了所有三个Th17细胞相关标记（CCR6，RORγt，IL-17A）的表达来评估我们的人Th17 体外分化检测的鲁棒性。此外，我们培养非偏振的条件下，在没有细胞因子或阻断抗体添加到培养基中作为阴性对照使用，因为这些Th17细胞标志物的表达应该是非常低的或不存在下的人CD4 ⁺ T细胞。

ve_content">学习正常的人T细胞的发育和生物学的一种方法是其发展过程中操纵基因表达。短干扰RNA（siRNA）是靶向蛋白质编码的mRNA，并且可以被利用来降低特定基因表达的合成的小RNA分子。微RNA（miRNA）是公知的调节基因表达的转录后的内源性非编码小RNA。的miRNA已显示出在小鼠和人的T细胞生物学中起重要作用，包括在Th17细胞^7，8，9，它关键的是要具有在人T细胞操纵的小RNA的活性，研究其对基因表达，并最终对人T细胞生物学效应的可靠的方法。在此，我们描述了我们用于引入开发了一种易于使用的，一致的和可靠的协议小合成的RNA和锁定核酸（LNA，化学修饰的核酸具有增加的稳定性）成免疫细胞，并且具体到人Th17细胞。

有引入的小RNA到哺乳动物细胞中，其通常落入化学，生物或物理类别¹⁰的若干替代方法。常用的化学方法，包括基于脂质的转染和磷酸钙转染，依靠创建被细胞更有效地吸收化学-DNA复合物。一般而言，化学方法是不适合的原代T细胞的转染效率高。最常见的生物的方法是使用病毒载体（ 例如逆转录病毒或慢病毒），其直接插入外来RNA引入宿主作为其天然复制周期的一部分。病毒转导通常需要更长的时间来完成，特别是当一个在时间因素的原病毒的质粒分子克隆。此外，病毒转导载体可以是可能危害人体研究。电穿孔是一种物理米通过使细胞对高的电压脉冲，从而允许核酸以瞬时进入细胞在那里他们可以在他们的目标作用诱导膜通透性ethod。传统的电文书不能有效转染主要淋巴细胞。然而，优化的下一代电穿孔已经被证明是能够以很高的效率转染的T细胞，特别是当待转染的材料为小RNA。术语下一代是松散用来区分传统的电穿孔机两个新的平台（ 例如 ，霓虹灯，Amaxa公司）。此外，此方法是一种用于具有高达在单一实验中约120的小RNA，其通常使用验证合成试剂中等通量筛选容易扩展。重要的是，转染的成功可以在T细胞活化后只需16小时来实现。这种方法的缺点，但是，它不会导致基因组稳定incorporati上，因此是短暂的。因此，这是值得的额外的努力以创建可以被包装到病毒载体中并在T细胞在需要小RNA的长期表达的情况下成功地表达了稳定的表达构建体。

我们已经使用了下一代的转染（ 例如 ，氖），实现多样化合成的单链或双链RNA或LNA寡核苷酸的工具用于不同的目的^{11，12，13。}有效的RNA干扰可以在原代小鼠和人T细胞使用双链短干扰RNA（siRNA）所诱导。这个协议描述了用于在人Th17细胞使用这种技术的优化条件。除了的siRNA，可商购的合成的miRNA模拟物和抑制剂可用于研究的miRNA增益和功能丧失。 miRNA模拟物是双链RNA分子非常相似的siRNA，但designe20d与内源成熟miRNA的序列。 miRNA的抑制剂是经化学修饰的结合天然miRNA和拮抗它们的功能的RNA和/或LNA基于单链寡核苷酸。我们发现，所有这些工具都可以在原代培养的T淋巴细胞有效地使用，包括但不限于人Th17细胞。

