Chromatin Interaction Analysis with Paired-End Tag Sequencing (ChIA-PET) for Mapping Chromatin Interactions and Understanding Transcription Regulation

Genomes are organized into three-dimensional structures, adopting higher-order conformations inside the micron-sized nuclear spaces 7, 2, 12. Such ...

Agency for Science, Technology and Research, Singapore

&#x6269;&#x5C55;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#xFF0C;&#x5E76;&#x4E0E;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5206;&#x88C2;&#x7684;&#x534F;&#x8C03;&#x589E;&#x957F;&#x548C;&#x690D;&#x7269;&#x5668;&#x5B98;&#x53D1;&#x80B2;&#x7684;&#x5173;&#x952E;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x63A7;&#x5236;&#x7EC6;&#x80DE;&#x6269;&#x5F20;&#x671F;&#x95F4;&#x5668;&#x5B98;&#x53D1;&#x751F;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x662F;&#x4E3B;&#x8981;&#x662F;&#x672A;&#x77E5;&#x7684;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x8868;&#x73B0;&#x51FA;&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x57FA;&#x56E0;&#xFF0C;ARGOS-LIKE &#xFF08;&#x963F;&#x5C14;&#xFF09;&#xFF0C;&#x5176;&#x4E2D;&#x6709;&#x4E00;&#x4E9B;&#x4E3A; ARGOS &#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x5E8F;&#x5217;&#x540C;&#x6E90;&#x6027;&#xFF0C;&#x53C2;&#x4E0E;&#x8FD9;&#x4E00;&#x8FDB;&#x7A0B;&#x3002;&#x7B80;&#x5316;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x5F0F;&#x6216;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x4E2D;&#x5206;&#x522B;&#x5BFC;&#x81F4;&#x66F4;&#x5C0F;&#x6216;&#x66F4;&#x5927;&#x7684;&#x5B50;&#x53F6;&#x548C;&#x53F6;&#x5B50;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA;&#x5176;&#x4ED6;&#x5916;&#x4FA7;&#x7684;&#x673A;&#x5173;&#x3002;&#x963F;&#x5C14;&#x8F6C;&#x57FA;&#x56E0;&#x690D;&#x7269;&#x5B50;&#x53F6;&#x548C;&#x53F6;&#x7684;&#x89E3;&#x5256;&#x5B66;&#x8003;&#x8BD5;&#x6F14;&#x793A;&#x7684;&#x5927;&#x5C0F;&#x6539;&#x53D8;&#x53EF;&#x4EE5;&#x5F52;&#x548E;&#x4E8E;&#x66F4;&#x6539;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7684;&#x5927;&#x5C0F;&#xFF0C;&#x800C;&#x4E0D;&#x662F;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x6570;&#x76EE;&#xFF0C;&#x8BE5;&#x503C;&#x963F;&#x5C14;&#x7EC6;&#x80DE;&#x6269;&#x5C55;&#x4F9D;&#x8D56;&#x5668;&#x5B98;&#x751F;&#x957F;&#x4E2D;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;&#x963F;&#x5C14;&#x662F;&#x6CB9;&#x83DC; (BR) &#x4E0A;&#x8C03;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x79CD;&#x611F;&#x5E94;&#x662F;&#x53D7;&#x635F; BR &#x4E0D;&#x654F;&#x611F;&#x7A81;&#x53D8;&#x4F53; bri1&#xFF0C;&#x4F46;&#x4E0D;&#x662F;&#x5728; BR &#x7F3A;&#x9677;&#x7A81;&#x53D8;&#x4F53; det2&#x3002;&#x963F;&#x5C14;&#x5F02;&#x4F4D;&#x8868;&#x8FBE; bri1-119 &#x90E8;&#x5206;&#x6062;&#x590D;&#x5B50;&#x53F6;&#x7EC6;&#x80DE;&#x751F;&#x957F;&#x548C;&#x53F6;&#x7247;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x7ED3;&#x679C;&#x8868;&#x660E;&#x963F;&#x5C14;&#x4E0B;&#x6E38;&#x884C;&#x4E3A;&#x7684; BRI1 &#x548C;&#x90E8;&#x5206;&#x5668;&#x5B98;&#x751F;&#x957F;&#x671F;&#x95F4;&#x4ECB;&#x5BFC; BR &#x76F8;&#x5173;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x6269;&#x5C55;&#x4FE1;&#x53F7;&#x3002;

&#x62DF;&#x5357;&#x82A5; ARGOS &#x6837;&#x57FA;&#x56E0;&#x8C03;&#x8282;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5668;&#x5B98;&#x751F;&#x957F;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x7684;&#x6269;&#x5F20;&#x3002;

Cell expansion, and its coordination with cell division, plays a critical role in the growth and development of plant organs. However, the genes controlling cell expansion during organogenesis are largely unknown. Here, we demonstrate that a novel Arabidopsis gene, ARGOS-LIKE (ARL), which has some sequence homology to the ARGOS gene, is involved in this process. Reduced expression or overexpression of ARL in Arabidopsis results in smaller or larger cotyledons and leaves as well as other lateral organs, respectively. Anatomical examination of cotyledons and leaves in ARL transgenic plants demonstrates that the alteration in size can be attributed to changes in cell size rather than cell number, indicating that ARL plays a role in cell expansion-dependent organ growth. ARL is upregulated by brassinosteroid (BR) and this induction is impaired in the BR-insensitive mutant bri1, but not in the BR-deficient mutant det2. Ectopic expression of ARL in bri1-119 partially restores cell growth in cotyledons and leaves. Our results suggest that ARL acts downstream of BRI1 and partially mediates BR-related cell expansion signals during organ growth.

