Chromatin Interaction Analysis with Paired-End Tag Sequencing (ChIA-PET) for Mapping Chromatin Interactions and Understanding Transcription Regulation

Genomes are organized into three-dimensional structures, adopting higher-order conformations inside the micron-sized nuclear spaces 7, 2, 12. Such ...

Agency for Science, Technology and Research, Singapore

&#x6FC0;&#x6D3B; Stat &#x86CB;&#x767D;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x56E0;&#x5B50;&#x662F;&#x7531;&#x5176; Src &#x4ECB;&#x5BFC;&#x57DF;&#x7684;&#x540C;&#x6E90;&#x6027; 2 (SH2) &#x534F;&#x4F1A;&#x4E0E;&#x7EC6;&#x80DE;&#x56E0;&#x5B50;&#x53D7;&#x4F53;&#x542F;&#x52A8;&#x7684;&#x3002;&#x4EE5;&#x524D;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x5728;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x4E2D;&#x7684;&#x767D;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4ECB;&#x7D20;-6 &#x53D7;&#x4F53;&#x4E9A;&#x57FA;&#xFF0C;&#x7CD6;&#x86CB;&#x767D; 130 &#x80BD;&#x53D7;&#x4F53;&#x786E;&#x5B9A;&#x5377;&#x7EBF;&#x5708;&#x57DF; Stat3 &#x7684;&#x5FC5;&#x4E0D;&#x53EF;&#x5C11;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;&#x5728;&#x6B64;&#x7814;&#x7A76;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x8C03;&#x67E5;&#x8FD9;&#x9879;&#x89C4;&#x4F8B;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x57FA;&#x7840;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x53D1;&#x73B0; Stat3 &#x7684; C &#x672B;&#x7AEF;&#x57DF;&#x4E0D;&#x5229;&#x89C4;&#x7BA1;&#x5176;&#x53D7;&#x4F53;&#x7ED3;&#x5408;&#x6D3B;&#x6027;&#xFF0C;&#x53EA;&#x6709;&#x5728;&#x6CA1;&#x6709;&#x7B2C;&#x4E00;&#x87BA;&#x65CB;&#x76D8;&#x7ED5;&#x7EBF;&#x5708;&#x57DF;&#xFF0C;&#x4ECE;&#x800C;&#x5BFC;&#x81F4;&#x5206;&#x5B50;&#x5185;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5047;&#x8BBE;&#x3002;&#x7269;&#x7406;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x76D8;&#x7ED5;&#x7EBF;&#x5708;&#x57DF;&#x548C; C &#x672B;&#x7AEF;&#x57DF;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA; SH2 &#x57DF;&#xFF0C;&#x786E;&#x5B9E;&#x88AB;&#x68C0;&#x6D4B;&#x5230;&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;&#x65B0;&#x754C;&#x4E1C;&#x5357;&#x7684; C &#x7EC8;&#x7AEF;&#x57DF; (&#x6C28;&#x57FA;&#x9178; 720-740&#xFF09;&#xFF0C;&#x8FD8;&#x6D89;&#x53CA;&#x4E0E;&#x7EBF;&#x5708;&#x76D8;&#x7ED5;&#x57DF;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#xFF0C;&#x8BC1;&#x660E;&#x8FD9;&#x662F;&#x5173;&#x952E;&#x7684;&#x53D7;&#x4F53;&#x7ED3;&#x5408;&#x7684;&#x89C4;&#x7BA1;&#x3002;&#x76F8;&#x5E94;&#x5730;&#xFF0C;&#x5728;&#x6B64;&#x533A;&#x57DF;&#x5185;&#x7684;&#x78F7;&#x9178;&#x5316;&#x5728; Ser 727 &#x6291;&#x5236;&#x8FD9;&#x79CD;&#x4E92;&#x52A8;&#x3002;&#x4E0E;&#x80BD;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x7ED3;&#x679C;&#xFF0C;&#x7EBF;&#x5708;&#x76D8;&#x7ED5;&#x57DF;&#x548C; C &#x7EC8;&#x7AEF;&#x5206;&#x533A;&#x57DF;&#x662F;&#x5FC5;&#x8981;&#x7684;&#x767D;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4ECB;&#x7D20;-6&#xFF0C;&#x8FD9;&#x8868;&#x660E;&#x57DF;&#x95F4;&#x7684;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528; SH2 &#x4ECB;&#x5BFC;&#x7684;&#x53D7;&#x4F53;&#x7ED3;&#x5408;&#x7684;&#x5148;&#x51B3;&#x6761;&#x4EF6;&#xFF0C;&#x5728;&#x767D;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4ECB;&#x7D20;-6 &#x4FE1;&#x53F7;&#x54CD;&#x5E94;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7CD6;&#x86CB;&#x767D; 130 Stat3 &#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#x6027;&#x62DB;&#x52DF;&#x4EBA;&#x5458;&#x3002;

&#x57DF;&#x95F4;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x7684; Stat3 &#x89C4;&#x7BA1;&#x5176; Src &#x540C;&#x6E90; 2 &#x4ECB;&#x5BFC;&#x57DF;&#x7684;&#x53D7;&#x4F53;&#x7ED3;&#x5408;&#x6D3B;&#x6027;&#x3002;

Activation of Stat proteins by cytokines is initiated by their Src homology 2 (SH2) domain-mediated association with the cytokine receptors. Previously, we identified an essential role of the coiled-coil domain of Stat3 in binding of the receptor peptides derived from the interleukin-6 receptor subunit, gp130. In this study, we further investigated the molecular basis of this regulation. We found that the C-terminal domain of Stat3 negatively regulates its receptor binding activity only in the absence of the first alpha-helix of the coiled-coil domain, which leads to a hypothesis of intramolecular interaction. Physical interactions between the coiled-coil domain and the C-terminal domain, as well as the SH2 domain, were indeed detected. Furthermore, a sub-region of the C-terminal domain (amino acids 720-740), which is also involved in the interaction with the coiled-coil domain, was demonstrated to be critical for the regulation of the receptor binding. Correspondingly, phosphorylation on Ser-727 within this region inhibits this interaction. In agreement with the peptide binding results, both the coiled-coil domain and the C-terminal sub-region are necessary for the functional recruitment of Stat3 to the cellular gp130 in response to interleukin-6, suggesting that the interdomain interaction is a prerequisite for the SH2-mediated receptor binding in interleukin-6 signaling.

Interdomain interaction of Stat3 regulates its Src homology 2 domain-mediated receptor binding activity.

Activation des prot&eacute;ines statistiques de cytokines est initi&eacute;e par leur association de 2 (SH2) par domaine d&#39;homologie Src avec les r&eacute;cepteurs de cytokines. Pr&eacute;c&eacute;demment, nous avons identifi&eacute; un r&ocirc;le essentiel du domaine coiled-coil de Stat3 dans les r&eacute;cepteurs des acides d&eacute;riv&eacute;s de la sous-unit&eacute; du r&eacute;cepteur de l&#39;interleukine-6, gp130. Dans cette &eacute;tude, nous avons examin&eacute; les bases mol&eacute;culaires du pr&eacute;sent r&egrave;glement. Nous avons trouv&eacute; que le domaine C-terminal de Stat3 r&eacute;gule n&eacute;gativement son r&eacute;cepteur liaison activit&eacute; qu&#39;en l&#39;absence de la premi&egrave;re h&eacute;lice alpha du domaine coiled-coil, qui conduit &agrave; une hypoth&egrave;se d&#39;une interaction intramol&eacute;culaire. Interactions physiques entre le domaine coiled-coil et le domaine C-terminal, ainsi que le domaine SH2, &eacute;taient en effet d&eacute;tect&eacute;es. En outre, une sous-r&eacute;gion du domaine C-terminal (acides amin&eacute;s 720-740), qui est &eacute;galement impliqu&eacute;e dans l&#39;interaction avec le domaine coiled-coil, a &eacute;t&eacute; d&eacute;montr&eacute;e comme critiques pour la r&eacute;gulation de la liaison aux r&eacute;cepteurs. En cons&eacute;quence, dans cette r&eacute;gion, la phosphorylation sur Ser-727 inhibe cette interaction. En accord avec les r&eacute;sultats de liaison peptidique, le domaine coiled-coil et la sous r&eacute;gion C-terminale sont n&eacute;cessaires pour le recrutement fonctionnel de Stat3 pour le gp130 cellulaire en r&eacute;ponse &agrave; l&#39;interleukine-6, ce qui sugg&egrave;re que l&#39;interaction entre domaines est une condition sine qua non pour la fixation aux r&eacute;cepteurs SH2-m&eacute;diation dans la signalisation de l&#39;interleukine-6.

Interaction entre domaines de Stat3 r&eacute;gule son activit&eacute; de liaison Src homologie 2 domaine par l&#39;interm&eacute;diaire du r&eacute;cepteur.

Interdomain Interaktion von Stat3 reguliert seine Src-Homologie 2-Dom&#xE4;ne-vermittelten Rezeptorbindungsaktivit&#xE4;t.

Attivazione delle proteine Stat da citochine &egrave; iniziata dal loro Src homology 2 (SH2) dominio-mediata associazione con i recettori delle citochine. In precedenza, abbiamo identificato un ruolo essenziale del dominio coiled-coil di Stat3 nell&#39;associazione dei peptidi del recettore derivato dalla subunit&agrave; del recettore interleuchina-6, gp130. In questo studio, abbiamo studiato ulteriormente la base molecolare di questo regolamento. Abbiamo trovato che il dominio C-terminale di Stat3 regola negativamente il suo recettore associazione attivit&agrave; solo in mancanza dell&#39;alfa-elica prima del dominio coiled-coil, che conduce a un&#39;ipotesi di interazione intramolecolare. Interazioni fisiche tra il dominio coiled-coil e il dominio C-terminale, come pure il dominio SH2, infatti sono state rilevate. Inoltre, una subregione del dominio C-terminale (aminoacidi 720-740), che &egrave; anche coinvolto nell&#39;interazione con il dominio coiled-coil, &egrave; stato dimostrato essere critici per il regolamento dell&#39;associazione del recettore. Corrispondentemente, la fosforilazione in Ser-727 all&#39;interno di questa regione inibisce questa interazione. In accordo con i risultati dell&#39;associazione del peptide, sia il dominio coiled-coil e la sub-regione C-terminale sono necessari per l&#39;assunzione funzionale di Stat3 per la gp130 cellulare in risposta a interleukin-6, suggerendo che l&#39;interazione tra domini &egrave; un prerequisito per l&#39;associazione del recettore SH2-mediata nella segnalazione di interleuchina-6.

Interazione tra domini di Stat3 regola la sua attivit&agrave; di associazione Src homology 2 recettore mediata dal dominio.

