该协议描述了使用 拟南芥 初级花序茎和 甘蓝型油菜 下胚轴的毛根诱导。毛茸茸的根可以培养并用作外植体来再生转基因植物。
毛根转化是各种物种植物生物技术的多功能工具。携带根诱导 (Ri) 质粒的农杆菌菌株感染在将 T-DNA 从 Ri 质粒转移到植物基因组后,诱导在受伤部位形成毛根。该方案详细描述了在芸苔型油菜DH12075和拟南芥Col-0中基于注射的毛根诱导程序。毛茸茸的根可用于分析感兴趣的转基因或加工用于产生转基因植物。含有细胞分裂素 6-苄氨基嘌呤 (5 mg/L) 和生长素 1-萘乙酸 (8 mg/L) 的再生培养基成功地在两个物种中引起芽的形成。该方案涵盖了再生体和 T1 植物的基因分型和选择,以获得携带目标转基因且不含 Ri 质粒的 T-DNA 的植物。还描述了导致复合材料工厂形成的替代过程。在这种情况下,毛根保留在枝条上(而不是天然根),这使得在整个植物的背景下研究毛根培养物中的转基因成为可能。
植物转化是植物生物学中任何遗传研究的瓶颈。一种土源性细菌,根癌农杆菌,被广泛用作通过花浸或组织培养产生转化物的基因递送手段。根癌弧菌感染伤口部位的植物,由于肿瘤诱导 (Ti) 质粒的 T-DNA 转移和整合到宿主植物基因组中,从而引起肿瘤。具有不含野生型 T-DNA 的修饰 Ti 质粒和具有人工 T-DNA 的二元载体以及用于插入目的基因的克隆位点的工程化根癌根癌杆菌菌株通常用作高效的植物转化系统1。然而,许多模式物种和作物对花浸或体外植物再生不敏感,或者生长周期长,影响了这种转化系统的效率。
根瘤农杆菌在感染寄主植物后,在受伤部位诱导不定根或毛根的形成。与根癌根瘤曲霉类似,根瘤菌将 T-DNA 从根诱导 (Ri) 质粒转移到宿主植物基因组,导致转基因毛根的发育。该过程主要由根致癌位点 (rol) 基因 2,3 控制。使用携带 Ri 质粒和编码目标基因的人工二元载体的农细菌菌株,毛根培养物已被用于生产重组蛋白、分析启动子或基因的功能,或使用成簇规则间隔短回文重复序列 (CRISPR)/CRISPR 相关蛋白 9 (Cas9)4,5,6 编辑基因组。
我们的方案使用携带 Ri 质粒 pRiA4b的转偶联菌株 Ti-less Ti. tumefaciens C58C1 7。Ri 质粒的 T-DNA 由两个区域组成,分别是右 T-DNA 和左 T-DNA(TR-DNA 和 TL-DNA),它们可以独立整合到植物基因组中 8.利用该系统,优化了芸苔型油菜DH12075品种漫长的外植体转化过程9。下面详述的方案允许在大约1年内再生选定的毛茸茸的根系,并获得携带目标转基因且不含rol基因的T1植物。基于注射的毛根转化可用于其他十字花科物种,如转化拟南芥Col-0所示。 下胚轴用于转化甘蓝型油菜,而拟南芥则被注射到初级花序茎中。
1. 培养基和溶液的制备
2. 用二元载体转化农杆菌
3. 甘蓝型油菜 的毛根转化DH12075
4. 芸苔型油菜DH12075毛根的再生
5. 再生剂和T1植物的选择
注意:在进入再生过程之前,可以选择毛茸茸的根系。选择的类型取决于转基因携带的内容。可以对毛根进行采样进行DNA提取和基因分型或突变检测,RNA提取并随后进行cDNA合成和RT-qPCR以分析所选基因的表达水平,显微镜检查用于荧光检测,或进行GUS染色处理。
6. 拟南芥Col-0的毛根转化与再生
我们之前在三个 芸苔型油菜品种(即 DH12075、Topas DH4079 和 Westar9)中优化了基于注射的毛根诱导方案。为了将这种转化方案应用于模式物种 拟南芥,将1个月大的植株的初级花序茎注射农杆菌接种物。2-4周后,注射部位出现毛茸茸的根。毛根被切除并在固体培养基上培养。 图1描述了这两个物种的方法比较。
将选定的毛根系转移到再生培养基中以诱导枝条形成。在拟南芥中,所有10个测试的毛根系在14天内诱导了黄色愈伤组织。在转移到再生培养基后 3 周内,可以看到深绿色斑点的第一个芽原基(图 2)。培养 4 周后,枝条覆盖 10 个毛根系中的 9 个毛根(再生效率 90%)。在某些情况下,从愈伤组织中引出不定根(图2H)。即使在再生培养基上 3 个月后,一条线也没有再生(每 4 周将毛根转移到新鲜培养基中)。因此,拟南芥毛根的再生效率与DH120759的甘油菜的再生效率相似。
甘油菜和拟南芥的毛根再生物显示出矮化表型(图3),这是毛根衍生植物的典型特征2。我们还观察到密集的根系、皱纹的叶子和开花时间的变化。这种所谓的毛根(或 Ri)表型是由插入植物基因组的 Ri 质粒的 rol 基因引起的。Ri T-DNA的插入和二元载体上编码的转基因可以是独立的,也可以是相连的。因此,对自花授粉产生的 T1 后代进行分离分析有助于识别表达目的转基因的无 rol 植物。T1 植物的基因分型通过对 TL 和 TR 的 ORF 以及目标转基因具有特异性的 PCR 引物进行。通过缺少virC引物的PCR产物来验证没有农杆菌污染(图1)。
图 1: 拟南芥 和 甘油菜的程序摘要。 在下胚轴或初级花序茎中注射 农杆菌 接种物可诱导毛根的发育。毛茸茸的根可以取代原生根,产生复合植物,该植物将被基因分型和分析(蓝色箭头)。培养的毛根可以再生成 T0 植物,在 T1 植物中繁殖,并进行基因分型(绿色箭头)。毛茸茸的根也可以进行传代培养以进行功能分析(黑色箭头)。给出了基因分型结果的示例。 请点击这里查看此图的较大版本.