The Arabidopsis ARGOS-LIKE gene regulates cell expansion during organ growth.

Expansion des cellules et sa coordination avec la division cellulaire, joue un r&ocirc;le essentiel dans la croissance et le d&eacute;veloppement des organes v&eacute;g&eacute;taux. Toutefois, les g&egrave;nes contr&ocirc;lant l&#39;expansion des cellules pendant l&#39;organogen&egrave;se sont largement inconnus. Ici, nous d&eacute;montrons qu&#39;un nouveau g&egrave;ne d&#39;Arabidopsis, ARGOS-LIKE (ARL), qui a une homologie de s&eacute;quence au g&egrave;ne ARGOS, est impliqu&eacute; dans ce processus. R&eacute;duction de l&#39;expression ou la surexpression des ARL dans Arabidopsis se traduit par le plus petits ou plus gros cotyl&eacute;dons et les feuilles ainsi qu&#39;autres organes lat&eacute;raux, respectivement. L&#39;examen anatomique des cotyl&eacute;dons et les feuilles dans des plantes transg&eacute;niques ARL d&eacute;montre que l&#39;alt&eacute;ration de taille peut &ecirc;tre attribu&eacute;e aux changements de taille des cellules, et non le nombre de cellules, ce qui indique que l&#39;ARL joue un r&ocirc;le dans la croissance cellulaire d&eacute;pendante expansion orgue. ARL est augment&eacute;e de brasinoest&eacute;ro&iuml;de (BR) et cette induction est alt&eacute;r&eacute;e dans le BR-insensible bri1 mutant, mais pas dans le det2 mutant d&eacute;ficient en BR. L&#39;expression ectopique de ARL dans bri1-119 partiellement restaure la croissance cellulaire dans les cotyl&eacute;dons et feuilles. Nos r&eacute;sultats sugg&egrave;rent que l&#39;ARL agit en aval de BRI1 et partiellement intervient dans les cellules li&eacute;es &agrave; BR expansion signaux durant la croissance de l&#39;orgue.

Le g&egrave;ne Arabidopsis ARGOS r&eacute;glemente expansion cellulaire pendant la croissance de l&#39;orgue.

Zelle Expansion und deren Koordinierung mit Zellteilung, spielt eine wichtige Rolle beim Wachstum und die Entwicklung der Organe der Pflanze. Die Gene Steuern der Zelle Erweiterung w&auml;hrend der Organogenese sind jedoch weitgehend unbekannt. Hier zeigen wir, dass ein neuartiges Arabidopsis-gen, ARGOS-LIKE (ARL), die einige Sequenz-Homologie an das ARGOS-gen hat, an diesem Prozess beteiligt ist. Reduzierte Ausdruck oder eine &Uuml;berexpression von ARL in Arabidopsis Ergebnisse in kleinere oder gr&ouml;&szlig;ere Keimbl&auml;tter und Bl&auml;tter sowie andere seitliche Organe. Anatomische Untersuchung der Keimbl&auml;tter und Bl&auml;tter in ARL transgener Pflanzen zeigt, dass die &Auml;nderung in der Gr&ouml;&szlig;e kann, um &Auml;nderungen in Zellengr&ouml;&szlig;e anstatt Zellpopulation zur&uuml;ckgef&uuml;hrt werden, darauf hinweist, dass ARL eine Rolle im Ausbau-abh&auml;ngige Orgel Zellwachstum spielt. ARL herraufreguliert durch Brassinosteroide (BR) und diese Induktion ist beeintr&auml;chtigt in der BR-unempfindliche Mutante bri1, aber nicht in der BR-defizienten mutant det2. Ektopische Expression von ARL bri1-119 teilweise wiederhergestellt Zellwachstum in Keimbl&auml;tter und verl&auml;sst. Unsere Ergebnisse legen nahe, dass ARL stromabw&auml;rts von BRI1 und teilweise wirkt vermittelt BR-bezogenen Zelle Erweiterung Signale w&auml;hrend des Wachstums der Orgel.

Das Arabidopsis-ARGOS-LIKE-gen reguliert Zelle Expansion Orgel Wachstum.

Espansione delle cellule e il coordinamento con la divisione cellulare, gioca un ruolo fondamentale nella crescita e lo sviluppo degli organi della pianta. Tuttavia, i geni che controllano la espansione delle cellule durante l&#39;organogenesi sono in gran parte sconosciuti. Qui, ci dimostrano che un gene di Arabidopsis romanzo, ARGOS-LIKE (ARL), che ha qualche omologia di sequenza per il gene di ARGOS, &egrave; coinvolto in questo processo. Espressione ridotta o sovraespressione di ARL in Arabidopsis risultati in piccoli o grandi cotiledoni e foglie, come pure altri organi laterali, rispettivamente. Esame anatomico di cotiledoni e foglie in piante transgeniche ARL dimostra che l&#39;alterazione nella dimensione pu&ograve; essere attribuita ai cambiamenti nella cella dimensioni piuttosto che il numero di cellule, che indica che ARL gioca un ruolo nella crescita cellulare organo di espansione-dipendente. ARL &egrave; sovraregolati da brassinosteroide (BR) e questa induzione &egrave; alterata nella BR-insensibile bri1 mutante, ma non nel det2 mutante BR-carenti. Espressione ectopica di ARL bri1-119 parzialmente ripristina la crescita delle cellule nei cotiledoni e foglie. I nostri risultati suggeriscono che ARL agisce a valle di BRI1 e parzialmente da intermediario segnali di espansione BR-relativi delle cellule durante lo sviluppo di organo.