&#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x30AB;&#x30A4;&#x30F3;&#x306B;&#x3088;&#x308B; Stat &#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x30AB;&#x30A4;&#x30F3;&#x53D7;&#x5BB9;&#x4F53;&#x3068;&#x306E; Src &#x76F8;&#x540C;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x305F; 2 (SH2) &#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x958B;&#x59CB;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x4EE5;&#x524D;&#x306F;&#x3001;gp130 &#x30A4;&#x30F3;&#x30BF;&#x30FC;&#x30ED;&#x30A4;&#x30AD;&#x30F3; 6 &#x53D7;&#x5BB9;&#x4F53;&#x30B5;&#x30D6;&#x30E6;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C8;&#x304B;&#x3089;&#x6D3E;&#x751F;&#x3057;&#x305F;&#x53D7;&#x5BB9;&#x4F53;&#x306E;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x7D50;&#x5408;&#x306E; Stat3 &#x306E;&#x30B3;&#x30A4;&#x30EB;&#x30C9; &#x30B3;&#x30A4;&#x30EB; &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x306E;&#x5FC5;&#x9808;&#x306E;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;, &#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x3053;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306E;&#x5206;&#x5B50;&#x57FA;&#x76E4;&#x3092;&#x691C;&#x8A0E;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x306F;&#x3001;C &#x672B;&#x7AEF;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3; Stat3 &#x306E;&#x60AA;&#x5F71;&#x97FF;&#x305D;&#x306E;&#x53D7;&#x5BB9;&#x4F53;&#x306E;&#x5206;&#x5B50;&#x5185;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306E;&#x4EEE;&#x8AAC;&#x306B;&#x3064;&#x306A;&#x304C;&#x308B;&#x30B3;&#x30A4;&#x30EB;&#x30C9; &#x30B3;&#x30A4;&#x30EB; &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x306E;&#x6700;&#x521D;&#x306E;&#x30A2;&#x30EB;&#x30D5;&#x30A1;&#x87BA;&#x65CB;&#x306E;&#x4E0D;&#x5728;&#x3067;&#x306E;&#x307F;&#x6D3B;&#x52D5;&#x3092;&#x7D50;&#x5408;&#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x767A;&#x898B;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30B3;&#x30A4;&#x30EB;&#x30C9; &#x30B3;&#x30A4;&#x30EB; &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x3068; C &#x7AEF;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x3068;&#x3057;&#x3066; SH2 &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x9593;&#x306E;&#x7269;&#x7406;&#x7684;&#x306A;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306F;&#x78BA;&#x304B;&#x306B;&#x691C;&#x51FA;&#x3055;&#x308C;&#x305F;.&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x3001;&#x307E;&#x305F;&#x30B3;&#x30A4;&#x30EB;&#x30C9; &#x30B3;&#x30A4;&#x30EB; &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x3068;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306B;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3001;C &#x672B;&#x7AEF;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3; (&#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;&#x9178; 720-740&#xFF09;&#x3001;&#x30B5;&#x30D6;&#x5730;&#x57DF;&#x306E;&#x53D7;&#x5BB9;&#x4F53;&#x7D50;&#x5408;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x306B;&#x3064;&#x308C;&#x3066;&#x3001;&#x30EA;&#x30F3;&#x9178;&#x5316; Ser 727 &#x306B;&#x3053;&#x306E;&#x9818;&#x57DF;&#x5185;&#x3067;&#x3053;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x963B;&#x5BB3;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x7D50;&#x5408;&#x7D50;&#x679C;&#x3068;&#x4E00;&#x81F4;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x30B3;&#x30A4;&#x30EB;&#x30C9; &#x30B3;&#x30A4;&#x30EB; &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x3068; C &#x672B;&#x7AEF;&#x306E;&#x30B5;&#x30D6;&#x5730;&#x57DF; Stat3 &#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x52DF;&#x96C6;&#x7D30;&#x80DE; gp130 &#x306B;&#x5FDC;&#x3048;&#x3066;&#x30A4;&#x30F3;&#x30BF;&#x30FC;&#x30ED;&#x30A4;&#x30AD;&#x30F3;-6 &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x9593;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306F; SH2 &#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x305F;&#x53D7;&#x5BB9;&#x4F53;&#x7D50;&#x5408;&#x306E;&#x524D;&#x63D0;&#x6761;&#x4EF6;&#x306F;&#x3001;&#x30A4;&#x30F3;&#x30BF;&#x30FC;&#x30ED;&#x30A4;&#x30AD;&#x30F3; 6 &#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x4F1D;&#x9054;&#x306B;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x5FC5;&#x8981;&#x3067;&#x3059;&#x3002;

&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x9593;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306E; Stat3 &#x305D;&#x306E; Src &#x30DB;&#x30E2;&#x30ED;&#x30B8;&#x30FC; 2 &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x3092;&#x4ECB;&#x3059;&#x308B;&#x53D7;&#x5BB9;&#x4F53;&#x7D50;&#x5408;&#x6D3B;&#x6027;&#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

Cytokines&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; Stat &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xD65C;&#xC131;&#xD654;&#xB294; cytokine &#xC218;&#xC6A9; &#xCCB4;&#xC640; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; Src homology 2 (SH2) &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778; &#xC911;&#xC7AC; &#xD611;&#xD68C;&#xAC00; &#xC2DC;&#xC791; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xC804;&#xC5D0;, &#xC6B0;&#xB9AC; &#xC778;&#xD130; &#xB8E8; &#xD0A8;-6 &#xC218;&#xC6A9; &#xCCB4; &#xC18C; &#xB2E8;&#xC704;, gp130&#xC5D0;&#xC11C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD30C;&#xC0DD; &#xB41C; &#xC218;&#xC6A9; &#xCCB4; &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC;&#xC758; &#xBC14;&#xC778;&#xB529; Stat3 &#xCF54;&#xC77C; &#xCF54;&#xC77C; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;&#xC758; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xBC1C;&#xACAC;. &#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC6B0;&#xB9AC; &#xB354;&#xC774; &#xADDC;&#xC815;&#xC758; &#xBD84;&#xC790; &#xAE30;&#xC900;&#xC73C;&#xB85C; &#xC870;&#xC0AC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; stat3&#xC758; C-&#xD130;&#xBBF8;&#xB110; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778; intramolecular &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC758; &#xAC00;&#xC124;&#xC5D0; &#xC774;&#xB974;&#xAC8C; &#xCF54;&#xC77C; &#xCF54;&#xC77C; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;&#xC758; &#xCCAB; &#xBC88;&#xC9F8; &#xC54C;&#xD30C; &#xB098;&#xC120; &#xC5C6;&#xC744; &#xACBD;&#xC6B0;&#xC5D0;&#xB9CC; &#xD65C;&#xB3D9; &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xADF8;&#xAC83;&#xC758; &#xC218;&#xC6A9; &#xCCB4;&#xB97C; &#xC870;&#xC808; &#xBD80;&#xC815;&#xC801;&#xC778; &#xBC1C;&#xACAC;. SH2 &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778; &#xBFD0;&#xB9CC; &#xC544;&#xB2C8;&#xB77C; &#xCF54;&#xC77C; &#xCF54;&#xC77C; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778; C &#xD130;&#xBBF8;&#xB110; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778; &#xAC04;&#xC758; &#xC2E4;&#xC81C; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC5D0; &#xC2E4;&#xC81C;&#xB85C; &#xAC80;&#xC0C9; &#xB41C;. &#xB610;&#xD55C;, &#xB610;&#xD55C; &#xCF54;&#xC77C; &#xCF54;&#xC77C; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;&#xACFC; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC5D0; &#xAD00;&#xC5EC; &#xD558;&#xB294; C &#xD130;&#xBBF8;&#xB110; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778; (&#xC544;&#xBBF8;&#xB178;&#xC0B0; 720-740) &#xD558;&#xC704; &#xC218;&#xC6A9; &#xCCB4; &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xADDC;&#xCE59;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xAC83;&#xC744; &#xC2DC;&#xC5F0; &#xD588;&#xB2E4;. &#xB300;&#xC751; &#xD558; &#xC5EC;,&#xC774; &#xC9C0;&#xC5ED; &#xB0B4;&#xC5D0;&#xC11C; Ser-727&#xC5D0; &#xC778; &#xC0B0;&#xD654;&#xAC00; &#xC0C1;&#xD638;&#xC774; &#xC791;&#xC6A9;&#xC744; &#xC5B5;&#xC81C; &#xD55C;&#xB2E4;. &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC; &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xACB0;&#xACFC;&#xC640; &#xCF54;&#xC77C; &#xCF54;&#xC77C; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;&#xACFC; C &#xD130;&#xBBF8;&#xB110; &#xD558;&#xC704; &#xC140;&#xB8F0;&#xB7EC; gp130 &#xC778;&#xD130; &#xB8E8; &#xD0A8;-6, &#xC778;&#xD130; &#xB8E8; &#xD0A8;-6 &#xC2E0;&#xD638;&#xC5D0; &#xC6B0;&#xC120; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; SH2 &#xC911;&#xC7AC; &#xC218;&#xC6A9; &#xCCB4; &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xC704;&#xD55C; &#xD544;&#xC218;&#xB294; &#xC81C;&#xC548;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC751;&#xB2F5;&#xC744; Stat3 &#xAE30;&#xB2A5; &#xD68C;&#xC6D0; &#xBAA8;&#xC9D1;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; &#xD544;&#xC694; &#xD558;&#xB2E4;.

Stat3&#xC758; &#xC6B0;&#xC120; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC758; Src homology 2 &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778; &#xC911;&#xC7AC; &#xC218;&#xC6A9; &#xCCB4; &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xD65C;&#xB3D9;&#xC744; &#xC870;&#xC808;.

Activaci&oacute;n de prote&iacute;nas Stat por citoquinas se inicia por su asociaci&oacute;n de homolog&iacute;a 2 (SH2) mediada por el dominio de la fuente con los receptores de citoquinas. Previamente, identificamos un papel esencial del dominio coiled-coil de Stat3 en Uni&oacute;n de los p&eacute;ptidos del receptor derivado de la subunidad del receptor de interleucina-6, gp130. En este estudio, investigamos m&aacute;s la base molecular del presente Reglamento. Encontramos que el dominio c-terminal de Stat3 regula negativamente su receptor binding actividad s&oacute;lo en la ausencia de la primera h&eacute;lice alfa del dominio coiled-coil, que conduce a una hip&oacute;tesis de interacci&oacute;n intramolecular. De hecho, se detectaron interacciones f&iacute;sicas entre el dominio coiled-coil y el dominio c-terminal, as&iacute; como el dominio SH2. Adem&aacute;s, una subregi&oacute;n del dominio c-terminal (amino&aacute;cidos 720-740), que tambi&eacute;n est&aacute; implicada en la interacci&oacute;n con el dominio de coiled-coil, fue demostrado para ser cr&iacute;tico para la regulaci&oacute;n de la Uni&oacute;n del receptor. Correspondientemente, inhibe la fosforilaci&oacute;n en Ser-727 dentro de esta regi&oacute;n esta interacci&oacute;n. De acuerdo con los resultados de enlace de p&eacute;ptido, tanto en el dominio de coiled-coil y en la regi&oacute;n c-terminal son necesarias para el reclutamiento funcional de Stat3 a la gp130 celular en respuesta a la interleucina-6, lo que sugiere que la interacci&oacute;n entre dominios es un prerrequisito para el enlace del receptor mediada por SH2 en la se&ntilde;alizaci&oacute;n de la interleucina-6.

Interacci&oacute;n entre dominios de Stat3 regula su actividad fuente homolog&iacute;a 2 receptor mediada por dominio.

