Chromatin Interaction Analysis with Paired-End Tag Sequencing (ChIA-PET) for Mapping Chromatin Interactions and Understanding Transcription Regulation

Genomes are organized into three-dimensional structures, adopting higher-order conformations inside the micron-sized nuclear spaces 7, 2, 12. Such ...

Agency for Science, Technology and Research, Singapore

&#x6D1E;&#x5BDF;&#x6838;&#x5FC3;&#x8F6C;&#x5F55;&#x56E0;&#x5B50;&#x7684;&#x8C03;&#x63A7;&#x662F;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x63A7;&#x5236;&#x81EA;&#x6211;&#x66F4;&#x65B0;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x673A;&#x5236;&#x66F4;&#x597D;&#x5730;&#x7406;&#x89E3;&#x548C;&#x6F5C;&#x80FD;&#x7684;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x80DA;&#x80CE;&#x5E72;&#x7EC6;&#x80DE; (hESCs)&#x3002;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x5728; hESCs NANOG &#x672C;&#x8EAB;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8C03;&#x63A7;&#x5F88;&#x5927;&#x7A0B;&#x5EA6;&#x4E0A;&#x4E5F;&#x96BE;&#x4EE5;&#x5B9E;&#x73B0;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x8BBE;&#x7ACB; NANOG &#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x8367;&#x5149;&#x7D20;&#x9176;&#x8BB0;&#x8005;&#x68C0;&#x6D4B;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x7528;&#x4E8E;&#x8868;&#x793A;&#x591A;&#x80FD;&#x5E72;&#x7684; hESCs &#x72B6;&#x6001;&#x5FEB;&#x901F;&#x8BFB;&#x51FA;&#x3002;&#x4ECE;&#x529F;&#x80FD;&#x57FA;&#x56E0;&#x5C4F;&#x5E55;&#x548C; NANOG &#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x533A;&#x8868;&#x5F81;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x6210;&#x529F;&#x5730;&#x5217;&#x4E3A;&#x950C;&#x6307;&#x8F6C;&#x5F55;&#x56E0;&#x5B50; KLF4 &#x548C; homeodomain &#x8F6C;&#x5F55;&#x56E0;&#x5B50; PBX1 &#x4FDD;&#x6301;&#x672A;&#x5206;&#x5316;&#x7684;&#x72B6;&#x6001;&#x7684; hESCs &#x4E0E;&#x591A;&#x80FD;&#x5E72;&#x7684;&#x4E24;&#x79CD;&#x65B0;&#x578B;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8C03;&#x8282;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x8868;&#x660E;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x4E24;&#x4E2A; KLF4 &#x548C; PBX1 &#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x548C;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x8868;&#x8FBE; hESC &#x5206;&#x5316;&#x671F;&#x95F4;&#x88AB;&#x7F16;&#x7801;&#x3002;&#x6B64;&#x5916; KLF4 &#x548C; PBX1 &#x4E0A;&#x8C03; NANOG &#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x6D3B;&#x6027;&#x7684;&#x8FC7;&#x8868;&#x8FBE;&#x548C;&#x8FD8; hESCs &#x5185;&#x6E90;&#x6027; NANOG &#x86CB;&#x767D;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;&#x76F4;&#x63A5;&#x7ED3;&#x5408; KLF4 NANOG &#x8FD1;&#x4FA7;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x533A;&#x548C; PBX1 &#x5BF9;&#x65B0;&#x4E0A;&#x6E38;&#x5F3A;&#x5316;&#x5242;&#x548C;&#x8FD1;&#x4FA7;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x533A;&#x8BC1;&#x5B9E;&#x4E86;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x6C89;&#x6DC0;&#x548C;&#x7535;&#x6CF3;&#x8FC1;&#x79FB;&#x3002;&#x7EC4;&#x5408;&#x5F0F; KLF4/PBX1 &#x6216;&#x7A81;&#x53D8; KLF4/PBX1 &#x7ED1;&#x5B9A;&#x56FE;&#x6848;&#x5927;&#x5927;&#x7F16;&#x7801; NANOG &#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x6D3B;&#x6027;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x8FD8;&#x8868;&#x660E; SP/&#x767D;&#x70ED;&#x5316;&#x548C; PBX &#x5BB6;&#x5EAD;&#x4E2D;&#x7684;&#x7279;&#x5B9A;&#x6210;&#x5458;&#x662F;&#x5728; NANOG &#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x529F;&#x80FD;&#x5197;&#x4F59;&#x548C; KLF4 &#x548C; PBX1 &#x4E0E; OCT4&#x3001; SOX2&#x3001; &#x5408;&#x4F5C;&#x548C;&#x534F;&#x540C;&#x53CD;&#x5F0F;&#x8C03;&#x8282; NANOG &#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x6D3B;&#x6027;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x7ED3;&#x679C;&#x663E;&#x793A;&#x4E24;&#x79CD;&#x65B0;&#x578B;&#x4E0A;&#x6E38;&#x8F6C;&#x5F55;&#x6FC0;&#x6D3B; NANOG &#x7684;&#x5668; hESC &#x7684;&#x81EA;&#x6211;&#x66F4;&#x65B0;&#x7684;&#x91CD;&#x8981;&#x529F;&#x80FD;&#xFF0C;&#x5E76;&#x63D0;&#x4F9B;&#x6269;&#x5927;&#x7684;&#x89C4;&#x7BA1;&#x7535;&#x8DEF;&#xFF0C;&#x53EF;&#x4FDD;&#x6301; hESC &#x6F5C;&#x80FD;&#x7684;&#x65B0;&#x89C1;&#x89E3;&#x3002;