Il gene di ARGOS-come Arabidopsis regola espansione delle cellule durante lo sviluppo di organo.

&#x7D30;&#x80DE;&#x4F38;&#x9577;&#x3068;&#x7D30;&#x80DE;&#x5206;&#x88C2;&#x3068;&#x305D;&#x306E;&#x8ABF;&#x6574;&#x306E;&#x6210;&#x9577;&#x3068;&#x690D;&#x7269;&#x5668;&#x5B98;&#x306E;&#x958B;&#x767A;&#x306B;&#x304A;&#x3044;&#x3066;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x679C;&#x305F;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x305F;&#x3060;&#x3057;&#x3001;&#x5668;&#x5B98;&#x5206;&#x5316;&#x4E2D;&#x7D30;&#x80DE;&#x4F38;&#x9577;&#x3092;&#x5236;&#x5FA1;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306F;&#x4E3B;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x65B0;&#x898F;&#x306E;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3001;ARGOS-LIKE &#xFF08;&#x4E00;&#x90E8;&#x30A2;&#x30EB;&#x30B4;&#x30B9;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306B;&#x76F8;&#x540C;&#x6027;&#x3092;&#x6301;&#x3064; ARL)&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30BB;&#x30B9;&#x306B;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x5358;&#x7D14;&#x5316;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x5F0F;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x904E;&#x5270;&#x767A;&#x73FE;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x306E; ARL &#x306E;&#x5C0F;&#x3055;&#x3044;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x5927;&#x304D;&#x3044;&#x5B50;&#x8449;&#x3068;&#x8449;&#x3068;&#x540C;&#x69D8;&#x306E;&#x6A2A;&#x65B9;&#x5411;&#x306E;&#x4ED6;&#x306E;&#x81D3;&#x5668;&#x3092;&#x305D;&#x308C;&#x305E;&#x308C;&#x7D50;&#x679C;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;ARL &#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CB;&#x30C3;&#x30AF;&#x690D;&#x7269;&#x306E;&#x5B50;&#x8449;&#x3068;&#x8449;&#x306E;&#x89E3;&#x5256;&#x5B66;&#x7684;&#x691C;&#x8A0E; ARL &#x30BB;&#x30EB;&#x62E1;&#x5F35;&#x306B;&#x4F9D;&#x5B58;&#x3059;&#x308B;&#x81D3;&#x5668;&#x6210;&#x9577;&#x3067;&#x306F;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x679C;&#x305F;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x7D30;&#x80DE;&#x6570;&#x3067;&#x306F;&#x306A;&#x304F;&#x3001;&#x30BB;&#x30EB; &#x30B5;&#x30A4;&#x30BA;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x30B5;&#x30A4;&#x30BA;&#x3067;&#x6539;&#x3056;&#x3093;&#x304C;&#x8D77;&#x56E0;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;ARL &#x30D6;&#x30E9;&#x30B7;&#x30CE;&#x30B9;&#x30C6;&#x30ED;&#x30A4;&#x30C9; &#xFF08;BR&#xFF09; &#x767A;&#x73FE;&#x304C;&#x8A98;&#x5C0E;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x8A98;&#x5C0E;&#x969C;&#x5BB3;&#x3067;&#x3059; BR &#x7121;&#x4F9D;&#x5B58;&#x306E;&#x5909;&#x7570; bri1 BR &#x6B20;&#x640D;&#x7A81;&#x7136;&#x5909;&#x7570;&#x4F53; det2 &#x3067;&#x306F;&#x3002;ARL bri1 119 &#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x7570;&#x6240;&#x6027;&#x767A;&#x73FE;&#x306F;&#x90E8;&#x5206;&#x7684;&#x306B;&#x5B50;&#x8449;&#x4E2D;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x6210;&#x9577;&#x3092;&#x5FA9;&#x5143;&#x3057;&#x3001;&#x8449;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;ARL &#x4E0B;&#x6D41; BRI1 &#x306E;&#x3068;&#x90E8;&#x5206;&#x7684;&#x306B;&#x884C;&#x52D5;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x793A;&#x5506;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x5668;&#x5B98;&#x6210;&#x9577;&#x4E2D; BR &#x95A2;&#x9023;&#x30BB;&#x30EB;&#x62E1;&#x5F35;&#x4FE1;&#x53F7;&#x3092;&#x4EF2;&#x4ECB;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x306E;&#x30A2;&#x30EB;&#x30B4;&#x30B9;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x7D30;&#x80DE;&#x4F38;&#x9577;&#x5668;&#x5B98;&#x6210;&#x9577;&#x904E;&#x7A0B;&#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#xC140; &#xD655;&#xC7A5; &#xBC0F; &#xC138;&#xD3EC; &#xBD84;&#xC5F4;&#xC758; &#xC870;&#xD654; &#xACF5;&#xC7A5; &#xC7A5;&#xAE30;&#xC758; &#xAC1C;&#xBC1C;&#xACFC; &#xC131;&#xC7A5;&#xC5D0; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xD55C;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, organogenesis &#xC911; &#xC140; &#xD655;&#xC7A5; &#xC81C;&#xC5B4; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD06C;&#xAC8C; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C0;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC740;.&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30;, &#xC6B0;&#xB9AC; &#xC18C;&#xC124; Arabidopsis &#xC720;&#xC804;&#xC790; ARGOS-LIKE (ARL), &#xC544;&#xB974;&#xACE0;&#xC2A4; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xC77C;&#xBD80; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; homology&#xB97C; &#xAC16;&#xB294;&#xC774; &#xACFC;&#xC815;&#xC5D0; &#xCC38;&#xC5EC; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xAC10;&#xC18C; &#xC2DD; &#xB610;&#xB294; overexpression Arabidopsis&#xC5D0; ARL&#xC758; &#xAC01;&#xAC01; &#xC791;&#xAC70;&#xB098; &#xD06C;&#xAC8C; cotyledons &#xC78E; &#xBFD0;&#xB9CC; &#xC544;&#xB2C8;&#xB77C; &#xB2E4;&#xB978; &#xCE21;&#xBA74; &#xC7A5;&#xAE30; &#xACB0;&#xACFC;. ARL &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBCC0;&#xD615; &#xC2DD;&#xBB3C;&#xC5D0; &#xD574; &#xBD80; &#xC2DC;&#xD5D8; cotyledons &#xBC0F; &#xC78E;&#xC758; &#xD06C;&#xAE30;&#xC5D0; &#xBCC0;&#xD654; &#xBCC0;&#xD654; ARL &#xC140; &#xD655;&#xC7A5; &#xC885;&#xC18D; &#xC7A5;&#xAE30; &#xC131;&#xC7A5;&#xC5D0; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xC7AC;&#xC0DD;&#xC744; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; &#xC140; &#xC22B;&#xC790; &#xBCF4;&#xB2E4;&#xB294; &#xC140; &#xD06C;&#xAE30;&#xC5D0; &#xD45C;&#xC2DC; &#xB420; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. ARL&#xC740; upregulated brassinosteroid (BR), &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0;&#xC774; &#xC720;&#xB3C4; &#xC7A5;&#xC560; BR&#xC744; &#xAD6C;&#xBD84; &#xD558;&#xC9C0; &#xC54A;&#xB294; &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774; bri1 &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; BR &#xBD88;&#xCDA9;&#xBD84; &#xD55C; &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774; det2. Bri1-119&#xC5D0; ARL&#xC758; &#xC18C;&#xC131; &#xC2DD; &#xBD80;&#xBD84;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; cotyledons &#xC138;&#xD3EC;&#xC758; &#xC131;&#xC7A5;&#xC744; &#xBCF5;&#xC6D0; &#xD558; &#xACE0; &#xB0A8;&#xACA8; &#xB461;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xACB0;&#xACFC; &#xAC74;&#xC758; ARL &#xC5ED;&#xD560; &#xD558;&#xB958; BRI1 &#xD558; &#xACE0; &#xBD80;&#xBD84;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC7A5;&#xAE30; &#xC131;&#xC7A5; &#xC911; BR &#xAD00;&#xB828; &#xC140; &#xD655;&#xC7A5; &#xC2E0;&#xD638;&#xB97C; &#xC911;&#xC7AC; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Arabidopsis &#xC544;&#xB974;&#xACE0;&#xC2A4; &#xAC19;&#xC740; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC870;&#xC808; &#xAE30;&#xAD00;&#xC774; &#xC131;&#xC7A5; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xC140; &#xD655;&#xC7A5;.