&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x8D28;&#x8F6C;&#x5F55;&#x56E0;&#x5B50;&#x53EF;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x56E0;&#x5B50;&#x548C;&#x751F;&#x957F;&#x56E0;&#x5B50;&#x4FE1;&#x53F7;&#x8F6C;&#x5BFC;&#x548C;&#x8F6C;&#x5F55;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x5B50; 3 (Stat3)&#x3002;Stat3 &#x5728;&#x7EC6;&#x80DE;&#x751F;&#x957F;&#x3001; &#x6297;&#x51CB;&#x4EA1;&#x548C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x8F6C;&#x5316;&#x4E2D;&#x626E;&#x6F14;&#x91CD;&#x8981;&#x89D2;&#x8272;&#xFF0C;&#x5E76;&#x5728;&#x5404;&#x79CD;&#x764C;&#x75C7;&#x4E2D;&#x4E00;&#x79EF;&#x6781;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7531;&#x9175;&#x6BCD;&#x53CC;&#x6742;&#x4EA4;&#x7B5B;&#x9009;&#x5BA1;&#x67E5;&#x5176;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x76D1;&#x7BA1;&#x673A;&#x6784;&#x3002;&#x51B7;&#x9177;-19 &#x57FA;&#x56E0;&#x4EA7;&#x54C1;&#x6709;&#x5173;&#x7684;&#x5E72;&#x6270;&#x7D20;-&beta; &#x548C;&#x7EF4;&#x7532;&#x9178;&#x9178;&#x8BF1;&#x53D1;&#x764C;&#x75C7;&#x7EC6;&#x80DE;&#x6B7B;&#x4EA1;&#xFF0C;&#x662F;&#x786E;&#x5B9A;&#x548C;&#x8BC1;&#x660E;&#x4E0E; Stat3 &#x5404;&#x79CD;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7C7B;&#x578B;&#x7684;&#x4EA4;&#x4E92;&#x3002;&#x4E92;&#x52A8;&#x662F;&#x5177;&#x4F53;&#x4E3A; Stat3&#xFF0C;&#x800C;&#x4E0D;&#x662F; Stat1 &#x548C; Stat5a&#x3002;&#x8FD9;&#x4E24;&#x79CD;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7684;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x5730;&#x533A;&#x88AB;&#x6620;&#x5C04;&#xFF0C;&#x5E76;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5B9A;&#x4F4D;&#x8FDB;&#x884C;&#x4E86;&#x5BA1;&#x67E5;&#x3002;&#x672C;&#x8EAB;&#x7684;&#x51B7;&#x9177; 19 co-localizes &#x4E0E;&#x7EBF;&#x7C92;&#x4F53;&#x6807;&#x8BB0;&#x548C;&#x5F62;&#x5F0F;&#x805A;&#x5408;&#x4E0E;&#x591A;&#x53D1;&#x6027;&#x9AA8;&#x9AD3;&#x7624; Stat3&#xFF0C;&#x6291;&#x5236; Stat3 &#x6838;&#x6613;&#x4F4D;&#x523A;&#x6FC0;&#x8868;&#x76AE;&#x7EC6;&#x80DE;&#x751F;&#x957F;&#x56E0;&#x5B50; (EGF) &#x7684; perinulear &#x5730;&#x533A;&#x3002;&#x51B7;&#x9177; 19 &#x538B;&#x6291; Stat3 &#x8F6C;&#x5F55;&#x6D3B;&#x6027;&#x548C;&#x5176;&#x76EE;&#x6807;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#xFF0C;&#x5E76;&#x8FD8;&#x6291;&#x5236; Src &#x8F6C;&#x5316;&#x7EC6;&#x80DE;&#x548C; Stat3 &#x8868;&#x8FBE;&#x7EC6;&#x80DE;&#x682A;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x751F;&#x957F;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x6570;&#x636E;&#x8868;&#x660E;&#x867D;&#x7136;&#x4E25;&#x9177; 19 &#x7684; Stat3 &#x7684;&#x65B0;&#x578B;&#x8D1F;&#x8C03;&#x8282;&#x3002;

&#x51B7;&#x9177;-19&#xFF0C;&#x6B7B;&#x4EA1;&#x76D1;&#x7BA1;&#x57FA;&#x56E0;&#x4EA7;&#x54C1;&#xFF0C;&#x6291;&#x5236; Stat3 &#x901A;&#x8FC7;&#x529F;&#x80FD;&#x4EA4;&#x4E92;&#x7684;&#x6D3B;&#x52A8;&#x3002;

Signal transducer and activator of transcription 3 (Stat3) is a latent cytoplasmic transcription factor that can be activated by cytokines and growth factors. Stat3 plays important roles in cell growth, anti-apoptosis and cell transformation, and is constitutively active in various cancers. We examined its potential regulators by yeast two-hybrid screening. GRIM-19, a gene product related to interferon-beta- and retinoic acid-induced cancer cell death, was identified and demonstrated to interact with Stat3 in various cell types. The interaction is specific for Stat3, but not for Stat1 and Stat5a. The interaction regions in both proteins were mapped, and the cellular localization of the interaction was examined. GRIM-19 itself co-localizes with mitochondrial markers, and forms aggregates at the perinulear region with co-expressed Stat3, which inhibits Stat3 nuclear translocation stimulated by epidermal growth factor (EGF). GRIM-19 represses Stat3 transcriptional activity and its target gene expression, and also suppresses cell growth in Src-transformed cells and a Stat3-expressing cell line. Our data suggest that GRIM-19 is a novel negative regulator of Stat3.

GRIM-19, a death-regulatory gene product, suppresses Stat3 activity via functional interaction.

Transducteur de signal et activateur de la transcription 3 (Stat3) est un facteur de transcription cytoplasmique latente pouvant &ecirc;tre activ&eacute;s par des cytokines et de facteurs de croissance. Stat3 joue un r&ocirc;le important dans la transformation de la croissance, anti-apoptose et cellule cellulaire et est constitutivement active dans divers cancers. Nous avons examin&eacute; ses r&eacute;gulateurs potentiels par la projection de deux-hybride de levure. GRIM-19, produit d&#39;un g&egrave;ne li&eacute; &agrave; l&#39;interf&eacute;ron-b&ecirc;ta - et r&eacute;tino&iuml;que la mort cellulaire induite par l&#39;acide du cancer, a &eacute;t&eacute; identifi&eacute; et d&eacute;montr&eacute; d&#39;interagir avec Stat3 dans divers types de cellules. L&#39;interaction est sp&eacute;cifique de Stat3, mais pas pour Stat1 et Stat5a. Les r&eacute;gions d&#39;interaction dans les deux prot&eacute;ines ont &eacute;t&eacute; cartographi&eacute;es et la localisation cellulaire de l&#39;interaction a &eacute;t&eacute; &eacute;tudi&eacute;e. GRIM-19 lui-m&ecirc;me co-localise avec marqueurs mitochondries et agr&eacute;gats de formes &agrave; la r&eacute;gion de perinulear avec co-exprim&eacute;e Stat3, qui inhibe la translocation nucl&eacute;aire de Stat3 stimul&eacute;e par le facteur de croissance &eacute;pidermique (EGF). GRIM-19 r&eacute;prime l&#39;activit&eacute; transcriptionnelle de Stat3 et son expression du g&egrave;ne cible et supprime &eacute;galement la croissance cellulaire dans les cellules transform&eacute;es par le Src et une lign&eacute;e de cellules exprimant Stat3. Nos r&eacute;sultats sugg&egrave;rent que le GRIM-19 est un nouveau r&eacute;gulateur n&eacute;gatif de Stat3.

GRIM-19, le produit d&#39;un g&egrave;ne de r&eacute;glementation et de la mort, supprime l&#39;activit&eacute; de Stat3 via l&#39;interaction fonctionnelle.

GRIM-19, ein Tod-regulatorische Genprodukt unterdr&#xFC;ckt Stat3-Aktivit&#xE4;t &#xFC;ber funktionelle Interaktion.

Trasduttore di segnale e attivatore della trascrizione 3 (Stat3) &egrave; un fattore di trascrizione citoplasmici latenti che pu&ograve; essere attivato da citochine e fattori di crescita. Stat3 &egrave; costitutivamente attive in vari tipi di cancro e svolge ruoli importanti nella trasformazione di crescita, anti-apoptosi e cella cella. Abbiamo esaminato i potenziali dei regolatori di screening di due-ibrido del lievito. GRIM-19, correlati a un prodotto del gene per l&#39;interferone-beta - e retinoico morte cellulare indotta da acido cancro, &egrave; stato identificato e ha dimostrato di interagire con Stat3 in vari tipi di cellule. L&#39;interazione &egrave; specifico per Stat3, ma non per Stat1 e Stat5a. Sono state mappate le regioni di interazione in entrambe le proteine, e la localizzazione cellulare di interazione &egrave; stata esaminata. GRIM-19 si co-localizes con marcatori mitocondriali e forme aggregati alla regione perinulear con espressi Stat3, che inibisce la traslocazione nucleare Stat3 stimolata dal fattore di crescita epidermico (EGF). GRIM-19 reprime attivit&agrave; transcriptional Stat3 e sua espressione genica e inoltre sopprime la crescita delle cellule in cellule trasformato Src e una linea cellulare che esprime Stat3. I nostri dati suggeriscono che GRIM-19 &egrave; un romanzo regolatore negativo di Stat3.

GRIM-19, un prodotto del gene morte-normativo, sopprime Stat3 attivit&agrave; tramite interazione funzionale.

&#x4FE1;&#x53F7;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30C7;&#x30E5;&#x30FC;&#x30B5;&#x30FC;&#x3068;&#x30A2;&#x30AF;&#x30C6;&#x30A3;&#x30D9;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC; (Stat3) &#x8EE2;&#x5199; 3 &#x306E;&#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x30AB;&#x30A4;&#x30F3;&#x3068;&#x6210;&#x9577;&#x56E0;&#x5B50;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x306A;&#x7D30;&#x80DE;&#x5185;&#x8EE2;&#x5199;&#x56E0;&#x5B50;&#x3067;&#x3059;&#x3002;Stat3 &#x7D30;&#x80DE;&#x6210;&#x9577;&#x3001;&#x6297;&#x30A2;&#x30DD;&#x30C8;&#x30FC;&#x30B7;&#x30B9;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x5F62;&#x8CEA;&#x8EE2;&#x63DB;&#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x679C;&#x305F;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3057;&#x3001;&#x69D8;&#x3005; &#x306A;&#x764C;&#x3067;&#x6052;&#x5E38;&#x6D3B;&#x6027;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x305D;&#x306E;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x306A;&#x30EC;&#x30AE;&#x30E5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30BF;&#x9175;&#x6BCD;&#x30C4;&#x30FC;&#x30CF;&#x30A4;&#x30D6;&#x30EA;&#x30C3;&#x30C9;&#x6CD5;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x691C;&#x8A0E;&#x3057;&#x305F;.&#x30B0;&#x30EA;&#x30E0; 19 &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x7523;&#x7269;&#x306E;&#x95A2;&#x9023;&#x3059;&#x308B;&#x30A4;&#x30F3;&#x30BF;&#x30FC;&#x30D5;&#x30A7;&#x30ED;&#x30F3;-&#x30D9;&#x30FC;&#x30BF;&#x3068;&#x30EC;&#x30C1;&#x30CE;&#x30A4;&#x30F3;&#x9178;&#x8A98;&#x767A;&#x304C;&#x3093;&#x7D30;&#x80DE;&#x6B7B;&#x3001;&#x8B58;&#x5225;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x5206;&#x6790; Stat3 &#x3068;&#x3055;&#x307E;&#x3056;&#x307E;&#x306A;&#x30BB;&#x30EB;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D7;&#x3067;&#x5BFE;&#x8A71;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x5B9F;&#x8A3C;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306F;&#x7279;&#x5B9A;&#x3067;&#x3059; Stat3 &#x306E;&#x306A;&#x304F;&#x3001;Stat1 &#x3068; Stat5a &#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x3002;&#x4E21;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x9818;&#x57DF;&#x306B;&#x30DE;&#x30C3;&#x30D7;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3068;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x5C40;&#x5728;&#x3092;&#x8ABF;&#x3079;&#x305F;.&#x30B0;&#x30EA;&#x30E0; 19 &#x81EA;&#x4F53;&#x306F;&#x30DF;&#x30C8;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C9;&#x30EA;&#x30A2;&#x306E;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x3068;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0;&#x96C6;&#x8A08; Stat3 &#x6838;&#x79FB;&#x884C;&#x4E0A;&#x76AE;&#x6210;&#x9577;&#x56E0;&#x5B50; (EGF) &#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x523A;&#x6FC0;&#x3092;&#x6291;&#x5236;&#x3059;&#x308B;&#x30B7;&#x30E7;&#x30A6;&#x30B8;&#x30E7;&#x30A6;&#x30D0;&#x30A8;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0; Stat3 &#x3068; perinulear &#x5730;&#x57DF;&#x3067; co-localizes &#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30B0;&#x30EA;&#x30E0; 19 Stat3 &#x8EE2;&#x5199;&#x6D3B;&#x6027;&#x3068;&#x305D;&#x306E;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x6291;&#x5236;&#x3057;&#x3066;&#x3082; Src &#x5909;&#x63DB;&#x7D30;&#x80DE;&#x304A;&#x3088;&#x3073; Stat3 &#x8868;&#x73FE;&#x306E;&#x30BB;&#x30EB;&#x30E9;&#x30A4;&#x30F3;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x6210;&#x9577;&#x3092;&#x6291;&#x5236;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306F;&#x3001;&#x30B0;&#x30EA;&#x30E0; 19 Stat3 &#x306E;&#x5C0F;&#x8AAC;&#x306E;&#x8CA0;&#x30EC;&#x30AE;&#x30E5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30BF;&#x304C;&#x793A;&#x5506;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

