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这是秀 丽隐杆线虫 性腺解剖后冷冻裂纹的常用方法,该方法通过抗体染色 产生 用于免疫荧光的种系样本,或用于简单的DAPI染色以可视化DNA。该协议对于研究实验室和基于课程的本科生研究经验的本科生来说是成功的。
秀丽隐杆线虫种系是研究减数分裂的绝佳模型,部分原因是易于对解剖动物进行细胞学分析。整个支架制剂保留了减数分裂细胞核的结构,重要的是,每个性腺臂都包含减数分裂的所有阶段,按时间空间进展组织,便于识别不同阶段的细胞核。成年雌雄同体有两个性腺臂,每个臂组织成一个封闭的管子,远端封闭端有增殖的种系干细胞,近端开口端有细胞化的卵母细胞,它们在子宫的中心连接。解剖从体腔释放一个或两个性腺臂,使整个减数分裂可见。在这里,提出了针对目标蛋白质的免疫荧光的通用方案,然后进行DAPI染色以标记所有染色体。年轻人被固定在左旋咪唑中,并使用两个注射器针头快速解剖。种系挤出后,样品在液氮中经历冷冻裂纹之前固定,这有助于透化角质层和其他组织。然后将样品在乙醇中脱水,再水化,并与一抗和二抗一起孵育。将DAPI添加到封片剂中的样品中,这样可以可靠地可视化DNA,并易于找到动物在荧光显微镜下成像。熟悉处理秀丽隐杆线虫的人在练习解剖方法本身几个小时后很容易采用这种技术。该协议已教授给在研究实验室工作的高中生和本科生,并纳入文理学院基于课程的本科研究经验中。
减数分裂是用于在所有有性繁殖生物中产生配子(卵子和精子/花粉)的特殊细胞分裂1,2。交叉重组是同源染色体之间DNA的相互交换;它对减数分裂至关重要,既是遗传多样性的重要来源,又能促进基因组几代人的稳定性。在减数分裂过程中未能形成至少一个交叉的染色体将随机分离,这可能导致染色体不分离,从而产生染色体数量不正确的配子——这种情况对于产生的后代通常是致命的3.在减数分裂过程中,交叉是由程序化的双链DNA断裂诱导的4。这些断裂的一个子集将被修复为交叉,提供DNA的物理连接,称为交叉,帮助定向同源染色体,为细胞分裂5做准备。减数分裂阶段在所有真核生物中都是高度保守的,它们的染色体构象使它们易于识别。
减数分裂作为生物学的基本概念,是学生在不同的生物学课程中多次遇到的话题。他们经常在高中时介绍减数分裂染色体分离的机制,而大学水平的课程侧重于分离的细胞生物学和交叉重组的遗传影响。然而,减数分裂对于许多学生来说是一个众所周知的棘手概念1.未能理解基因,DNA,染色体和减数分裂之间的关系会产生学生的误解和理解差距,从而阻碍对基因遗传的全面理解6,7。提高学生对抽象主题的理解的一种方法是提供具体的实践活动。例如,在教授减数分裂时,教师可以选择模拟分子分析的活动8,允许学生操纵分子的3D模型9,或学生自己表演分子编排的角色扮演1。结合未知结果的研究是提高学生理解力的一种特别有效的方法。这种做法被称为基于课程的本科研究体验 (CURE),并具有加强学生态度和能动性的额外好处,特别是对于那些属于在 STEM10,11 中代表性不足的群体的人。线虫秀 丽隐杆线虫 特别适合行为、生育能力和遗传杂交的课堂研究,是向学生介绍生物学研究的有效模式12.