KLF4 &#x548C; PBX1 &#x76F4;&#x63A5;&#x8C03;&#x8282; NANOG &#x5728;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x80DA;&#x80CE;&#x5E72;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4E2D;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;

Insight into the regulation of core transcription factors is important for a better understanding of the molecular mechanisms that control self-renewal and pluripotency of human ESCs (hESCs). However, the transcriptional regulation of NANOG itself in hESCs has largely been elusive. We established a NANOG promoter luciferase reporter assay as a fast read-out for indicating the pluripotent status of hESCs. From the functional cDNA screens and NANOG promoter characterization, we successfully identified a zinc finger transcription factor KLF4 and a homeodomain transcription factor PBX1 as two novel transcriptional regulators that maintain the pluripotent and undifferentiated state of hESCs. We showed that both KLF4 and PBX1 mRNA and protein expression were downregulated during hESC differentiation. In addition, overexpression of KLF4 and PBX1 upregulated NANOG promoter activity and also the endogenous NANOG protein expression in hESCs. Direct binding of KLF4 on NANOG proximal promoter and PBX1 on a new upstream enhancer and proximal promoter were confirmed by chromatin immunoprecipitation and electrophoretic mobility shift assay. Knockdown of KLF4/PBX1 or mutation of KLF4/PBX1 binding motifs significantly downregulated NANOG promoter activity. We also showed that specific members of the SP/KLF and PBX family are functionally redundant at the NANOG promoter and that KLF4 and PBX1 cooperated with OCT4 and SOX2, and transactivated synergistically the NANOG promoter activity. Our results show two novel upstream transcription activators of NANOG that are functionally important for the self-renewal of hESC and provide new insights into the expanded regulatory circuitry that maintains hESC pluripotency.

KLF4 and PBX1 directly regulate NANOG expression in human embryonic stem cells.