Expansi&oacute;n de la c&eacute;lula y su coordinaci&oacute;n con la divisi&oacute;n celular, desempe&ntilde;a un papel fundamental en el crecimiento y desarrollo de los &oacute;rganos de la planta. Sin embargo, los genes que controlan la expansi&oacute;n celular durante organog&eacute;nesis son en gran parte desconocidos. Aqu&iacute;, demostramos que un nuevo gen de Arabidopsis, ARGOS-LIKE (ARL), que tiene cierta homolog&iacute;a de secuencia con el gen de ARGOS, est&aacute; implicado en este proceso. Expresi&oacute;n reducida o sobreexpresi&oacute;n de ARL en Arabidopsis resultados en m&aacute;s o menos grandes cotiledones y hojas as&iacute; como otros &oacute;rganos laterales, respectivamente. Examen anat&oacute;mico de los cotiledones y hojas en las plantas transg&eacute;nicas ARL demuestra que la alteraci&oacute;n en el tama&ntilde;o puede ser atribuida a los cambios en el tama&ntilde;o de celda en lugar de numero de celular, indicando que la ARL desempe&ntilde;a un papel en el crecimiento del &oacute;rgano dependiente de la expansi&oacute;n celular. ARL es alza de Brasinoesteroides (BR) y esta inducci&oacute;n se deteriora en la BR-insensible bri1 mutante, pero no en el det2 mutante BR-deficiente. La expresi&oacute;n ect&oacute;pica de ARL en bri1-119 parcialmente restaura el crecimiento celular en los cotiledones y hojas. Nuestros resultados sugieren que la ARL act&uacute;a aguas abajo de BRI1 y parcialmente media se&ntilde;ales de expansi&oacute;n relacionadas con BR celular durante el crecimiento del &oacute;rgano.

El gen de Arabidopsis ARGOS-como regula la expansi&oacute;n celular durante el crecimiento del &oacute;rgano.