秀丽隐杆线虫通过将分子遗传学与简单的细胞学分析相结合,为细胞生物学制造了强大的模式生物。它也特别适合在生物教室中使用13,14,15。它们在实验室中易于维护且经济,在标准室温或最常见的孵育温度 20 °C 下每 3 天产生数百个后代。重要的是,它们可以作为甘油储备液冷冻并保存在-80°C的冰箱中,这意味着新手研究人员犯的任何饲养错误都可以轻松纠正16。此外,其注释良好的基因组允许正向和反向遗传技术17,18,允许秀丽隐杆线虫用于解决从分子到进化的生物学问题。最后,秀丽隐杆线虫研究人员创建了一个支持性的社区,通常愿意为崭露头角的科学家提供帮助和建议19。这些优点导致秀丽隐杆线虫被纳入各种类型的机构的许多CURE中12,19,20,21,22,23。
除了对研究和教学的好处外,秀丽隐杆线虫已成为研究减数分裂和种系发育的流行模型24,25,26。这些动物的光学清晰度简化了细胞学方法27,在成年动物中,性腺占动物的近一半,提供了数百个减数分裂细胞进行研究。在性腺中,减数分裂种系细胞核像装配线一样排列(图1);有丝分裂复制发生在性腺的远端,细胞核在向性腺近端迁移时通过减数分裂阶段进行,受精胚胎从外阴中出现。由于刻板的空间组织也代表了减数分裂的时间进展,因此可以根据其染色体组织和在性腺中的位置轻松识别不同的阶段。最后,破坏减数分裂并导致非整倍体的过程会产生易于表征的表型,即使对于新手也是如此:不育、胚胎致死率或男性的高发病率(Him 表型)28。
这是一个简单的协议,用于可视化秀丽隐杆线虫中的减数分裂染色体。安装、解剖、固定和抗体染色均在同一显微镜载玻片上进行,这简化了方案并实现了近乎完美的样品回收率。该方法适用于简单的DAPI染色以可视化染色体,并可用于免疫荧光以可视化性腺中蛋白质的定位。学生使用基本的解剖显微镜解剖性腺,生成用于可视化DNA或免疫荧光的全安装制剂,并在复合荧光显微镜上成像。该协议已教授给在秀丽隐杆线虫研究实验室工作的高中生和本科生,并纳入文理学院的CURE12。尽管CURE的班级规模相对较小,但由于蠕虫菌株和试剂的成本相对较低,因此该协议适用于一系列机构的课程。讲师只会受到可供使用的解剖显微镜数量的限制。以前的实施让学生以三人为一组,共享一台显微镜,并在三个90分钟的课程中进行:第一个练习解剖,第二个实施解剖和DAPI染色,第三个在宽场荧光显微镜上成像载玻片。参与本科研究为学生11,29 提供了许多好处,包括学术和个人。通过治愈将研究嵌入课程中,允许学生在正常课堂时间参与研究11,30,31,这使得接触这些好处更容易获得和公平。
1. 秀丽隐杆线虫 饲养
注意:有关更多详细信息,请参阅 秀丽隐杆线虫 维护协议16 和 Elgin 等人 32 。 秀丽隐杆线虫 菌株可以很容易地从 Caenorhabditis 遗传学中心(https://cgc.umn.edu)获得,并通过普通邮件运送到美国的任何地方。每个菌株的成本为10美元,每个实验室/用户支付30美元的年费。
2.性腺夹层
3. 抗体染色
4. 安装和成像
DAPI与DNA紧密结合,即使在各种条件下,其染色也很稳健(图3A,B)。它应该存在于所有细胞核中,因此对载玻片上是否存在任何蠕虫组织以及在显微镜上检测荧光的能力进行有效的阳性对照。当抗体存在于减数分裂细胞核内时,染色是有效的(图3A,B)。例如, 图3A,B 显示了用DAPI染色的中厚皮细胞核和靶向RAD-51的抗体,RAD-51是双链断裂的标志物。KLE-2是凝聚蛋白的成分,凝聚蛋白是一种高度保守的蛋白质复合物,可构建染色体以准备有丝分裂和减数分裂。 kle-2/+ 突变体在染色体结构上具有轻微缺陷,如轻微无序的 DAPI 染色和双链断裂数的增加所反映的 RAD-51 病灶数量增加(图 3B)。免疫荧光的一个常见错误是将样品留在固定溶液中的时间过长。过度固定会导致染色不成功,因为它通常会阻止抗体扩散到细胞核中。当抗体扩散在性腺的细胞质区域,但似乎被排除在细胞核之外时,可以识别出这个错误。
在种系中(图1),细胞核在远端有丝增殖,在过渡区进入减数分裂,并通过厚皮(通常被许多细胞核行分为三个相等的阶段)进展,然后进入二普洛汀,最后进入diakinesis。卵母细胞根据它们与精子的接近程度进行编号,其中-1卵母细胞最靠近精子,-2卵母细胞是下一个远端,依此类推。 秀丽隐杆线虫 有六条染色体,在透视核中表现为紧凑的椭圆形。它们中的每一个都代表一对由交叉(也称为二价)结合在一起的两个姐妹染色单体的同源(图3C)。像 spo-11这样破坏交叉形成的突变体将无法形成交叉;因此,Dikinesis细胞核将有12个独立的DAPI体(也称为单价体),每个姐妹染色单体一个(图3D)。
图1:种系细胞核以时空方式排列,代表它们通过减数分裂的进展 。 (A)用DAPI染色的全安装年轻成年雌雄同体。勾勒出性腺和减数分裂阶段,从远端尖端(星号)到近端区域(-1卵母细胞,用箭头表示),其中包含精子(三角形)。比例尺代表100μm。 (B)用DAPI染色的解剖雌雄同体性腺的投影荧光图像。表示减数分裂阶段,代表性细胞核以插图显示(所有插图都显示为彼此缩放)。根据细胞核在种系中的位置和特征染色体形态,可以很容易地分期,从远端的有丝分裂区(星号)发展到过渡区,通过厚皮烯、双普洛汀和透析。精子由三角形标记。该数字改编自Hillers等人,许可为CC BY 3.028。 请点击此处查看此图的大图。