研究方案

该协议坚持加州大学旧金山分校的人类研究伦理指导原则。

1. T细胞培养，CD4 ⁺ T细胞的分离，和Th17极化的制备

1. 在第0天，涂层6孔，每个抗人CD3（2微克/ mL）和抗人CD28的孔1.5ml组织培养板（4微克/毫升）的PBS与钙和镁为至少2小时37℃。
   1. 可替代地，涂层在4℃下过夜平板。裹在板封口膜。
2. 制备脐带血单核细胞（CBMCs）通过根据制造商说明书密度梯度离心。
   注意:仔细工作，确保适当的个人防护装备（PPE）处理人血的时候以避免暴露于血源性病原体的风险已磨损。
3. 一旦单核细胞已被分离和洗涤，通过负塞莱执行人CD4 ⁺ T细胞分离ction使用市售的人CD4 ⁺ T细胞的试剂盒。
   注意:如果有后单核细胞的分离红血细胞污染，任选的红血细胞裂解可以先于CD4 ⁺ T细胞分离的步骤中进行。重悬的单核细胞在1mL隔离缓冲液（2％FBS的PBS中）的。加入5毫升的1X溶胞液。孵育在室温下15分钟。然后在300×g下在4℃下加入5毫升分离缓冲液和离心机5分钟以沉淀细胞。
   1. 重悬的单核细胞在隔离缓冲器一个的50×10 ⁶密度为每500μL在一个新的5mL的试管中。
   2. 加入100μLFBS和100μL抗体混合物每管，然后在4℃下孵育各管20分钟定轨振荡器上充分混合的。
   3. 在温育后，加入隔离缓冲器3-4 mL至洗涤细胞。离心将细胞在300×g离心8分钟，在4℃以沉淀细胞。小心吸苏佩rnatant。
   4. 在这个旋转，预洗磁珠。转移的磁珠的所需量进新管中（在1中使用:1与细胞），并添加隔离缓冲器的等体积的洗涤珠。拌匀使用1种毫升微量，然后将管在磁体至少1分钟。小心吸出上清液。重悬在相同体积的初始前的洗涤传送的磁珠。
   5. 将细胞重悬于每个管与隔离缓冲器500μL，并添加预洗涤磁珠500μL。
   6. 孵育在室温下（18℃至25℃）的定轨摇床上以15分钟的磁珠的细胞拌匀。
   7. 孵育后，彻底吸管使用1毫升微量的至少10倍的细胞。然后添加隔离缓冲器的3-4毫升，并放置各管在磁体2分钟。
   8. 小心转移是在带负选择的CD4 ⁺ T细胞上清至新管。
4. 一旦CD4 ⁺ T细胞分离完成后，计数与血球细胞和保持细胞在冰上。
5. 用PBS洗涤抗体包被的平板两次。然后1.5 Th17的偏振媒体的2倍的溶液混合添加到每个孔中:抗人IFNγ（20微克/毫升），抗人IL-4（20μg/ mL的），人TGFβ（10ng / mL的），人IL-1β（40毫微克/毫升），人IL-23（40毫微克/毫升），人IL-6（50毫微克/毫升）的所有稀释在无血清基础培养基（补充有2mM L-谷氨酰胺，100 U / ml的青霉素，100μg/ mL链霉素，10mM的HEPES，1mM丙酮酸钠和100μM2-巯基乙醇）。
   注:转染和RNA干扰确实在含血清媒体工作。使用无血清培养基与该协议的目的是为了实现更好的IL-17A的生产。
6. 离心机人类CD4 ⁺ T细胞在500×g离心5分钟，在4℃以沉淀细胞。小心吸supernat蚂蚁。然后重悬在无血清基础培养基的细胞和板上的细胞以3×10 ^6个的密度在每孔，使得最终体积为每孔3 mL和偏振细胞因子现在正处于1X终浓度1.5毫升。
   1. 将平板在5％CO _2，37℃的培养箱中两天。

2. 体外的电穿孔极化人Th17细胞

1. 第2天，外套48孔每抗人CD3（2微克/ mL）和抗人CD28的井250μL的组织培养板（4微克/毫升）的PBS与钙和镁为至少2小时37℃。
   1. 可替代地，涂层在4℃下过夜平板。裹在板封口膜。
2. 准备小RNA转染。对于每次转染，等分试样1 5μM储备溶液的siRNA到1.5mL微量离心管中的μL。包括适当的化学匹配的小RNA对照醇。置于冰上所有的管子。
3. 用PBS洗涤抗体包被的平板两次。然后添加500μL的1X的Th17极化介质到每个孔中:抗人IFNγ（10微克/毫升），抗人IL-4（10μg/ mL的），人TGFβ（5毫微克/毫升），人IL- 1β（20ng / mL的），人IL-23（20ng / mL的），人IL-6（25毫微克/毫升）的所有稀释在无血清基础培养基（补充有2mM L-谷氨酰胺，100U / mL青霉素，100微克/毫升链霉素，10mM的HEPES，1mM丙酮酸钠和100μM2-巯基乙醇）。
4. 制备的培养板中并转染试剂后，重悬以1种毫升微量，轻轻移液，但要确保所有的细胞从孔的底部分离的细胞。池中的细胞进入一个锥形管和离心机在500×g下在4℃下5分钟。
   注:对于除本文所提出的四天协议更长的培养期间，细胞应大致使用相同的协议转染的每3天。第2步0.4应当但是修改，因为用不同的小RNA处理的细胞不应该被合并。所有的被测试的条件必须收集，计数，并单独转染。
5. 小心吸出上清液，然后重悬细胞中至少1毫升的PBS洗涤。计数活Th17细胞（ 例如 ，使用台盼蓝排除来评估活力血球），然后将细胞转移到一个离心管中。
6. 离心在500xg 5分钟在室温下使细胞沉淀。
7. 小心吸出上清液，然后使用从转染系统10μL试剂盒所提供的重悬缓冲液以每毫升2.5-4×10 ⁷个细胞的密度悬浮细胞。保持细胞在室温下。
   注:作为指导原则，尽量只准备尽可能多的细胞可以在30分钟内被转染。多批次可以比拟的。
8. 添加细胞的9μL到的小RNA 1μL在每个的MicroCentrifuge管。移液管一次混合用于转染细胞和小RNA然后加载到移液管提供电极尖端。
   注意:通常情况下，添加细胞悬浮液的9.5μL，以确保有足够的混合物，以防止在转染前吸管电极末端产生气泡。
9. 用3mL室温电解缓冲液E.地点的吸液管站内的反应杯填充提供反应杯，然后将吸管到试管内的位置。
10. 立即电穿孔使用下列参数细胞和小RNA的各10μL混合物:脉冲电压1,500-1,550伏，脉冲宽度为10ms，和3个脉冲总转染装置上。
11. 电穿孔完成后，直接在细胞混合物添加到1X的Th17偏振媒体在一个培养板的孔中制备的500μL。代替板在5％CO _2，37℃的培养箱中两天。
    注意:通过移液洗净移液管尖电极起来，并在PBS中向下每次转染之间。