图2: 拟南芥毛根的再生。 (A)毛根培养1天后转移到平板上。(乙、丙)愈伤组织在再生培养基上培养后 2 周内发育。(D、E)芽原基在培养 3 周后出现。(G、H)4周后形成枝条。(H) 从愈伤组织发育而来的不定根。(C、F、I)不可再生的毛茸茸的根系。比例尺代表 1 厘米。 请点击这里查看此图的较大版本.
图3: 甘油菜 和 拟南芥 野生型植物和毛根衍生再生物(T0植物)的代表性照片。 注意再生物的 Ri 表型。比例尺代表 2 厘米。 请点击这里查看此图的较大版本.
我们开发了一种简单的方案,用于甘油菜和拟南芥的毛根转化和随后的再生。该过程包括在下胚轴(甘油菜)或初级花序茎(拟南芥)中基于注射的毛根诱导。除了本研究中介绍的十字花科成员外,用携带 Ri 质粒的农杆菌菌株 C58C1 注射下胚轴的方法在豆科10,11 中也有效。
基于注射的方法的替代方案是基于浸泡的转化,包括将外植体浸泡在细菌悬浮液中,然后将外植体与农杆菌共培养。与浸泡法相比,基于注射的方法的优点是由于没有一些协议步骤而节省了时间:外植体制备、共培养时间测试以及在含有激素的培养基上培养以诱导毛根。尽管这两种方法对毛根诱导都有效,但与外植体浸泡法相比,使用基于注射的方法在某些物种中观察到更高的转化效率12,13。此外,基于注射的转化也可用于生成复合植物(转基因毛根和野生型芽)。在切断转化植物的原始根后,毛根支持植物生长,并且可以在整个植物的背景下研究转基因。
毛根诱导的关键步骤是将接种物注射到下胚轴或初级花序茎中。 甘油菜 的下胚轴是易碎的,很容易切断整个下胚轴。由于花序茎薄,在 拟南芥 中也可以观察到同样的情况。如果需要比较不同物种/栽培品种的转化效率,我们建议一个人进行所有实验,以避免因操作和注射植物的技巧而造成的错误。
我们开发了一种有效的油菜DH12075和拟南菜Col-0的毛根再生方案。由于再生是一个高度可变的过程,因此可以对所选物种或栽培品种进行一些方案修改。例如,毛茸茸的根衍生芽可以通过不同的生长素/细胞分裂素比例 (1:1) 在 B. oleracea14 中引起。或者,可以使用细胞分裂素噻二氮隆代替BAP,例如在B. campestris毛根15的情况下。
Ri质粒T-DNA多次插入植物基因组代表了毛根转化和再生系统的潜在限制。在这种情况下,在对 T1 幼苗进行分离分析后,未发现不含 Ri 质粒中 TL/TR 的植物。因此,我们建议为每个转基因生成几个独立的毛根系。
毛根培养物是基因功能研究的极其强大的工具,主要是因为它们的快速建立和廉价的维护(培养基中不需要激素)。该协议涵盖了 甘油菜 和 拟南芥的毛根诱导和再生方法,可用于直接在毛根培养物中研究感兴趣的转基因,在使用复合植物的整个植物的背景下,或在转基因植物的再生之后。
作者声明,该研究是在没有任何商业或财务关系的情况下进行的,这些关系可能被解释为潜在的利益冲突。
我们感谢 Jiří Macas(捷克共和国捷克布杰约维采 CAS 生物中心)提供农杆菌菌株。CEITEC MU的核心设施植物科学因其技术支持而受到认可。这项工作得到了捷克共和国教育、青年和体育部的支持,欧洲区域发展基金项目“SINGING PLANT”(编号。CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_026/0008446)和INTER-COST项目LTC20004。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1.50 mL tubes | Eppendorf | 125.215 | |
10% solution of commercial bleach | SAVO | ||
1-naphthaleneacetic acid (NAA) | Duchefa | N0903 | Callus regeneration medium |
2.0 mL tubes | Eppendorf | 108.132/108.078 | |
3M micropore tape | Micropore | ||
6-Benzylaminopurine (BAP) | Duchefa | B0904 | Callus regeneration medium, Shoot elongation medium |
70% ethanol | |||
bacteriological agar | HiMedia | RM201 | LB medium |
Bacteriological peptone | Oxoid | LP0037 | LB and YEB media |
Beef extract | Roth | X975.1 | YEB medium |
Bottles | DURAN | L300025 | |
Cefotaxime sodium | Duchefa | C0111 | Hairy root growing medium, Callus regeneration medium, Shoot elongation medium, Root induction medium |
chloroform | Serva | 3955301 | |
CTAB Hexadecyltrimethylammonium bromide | Sigma | 52365 | |
dNTP mix | Thermo Fisher Scientific | R0193 | |
EDTA - Titriplex III, (Ethylenendinitrilo)tetraacetic Acid, Disodium Salt, Dihydrate | Sigma | ES134-250G | |