Aper&ccedil;u de la r&eacute;glementation des facteurs de transcription de base est important pour une meilleure compr&eacute;hension des m&eacute;canismes mol&eacute;culaires qui contr&ocirc;lent l&#39;auto-renouvellement et pluripotence des ces humaines (CSEh). Toutefois, la r&eacute;gulation transcriptionnelle de NANOG lui-m&ecirc;me dans les CSEh a &eacute;t&eacute; largement insaisissable. Nous avons &eacute;tabli une analyse de journaliste de luciferase NANOG promoteur comme une lecture rapide pour indiquer l&#39;&eacute;tat pluripotent de CSEh. Des &eacute;crans de cDNA fonctionnelle et caract&eacute;risation du promoteur NANOG, nous avons identifi&eacute; avec succ&egrave;s un facteur de transcription de doigt de zinc KLF4 et un facteur de transcription de l&#39;hom&eacute;odomaine PBX1 comme deux nouveaux r&eacute;gulateurs transcriptionnels qui maintiennent le pluripotentes et &eacute;tat indiff&eacute;renci&eacute; des CSEh. Nous avons d&eacute;montr&eacute; que les deux KLF4 et PBX1 ARNm et prot&eacute;ines expression &eacute;taient r&eacute;prim&eacute;s durant la diff&eacute;renciation des CSEh. En outre, la surexpression de KLF4 et PBX1 surexprim&eacute;s activit&eacute; du promoteur NANOG et aussi l&#39;expression des prot&eacute;ines endog&egrave;ne NANOG dans CSEh. Liaison directe de KLF4 promoteur proximale NANOG et PBX1 sur un nouveau renforceur en amont et un promoteur proximal ont &eacute;t&eacute; confirm&eacute;s par immunopr&eacute;cipitation de la chromatine et analyse de d&eacute;calage de mobilit&eacute; &eacute;lectrophor&eacute;tique. Pr&eacute;cipitation de KLF4/PBX1 ou mutation de motifs de liaison KLF4/PBX1 significativement diminu&eacute;e activit&eacute; du promoteur NANOG. Nous avons &eacute;galement montr&eacute; que certains membres de la famille de PBX et de SP/KLF sont fonctionnellement redondantes au promoteur NANOG et que KLF4 PBX1 coop&eacute;r&eacute; avec OCT4 et SOX2 et transactivated en synergie l&#39;activit&eacute; du promoteur NANOG. Nos r&eacute;sultats montrent deux activateurs roman transcription en amont de NANOG qui sont fonctionnellement importantes pour l&#39;autorenouvellement des CSEh et apporter un nouvel &eacute;clairage dans les circuits de r&eacute;gulation &eacute;largi qui maintient la pluripotence CSEh.

KLF4 et PBX1 directement r&eacute;gulent l&#39;expression de NANOG dans les cellules souches embryonnaires humaines.

Einblick in die Regulierung des Kern-Transkriptionsfaktoren ist wichtig f&uuml;r ein besseres Verst&auml;ndnis der molekularen Mechanismen, die Selbsterneuerung zu steuern und Pluripotenz der menschlichen WSR (Zellkulturen). Jedoch hat die transkriptionelle Regulation nanog selbst in Zellkulturen weitgehend tr&uuml;gerisch erwiesen. Wir etablierte eine NANOG Projekttr&auml;ger Luciferase Reporter Assay als ein schnelles Auslesen f&uuml;r den pluripotenten Zustand des Zellkulturen. Vom funktionalen cDNA Bildschirme und NANOG Projekttr&auml;ger Charakterisierung identifizierten wir erfolgreich ein Zink-Finger-Transkriptionsfaktor KLF4 und Hom&ouml;odom&auml;ne Transkriptionsfaktor PBX1 als zwei neuartige transkriptionelle Regulatoren, die Aufrechterhaltung der pluripotenten und undifferenzierte Zustand von Zellkulturen. Wir zeigten, dass beide KLF4 und PBX1-mRNA und Protein-Ausdruck waren Downregulated w&auml;hrend hESC Differenzierung. Dar&uuml;ber hinaus eine &Uuml;berexpression von KLF4 und PBX1 herraufreguliert NANOG Promotor-Aktivit&auml;t und auch die endogene NANOG-Proteinexpression in Zellkulturen. Direkte Bindung der KLF4 NANOG proximale Promotor und PBX1 auf einem neuen upstream Enhancer und proximale Promotor wurden durch Chromatin Immunopr&auml;zipitation und elektrophoretische Mobilit&auml;tsschichtprobe best&auml;tigt. Niederschlag KLF4/PBX1 oder Mutation der KLF4/PBX1 Bindung Motive deutlich Downregulated NANOG Promotor-Aktivit&auml;t. Wir haben auch gezeigt, dass bestimmte Mitglieder der SP/KLF und PBX-Familie bei der NANOG Projekttr&auml;ger funktionell &uuml;berholt sind und KLF4 PBX1 mit OCT4 und SOX2 kooperierte und transactivated synergistisch die NANOG-Promotor-Aktivit&auml;t. Unsere Ergebnisse zeigen zwei neuartige upstream Transkription-Aktivatoren nanog, die funktionell wichtig ist, dass der Selbsterneuerung von hESC und erlauben neue Einblicke in die erweiterten regulatorischen Schaltungen, die hESC Pluripotenz verwaltet.