图 2:解剖设置演示 。 (A)解剖过程中的显微镜载物台。在放置在固定载玻片上的盖玻片上的 4 μL 解剖溶液中解剖动物,用于将盖玻片移入视野。该图显示了理想的针头位置。针头的斜边朝下,交叉在咽部区域。粉红色箭头展示了针的剪刀状运动。粉红色虚线表示理想的切割位置。(B)解剖动物的图像,包括完全挤压和不完全挤压的示例。挤出的性腺和内脏的部分被标记。(C) 显示冻结裂纹步骤的图像。载玻片应一只手牢牢握住,盖玻片侧背对身体。对面的边缘支撑在板凳上。剃须刀应握在另一只手上。粉红色箭头指示剃须刀将盖玻片从载玻片上甩开的移动方向,稍微转动一下,使盖玻片从身体上甩开。请注意,盖玻片的位置使得一个角悬挂在载玻片的长边缘上。(D)玻璃胚胎染色皿中解剖实践的设置图像。将动物置于50-200μL的解剖溶液中,这消除了蒸发问题并延长了解剖时间。 请点击此处查看此图的大图。
图3:种系细胞核的代表性荧光结果。 (A,B) 在 (A) 野生型和 (B) kle-2/+ 杂合子中用 RAD-51 抗体(绿色)和 DAPI(红色)染色的晚期厚皮烯细胞核的 Z 堆栈投影。(中,四)在 (C) 野生型(具有 6 个 DAPI 染色体)和 (D) spo-11 突变体(具有 12 个 DAPI 染色体)中用 DAPI 染色的单个 diakinesis 细胞核的 Z 堆栈投影。比例尺代表 5 μm。 请点击此处查看此图的大图。
有性生殖需要产生单倍体配子,单倍体配子是通过减数分裂的特殊细胞分裂 产生的 。 秀丽隐杆线虫 由于其光学透明性、方便的种系解剖结构和强大的遗传学而成为减数分裂细胞学研究的流行模型28.评估生育力和胚胎致死性的简单有机体实验可以与分子遗传学相结合,以解决实验室或课堂上的许多问题。例如,由于交叉对于适当的染色体分离至关重要,因此破坏其形成或分辨率的过程将产生非整倍体配子。反过来,非整倍性导致无法存活的后代,这可以通过计数后代或通过稍微复杂的确定胚胎致死率的方法轻松评估。在细胞学上,缺乏交叉会影响在运动过程中观察到的DAPI染色小体的数量。DAPI染色的稳健性和易于评分使其成为教授细胞学技术的理想实验。雌雄同体种系中细胞核的时空布局提供了减数分裂每个阶段在某一时刻的快照。细胞核从种系的远端有丝分裂端到近端大约需要54小时(例如,参见Jaramillo-Lambert等人33,Stamper等人34 和Libuda等人35)。这种既定的减数分裂进展时间允许脉冲追逐标记或DNA损伤实验。
由于DAPI染色几乎总是有效,因此它可以作为荧光显微镜的有用技术对照(并且可以为接受培训的显微镜学家提供满意度)。抗体染色的可变性可能更大,是重复之间重现性的良好衡量标准。 秀丽隐杆线虫 性腺可能难以始终如一地固定,因为这一步需要在保留染色体结构和允许足够的抗体扩散之间取得平衡。用甲醛固定可以最好地保留染色体形态,用多聚甲醛安瓿制备新鲜甲醛提供了最可重复的结果。也可以使用由福尔马林(37%甲醛和甲醇水溶液)制备的甲醛。每种抗体的固定强度和时机可能需要根据经验确定。替代方法包括在步骤2.4中跳过甲醛固定,并在冷冻裂解后,在-20°C下浸入100%乙醇中,或浸入100%甲醇中10分钟,然后在-20°C下浸入100%丙酮中10分钟。 这些固定条件允许更好的抗体渗透,但会对组织形态产生负面影响(染色体看起来会膨胀和浮肿)。
时间对于步骤 2 中概述的解剖和修复步骤非常重要。由于解剖液的体积非常小,蒸发会影响最终的固定浓度,从而导致抗体染色不一。经验丰富的 秀丽隐杆线虫 处理人员可以在从开始(步骤2.3)到修复(步骤2.4)的不到2分钟内准备一张幻灯片。主要的技术障碍是能够将动物挑选到解剖液中并快速解剖它们。学习如何进行大体积解剖会更容易。新学员首先将动物挑选到玻璃胚胎染色皿中的 50-200 μL 解剖溶液中(图 2D);在确定理想的针头位置以实现良好的性腺挤出时,较宽的表面提供了更大的回旋余地,而较大的液体体积使蒸发问题更少。一旦对解剖的动作感到满意,学员就开始在培养皿中仅使用 50 μL 进行解剖,然后切换到在载玻片上以 20 μL 进行解剖。在载玻片上解剖后,受训者可以快速开始减少溶液量,直到他们在 4 μL 中工作的速度足够快,蒸发可以忽略不计。
如果解剖时间仍然存在问题,受训者可以在步骤2.3中解剖8 μL的解剖溶液。然后,在步骤2.4中,他们可以加入8 μL固定溶液,轻轻移液以彻底混合(密切观察以确保胴体不会被破坏或移走),并从混合溶液中取出8 μL。这种替代方法将产生相同的8 μL最终体积和相同的最终固定浓度;该体积对于确保胴体在步骤2.5中的冷冻裂纹期间接触盖玻片和载玻片表面非常重要。如果即使在较大的解剖体积中,准备每张载玻片的时间仍然是一个问题,则Gervaise和Arur26描述了种系免疫荧光方案的悬浮方法。
使用免疫荧光原 位 可视化蛋白质的主要限制是靶向特定目标蛋白质的一抗的可用性。但是,如果已经设计了蛋白质的标记版本,则可以调整该协议以可视化蛋白质标签。靶向常见标签的抗体,如FLAG、HA或GFP,是常见的。像GFP这样的荧光标签通常可以通过固定步骤淬灭,因此建议使用靶向GFP的一抗,而不是依赖天然荧光信号本身。该协议的另一个限制是它在单个时间范围内捕获种系(尽管卵子发生的所有阶段都将在种系中表示)。因此,这种技术可能会错过卵母细胞通过卵子发生过程中可能发生的动态变化。然而,配子发生的时机已经在 秀丽隐杆线虫中得到了很好的研究;在野生型年轻成人中,卵母细胞从种系的远端尖端(有丝分裂区)进展到diakinesis 33大约需要60小时。因此,脉冲追逐或特定干预(如照射)后的时间过程将允许观察减数分裂不同阶段的效果。