&#x30B0;&#x30EA;&#x30E0;-19&#x3001;&#x6B7B;&#x898F;&#x5236;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x7523;&#x7269;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066; Stat3 &#x6D3B;&#x6027;&#x3092;&#x6291;&#x5236;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#xC2E0;&#xD638; &#xBCC0;&#xD658;&#xAE30; &#xBC0F; &#xD65C;&#xC131; &#xC81C; 3&#xC758; &#xC804;&#xC0AC;&#xC758; (Stat3) cytokines &#xBC0F; &#xC131;&#xC7A5; &#xC694;&#xC778;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xB420; &#xC218; &#xC788;&#xB294; &#xC7A0;&#xC7AC; &#xB41C; &#xC138;&#xD3EC;&#xC9C8; &#xC804;&#xC0AC; &#xC694;&#xC18C; &#xC774;&#xB2E4;. Stat3 &#xC138;&#xD3EC; &#xC131;&#xC7A5;, &#xC548;&#xD2F0; apoptosis &#xBC0F; &#xC138;&#xD3EC; &#xBCC0;&#xD654;&#xC5D0; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xC7AC;&#xC0DD; &#xD558; &#xACE0; constitutively &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xC554;&#xC5D0; &#xC801;&#xADF9;&#xC801; &#xC774;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC; &#xD6A8; &#xBAA8; 2 &#xC7A1;&#xC885; &#xC2EC;&#xC0AC;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xADF8; &#xC7A0;&#xC7AC;&#xC801;&#xC778; &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774; &#xD130;&#xB97C; &#xAC80;&#xC0AC;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB9BC; 19 &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC81C;&#xD488; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xC778;&#xD130;&#xD398;&#xB860;-&#xBCA0;&#xD0C0;-&#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; retinoic &#xC0B0;&#xC744; &#xC774;&#xC6A9;&#xD55C; &#xC554; &#xC138;&#xD3EC; &#xC8FD;&#xC74C; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD558; &#xACE0; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xC140; &#xD615;&#xC2DD;&#xC5D0; Stat3 &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC744; &#xC2DC;&#xC5F0; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC740; &#xD2B9;&#xC815; Stat3, &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xD558;&#xC9C0; Stat1 &#xBC0F; Stat5a. &#xB450; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; &#xC601;&#xC5ED;, &#xB9E4;&#xD551;&#xB41C; &#xBC0F; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC758; &#xC140;&#xB8F0;&#xB7EC; &#xC9C0;&#xC5ED;&#xD654; &#xC870;&#xC0AC; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB9BC; 19 &#xC790;&#xCCB4; &#xBBF8;&#xD1A0; &#xCF58; &#xB4DC; &#xB9AC;&#xC544; &#xB9C8;&#xCEE4;&#xC640; Stat3 &#xD575; &#xC804; &#xD45C; &#xD53C; &#xC131;&#xC7A5; &#xC778;&#xC790; (EGF)&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC790;&#xADF9;&#xB41C;&#xC744; &#xC5B5;&#xC81C; &#xD558;&#xB294; co-expressed Stat3 perinulear &#xC9C0;&#xC5ED;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC591;&#xC2DD; &#xC9D1;&#xACC4;&#xC640; &#xD568;&#xAED8; co-localizes. &#xADF8;&#xB9BC; 19 &#xB204;&#xB974;&#xB294; Stat3 transcriptional &#xD65C;&#xB3D9;&#xACFC; &#xADF8; &#xB300;&#xC0C1; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604; &#xBC0F; Src &#xBCC0;&#xD615; &#xC804;&#xC9C0;&#xC640; Stat3 &#xD45C;&#xD604; &#xC140; &#xB77C;&#xC778;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC138;&#xD3EC; &#xC131;&#xC7A5;&#xC744; &#xD45C;&#xC2DC; &#xD558;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xADF8;&#xB9BC; 19 stat3&#xC758; &#xC18C;&#xC124; &#xB124;&#xAC70;&#xD2F0;&#xBE0C; &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774; &#xD130;&#xB294; &#xAC83;&#xC774; &#xC88B;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xCFE1;-19, &#xC0AC;&#xB9DD; &#xADDC;&#xC81C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC81C;&#xD488; &#xAE30;&#xB2A5; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC744; &#xD1B5;&#xD574; Stat3 &#xD65C;&#xB3D9;&#xC744; &#xC5B5;&#xC81C;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Transductor de se&ntilde;al y activador de la transcripci&oacute;n 3 (Stat3) es un factor de transcripci&oacute;n citopl&aacute;smicos latente que puede ser activado por citoquinas y factores de crecimiento. STAT3 juega un papel importante en la transformaci&oacute;n de la c&eacute;lula de crecimiento y anti-apoptosis de la c&eacute;lula y es constitutivamente activa en varios tipos de c&aacute;ncer. Examinamos sus reguladores potenciales por la proyecci&oacute;n de dos h&iacute;bridos de levadura. GRIM-19, un producto g&eacute;nico relacionadas con interfer&oacute;n-beta - y retinoico de la muerte de la c&eacute;lula de c&aacute;ncer inducido por &aacute;cido, fue identificado y demostrado que para interactuar con Stat3 en diversos tipos celulares. La interacci&oacute;n es espec&iacute;fica para Stat3, pero no para Stat1 y Stat5a. Se mapearon las regiones de interacci&oacute;n de ambas prote&iacute;nas, y examinaron la localizaci&oacute;n celular de la interacci&oacute;n. GRIM-19 s&iacute; mismo co-localizes con marcadores mitocondriales y agregados de formas en la regi&oacute;n de perinulear con co-expressed Stat3, que inhibe la translocaci&oacute;n nuclear de Stat3 estimulada por el factor de crecimiento epid&eacute;rmico (EGF). GRIM-19 reprime la actividad transcripcional de Stat3 y su expresi&oacute;n g&eacute;nica de destino y tambi&eacute;n suprime el crecimiento celular en las c&eacute;lulas transformadas fuente y una l&iacute;nea celular de Stat3-expresi&oacute;n. Nuestros datos sugieren que GRIM-19 es un regulador negativo novela de Stat3.

GRIM-19, un producto de la muerte-regulador g&eacute;nico, suprime la actividad de Stat3 v&iacute;a la interacci&oacute;n funcional.

DNA &#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x662F;&#x54FA;&#x4E73;&#x52A8;&#x7269;&#x53D1;&#x5C55;&#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5173;&#x952E;&#x8868;&#x89C2;&#x9057;&#x4F20;&#x76D1;&#x7BA1;&#x673A;&#x6784;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x76EE;&#x524D;&#x4F7F;&#x7528;&#x7684;&#x4E09;&#x4E2A;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7C7B;&#x578B;&#x8868;&#x793A;&#x5206;&#x9636;&#x6BB5;&#x9010;&#x6B65;&#x5206;&#x5316;&#x7684;&#x4E9A;&#x786B;&#x9178;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x7684; DNA &#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x7684;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6BD4;&#x8F83;&#x89C6;&#x56FE;&#xFF1A; &#x4EBA;&#x7C7B;&#x80DA;&#x80CE;&#x5E72;&#x7EC6;&#x80DE; (hESCs)&#x3001; hESCs &#x548C;&#x65B0;&#x751F;&#x513F;&#x7684;&#x6210;&#x7EA4;&#x7EF4;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x6210;&#x7EA4;&#x7EF4;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5206;&#x5316;&#x7684;&#x884D;&#x751F;&#x3002;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x53C2;&#x8003;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x6BD4;&#x6211;&#x4EEC;&#x6210;&#x719F;&#x7684;&#x5916;&#x5468;&#x8840;&#x5355;&#x4E2A;&#x6838;&#x7EC6;&#x80DE; (&#x5355;&#x6838;&#x7EC6;&#x80DE;) &#x4E0E;&#x5145;&#x5206;&#x5206;&#x5316;&#x578B;&#x6210;&#x4EBA;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7C7B;&#x578B;&#xFF0C;methylome &#x5730;&#x56FE;&#x7684;&#x5730;&#x56FE;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x89C2;&#x5BDF;&#x5230;&#x6240;&#x6709;&#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7C7B;&#x578B;&#x4E4B;&#x95F4;&#x8BB8;&#x591A;&#x663E;&#x8457;&#x5171;&#x540C;&#x548C;&#x7279;&#x5B9A;&#x4E8E;&#x7C7B;&#x578B;&#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#x3002;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x533A;&#x7532;&#x57FA; (CG &#x548C; CA) &#x548C;&#x66F4;&#x9AD8;&#x6C34;&#x5E73;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x4F53;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x88AB;&#x8F6C;&#x5F55;&#x7684;&#x6240;&#x6709;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7C7B;&#x578B;&#x4E0E;&#x6210;&#x6B63;&#x6BD4;&#x3002;&#x7528;&#x4E86;&#x6BD4;&#x5185;&#x542B;&#x5B50;&#xFF0C;&#x66F4;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x53CA;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x7684;&#x7A81;&#x7136;&#x8F6C;&#x6362;&#x53D1;&#x751F;&#x5728;&#x5916;&#x663E;&#x5B50;&#x5185;&#x542B;&#x5B50;&#x8FB9;&#x754C;&#xFF0C;&#x8868;&#x660E;&#x5DEE;&#x5F02;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x6210;&#x7EE9;&#x5355;&#x62FC;&#x63A5;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E24;&#x4E2A;&#x7EA7;&#x522B;&#x7684;&#x5168;&#x7403;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x548C;&#x975E; CpG &#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#xFF0C;&#x4E0E; hESC &#x6700;&#x9AD8;&#x3001; &#x4E2D;&#x95F4;&#x4F53;&#x6210;&#x7EA4;&#x7EF4;&#x7EC6;&#x80DE;&#x3001; &#x5355;&#x6838;&#x7EC6;&#x80DE;&#x6700;&#x4F4E;&#x7A0B;&#x5EA6;&#x53CD;&#x6620;&#x4E86;&#x53D1;&#x5C55;&#x9636;&#x6BB5;&#x3002;&#x53D1;&#x80B2;&#x8C03;&#x8282;&#x57FA;&#x56E0;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC; HOX &#x96C6;&#x7FA4;&#x3001; &#x5176;&#x4ED6;&#x540C;&#x6E90;&#x76D2;&#x57FA;&#x56E0;&#x8F6C;&#x5F55;&#x56E0;&#x5B50;&#x548C; pluripotence &#x76F8;&#x5173;&#x57FA;&#x56E0; POU5F1&#x3001; TCF3&#x3001; KLF4 &#x7B49;&#x89C2;&#x5BDF;&#x5230;&#x5206;&#x5316;&#x76F8;&#x5173;&#x5DEE;&#x5F02;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x8C31;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x7ED3;&#x679C;&#x7A81;&#x51FA;&#x663E;&#x793A;&#x7684;&#x9AD8;&#x5206;&#x8FA8;&#x7387;&#x7684;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x5730;&#x56FE;&#xFF0C;&#x8FDE;&#x540C;&#x5176;&#x4ED6;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x4E00;&#x7EA7;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x3001; &#x8C03;&#x67E5;&#x4EE5;&#x524D;&#x65E0;&#x6CD5;&#x63A2;&#x6D4B;&#x7684;&#x53D1;&#x5C55;&#x7BA1;&#x5236;&#x673A;&#x5236;&#x7684;&#x4EF7;&#x503C;&#x3002;