KLF4 und PBX1 Regeln direkt NANOG Ausdruck in humanen embryonalen Stammzellen.

Visione del regolamento i principali fattori di trascrizione &egrave; importante per una migliore comprensione dei meccanismi molecolari che controllano l&#39;auto-rinnovamento e pluripotenza di CES umane (hESC). Tuttavia, la regolazione trascrizionale di NANOG stessa in hESCs in gran parte &egrave; stato sfuggente. Abbiamo stabilito un&#39;analisi di reporter NANOG promotore luciferase come una veloce lettura per indicare lo status di pluripotent di hESC. Dalle schermate di cDNA funzionale e caratterizzazione promotore NANOG, abbiamo identificato con successo un fattore di trascrizione zinc finger KLF4 e un fattore di trascrizione homeodomain PBX1 come due regolatori trascrizionali romanzo che mantengono le pluripotenti e stato indifferenziato del hESC. Abbiamo dimostrato che entrambi KLF4 ed espressione di mRNA e proteina PBX1 erano downregolata durante la differenziazione hESC. In aggiunta, sovraespressione di KLF4 e PBX1 sovraregolati NANOG promotore attivit&agrave; e anche l&#39;espressione di proteina NANOG endogeno nelle hESC. Il binding diretto del KLF4 su NANOG promotore prossimale e PBX1 su un nuovo enhancer a monte e promotore prossimale sono state confermate da immunoprecipitazione della cromatina e mobilit&agrave; elettroforetica shift assay. Atterramento di KLF4/PBX1 o mutazione di motivi associazione KLF4/PBX1 significativamente downregolata attivit&agrave; di promotore NANOG. Abbiamo anche dimostrato che specifici membri della famiglia di PBX e SP/KLF sono funzionalmente ridondanti presso il promotore NANOG e KLF4 e PBX1 hanno collaborato con OCT4 e SOX2 che transactivated in sinergia l&#39;attivit&agrave; di promotore NANOG. I nostri risultati mostrano due attivatori della trascrizione upstream romanzo di NANOG che sono funzionalmente importanti per l&#39;auto-rinnovamento delle hESC e forniscono nuove intuizioni nel circuito regolamentare espanso che mantiene la pluripotenza hESC.

KLF4 e PBX1 regolare direttamente espressione di NANOG in cellule staminali embrionali umane.