&#x9AD8;&#x9636;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8C03;&#x63A7;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x6240;&#x77E5;&#x751A;&#x5728;&#x771F;&#x6838;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4E2D;&#x3002;&#x5229;&#x7528;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x5206;&#x6790;&#x4E0E;&#x914D;&#x5BF9;&#x7ED3;&#x675F;&#x6807;&#x8BB0;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x6CD5; (&#x90C1;&#x90C1;&#x8471;&#x8471;) &#x6211;&#x4EEC;&#x6620;&#x5C04;&#x8FDC;&#x7A0B;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x4E0E; RNA &#x805A;&#x5408;&#x9176; II &#x5728;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x7EC6;&#x80DE;&#x548C;&#x53D1;&#x73B0;&#x666E;&#x904D;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x533A;&#x5C45;&#x4E2D;&#x57FA;&#x56E0;&#x5185;&#x6291;&#x5236;&#x3001; extragenic&#x3001; &#x548C;&#x57FA;&#x56E0;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x4EA4;&#x4E92;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x805A;&#x5408;&#x5230;&#x9AD8;&#x9636;&#x96C6;&#x7FA4;&#xFF0C;&#x5176;&#x4E2D;&#x8FD1;&#x7AEF;&#x548C;&#x8FDC;&#x7AEF;&#x57FA;&#x56E0;&#x6B63;&#x5728;&#x901A;&#x8FC7;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;-&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x533A;&#x7684;&#x4E92;&#x52A8;&#x3002;&#x5927;&#x591A;&#x6570;&#x57FA;&#x56E0;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;-&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x533A;&#x7684;&#x4E92;&#x52A8;&#x4E0E;&#x5408;&#x4F5C;&#xFF0C;&#x662F;&#x79EF;&#x6781;&#x548C;&#x8F6C;&#x5F55;&#x548C;&#x4E00;&#x4E9B;&#x4E92;&#x52A8;&#x4FC3;&#x8FDB;&#x8005;&#x53EF;&#x4EE5;&#x5F71;&#x54CD;&#x5BF9;&#x65B9;&#x6697;&#x793A;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x63A7;&#x4EF6;&#x7EC4;&#x5408;&#x7684;&#x590D;&#x6742;&#x6027;&#x3002;&#x4E0D;&#x540C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7CFB;&#x7684;&#x6BD4;&#x8F83;&#x5206;&#x6790;&#x8868;&#x660E;&#x7279;&#x5B9A;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x53EF;&#x4EE5;&#x4E3A;&#x7279;&#x5B9A;&#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#xFF0C;&#x63D0;&#x4F9B;&#x7ED3;&#x6784;&#x6846;&#x67B6;&#xFF0C;&#x5E76;&#x5EFA;&#x8BAE;&#x91CD;&#x5927;&#x6D53;&#x7F29;&#x4E3A;&#x7279;&#x5B9A;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#x589E;&#x5F3A;&#x5B50;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;&#x57FA;&#x56E0;&#x786E;&#x5B9A;&#x75BE;&#x75C5;&#x5173;&#x8054;&#x7684;&#x975E;&#x7F16;&#x7801;&#x5143;&#x7D20;&#x88AB;&#x53D1;&#x73B0;&#x7A7A;&#x95F4;&#x4ECE;&#x4E8B;&#x4E0E;&#x76F8;&#x5E94;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x901A;&#x8FC7;&#x8FDC;&#x7A0B;&#x4EA4;&#x4E92;&#x3002;&#x603B;&#x4F53;&#x800C;&#x8A00;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x63D0;&#x4F9B;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8C03;&#x63A7;&#x623F;&#x52A1;&#x548C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7279;&#x5F02;&#x6027;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x4E09;&#x7EF4;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x4EA4;&#x4E92;&#x3002;

&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x4E3A;&#x4E2D;&#x5FC3;&#x7684;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x4E3A;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8C03;&#x63A7;&#x63D0;&#x4F9B;&#x62D3;&#x6251;&#x7684;&#x57FA;&#x7840;&#x3002;

Higher-order chromosomal organization for transcription regulation is poorly understood in eukaryotes. Using genome-wide Chromatin Interaction Analysis with Paired-End-Tag sequencing (ChIA-PET), we mapped long-range chromatin interactions associated with RNA polymerase II in human cells and uncovered widespread promoter-centered intragenic, extragenic, and intergenic interactions. These interactions further aggregated into higher-order clusters, wherein proximal and distal genes were engaged through promoter-promoter interactions. Most genes with promoter-promoter interactions were active and transcribed cooperatively, and some interacting promoters could influence each other implying combinatorial complexity of transcriptional controls. Comparative analyses of different cell lines showed that cell-specific chromatin interactions could provide structural frameworks for cell-specific transcription, and suggested significant enrichment of enhancer-promoter interactions for cell-specific functions. Furthermore, genetically-identified disease-associated noncoding elements were found to be spatially engaged with corresponding genes through long-range interactions. Overall, our study provides insights into transcription regulation by three-dimensional chromatin interactions for both housekeeping and cell-specific genes in human cells.

Extensive promoter-centered chromatin interactions provide a topological basis for transcription regulation.