elctroporation cuvette | |||
electrophesis agar, peqGOLD universal | VWR | 732-2789 | |
electrophoresis chamber | BIO-RAD | ||
electrophoresis gel reader | BIO-RAD | ||
electroporator GenePulser Xcell | BIO-RAD | ||
ethidium bromide | AppliChem | ||
Gene Pulser/MicroPulser electroporation cuvettes, 0.2 cm gap | BIO-RAD | 1652082 | |
Gene Ruler DNA ladder mix | Thermo Fisher Scientific | SM0331 | |
Gibberellic acid (GA3) | Duchefa | G0907 | Shoot elongation medium |
glycerol | Sigma | G5516-1L | |
HEPES (2-(4-(2-hydroxyethyl)-1-pirerazinyl)-ethansulfonique | Merck | 1101100250 | |
indole-3-butyric acid (IBA) | Duchefa | I0902 | Root induction medium |
kanamycin monosulfate | Duchefa | K0126 | |
Magenta GA-7 Plant Culture Box w/ Lid | Plant Media | V8505-100 | |
Measuring cylinder | |||
MES monohydrate | Duchefa | M1503 | Hairy root growing medium, Callus regeneration medium, Shoot elongation medium, Root induction medium, Medium for germination, Plant growing medium |
Murashige and Skoog medium (MS) | Duchefa | M0237 | Medium for germination, Plant growing medium |
Murashige and Skoog medium (MS) + B5 vitamins | Duchefa | M0231 | Hairy root growing medium, Callus regeneration medium, Shoot elongation medium, Root induction medium |
needle Agani 26G x 1/2 - 0.45 x 13mm | Terumo | ||
pH meter | |||
Phytagel | Sigma | P8169 | Callus regeneration medium, Root induction medium, Medium for germination |
PVP 40 (polyvinylpyrolidone Mr 40000) | Sigma | 9003-39-8 | |
Redtaq DNA Polymerase,Taq for routine PCR with inert dye, 10X buffer included | Sigma | D4309-250UN | |
Retsh mill | Qiagen | ||
sodium chloride | Lachner | 30093-APO | LB medium |
square Petri Dishes | Corning | GOSSBP124-05 | |
sucrose | Penta | 24970-31000 | Hairy root growing medium, Callus regeneration medium, Shoot elongation medium, Root induction medium, Medium for germination, Plant growing medium |
Syringe filter | Carl Roth | P666.1 | Rotylabo syringe filters 0.22 µm pore size |
thermomixer | Eppendorf | ||
Ticarcillin disodium | Duchefa | T0180 | Hairy root growing medium |
Tris(hydroxymethyl)aminomethan | Serva | 3719003 | |
ultrapure water | Millipore Milli-Q purified water | ||
Yeast extract | Duchefa | Y1333 | LB medium |
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