&#x5728;&#x4EBA;&#x7C7B; methylome &#x5206;&#x5316;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x4E2D;&#x7684;&#x52A8;&#x6001;&#x53D8;&#x5316;&#x3002;

DNA methylation is a critical epigenetic regulator in mammalian development. Here, we present a whole-genome comparative view of DNA methylation using bisulfite sequencing of three cultured cell types representing progressive stages of differentiation: human embryonic stem cells (hESCs), a fibroblastic differentiated derivative of the hESCs, and neonatal fibroblasts. As a reference, we compared our maps with a methylome map of a fully differentiated adult cell type, mature peripheral blood mononuclear cells (monocytes). We observed many notable common and cell-type-specific features among all cell types. Promoter hypomethylation (both CG and CA) and higher levels of gene body methylation were positively correlated with transcription in all cell types. Exons were more highly methylated than introns, and sharp transitions of methylation occurred at exon-intron boundaries, suggesting a role for differential methylation in transcript splicing. Developmental stage was reflected in both the level of global methylation and extent of non-CpG methylation, with hESC highest, fibroblasts intermediate, and monocytes lowest. Differentiation-associated differential methylation profiles were observed for developmentally regulated genes, including the HOX clusters, other homeobox transcription factors, and pluripotence-associated genes such as POU5F1, TCF3, and KLF4. Our results highlight the value of high-resolution methylation maps, in conjunction with other systems-level analyses, for investigation of previously undetectable developmental regulatory mechanisms.

Dynamic changes in the human methylome during differentiation.

M&eacute;thylation de l&#39;ADN est un r&eacute;gulateur &eacute;pig&eacute;n&eacute;tique critique dans le d&eacute;veloppement chez les mammif&egrave;res. Nous pr&eacute;sentons ici une vue comparative du g&eacute;nome entier de m&eacute;thylation de l&#39;ADN du bisulfite de s&eacute;quen&ccedil;age de trois types de cellules cultiv&eacute;es qui repr&eacute;sentent des &eacute;tapes progressives de la diff&eacute;renciation : les cellules souches embryonnaires humaines (CSEh), un d&eacute;riv&eacute; fibroblastique diff&eacute;renci&eacute; des CSEh et fibroblastes n&eacute;onatales. Comme r&eacute;f&eacute;rence, nous avons compar&eacute; nos cartes avec une carte de m&eacute;thylome d&#39;un type de cellule adulte compl&egrave;tement diff&eacute;renci&eacute;es, les cellules mononucl&eacute;aires de sang p&eacute;riph&eacute;rique mature (monocytes). Nous avons observ&eacute; plusieurs caract&eacute;ristiques notables de cellule-type sp&eacute;cifique et communs parmi tous les types de cellules. Promoteur hypom&eacute;thylation (CG et CA) et des niveaux plus &eacute;lev&eacute;s de la m&eacute;thylation de corps g&egrave;ne &eacute;taient corr&eacute;l&eacute;s avec la transcription dans tous les types de cellules. Exons ont &eacute;t&eacute; plus fortement m&eacute;thyl&eacute;s qu&#39;introns et transitions nettes de m&eacute;thylation ont eu lieu aux limites de l&#39;exon-intron, sugg&eacute;rant un r&ocirc;le pour la m&eacute;thylation diff&eacute;rentielle dans l&#39;&eacute;pissage de transcription. Stade de d&eacute;veloppement s&#39;est traduit par le niveau de m&eacute;thylation global et l&#39;&eacute;tendue des CpG non m&eacute;thylation, CSEh plus &eacute;lev&eacute;, interm&eacute;diaire de fibroblastes et monocytes plus bas. Profils de m&eacute;thylation diff&eacute;rentielle associ&eacute;e &agrave; la diff&eacute;renciation ont &eacute;t&eacute; observ&eacute;es pour les g&egrave;nes d&eacute;veloppemental r&eacute;gl&eacute;s, y compris les clusters HOX, autres facteurs de transcription hom&eacute;otique et g&egrave;nes associ&eacute;s &agrave; la pluripotence, comme POU5F1, TCF3 et KLF4. Nos r&eacute;sultats mettent en &eacute;vidence la valeur des cartes &agrave; haute r&eacute;solution de m&eacute;thylation, conjointement avec d&#39;autres analyses au niveau des syst&egrave;mes, pour l&#39;investigation des m&eacute;canismes de r&eacute;gulation du d&eacute;veloppement pr&eacute;c&eacute;demment ind&eacute;tectables.

Changements dynamiques dans la m&eacute;thylome humaine au cours de la diff&eacute;renciation.

Metilaci&oacute;n del ADN es un cr&iacute;tico regulador epigen&eacute;tico en el desarrollo de los mam&iacute;fero. Aqu&iacute;, presentamos una visi&oacute;n comparativa de todo el genoma de la metilaci&oacute;n del ADN mediante secuenciaci&oacute;n de bisulfito de tres tipos de cultivo de c&eacute;lulas que representan etapas progresivas de la diferenciaci&oacute;n: c&eacute;lulas madre embrionarias humanas (hESCs), un derivado fibrobl&aacute;stico diferenciado del hESCs y fibroblastos neonatales. Como referencia, comparamos nuestros mapas con un mapa del metiloma de un tipo de c&eacute;lula adulta totalmente diferenciada, las c&eacute;lulas mononucleares de sangre perif&eacute;rica maduro (monocitos). Observamos muchas caracter&iacute;sticas notables de c&eacute;lula-tipo-espec&iacute;ficas y comunes entre todos los tipos de c&eacute;lulas. Hipometilaci&oacute;n del promotor (CG y CA) y niveles m&aacute;s altos de metilaci&oacute;n del gen cuerpo se correlacionan positivamente con la transcripci&oacute;n en todos los tipos celulares. Exones eran m&aacute;s altamente metilados de intrones y transiciones n&iacute;tidas de metilaci&oacute;n ocurrieron en los l&iacute;mites del ex&oacute;n-intr&oacute;n, sugiriendo un papel de metilaci&oacute;n diferencial en la transcripci&oacute;n. Etapa de desarrollo se reflej&oacute; en el nivel de metilaci&oacute;n global y el grado de metilaci&oacute;n no-CpG, con hESC m&aacute;s alto, intermedio de fibroblastos y monocitos m&aacute;s bajos. Perfiles de metilaci&oacute;n diferencial asociada a la diferenciaci&oacute;n observaron desarrollo regulados genes, incluyendo los grupos HOX, otros factores de transcripci&oacute;n homeobox y genes asociados pluripotence como POU5F1, TCF3 y KLF4. Nuestros resultados destacan el valor de mapas de alta resoluci&oacute;n de metilaci&oacute;n, junto con otros an&aacute;lisis de nivel de sistemas, para la investigaci&oacute;n de los mecanismos de desarrollo previamente indetectables.

Cambios din&aacute;micos en el metiloma humano durante la diferenciaci&oacute;n.

DNA-Methylierung ist ein kritischer epigenetische Regulator in der S&auml;ugetier-Entwicklung. Hier pr&auml;sentieren wir ganz-Genom komparativen Perspektive der DNA-Methylierung mit Bisulfit-Sequenzierung von drei kultivierten Zelltypen, die schrittweise Differenzierung: menschlicher embryonaler Stammzellen (Zellkulturen), eine fibroblastic differenzierte Ableitung der Zellkulturen und neonatale Fibroblasten. Als Referenz verglichen wir unsere Karten mit einer Methylome-Karte vollst&auml;ndig differenzierten Erwachsenen Zelle Art, Reifen peripheren mononukle&auml;ren Blutzellen (Monozyten). Wir beobachteten viele bemerkenswerte gemeinsame und Zelle-Typ-spezifische Eigenschaften unter allen Zelltypen. Projekttr&auml;ger Hypomethylierung (CG und CA) und h&ouml;heren Ebenen der Gen-K&ouml;rper-Methylierung wurden mit Transkription in alle Zelltypen positiv korreliert. Exon waren mehr hoch methylierte als Introns und scharfe &Uuml;berg&auml;nge der Methylierung ist aufgetreten bei Exon-Intron-Grenzen, schl&auml;gt eine Rolle f&uuml;r differenzielle Methylierung in Abschrift Splei&szlig;en. Entwicklungsstadium spiegelte sich sowohl auf der Ebene der globalen Methylierung und Umfang der nicht-CpG Methylierung mit hESC h&ouml;chste, Fibroblasten zwischen- und Monozyten niedrigsten. Differenzierung-assoziierte differenzielle Methylierung-Profile wurden f&uuml;r entwicklungspolitisch regulierter Gene, darunter die HOX-Cluster, andere Homeobox Transkriptionsfaktoren und Pluripotence-assoziierten Gene wie POU5F1 TCF3 und KLF4 beobachtet. Unsere Ergebnisse zeigen den Wert von hochaufl&ouml;senden Methylierung Landkarten, in Verbindung mit anderen Systemebene-Analysen zur Untersuchung von zuvor nicht nachweisbar Entwicklungsst&ouml;rungen Regelungsmechanismen.

Dynamische Ver&auml;nderungen der menschlichen Methylome w&auml;hrend der Differenzierung.