&#x30B3;&#x30A2;&#x8EE2;&#x5199;&#x56E0;&#x5B50;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3078;&#x306E;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x529B;&#x306F;&#x81EA;&#x5DF1;&#x8907;&#x88FD;&#x3092;&#x5236;&#x5FA1;&#x3059;&#x308B;&#x5206;&#x5B50;&#x6A5F;&#x69CB;&#x306E;&#x7406;&#x89E3;&#x3092;&#x6DF1;&#x3081;&#x308B;&#x3001;&#x591A;&#x80FD;&#x6027;&#x3072;&#x3068; Esc &#xFF08;hESCs&#xFF09; &#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x305F;&#x3060;&#x3057;&#x3001;hESCs &#x306E;&#x81EA;&#x4F53;&#x3092; NANOG &#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x4E3B;&#x3068;&#x3089;&#x3048;&#x3069;&#x3053;&#x308D;&#x306E;&#x306A;&#x3044;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x306F; hESCs &#x306E;&#x591A;&#x80FD;&#x6027;&#x306E;&#x72B6;&#x614B;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x305F;&#x3081;&#x3001;&#x9AD8;&#x901F;&#x8AAD;&#x307F;&#x51FA;&#x3057;&#x3068;&#x3057;&#x3066; NANOG &#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC; &#x30EB;&#x30B7;&#x30D5;&#x30A7;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC; &#x30EC;&#x30DD;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC; &#x30A2;&#x30C3;&#x30BB;&#x30A4;&#x3092;&#x8A2D;&#x7ACB;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x306A; cDNA &#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30FC;&#x30F3;&#x3068; NANOG &#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x7279;&#x6027;&#x304B;&#x3089;&#x3001;&#x6211;&#x3005; &#x304C;&#x6B63;&#x5E38;&#x306B;&#x4E9C;&#x925B;&#x30D5;&#x30A3;&#x30F3;&#x30AC;&#x30FC;&#x8EE2;&#x5199;&#x56E0;&#x5B50; KLF4 &#x3068;&#x30DB;&#x30E1;&#x30AA; &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x8EE2;&#x5199;&#x56E0;&#x5B50; PBX1 &#x591A;&#x80FD;&#x6027;&#x3068; hESCs &#x306E;&#x672A;&#x5206;&#x5316;&#x306E;&#x72B6;&#x614B;&#x3092;&#x7DAD;&#x6301;&#x3059;&#x308B; 2 &#x3064;&#x65B0;&#x898F;&#x8EE2;&#x5199;&#x30EC;&#x30AE;&#x30E5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30BF;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x8B58;&#x5225;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x306F;&#x4E21;&#x65B9; KLF4 &#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3068; PBX1 mRNA &#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x3055;&#x308C;&#x305F; downregulated hESC &#x5206;&#x5316;&#x4E2D;&#x3002;&#x6DFB;&#x52A0; KLF4 &#x3068; PBX1 &#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x4EA2;&#x9032; NANOG &#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x6D3B;&#x6027;&#x306E;&#x904E;&#x5270;&#x767A;&#x73FE;&#x3068; hESCs &#x306E;&#x5185;&#x56E0;&#x6027;&#x306E; NANOG &#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x8868;&#x73FE;&#x3067;&#x3082;&#x3002;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x514D;&#x75AB;&#x6C88;&#x964D;&#x3068;&#x96FB;&#x6C17;&#x6CF3;&#x52D5;&#x306E;&#x79FB;&#x52D5;&#x6027;&#x30B7;&#x30D5;&#x30C8;&#x8A66;&#x91D1;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x4E0A;&#x6D41;&#x30A8;&#x30F3;&#x30CF;&#x30F3;&#x30B5;&#x30FC;&#x3068;&#x8FD1;&#x4F4D;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x3067;&#x306E;&#x76F4;&#x63A5;&#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9; KLF4 &#x306E; NANOG &#x8FD1;&#x4F4D;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x3068; PBX1 &#x304C;&#x78BA;&#x8A8D;&#x3055;&#x308C;&#x305F;.