3.收获人Th17细胞

1. 重悬在培养基中的细胞微量，轻轻吹打，但要确保所有的细胞是从孔的底部分离。准备功能和/或基因表达分析的细胞。
   注意:常规地，足够的细胞被转染的Th17细胞的单个孔中，得到用于表面标记物和细胞内细胞因子和转录因子染色的流式细胞术分析或用于制备RNA的用于基因表达分析。

结果

第一步，显影的成功电穿孔人Th17细胞的可靠系统是产生在体外分化的人Th17细胞培养物的鲁棒性。 Th17的偏振条件下培养的T细胞中表达的趋化因子受体CCR6和转录因子RORγt（ 图1A，左）。当T细胞非偏振（THN）的条件下（ 图1A，右图）培养没有表达这些标记物。 Th17的偏振条件下培养的T细胞也取决于再刺激产生的IL-17A（ 图1B，左侧...

讨论

该协议提供用于递送的小RNA的成人Th17细胞的改进的方法。虽然人Th17细胞在此使用，电穿孔的这种方法与小RNA可以与其他主人T辅助细胞亚组，如TH1，TH2，以及调节性T细胞可以使用。它不是幼稚的CD4 ⁺ T细胞的运作良好，因此细胞必须培养的转染之前被激活。对于此协议中，我们首先优化了体外培养体系为更好的IL-17A的生产。最大的因素是基础的媒体。我们发现，无血清培养基优于传...

材料

Name	Company	Catalog Number	Comments
anti-human IL-17A PE	ebioscience	12-7179-42	Clone: eBio64DEC17
anti-human IFNg FITC	ebioscience	11-7319-82	Clone: 4S.B3
anti-human CD4 eVolve605	ebioscience	83-0047-42	Clone: SK3
mouse anti-human CD196 (CCR6) BV421	BD biosciences	562515	Clone: 11A9
anti-human RORgt AF647	BD biosciences	563620	Clone: Q21-559
anti-human CD45 eFluor450	ebioscience	48-9459-42	Clone: 2D1
Foxp3/Transcription Factor Staining Buffer Set	ebioscience	00-5523-00	For intracellular transcription factor flow cytometry staining
Hu FcR Binding Inhibitor Purified	ebioscience	14-9161-71
ImmunoCult-XF T Cell Expansion Medium	Stemcell Technologies	10981	"Serum-Free Base Media"
MACS CD28 pure functional grade, human	Miltenyi Biotec	130-093-375	Clone: 15E8
anti-human CD3 Purified	UCSF monoclonal antibody core	N/A	Clone: OKT-3
LEAF purified anti-human IL-4	Biolegend	500815	Clone: MP4-25D2
anti-human IFNg, functional grade purified	ebioscience	16-7318-85	Clone: NIB42
Recombinant human IL-23	Peprotech	200-23
Recombinant human IL-1β	Peprotech	200-01B
Recombinant human TGF-β1	Peprotech	100-21C
Recombinant human IL-6	Peprotech	200-06
siGENOME Control Pool, Non-targeting #2	Dharmacon	D-001206-14-05
siGENOME SMARTpool Human RORC	Dharmacon	M-003442-00
siGENOME SMARTpool Human PTPRC	Dharmacon	M-008067-01
Dynabeads Untouched Human CD4 T Cells Kit	ThermoFisher Scientific	11346D	Human CD4+ T cell Isolation Kit
Neon Tranfection System	ThermoFisher Scientific	MPK5000	Next generation electroporation instrument
Neon Tranfection System 10 μL Kit	ThermoFisher Scientific	MPK1096
Resuspension Buffer T	ThermoFisher Scientific	Provided in kit (MPK1096)	"Transfection Resuspension Buffer"
Lymphoprep	Stemcell Technologies	#07801	Density Gradient Medium
costar 6-well tissue culture treated plates	Corning	3516	flat bottom plates
costar 48-well tissue culture treated plates	Corning	3548	flat bottom plates
BD Pharm Lyse lysing buffer, 10x	BD biosciences	555899	Must make 1x solution with distilled water prior to use