Metilazione del DNA &egrave; un regolatore epigenetico critico nello sviluppo dei mammiferi. Qui di seguito, presentiamo una visione comparativa intero genoma di metilazione del DNA mediante sequenziamento del bisolfuro di tre tipi di cellule coltivate che rappresentano stadi progressivi di differenziazione: cellule staminali embrionali umane (hESC), un derivato fibroblastico differenziato delle hESC e fibroblasti neonatali. Come riferimento, abbiamo confrontato le nostre mappe con methylome in una mappa di un tipo di cellula adulta pienamente differenziati, maturo mononucleari di sangue periferico le cellule (monociti). Abbiamo osservato molti notevoli caratteristiche comuni e specifici del tipo di cella tra tutti i tipi di cellule. Promotore ipometilazione (CG e CA) e livelli pi&ugrave; elevati di metilazione corpo gene sono state positivamente correlati con trascrizione in tutti i tipi di cellule. Esoni erano pi&ugrave; altamente metilati di introni, e taglienti transizioni di metilazione si &egrave; verificato presso i confini introne-esone, suggerendo un ruolo per differenziali di metilazione in trascrizione lo splicing. Fase dello sviluppo &egrave; stato riflesso nel livello di metilazione globale e misura di non-CpG metilazione, con hESC pi&ugrave; alto, intermedio di fibroblasti e monociti pi&ugrave; bassi. Profili differenziali di metilazione differenziazione associati sono stati osservati per evolutivamente geni, tra cui il cluster HOX, altri fattori di trascrizione homeobox e geni associati al pluripotence come POU5F1, TCF3 e KLF4. I nostri risultati evidenziano il valore di mappe ad alta risoluzione metilazione, in concomitanza con altre analisi del livello dei sistemi, per indagine dei meccanismi di regolamentazione dello sviluppo in precedenza non rilevabili.

Cambiamenti dinamici nella methylome umana durante la differenziazione.

DNA &#x306E;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x306F;&#x54FA;&#x4E73;&#x985E;&#x306E;&#x958B;&#x767A;&#x3067;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x30A8;&#x30D4;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CD;&#x30C6;&#x30A3;&#x30C3;&#x30AF;&#x306A;&#x30EC;&#x30AE;&#x30E5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30BF;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x6211;&#x3005; &#x306E;&#x5206;&#x5316;&#x306E;&#x9032;&#x884C;&#x6BB5;&#x968E;&#x3092;&#x8868;&#x3059; 3 &#x3064;&#x306E;&#x57F9;&#x990A;&#x7D30;&#x80DE;&#x578B;&#x306E;&#x91CD;&#x4E9C;&#x786B;&#x9178;&#x5869;&#x306E;&#x914D;&#x5217;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066; DNA &#x306E;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x306E;&#x5168;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x6BD4;&#x8F03;&#x30D3;&#x30E5;&#x30FC;&#x3092;&#x63D0;&#x793A;: &#x30D2;&#x30C8;&#x80DA;&#x6027;&#x5E79;&#x7D30;&#x80DE; &#xFF08;hESCs&#xFF09;&#x3001;hESCs&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x65B0;&#x751F;&#x5150;&#x7DDA;&#x7DAD;&#x82BD;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x5206;&#x5316;&#x8A98;&#x5C0E;&#x4F53;&#x306E;&#x7DDA;&#x7DAD;&#x82BD;&#x3002;&#x53C2;&#x7167;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x79C1;&#x305F;&#x3061;&#x306F;&#x79C1;&#x305F;&#x3061;&#x306E;&#x30DE;&#x30C3;&#x30D7;&#x306F;&#x5B8C;&#x5168;&#x306B;&#x5206;&#x5316;&#x3057;&#x305F;&#x5927;&#x4EBA;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x578B;&#x306E;&#x5206;&#x5316;&#x7CFB;&#x5217;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x30E1;&#x30C1;&#x30ED;&#x30FC;&#x30E0;&#x5730;&#x56F3;&#x3092;&#x6BD4;&#x8F03;&#x3001;&#x6210;&#x719F;&#x3057;&#x305F;&#x672B;&#x68A2;&#x8840;&#x5358;&#x6838;&#x7D30;&#x80DE; (&#x5358;&#x7403;&#x3060;&#xFF09;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x306F;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x6CE8;&#x76EE;&#x306B;&#x5024;&#x3059;&#x308B;&#x5171;&#x901A;&#x3068;&#x7D30;&#x80DE;&#x578B;&#x7279;&#x7570;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D7;&#x9593;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3002;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x4F4E;&#x3044;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316; (CG &#x3068; CA &#x306E;&#x4E21;&#x65B9;) &#x3068;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x4F53;&#x306E;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x306E;&#x3088;&#x308A;&#x9AD8;&#x3044;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306E;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x30BB;&#x30EB;&#x306E;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D7;&#x8EE2;&#x5199;&#x76F8;&#x95A2;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30A8;&#x30AF;&#x30BD;&#x30F3;&#x304C;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x3088;&#x308A;&#x3082;&#x3088;&#x308A;&#x9AD8;&#x3044;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3; &#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x3092;&#x30B9;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x306B;&#x5DEE;&#x52D5;&#x306E;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x306E;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x306E;&#x30A8;&#x30AF;&#x30BD;&#x30F3; &#x30FB; &#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x5883;&#x754C;&#x3067;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x306E;&#x6025;&#x6FC0;&#x306A;&#x9077;&#x79FB;&#x304C;&#x767A;&#x751F;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x767A;&#x9054;&#x6BB5;&#x968E;&#x306F;&#x30B0;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D0;&#x30EB;&#x306A;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3068; hESC &#x6700;&#x9AD8;&#x3001;&#x7DDA;&#x7DAD;&#x82BD;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x4E2D;&#x9593;&#x3001;&#x6700;&#x4F4E;&#x306E;&#x5358;&#x7403;&#x306E;&#x975E; CpG &#x306E;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x306E;&#x7A0B;&#x5EA6;&#x306B;&#x53CD;&#x6620;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;HOX &#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF;&#x30FC;&#x306A;&#x3069;&#x4ED6;&#x30DB;&#x30E1;&#x30AA; &#x30DC;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B9;&#x8EE2;&#x5199;&#x56E0;&#x5B50;&#x3001;POU5F1&#x3001;TCF3&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073; KLF4 &#x306A;&#x3069;&#x306E; pluripotence &#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3001;&#x767A;&#x9054;&#x306B;&#x8ABF;&#x6574;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x5206;&#x5316;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x5DEE;&#x5206;&#x306E;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EB;&#x304C;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x306F;&#x3001;&#x4EE5;&#x524D;&#x691C;&#x51FA;&#x4E0D;&#x53EF;&#x80FD;&#x306A;&#x767A;&#x9054;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x6A5F;&#x69CB;&#x306E;&#x8ABF;&#x67FB;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x4ED6;&#x306E;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0; &#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x5206;&#x6790;&#x3068;&#x7D44;&#x307F;&#x5408;&#x308F;&#x305B;&#x3066;&#x306E;&#x9AD8;&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;&#x306E;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x30DE;&#x30C3;&#x30D7;&#x306E;&#x5024;&#x3092;&#x5F37;&#x8ABF;&#x8868;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x5206;&#x5316;&#x904E;&#x7A0B;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x4EBA;&#x9593;&#x306E;&#x5206;&#x5316;&#x7CFB;&#x5217;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x30E1;&#x30C1;&#x30ED;&#x30FC;&#x30E0;&#x306E;&#x52D5;&#x7684;&#x5909;&#x5316;&#x3002;