D&#x26;#39;ordre sup&#xE9;rieur pour l&#x26;#39;organisation chromosomique r&#xE9;gulation de la transcription est mal comprise chez les eucaryotes. En utilisant l&#x26;#39;&#xE9;chelle du g&#xE9;nome analyse de l&#x26;#39;interaction avec la chromatine appari&#xE9;s balise de fin de s&#xE9;quen&#xE7;age (Chia-PET), nous avons cartographi&#xE9; les interactions &#xE0; longue port&#xE9;e chromatine associ&#xE9;s &#xE0; l&#x26;#39;ARN polym&#xE9;rase II dans les cellules humaines et d&#xE9;couvert r&#xE9;pandues interactions promoteur-centr&#xE9;e intrag&#xE9;niques, extrag&#xE9;nique, et interg&#xE9;nique. Ces interactions en outre agr&#xE9;g&#xE9;s en un ordre sup&#xE9;rieur grappes, dans lequel les g&#xE8;nes proximale et distale ont &#xE9;t&#xE9; engag&#xE9;s &#xE0; travers promoteur-promoteur interactions. La plupart des g&#xE8;nes avec le promoteur-promoteur interactions ont &#xE9;t&#xE9; actifs et transcrite en collaboration, et certains promoteurs qui interagissent les uns des autres pourrait influer sur ce qui implique la complexit&#xE9; combinatoire des contr&#xF4;les transcriptionnels. Des analyses comparatives des diff&#xE9;rentes lign&#xE9;es cellulaires ont montr&#xE9; que les interactions chromatine cellulaire sp&#xE9;cifiques pourraient fournir des cadres structurels pour la cellule transcription sp&#xE9;cifique, et a sugg&#xE9;r&#xE9; l&#x26;#39;enrichissement significatif de enhancer-promoteur interactions cellule pour des fonctions sp&#xE9;cifiques. En outre, g&#xE9;n&#xE9;tiquement identifi&#xE9; les &#xE9;l&#xE9;ments non codants associ&#xE9;s &#xE0; la maladie ont &#xE9;t&#xE9; trouv&#xE9;s &#xE0; &#xEA;tre spatialement engag&#xE9; avec les g&#xE8;nes correspondants par le biais interactions &#xE0; longue port&#xE9;e. Dans l&#x26;#39;ensemble, notre &#xE9;tude fournit un aper&#xE7;u de r&#xE9;gulation de la transcription par la chromatine interactions en trois dimensions &#xE0; la fois pour l&#x26;#39;entretien m&#xE9;nager et la cellule des g&#xE8;nes sp&#xE9;cifiques dans les cellules humaines.

De vastes interactions chromatine promoteur centr&#xE9;es Fournir une base topologique pour le r&#xE8;glement de transcription

H&ouml;herer Ordnung chromosomale Organisation f&uuml;r Transkription Verordnung ist bei Eukaryoten oft missverstanden. Mit genomweiten Chromatin Interaktionsanalyse mit Paired-End-Tag-Sequenzierung (ChIA-PET), wir zugeordnet Langstrecken Chromatin-Interaktionen, die RNS-Polymerase II in menschlichen Zellen und ungedeckten weit verbreitete Projekttr&auml;ger-zentrierte intragenic, extragenic und intergenetischer Interaktionen zugeordnet. Diese Interaktionen aggregiert weiter in h&ouml;herer Ordnung Cluster aufgeteilt, wobei proximalen und distalen Gene durch Projekttr&auml;ger-Projekttr&auml;ger Interaktionen involviert waren. Die meisten Gene mit Projekttr&auml;ger-Projekttr&auml;ger Interaktionen waren aktiv und transkribierte kooperativ, und einige interagierende F&ouml;rderer konnte beeinflussen sich gegenseitig was bedeutet kombinatorischen Komplexit&auml;t transkriptionelle Steuerelemente. Vergleichende Analysen der verschiedenen Zelllinien zeigte, dass zellspezifische Chromatin Interaktionen k&ouml;nnte die strukturelle Rahmenbedingungen f&uuml;r zellspezifische Transkription bieten erhebliche Bereicherung der Vergr&ouml;&szlig;erer-Projekttr&auml;ger Interaktionen f&uuml;r zellspezifische Funktionen vorgeschlagen. Dar&uuml;ber hinaus wurden genetisch identifiziert Krankheit-verbundenen nichtkodierende Elemente gefunden, r&auml;umlich mit entsprechenden Gene durch weitr&auml;umige Interaktionen eingebunden werden. Insgesamt bietet unsere Studie Einblicke in Transkription Verordnung von dreidimensionalen Chromatin Interaktionen f&uuml;r Hauswirtschaft sowohl zellspezifische Gene in menschliche Zellen.

Umfangreiche Projekttr&auml;ger-zentrierte Chromatin Interaktionen bieten eine topologische Basis f&uuml;r Transkription-Verordnung.

Ordine superiore organizzazione cromosomica per regolazione trascrizione mal inteso negli eucarioti. Utilizzando l&#39;analisi di interazione della cromatina genome-wide con sequenziamento associati-fine-Tag (ChIA-PET), abbiamo mappato le interazioni a lungo raggio della cromatina associate con la RNA polimerasi II in cellule umane e scoperte diffuse promotore-centrato intragenic, extragenic e intergenic interazioni. Queste interazioni ulteriormente aggregate in ammassi di ordine superiore, in cui geni prossimali e distali sono stati impegnati attraverso interazioni Promotore-Organizzatore. La maggior parte dei geni con interazioni promoter-promotore erano attivi e trascritto in modo cooperativo, e alcuni promotori interagenti potrebbero influenzare l&#39;altro implicando complessit&agrave; combinatoria di transcriptional controlli. Analisi comparative di diverse variet&agrave; di cellula ha mostrato interazioni cellula-specifico della cromatina potrebbero fornire quadri strutturali per la trascrizione delle cellule specifiche che ha suggerito significativo arricchimento delle interazioni enhancer-promotore per funzioni specifiche di cella. Inoltre, identificati geneticamente associata a malattia non codificante elementi sono stati trovati per essere spazialmente impegnati con i geni corrispondenti attraverso interazioni a lungo raggio. Nel complesso, il nostro studio fornisce intuizioni nella regolazione della trascrizione di interazioni di cromatina tridimensionale per pulizia e cella specifici geni nelle cellule umane.