总之,该协议描述了 秀丽隐杆线虫 性腺解剖,然后进行DAPI和用于荧光显微镜的抗体染色。解剖和固定(步骤2)需要60-90分钟,具体取决于生成的载玻片数量。抗体染色(步骤3)大多无需人工干预,根据抗体孵育时间,至少7小时至1.5天不等。安装(步骤4.1-4.7)大约需要15分钟。如果存在抗体或荧光标签试剂,这种可视化种系染色体和性腺的一般方法可用于任何蛋白质的细胞学研究。在最简单的形式中,diakinesis细胞核的DAPI染色可用于筛选影响减数分裂重组的因素。当与后代数量、雄性发病率(Him表型)和胚胎致死率的生物体分析相结合时,这种细胞学方法为基于群体的分析提供了单细胞对应。
作者没有利益冲突需要披露。本稿件中的内容完全由作者负责。它不一定代表美国国立卫生研究院或国家科学基金会的官方观点。
Lee实验室的工作得到了美国国立卫生研究院国家普通医学科学研究所(奖励号为1R15GM144861)和国家儿童与人类发展研究所(奖励号为1R15HD104115)的支持。DA得到了UML肯尼迪科学学院科学学者计划的支持。NW得到了UML荣誉学院奖学金和UMLSAMP奖学金(由国家科学基金会资助,资助号HRD-1712771)的支持。我们感谢 A. Gartner 提供的 RAD-51 抗体。所有 秀丽隐杆线虫 菌株均由 Caenorhabditis 遗传学中心提供,该中心由美国国立卫生研究院研究基础设施计划办公室资助,奖励号为P40 OD010440。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Alexa Fluor 488 Donkey Anti-Rabbit IgG Secondary Antibody | Molecular Probes | 711-545-152 | |
Aluminum heating/cooling block | Millipore Sigma | Z743497 | |
Bacto Peptone | Gibco | DF0118 17 0 | |
Borosilicate Glass Pasteur Pipets, Disposable, 5.75 inches | Fisherbrand | 13 678 20B | Used to make worm picks |
BSA, Bovine Serum Albumin | VWR | 97061 420 | |
C. elegans wild type (ancestral) | Caenorhabditis Genetics Center | N2 (ancestral) | |
C. elegans kle-2 (ok1151) mutants | Caenorhabditis Genetics Center | VC768 | The full genotype of this strain is: kle-2(ok1151) III/hT2 [bli-4(e937) let-?(q782) qIs48] (I;III). It has kle-2 balanced with a balancer chromosome marked with pharangeal GFP. Pick non-green animals to identify homozygous kle-2 mutants. |
C. elegans spo-11 (me44) mutants | Caenorhabditis Genetics Center | TY4342 | The full genotype of this strains is: spo-11(me44) IV / nT1[qIs51] (IV:V). It has spo-11 balanced with a balancer chromosome marked with pharangeal GFP. Pick non-green animals to identify homozygous spo-11 mutants. |
Calcium Chloride Anhydrous | VWR | 97062 590 | |
Cholesterol | Sigma Aldrich | 501848300 | |
DAPI | Life Technologies | D1306 | |
EDTA, Disodium Dihydrate Salt | Apex Bioresearch Products | 20 147 | |
Embryo Dish, glass, 30mm cavity | Electron Microscopy Services | 100492-980 | Used to practice dissecting; glass is preferred because dissected animals can stick to plastic |
Escherichia coli | Caenorhabditis Genetics Center | OP50 | |