DNA &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654;&#xB294; &#xD3EC;&#xC720;&#xB958; &#xAC1C;&#xBC1C;&#xC5D0; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; epigenetic &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774; &#xD130;. &#xC5EC;&#xAE30;, &#xC120;&#xBB3C;&#xC774; &#xCC28;&#xBCC4;&#xD654;&#xC758; &#xC9C4;&#xBCF4;&#xC801;&#xC778; &#xB2E8;&#xACC4;&#xB97C; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; 3 &#xAC1C;&#xC758; &#xAD50;&#xC591;&#xB41C; &#xC140; &#xD615;&#xC2DD;&#xC758; &#xD669;&#xC0B0; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; DNA &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654;&#xC758; &#xC804;&#xCCB4; &#xAC8C;&#xB188; &#xBE44;&#xAD50; &#xBCF4;&#xAE30;: &#xC778;&#xAC04; &#xBC30;&#xC544; &#xC904;&#xAE30; &#xC138;&#xD3EC; (hESCs), hESCs, &#xBC0F; &#xC2E0;&#xC0DD;&#xC544; &#xC12C;&#xC720; &#xC544; &#xC138;&#xD3EC;&#xC758; fibroblastic &#xCC28;&#xBCC4;&#xD654; &#xB41C; &#xD30C;&#xC0DD;. &#xCC38;&#xACE0;&#xB85C;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC644;&#xBCBD; &#xD558; &#xAC8C; &#xCC28;&#xBCC4;&#xD654; &#xB41C; &#xC131;&#xC778; &#xC140; &#xD615;&#xC2DD;&#xC758; methylome &#xC9C0;&#xB3C4;&#xC640; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xC9C0;&#xB3C4; &#xC131;&#xC219;&#xD55C; &#xB9D0; &#xCD08; &#xD608;&#xC561; &#xB2E8; &#xC140; (monocytes) &#xBE44;&#xAD50;. &#xBAA8;&#xB4E0; &#xC140; &#xC885;&#xB958; &#xC911;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB9CE;&#xC740; &#xC8FC;&#xBAA9;&#xD560; &#xB9CC;&#xD55C; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC774; &#xACE0; &#xC140; &#xC720;&#xD615;&#xBCC4; &#xD2B9;&#xC9D5; &#xAD00;&#xCC30;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; hypomethylation (CG&#xC640; CA)&#xC640; &#xC9C4; &#xBAB8; &#xBA54; &#xD2F8;&#xC758; &#xC0C1;&#xBD80; &#xAE0D;&#xC815;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC804;&#xC0AC; &#xBAA8;&#xB4E0; &#xC140; &#xC885;&#xB958;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC640; &#xC0C1;&#xAD00; &#xD588;&#xB2E4;. Exons introns, &#xBCF4;&#xB2E4; &#xB354; &#xB192;&#xC740; methylated &#xB418;&#xC5C8;&#xACE0; &#xB300; &#xBCF8; &#xC811;&#xD569;&#xC5D0; &#xCC28;&#xB3D9; &#xBA54; &#xD2F8;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xC81C;&#xC548; &#xD558;&#xB294; exon intron &#xACBD;&#xACC4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xC0DD; &#xD55C; &#xBA54; &#xD2F8;&#xC758; &#xAE09;&#xACA9; &#xD55C; &#xC804;&#xD658;. &#xBC1C;&#xB2EC; &#xB2E8;&#xACC4;&#xB294; &#xAE00;&#xB85C;&#xBC8C; &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654; &#xC218;&#xC900; &#xBC0F; &#xAC00;&#xC7A5; &#xB192;&#xC740; hESC, &#xAC8C;&#xC7AC; &#xC911;&#xAE09; &#xBC0F; monocytes &#xCD5C;&#xC800; &#xBE44; CpG &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654; &#xC815;&#xB3C4;&#xC5D0; &#xBC18;&#xC601; &#xD588;&#xB2E4;. &#xBD84;&#xD654; &#xAD00;&#xB828; &#xCC28;&#xB3D9; &#xBA54; &#xD2F8; &#xD504;&#xB85C;&#xD544; HOX &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130;, &#xB2E4;&#xB978; homeobox &#xC804;&#xC0AC; &#xC778;&#xC790;&#xC640; POU5F1, TCF3, KLF4 &#xB4F1; pluripotence &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558; &#xC5EC; &#xBC1C;&#xB2EC; &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774;&#xD2B8; &#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAD00;&#xCC30; &#xB418;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC558;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xACB0;&#xACFC; &#xACE0;&#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654; &#xC9C0;&#xB3C4; &#xD568;&#xAED8; &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xBC1C;&#xACAC;&#xD560; &#xC218; &#xC5C6;&#xB294; &#xBC1C;&#xB2EC;&#xC744; &#xADDC;&#xC81C; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC870;&#xC0AC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xB2E4;&#xB978; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C; &#xC218;&#xC900; &#xBD84;&#xC11D; &#xAC12;&#xC744; &#xAC15;&#xC870; &#xD45C;&#xC2DC; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xCC28;&#xBCC4;&#xD654; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; methylome &#xB3D9;&#xC801; &#xBCC0;&#xD654;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#x9AD8;&#x9636;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8C03;&#x63A7;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x6240;&#x77E5;&#x751A;&#x5728;&#x771F;&#x6838;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4E2D;&#x3002;&#x5229;&#x7528;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x5206;&#x6790;&#x4E0E;&#x914D;&#x5BF9;&#x7ED3;&#x675F;&#x6807;&#x8BB0;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x6CD5; (&#x90C1;&#x90C1;&#x8471;&#x8471;) &#x6211;&#x4EEC;&#x6620;&#x5C04;&#x8FDC;&#x7A0B;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x4E0E; RNA &#x805A;&#x5408;&#x9176; II &#x5728;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x7EC6;&#x80DE;&#x548C;&#x53D1;&#x73B0;&#x666E;&#x904D;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x533A;&#x5C45;&#x4E2D;&#x57FA;&#x56E0;&#x5185;&#x6291;&#x5236;&#x3001; extragenic&#x3001; &#x548C;&#x57FA;&#x56E0;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x4EA4;&#x4E92;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x805A;&#x5408;&#x5230;&#x9AD8;&#x9636;&#x96C6;&#x7FA4;&#xFF0C;&#x5176;&#x4E2D;&#x8FD1;&#x7AEF;&#x548C;&#x8FDC;&#x7AEF;&#x57FA;&#x56E0;&#x6B63;&#x5728;&#x901A;&#x8FC7;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;-&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x533A;&#x7684;&#x4E92;&#x52A8;&#x3002;&#x5927;&#x591A;&#x6570;&#x57FA;&#x56E0;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;-&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x533A;&#x7684;&#x4E92;&#x52A8;&#x4E0E;&#x5408;&#x4F5C;&#xFF0C;&#x662F;&#x79EF;&#x6781;&#x548C;&#x8F6C;&#x5F55;&#x548C;&#x4E00;&#x4E9B;&#x4E92;&#x52A8;&#x4FC3;&#x8FDB;&#x8005;&#x53EF;&#x4EE5;&#x5F71;&#x54CD;&#x5BF9;&#x65B9;&#x6697;&#x793A;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x63A7;&#x4EF6;&#x7EC4;&#x5408;&#x7684;&#x590D;&#x6742;&#x6027;&#x3002;&#x4E0D;&#x540C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7CFB;&#x7684;&#x6BD4;&#x8F83;&#x5206;&#x6790;&#x8868;&#x660E;&#x7279;&#x5B9A;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x53EF;&#x4EE5;&#x4E3A;&#x7279;&#x5B9A;&#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#xFF0C;&#x63D0;&#x4F9B;&#x7ED3;&#x6784;&#x6846;&#x67B6;&#xFF0C;&#x5E76;&#x5EFA;&#x8BAE;&#x91CD;&#x5927;&#x6D53;&#x7F29;&#x4E3A;&#x7279;&#x5B9A;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#x589E;&#x5F3A;&#x5B50;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;&#x57FA;&#x56E0;&#x786E;&#x5B9A;&#x75BE;&#x75C5;&#x5173;&#x8054;&#x7684;&#x975E;&#x7F16;&#x7801;&#x5143;&#x7D20;&#x88AB;&#x53D1;&#x73B0;&#x7A7A;&#x95F4;&#x4ECE;&#x4E8B;&#x4E0E;&#x76F8;&#x5E94;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x901A;&#x8FC7;&#x8FDC;&#x7A0B;&#x4EA4;&#x4E92;&#x3002;&#x603B;&#x4F53;&#x800C;&#x8A00;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x63D0;&#x4F9B;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8C03;&#x63A7;&#x623F;&#x52A1;&#x548C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7279;&#x5F02;&#x6027;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x4E09;&#x7EF4;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x4EA4;&#x4E92;&#x3002;

&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x4E3A;&#x4E2D;&#x5FC3;&#x7684;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x4E3A;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8C03;&#x63A7;&#x63D0;&#x4F9B;&#x62D3;&#x6251;&#x7684;&#x57FA;&#x7840;&#x3002;

Higher-order chromosomal organization for transcription regulation is poorly understood in eukaryotes. Using genome-wide Chromatin Interaction Analysis with Paired-End-Tag sequencing (ChIA-PET), we mapped long-range chromatin interactions associated with RNA polymerase II in human cells and uncovered widespread promoter-centered intragenic, extragenic, and intergenic interactions. These interactions further aggregated into higher-order clusters, wherein proximal and distal genes were engaged through promoter-promoter interactions. Most genes with promoter-promoter interactions were active and transcribed cooperatively, and some interacting promoters could influence each other implying combinatorial complexity of transcriptional controls. Comparative analyses of different cell lines showed that cell-specific chromatin interactions could provide structural frameworks for cell-specific transcription, and suggested significant enrichment of enhancer-promoter interactions for cell-specific functions. Furthermore, genetically-identified disease-associated noncoding elements were found to be spatially engaged with corresponding genes through long-range interactions. Overall, our study provides insights into transcription regulation by three-dimensional chromatin interactions for both housekeeping and cell-specific genes in human cells.

Extensive promoter-centered chromatin interactions provide a topological basis for transcription regulation.

D&#x26;#39;ordre sup&#xE9;rieur pour l&#x26;#39;organisation chromosomique r&#xE9;gulation de la transcription est mal comprise chez les eucaryotes. En utilisant l&#x26;#39;&#xE9;chelle du g&#xE9;nome analyse de l&#x26;#39;interaction avec la chromatine appari&#xE9;s balise de fin de s&#xE9;quen&#xE7;age (Chia-PET), nous avons cartographi&#xE9; les interactions &#xE0; longue port&#xE9;e chromatine associ&#xE9;s &#xE0; l&#x26;#39;ARN polym&#xE9;rase II dans les cellules humaines et d&#xE9;couvert r&#xE9;pandues interactions promoteur-centr&#xE9;e intrag&#xE9;niques, extrag&#xE9;nique, et interg&#xE9;nique. Ces interactions en outre agr&#xE9;g&#xE9;s en un ordre sup&#xE9;rieur grappes, dans lequel les g&#xE8;nes proximale et distale ont &#xE9;t&#xE9; engag&#xE9;s &#xE0; travers promoteur-promoteur interactions. La plupart des g&#xE8;nes avec le promoteur-promoteur interactions ont &#xE9;t&#xE9; actifs et transcrite en collaboration, et certains promoteurs qui interagissent les uns des autres pourrait influer sur ce qui implique la complexit&#xE9; combinatoire des contr&#xF4;les transcriptionnels. Des analyses comparatives des diff&#xE9;rentes lign&#xE9;es cellulaires ont montr&#xE9; que les interactions chromatine cellulaire sp&#xE9;cifiques pourraient fournir des cadres structurels pour la cellule transcription sp&#xE9;cifique, et a sugg&#xE9;r&#xE9; l&#x26;#39;enrichissement significatif de enhancer-promoteur interactions cellule pour des fonctions sp&#xE9;cifiques. En outre, g&#xE9;n&#xE9;tiquement identifi&#xE9; les &#xE9;l&#xE9;ments non codants associ&#xE9;s &#xE0; la maladie ont &#xE9;t&#xE9; trouv&#xE9;s &#xE0; &#xEA;tre spatialement engag&#xE9; avec les g&#xE8;nes correspondants par le biais interactions &#xE0; longue port&#xE9;e. Dans l&#x26;#39;ensemble, notre &#xE9;tude fournit un aper&#xE7;u de r&#xE9;gulation de la transcription par la chromatine interactions en trois dimensions &#xE0; la fois pour l&#x26;#39;entretien m&#xE9;nager et la cellule des g&#xE8;nes sp&#xE9;cifiques dans les cellules humaines.

De vastes interactions chromatine promoteur centr&#xE9;es Fournir une base topologique pour le r&#xE8;glement de transcription

H&ouml;herer Ordnung chromosomale Organisation f&uuml;r Transkription Verordnung ist bei Eukaryoten oft missverstanden. Mit genomweiten Chromatin Interaktionsanalyse mit Paired-End-Tag-Sequenzierung (ChIA-PET), wir zugeordnet Langstrecken Chromatin-Interaktionen, die RNS-Polymerase II in menschlichen Zellen und ungedeckten weit verbreitete Projekttr&auml;ger-zentrierte intragenic, extragenic und intergenetischer Interaktionen zugeordnet. Diese Interaktionen aggregiert weiter in h&ouml;herer Ordnung Cluster aufgeteilt, wobei proximalen und distalen Gene durch Projekttr&auml;ger-Projekttr&auml;ger Interaktionen involviert waren. Die meisten Gene mit Projekttr&auml;ger-Projekttr&auml;ger Interaktionen waren aktiv und transkribierte kooperativ, und einige interagierende F&ouml;rderer konnte beeinflussen sich gegenseitig was bedeutet kombinatorischen Komplexit&auml;t transkriptionelle Steuerelemente. Vergleichende Analysen der verschiedenen Zelllinien zeigte, dass zellspezifische Chromatin Interaktionen k&ouml;nnte die strukturelle Rahmenbedingungen f&uuml;r zellspezifische Transkription bieten erhebliche Bereicherung der Vergr&ouml;&szlig;erer-Projekttr&auml;ger Interaktionen f&uuml;r zellspezifische Funktionen vorgeschlagen. Dar&uuml;ber hinaus wurden genetisch identifiziert Krankheit-verbundenen nichtkodierende Elemente gefunden, r&auml;umlich mit entsprechenden Gene durch weitr&auml;umige Interaktionen eingebunden werden. Insgesamt bietet unsere Studie Einblicke in Transkription Verordnung von dreidimensionalen Chromatin Interaktionen f&uuml;r Hauswirtschaft sowohl zellspezifische Gene in menschliche Zellen.

Umfangreiche Projekttr&auml;ger-zentrierte Chromatin Interaktionen bieten eine topologische Basis f&uuml;r Transkription-Verordnung.