Interazioni estese della cromatina promotore-centrato forniscono una base topologica per la regolazione della trascrizione.

&#x8EE2;&#x5199;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x9AD8;&#x6B21;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x306E;&#x7D44;&#x7E54;&#x304C;&#x4E0D;&#x5341;&#x5206;&#x306A;&#x771F;&#x6838;&#x751F;&#x7269;&#x306B;&#x7406;&#x89E3;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x5BFE;&#x306E;&#x7D42;&#x4E86;&#x30BF;&#x30B0;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#xFF08;CHIA-PET&#xFF09;&#x3067;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30EF;&#x30A4;&#x30C9;&#x306A;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x89E3;&#x6790;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x5E83;&#x7BC4;&#x306A;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x3092;&#x4E2D;&#x5FC3;&#x3068;&#x3057;&#x305F;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x5185;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x5916;&#x3068;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x9593;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x30D2;&#x30C8;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x3067;RNA&#x30DD;&#x30EA;&#x30E1;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;II&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x9577;&#x8DDD;&#x96E2;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x30DE;&#x30C3;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x767A;&#x898B;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306F;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x8FD1;&#x4F4D;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x9060;&#x4F4D;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x304C;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066;&#x5F93;&#x4E8B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3001;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x3001;&#x9AD8;&#x6B21;&#x306E;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF;&#x30FC;&#x306B;&#x96C6;&#x7D04;&#x3002;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x6301;&#x3064;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306F;&#x3001;&#x30A2;&#x30AF;&#x30C6;&#x30A3;&#x30D6;&#x3068;&#x5354;&#x529B;&#x3057;&#x3066;&#x8EE2;&#x5199;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3001;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306F;&#x3001;&#x8EE2;&#x5199;&#x5236;&#x5FA1;&#x306E;&#x7D44;&#x307F;&#x5408;&#x308F;&#x305B;&#x306E;&#x8907;&#x96D1;&#x3055;&#x3092;&#x610F;&#x5473;&#x304A;&#x4E92;&#x3044;&#x306B;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x4E0E;&#x3048;&#x308B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x7D30;&#x80DE;&#x682A;&#x306E;&#x6BD4;&#x8F03;&#x5206;&#x6790;&#x306F;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x306A;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x304C;&#x7D30;&#x80DE;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x306A;&#x8EE2;&#x5199;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x7684;&#x67A0;&#x7D44;&#x307F;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x56FA;&#x6709;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30A8;&#x30F3;&#x30CF;&#x30F3;&#x30B5;&#x30FC; - &#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x6FC3;&#x7E2E;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#x306B;&#x540C;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x75BE;&#x60A3;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x3059;&#x308B;&#x975E;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x8981;&#x7D20;&#x306F;&#x3001;&#x7A7A;&#x9593;&#x7684;&#x306B;&#x9577;&#x8DDD;&#x96E2;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066;&#x5BFE;&#x5FDC;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3067;&#x5F93;&#x4E8B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x5224;&#x660E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5168;&#x4F53;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x306F;&#x3001;&#x30D2;&#x30C8;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x30CF;&#x30A6;&#x30B9;&#x30AD;&#x30FC;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x4E09;&#x6B21;&#x5143;&#x306E;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x8EE2;&#x5199;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3078;&#x306E;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x8C4A;&#x5BCC;&#x306A;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x3092;&#x4E2D;&#x5FC3;&#x3068;&#x3057;&#x305F;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306F;&#x3001;&#x8EE2;&#x5199;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30C8;&#x30DD;&#x30ED;&#x30B8;&#x30FC;&#x306E;&#x57FA;&#x790E;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3059;&#x308B;

