Conversion of Time Points to Lifeline Points Using the Python Conversion Functions and the CLOCCS Parameters

首先，通过在终端中输入命令来激活 Conda 环境。使用该命令打开交互式 Python 笔记本。在所需文件夹中创建新的 Python 笔记本，并提供适当的名称。

然后通过在第一个单元格中运行命令来导入包含对齐函数的 Python 文件。如果使用出芽数据作为细胞周期阶段数据。通过在新单元格中运行命令，导入包含每个时间点芽化百分比的数据框。

然后，通过将函数输入到新单元格中，将出芽数据与生命线点时间刻度对齐。接下来，通过在新单元格中运行命令，将实验数据框导入笔记本。通过将函数输入到新单元格中，将实验数据与生命线时间点刻度对齐。

然后在新单元格中输入命令以下载生命线对齐的数据集。从条件 2 RNAseq 收集的萌芽数据显示，未对齐的时间尺度（以分钟为单位）和生命线点的对齐时间尺度随时间推移的百分比。为所选时间点绘制的条件2数据集收集的流式细胞术数据显示，数据与比对确定的相位相匹配。