首先,取一份 75 微升的等分试样,其中包含 1 毫克 DNA 结合的链霉亲和素包被的磁珠,然后用磁力架去除上清液。用 200 μL 上样缓冲液洗涤珠子。然后将珠子重悬于 75 μL 的上样缓冲液中,并通过移液轻轻混合。
接下来,将终浓度为 37.5 纳摩尔的起始识别复合物添加到微珠结合的 DNA 中,并在 30 摄氏度下以每分钟 800 转的搅动孵育反应 5 分钟。添加终浓度为 50 纳摩尔的 CDC6 并如前所述孵育反应。然后加入终浓度为 100 纳摩尔的 Mcm2-7 Cdt1,并如前所述孵育反应 20 分钟。
之后,加入终浓度为 100 纳摩尔的 DDK,并以类似方式孵育 30 分钟。去除上清液后,用 200 μL 高盐洗涤缓冲液洗涤含有磷酸化 Mcm-2-7 六聚体的微珠结合 DNA。通过移液混合,确保磁珠完全重悬。
接下来,去除缓冲液并用 200 μL CMG 缓冲液洗涤珠子一次。要将荧光标记的 CMG 组装并激活到微珠结合的 DNA 上,请去除 CMG 缓冲液,并将 DNA 结合的微珠重悬于 50 微升补充有 5 毫摩尔 ADP 的 CMG 缓冲液中。接下来,将屏幕上提到的所有成分混合在一个管中,然后将其放在冰上。
立即将重悬的微珠结合 DNA 添加到蛋白质混合物中。在 30 摄氏度下以 800 RPM 的转速搅拌孵育反应 15 分钟。用 HSW 缓冲液和 CMG 缓冲液依次洗涤珠子。
去除缓冲液后,将含有 DNA 结合磁珠的 CMG 重悬于 200 μL 洗脱缓冲液中,然后在室温下以 800 RPM 的转速搅拌孵育 1 小时。将试管放在磁力架上,让磁珠收集 5 分钟。小心收集含有洗脱的 DNA-CMG 复合物的上清液,不要破坏沉淀的珠子,并将其转移到新管中。
为确保溶液中没有珠子残留,请将收集的上清液再次放入磁力架中,并小心地再放置 5 分钟。收集上清液并将其转移到新试管中。向 200 微升上清液中加入 1, 400 微升 CMG 缓冲液。
样品现在可用于单分子成像。