Food storage container, plastic | various | n/a | Plastic containers with (1) relatively flat bottoms, to allow slides to rest level; (2) lids that are air-tight, but can still be easily removed without disturbing contents of container, and (3) are about 9 inches long by 6 inches wide are preferred |
Glass Coplin Jar | DWK Life Sciences Wheaton | 08-813E | |
Hydrophobic Barrier PAP Pen | ImmEdge | NC9545623 | |
Kimwipes | Kimtech Science | 06 666A | |
Levamisole Hydrochloride | Sigma Aldrich | L0380000 | |
Magnesium Sulfate Anhydrous | Fisher Chemical | M65 500 | |
Needles, Single-use, 25 G | BD PrecisionGlide | 14 821 13D | blue, 1 inch |
NGM Agar, Granulated | Apex Bioresearch Products | 20 249NGM | |
Parafilm | Bemis | 16 101 | |
Paraformaldehyde (16% w/v) Aqueous Solution | Electron Microscopy Sciences | 50 980 487 | |
PBS, Phosphate Buffered Saline (10x Solution) | Fisher BioReagents | BP399500 | |
Petri Dishes, 60-mm | Tritech Research | NC9321999 | Non-vented, sharp edge |
Platinum wire (90% platinum, 10% iridium) | Tritech Research | PT 9010 | Used to make worm picks |
Potassium Chloride | Fisher | BP366-500 | |
Potassium Phosphate Dibasic | VWR BDH Chemicals | BDH9266 500G | |
Potassium Phosphate Monobasic | VWR BDH Chemicals | BDH9268 500G | |
Premium Cover Glasses 18 mm x 18 mm | Fisherbrand | 12-548-AP | 0.13–0.17 mm thickness |
Razor Blades, Single Edge | VWR | 55411 055 | |
SlowFade Gold Antifade Mountant | Molecular Probes | S36937 | Alternatives: VectaShield Antifade Mounting Medium (Vector Laboratories, H-1000-10) or ProLong Diamond Antifade (Thermo Fisher Scientific, P36970). If using ProLong Diamond, no nail polish is required for sealing, but slides must cure for 24 hours before imaging. |
Sodium Azide | Fisher BioReagents | BP922I 500 | |
Sodium Chloride | Fisher Chemical | S271 500 | |
Sodium Phosphate Dibasic Anhydrous | Sigma Aldrich | 7558 79 4 | |
Sodium Phosphate Dibasic Heptahydrate | Sigma Aldrich | S9390 | |
Styrofoam box | various | n/a | Approximate dimensions of interior: 12 inches long, 9 inches wide, 8 inches deep |
Superfrost Plus Microscope Slides | Fisherbrand | 22 037 246 | |
Triton X-100 | Fisher BioReagents | BP151 500 | |
Tryptone | Apex Bioresearch Products | 20 251 | |
Tween 20 | Fisher Chemical | BP337 500 | |
Yeast Extract | Apex Bioresearch Products | 20 254 |
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