分子对接研究 Xanthatin 和 Keap1 蛋白之间的相互作用

首先，下载 Xanthatin 和 Keap1 的晶体结构。处理完结构后，导航两个任务并选择配体对接选项。从文件中选择受体网格，然后单击“浏览”。

然后点击桌面，打开分子对接文件夹，双击滑动网格2FLU文件。选择 glide-grid 2FLU zip 文件，然后单击 Open。现在，单击“从文件中使用配体”。

然后单击“浏览”并选择“桌面”。选择分子对接文件夹并打开ligprep_1文件。之后，选择 ligprep_1-out-maegz 文件，然后单击“打开”。

访问“设置”，然后选择精度为XP，额外精度选项。将作业名称修改为滑动。xp2flu，然后单击“运行”。

要查看停靠结果，请单击“文件”，然后选择“导入结构选项”。导航到桌面并打开分子对接文件夹。然后，选择 glide-dock XP 2FLU 文件。

选择滑行码头 XP 1 pv。maegz 文件，然后单击打开。然后双击工作区中的点以选择配体。

选择sitemap_1_protein。单击“表”，然后滑动到最右侧以查看对接分数。要可视化 2D 结果，请选择 sitemap_1_protein，如前所述。

单击“Ligand Interaction”，选择“View”，然后选中“LID 图例”框。然后单击“文件”，选择“保存屏幕截图”，并输入6， 000作为宽度。取消选中透明背景框，然后单击确定。在桌面上将文件另存为 2D-xanthatin-2FLU。

分子对接分析预测了Xanthatin与Keap1蛋白之间的相互作用。