Ordine superiore organizzazione cromosomica per regolazione trascrizione mal inteso negli eucarioti. Utilizzando l&#39;analisi di interazione della cromatina genome-wide con sequenziamento associati-fine-Tag (ChIA-PET), abbiamo mappato le interazioni a lungo raggio della cromatina associate con la RNA polimerasi II in cellule umane e scoperte diffuse promotore-centrato intragenic, extragenic e intergenic interazioni. Queste interazioni ulteriormente aggregate in ammassi di ordine superiore, in cui geni prossimali e distali sono stati impegnati attraverso interazioni Promotore-Organizzatore. La maggior parte dei geni con interazioni promoter-promotore erano attivi e trascritto in modo cooperativo, e alcuni promotori interagenti potrebbero influenzare l&#39;altro implicando complessit&agrave; combinatoria di transcriptional controlli. Analisi comparative di diverse variet&agrave; di cellula ha mostrato interazioni cellula-specifico della cromatina potrebbero fornire quadri strutturali per la trascrizione delle cellule specifiche che ha suggerito significativo arricchimento delle interazioni enhancer-promotore per funzioni specifiche di cella. Inoltre, identificati geneticamente associata a malattia non codificante elementi sono stati trovati per essere spazialmente impegnati con i geni corrispondenti attraverso interazioni a lungo raggio. Nel complesso, il nostro studio fornisce intuizioni nella regolazione della trascrizione di interazioni di cromatina tridimensionale per pulizia e cella specifici geni nelle cellule umane.

Interazioni estese della cromatina promotore-centrato forniscono una base topologica per la regolazione della trascrizione.

&#x8EE2;&#x5199;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x9AD8;&#x6B21;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x306E;&#x7D44;&#x7E54;&#x304C;&#x4E0D;&#x5341;&#x5206;&#x306A;&#x771F;&#x6838;&#x751F;&#x7269;&#x306B;&#x7406;&#x89E3;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x5BFE;&#x306E;&#x7D42;&#x4E86;&#x30BF;&#x30B0;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#xFF08;CHIA-PET&#xFF09;&#x3067;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30EF;&#x30A4;&#x30C9;&#x306A;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x89E3;&#x6790;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x5E83;&#x7BC4;&#x306A;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x3092;&#x4E2D;&#x5FC3;&#x3068;&#x3057;&#x305F;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x5185;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x5916;&#x3068;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x9593;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x30D2;&#x30C8;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x3067;RNA&#x30DD;&#x30EA;&#x30E1;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;II&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x9577;&#x8DDD;&#x96E2;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x30DE;&#x30C3;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x767A;&#x898B;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306F;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x8FD1;&#x4F4D;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x9060;&#x4F4D;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x304C;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066;&#x5F93;&#x4E8B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3001;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x3001;&#x9AD8;&#x6B21;&#x306E;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF;&#x30FC;&#x306B;&#x96C6;&#x7D04;&#x3002;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x6301;&#x3064;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306F;&#x3001;&#x30A2;&#x30AF;&#x30C6;&#x30A3;&#x30D6;&#x3068;&#x5354;&#x529B;&#x3057;&#x3066;&#x8EE2;&#x5199;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3001;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306F;&#x3001;&#x8EE2;&#x5199;&#x5236;&#x5FA1;&#x306E;&#x7D44;&#x307F;&#x5408;&#x308F;&#x305B;&#x306E;&#x8907;&#x96D1;&#x3055;&#x3092;&#x610F;&#x5473;&#x304A;&#x4E92;&#x3044;&#x306B;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x4E0E;&#x3048;&#x308B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x7D30;&#x80DE;&#x682A;&#x306E;&#x6BD4;&#x8F03;&#x5206;&#x6790;&#x306F;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x306A;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x304C;&#x7D30;&#x80DE;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x306A;&#x8EE2;&#x5199;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x7684;&#x67A0;&#x7D44;&#x307F;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x56FA;&#x6709;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30A8;&#x30F3;&#x30CF;&#x30F3;&#x30B5;&#x30FC; - &#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x6FC3;&#x7E2E;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#x306B;&#x540C;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x75BE;&#x60A3;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x3059;&#x308B;&#x975E;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x8981;&#x7D20;&#x306F;&#x3001;&#x7A7A;&#x9593;&#x7684;&#x306B;&#x9577;&#x8DDD;&#x96E2;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066;&#x5BFE;&#x5FDC;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3067;&#x5F93;&#x4E8B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x5224;&#x660E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5168;&#x4F53;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x306F;&#x3001;&#x30D2;&#x30C8;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x30CF;&#x30A6;&#x30B9;&#x30AD;&#x30FC;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x4E09;&#x6B21;&#x5143;&#x306E;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x8EE2;&#x5199;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3078;&#x306E;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x8C4A;&#x5BCC;&#x306A;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x3092;&#x4E2D;&#x5FC3;&#x3068;&#x3057;&#x305F;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306F;&#x3001;&#x8EE2;&#x5199;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30C8;&#x30DD;&#x30ED;&#x30B8;&#x30FC;&#x306E;&#x57FA;&#x790E;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3059;&#x308B;

&#xB179;&#xC74C; &#xBC29;&#xC1A1; &#xADDC;&#xC81C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xB192;&#xC740; &#xC21C;&#xC11C; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xC870;&#xC9C1; &#xC800;&#xC870;&#xD55C; &#xC9C4;&#xD575;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC774;&#xD574; &#xB41C;&#xB2E4;. &#xAC8C;&#xB188; &#xB113;&#xC740; Chromatin &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; &#xBD84;&#xC11D;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC30D; &#xB05D; &#xD0DC;&#xADF8; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1; (ChIA &#xC560;&#xC644; &#xB3D9;&#xBB3C;), &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC7A5;&#xAC70;&#xB9AC; chromatin &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; RNA &#xC911; &#xD569; &#xD6A8;&#xC18C; II &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC138;&#xD3EC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xACAC;&#xB41C; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD55C; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778;&#xC744; &#xC911;&#xC2EC;&#xC73C;&#xB85C; intragenic, extragenic, &#xBC0F; intergenic &#xC0C1;&#xD638; &#xC5F0;&#xAD00; &#xB9E4;&#xD551;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC744; &#xB354; &#xC778;&#xC811; &#xD558; &#xACE0; &#xC6D0;&#xC2EC; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC744; &#xD1B5;&#xD574; &#xC885;&#xC0AC; &#xD588;&#xB2E4;&#xB294; &#xC810;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB192;&#xC740; &#xC21C;&#xC11C; &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130;&#xB85C; &#xC9D1;&#xACC4; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC73C;&#xB85C; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC758; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB294; &#xD611;&#xB825;, &#xC801;&#xADF9;&#xC801;&#xC774; &#xACE0; &#xBCA0;&#xB080; &#xD588;&#xB2E4; &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xBA87; &#xAC00;&#xC9C0; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xC870;&#xD569; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C; transcriptional &#xCEE8;&#xD2B8;&#xB864;&#xC744; &#xC554;&#xC2DC; &#xD558; &#xACE0; &#xC11C;&#xB85C; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xBBF8;&#xCE60; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB2E4;&#xB978; &#xC140; &#xB77C;&#xC778;&#xC758; &#xBE44;&#xAD50; &#xBD84;&#xC11D; &#xC140; &#xD2B9;&#xC815; chromatin &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; &#xC138;&#xD3EC; &#xAD00;&#xB828; &#xC804;&#xC0AC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAD6C;&#xC870;&#xC801; &#xD504;&#xB808;&#xC784; &#xC6CC;&#xD06C;&#xB97C; &#xC81C;&#xACF5;&#xD560; &#xC218; &#xC99D;&#xAC15; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xC140; &#xD2B9;&#xC815; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC758; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xB18D;&#xCD95; &#xC81C;&#xC548; &#xBCF4;&#xC600;&#xB2E4;. &#xB610;&#xD55C;, noncoding &#xC694;&#xC18C; &#xC9C8;&#xBCD1; &#xAD00;&#xB828; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xACF5;&#xAC04;&#xC801; &#xC7A5;&#xAC70;&#xB9AC; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC744; &#xD1B5;&#xD574; &#xD574;&#xB2F9; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC640; &#xC57D;&#xD63C;&#xC744; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC804;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C;, &#xC778;&#xAC04; &#xC138;&#xD3EC;&#xC5D0; &#xC788;&#xB294; &#xAC00;&#xC0AC;&#xC640; &#xC138;&#xD3EC; &#xAD00;&#xB828; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; 3 &#xCC28;&#xC6D0; chromatin &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xD544; &#xC0AC; &#xADDC;&#xC815;&#xC5D0; &#xD1B5;&#xCC30;&#xB825;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5; &#xD558;&#xB294; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xC5F0;&#xAD6C;.

&#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD55C; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778;&#xC744; &#xC911;&#xC2EC;&#xC73C;&#xB85C; chromatin &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; &#xB179;&#xC74C; &#xBC29;&#xC1A1; &#xADDC;&#xC81C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD1A0;&#xD3F4;&#xB85C;&#xC9C0; &#xAE30;&#xBC18;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

De orden superior la organizaci&#xF3;n cromos&#xF3;mica de regulaci&#xF3;n de la transcripci&#xF3;n es poco conocida en eucariotas. Uso de todo el genoma An&#xE1;lisis de Interacci&#xF3;n de la cromatina con la secuenciaci&#xF3;n pareadas etiqueta final (Chia-PET), que asigna a largo plazo las interacciones asociadas a la cromatina con la RNA polimerasa II en las c&#xE9;lulas humanas y descubrieron amplias interacciones promotor centrado en intrag&#xE9;nicos, extrag&#xE9;nicas y interg&#xE9;nica. Estas interacciones m&#xE1;s agregados en un grupo de orden superior, en el que los genes proximal y distal se dedicaban a trav&#xE9;s de la interacci&#xF3;n del promotor promotor. La mayor&#xED;a de los genes con las interacciones promotor promotor-se mantuvieron activos y transcrita en forma cooperativa, y algunos promotores que interact&#xFA;an entre s&#xED; puede influir en lo que implica la complejidad combinatoria de los controles de la transcripci&#xF3;n. An&#xE1;lisis comparativos de diferentes l&#xED;neas celulares mostraron que las c&#xE9;lulas espec&#xED;ficas de la cromatina interacciones podr&#xED;an proporcionar marcos estructurales de c&#xE9;lulas espec&#xED;ficas de la transcripci&#xF3;n, y sugiri&#xF3; un importante enriquecimiento de las interacciones potenciador-promotor de c&#xE9;lulas espec&#xED;ficas de las funciones. Por otra parte, gen&#xE9;ticamente determinadas enfermedades asociadas a los elementos no codificantes se comprob&#xF3; que estaban espacialmente comprometida con los genes correspondientes a trav&#xE9;s de interacciones de largo alcance. En general, nuestro estudio proporciona informaci&#xF3;n detallada sobre regulaci&#xF3;n de la transcripci&#xF3;n de la cromatina por las interacciones en tres dimensiones tanto para la limpieza y los genes espec&#xED;ficos de la c&#xE9;lula en las c&#xE9;lulas humanas.

Chin Thing Ong

Genome Institute of Singapore

Agency for Science, Technology and Research, Singapore

Chromatin Interaction Analysis with Paired-End Tag Sequencing (ChIA-PET) for Mapping Chromatin Interactions and Understanding Transcription Regulation

Chin Thing Ong

.css-o250i3{font-size:18px;font-family:Open Sans,sans-serif;line-height:21.6px;}Genome Institute of Singapore

Agency for Science, Technology and Research, Singapore

Chromatin Interaction Analysis with Paired-End Tag Sequencing (ChIA-PET) for Mapping Chromatin Interactions and Understanding Transcription Regulation

Genome Institute of Singapore