&#xB179;&#xC74C; &#xBC29;&#xC1A1; &#xADDC;&#xC81C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xB192;&#xC740; &#xC21C;&#xC11C; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xC870;&#xC9C1; &#xC800;&#xC870;&#xD55C; &#xC9C4;&#xD575;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC774;&#xD574; &#xB41C;&#xB2E4;. &#xAC8C;&#xB188; &#xB113;&#xC740; Chromatin &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; &#xBD84;&#xC11D;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC30D; &#xB05D; &#xD0DC;&#xADF8; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1; (ChIA &#xC560;&#xC644; &#xB3D9;&#xBB3C;), &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC7A5;&#xAC70;&#xB9AC; chromatin &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; RNA &#xC911; &#xD569; &#xD6A8;&#xC18C; II &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC138;&#xD3EC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xACAC;&#xB41C; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD55C; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778;&#xC744; &#xC911;&#xC2EC;&#xC73C;&#xB85C; intragenic, extragenic, &#xBC0F; intergenic &#xC0C1;&#xD638; &#xC5F0;&#xAD00; &#xB9E4;&#xD551;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC744; &#xB354; &#xC778;&#xC811; &#xD558; &#xACE0; &#xC6D0;&#xC2EC; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC744; &#xD1B5;&#xD574; &#xC885;&#xC0AC; &#xD588;&#xB2E4;&#xB294; &#xC810;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB192;&#xC740; &#xC21C;&#xC11C; &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130;&#xB85C; &#xC9D1;&#xACC4; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC73C;&#xB85C; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC758; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB294; &#xD611;&#xB825;, &#xC801;&#xADF9;&#xC801;&#xC774; &#xACE0; &#xBCA0;&#xB080; &#xD588;&#xB2E4; &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xBA87; &#xAC00;&#xC9C0; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xC870;&#xD569; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C; transcriptional &#xCEE8;&#xD2B8;&#xB864;&#xC744; &#xC554;&#xC2DC; &#xD558; &#xACE0; &#xC11C;&#xB85C; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xBBF8;&#xCE60; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB2E4;&#xB978; &#xC140; &#xB77C;&#xC778;&#xC758; &#xBE44;&#xAD50; &#xBD84;&#xC11D; &#xC140; &#xD2B9;&#xC815; chromatin &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; &#xC138;&#xD3EC; &#xAD00;&#xB828; &#xC804;&#xC0AC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAD6C;&#xC870;&#xC801; &#xD504;&#xB808;&#xC784; &#xC6CC;&#xD06C;&#xB97C; &#xC81C;&#xACF5;&#xD560; &#xC218; &#xC99D;&#xAC15; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xC140; &#xD2B9;&#xC815; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC758; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xB18D;&#xCD95; &#xC81C;&#xC548; &#xBCF4;&#xC600;&#xB2E4;. &#xB610;&#xD55C;, noncoding &#xC694;&#xC18C; &#xC9C8;&#xBCD1; &#xAD00;&#xB828; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xACF5;&#xAC04;&#xC801; &#xC7A5;&#xAC70;&#xB9AC; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC744; &#xD1B5;&#xD574; &#xD574;&#xB2F9; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC640; &#xC57D;&#xD63C;&#xC744; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC804;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C;, &#xC778;&#xAC04; &#xC138;&#xD3EC;&#xC5D0; &#xC788;&#xB294; &#xAC00;&#xC0AC;&#xC640; &#xC138;&#xD3EC; &#xAD00;&#xB828; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; 3 &#xCC28;&#xC6D0; chromatin &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xD544; &#xC0AC; &#xADDC;&#xC815;&#xC5D0; &#xD1B5;&#xCC30;&#xB825;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5; &#xD558;&#xB294; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xC5F0;&#xAD6C;.

&#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD55C; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778;&#xC744; &#xC911;&#xC2EC;&#xC73C;&#xB85C; chromatin &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; &#xB179;&#xC74C; &#xBC29;&#xC1A1; &#xADDC;&#xC81C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD1A0;&#xD3F4;&#xB85C;&#xC9C0; &#xAE30;&#xBC18;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

De orden superior la organizaci&#xF3;n cromos&#xF3;mica de regulaci&#xF3;n de la transcripci&#xF3;n es poco conocida en eucariotas. Uso de todo el genoma An&#xE1;lisis de Interacci&#xF3;n de la cromatina con la secuenciaci&#xF3;n pareadas etiqueta final (Chia-PET), que asigna a largo plazo las interacciones asociadas a la cromatina con la RNA polimerasa II en las c&#xE9;lulas humanas y descubrieron amplias interacciones promotor centrado en intrag&#xE9;nicos, extrag&#xE9;nicas y interg&#xE9;nica. Estas interacciones m&#xE1;s agregados en un grupo de orden superior, en el que los genes proximal y distal se dedicaban a trav&#xE9;s de la interacci&#xF3;n del promotor promotor. La mayor&#xED;a de los genes con las interacciones promotor promotor-se mantuvieron activos y transcrita en forma cooperativa, y algunos promotores que interact&#xFA;an entre s&#xED; puede influir en lo que implica la complejidad combinatoria de los controles de la transcripci&#xF3;n. An&#xE1;lisis comparativos de diferentes l&#xED;neas celulares mostraron que las c&#xE9;lulas espec&#xED;ficas de la cromatina interacciones podr&#xED;an proporcionar marcos estructurales de c&#xE9;lulas espec&#xED;ficas de la transcripci&#xF3;n, y sugiri&#xF3; un importante enriquecimiento de las interacciones potenciador-promotor de c&#xE9;lulas espec&#xED;ficas de las funciones. Por otra parte, gen&#xE9;ticamente determinadas enfermedades asociadas a los elementos no codificantes se comprob&#xF3; que estaban espacialmente comprometida con los genes correspondientes a trav&#xE9;s de interacciones de largo alcance. En general, nuestro estudio proporciona informaci&#xF3;n detallada sobre regulaci&#xF3;n de la transcripci&#xF3;n de la cromatina por las interacciones en tres dimensiones tanto para la limpieza y los genes espec&#xED;ficos de la c&#xE9;lula en las c&#xE9;lulas humanas.

Huay Mei Poh

Genome Institute of Singapore

Agency for Science, Technology and Research, Singapore

Chromatin Interaction Analysis with Paired-End Tag Sequencing (ChIA-PET) for Mapping Chromatin Interactions and Understanding Transcription Regulation

Huay Mei Poh

.css-o250i3{font-size:18px;font-family:Open Sans,sans-serif;line-height:21.6px;}Genome Institute of Singapore

Agency for Science, Technology and Research, Singapore

Chromatin Interaction Analysis with Paired-End Tag Sequencing (ChIA-PET) for Mapping Chromatin Interactions and Understanding Transcription Regulation

Genome Institute of Singapore