&#x30CE;&#x30C3;&#x30AF;&#x30C0;&#x30A6;&#x30F3; KLF4/PBX1 &#x307E;&#x305F;&#x306F; KLF4/PBX1 &#x7D50;&#x5408;&#x30E2;&#x30C1;&#x30FC;&#x30D5;&#x306E;&#x7A81;&#x7136;&#x5909;&#x7570;&#x306E;&#x5927;&#x5E45; downregulated NANOG &#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x6D3B;&#x6027;&#x3002;&#x307E;&#x305F;&#x3001;SP/KLF &#x3068; PBX &#x306E;&#x5BB6;&#x65CF;&#x306E;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;&#x30E1;&#x30F3;&#x30D0;&#x30FC;&#x304C; NANOG &#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x3067;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x306B;&#x5197;&#x9577;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304A;&#x3088;&#x3073; KLF4 &#x3068; PBX1 OCT4 &#x3068; SOX2, &#x5354;&#x529B;&#x3057;&#x76F8;&#x4E57;&#x7684; transactivated NANOG &#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x6D3B;&#x6027;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x306F;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684; hESC &#x306E;&#x81EA;&#x5DF1;&#x66F4;&#x65B0;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x3068; hESC &#x591A;&#x80FD;&#x6027;&#x3092;&#x7DAD;&#x6301;&#x62E1;&#x5927;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x56DE;&#x8DEF;&#x306B;&#x65B0;&#x305F;&#x306A;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3059;&#x308B; 2 &#x3064;&#x306E;&#x65B0;&#x898F;&#x4E0A;&#x6D41;&#x8EE2;&#x5199;&#x30A2;&#x30AF;&#x30C6;&#x30A3;&#x30D9;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC; NANOG &#x306E;&#x8868;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x76F4;&#x63A5; KLF4 &#x3068; PBX1 &#x30D2;&#x30C8;&#x80DA;&#x6027;&#x5E79;&#x7D30;&#x80DE;&#x3067;&#x306E; NANOG &#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#xD575;&#xC2EC; &#xC804;&#xC0AC; &#xC778;&#xC790; &#xADDC;&#xC81C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD1B5;&#xCC30;&#xB825;&#xC740; &#xC790;&#xAE30; &#xAC31;&#xC2E0;&#xC744; &#xC81C;&#xC5B4; &#xD558;&#xB294; &#xBD84;&#xC790; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC744; &#xB354; &#xC798; &#xC774;&#xD574; &#xD558; &#xACE0; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; ESCs (hESCs)&#xC758; pluripotency&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC911;&#xC694; &#xD558;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098; Hescs&#xC758; &#xC790;&#xCCB4; NANOG transcriptional &#xADDC;&#xC81C; &#xD06C;&#xAC8C; &#xC560;&#xB9E4; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC; &#xBE68;&#xB9AC; &#xC77D;&#xC5B4; Hescs&#xC758; &#xB9CC;&#xB2A5; &#xC0C1;&#xD0DC;&#xB97C; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; NANOG &#xD504;&#xB85C;&#xBAA8;&#xD130; &#xB8E8;&#xC2DC;&#xD398;&#xB77C;&#xC544;&#xC81C; &#xAE30;&#xC790; &#xBD84;&#xC11D; &#xACB0;&#xACFC; &#xC124;&#xB9BD;. &#xAE30;&#xB2A5; cDNA &#xD654;&#xBA74;&#xACFC; NANOG &#xD504;&#xB85C;&#xBAA8;&#xD130; &#xD2B9;&#xC131;&#xD654;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xC131;&#xACF5;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC544;&#xC5F0; &#xC190;&#xAC00;&#xB77D; &#xC804;&#xC0AC; &#xC694;&#xC18C; klf4&#xC640; homeodomain &#xC804;&#xC0AC; &#xC778;&#xC790; pbx1&#xC73C;&#xB85C; &#xC2DD;&#xBCC4; pluripotent &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; Hescs&#xC758; undifferentiated &#xC0C1;&#xD0DC;&#xB97C; &#xC720;&#xC9C0; &#xD558;&#xB294; &#xB450; &#xAC1C;&#xC758; &#xC18C;&#xC124; transcriptional &#xADDC;&#xC81C;. &#xC6B0;&#xB9AC; &#xBAA8;&#xB450; KLF4 &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC900; PBX1 Mrna&#xC640; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC2DD; hESC &#xCC28;&#xBCC4;&#xD654; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; downregulated &#xD588;&#xB2E4;. &#xB610;&#xD55C;, klf4&#xC640; PBX1 upregulated NANOG &#xD504;&#xB85C;&#xBAA8;&#xD130; &#xD65C;&#xB3D9;&#xC758; overexpression &#xBC0F; &#xB610;&#xD55C; Hescs&#xC758; &#xC0DD; NANOG &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xD45C;&#xC815;. &#xC0C8; &#xC5C5;&#xC2A4;&#xD2B8;&#xB9BC; &#xC99D;&#xAC15; &#xBC0F; &#xADFC; &#xC704; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; NANOG &#xADFC; &#xC704; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xBC0F; PBX1 klf4&#xC758; &#xC9C1;&#xC811; &#xBC14;&#xC778;&#xB529; chromatin immunoprecipitation &#xBC0F; &#xC804;&#xAE30; &#xC774;&#xB3D9; &#xAE30;&#xB3D9;&#xC131; &#xAD50;&#xB300; &#xBD84;&#xC11D; &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xD655;&#xC778; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xCD5C;&#xC800;&#xC758; KLF4/PBX1 &#xB610;&#xB294; KLF4/PBX1 &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xBAA8;&#xD2F0;&#xD504;&#xC758; &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774;&#xC758; &#xD06C;&#xAC8C; downregulated NANOG &#xD504;&#xB85C;&#xBAA8;&#xD130; &#xD65C;&#xB3D9;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xB610;&#xD55C; SP/KLF &#xAC00;&#xC871;&#xACFC; PBX&#xC758; &#xD2B9;&#xC815; &#xBA64;&#xBC84;&#xB294; NANOG &#xD504;&#xB85C;&#xBAA8;&#xD130;&#xC5D0; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC911;&#xBCF5;&#xACFC; klf4&#xC640; PBX1 SOX2, oct4&#xC640; &#xD611;&#xB825; &#xBC0F; transactivated synergistically NANOG &#xD504;&#xB85C;&#xBAA8;&#xD130; &#xD65C;&#xB3D9;&#xC744; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC8FC;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xACB0;&#xACFC; Hesc&#xC758; &#xC790;&#xAE30; &#xAC31;&#xC2E0;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; hESC pluripotency &#xC720;&#xC9C0; &#xD655;&#xC7A5;&#xB41C; &#xADDC;&#xC81C; &#xD68C;&#xB85C;&#xC5D0; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xD1B5;&#xCC30;&#xB825;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5; NANOG&#xC758; &#xB450; &#xC18C;&#xC124; &#xC5C5;&#xC2A4;&#xD2B8;&#xB9BC; &#xC804;&#xC0AC; &#xD65C;&#xC131;&#xC744; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC900;&#xB2E4;.

Klf4&#xC640; PBX1 &#xC9C1;&#xC811; NANOG &#xC2DD; &#xC778;&#xAC04; &#xBC30;&#xC544; &#xC904;&#xAE30; &#xC138;&#xD3EC;&#xC758; &#xC870;&#xC808;.

Penetraci&oacute;n en la regulaci&oacute;n de factores de transcripci&oacute;n de base es importante para una mejor comprensi&oacute;n de los mecanismos moleculares que controlan la auto-renovaci&oacute;n y pluripotencia de CES humanas (hESCs). Sin embargo, la regulaci&oacute;n transcripcional de NANOG s&iacute; mismo en hESCs en gran parte ha sido esquiva. Establecimos un ensayo de reportero de luciferasa NANOG promotor como una lectura r&aacute;pida para indicar el estado pluripotente de hESCs. Desde las pantallas de cDNA funcional y caracterizaci&oacute;n del promotor NANOG, con &eacute;xito identificamos un factor de transcripci&oacute;n de dedo de cinc KLF4 y un factor de transcripci&oacute;n homeodomain PBX1 como dos reguladores transcripcionales novela que mantienen las pluripotentes y estado indiferenciado de hESCs. Se mostr&oacute; que ambos KLF4 y expresi&oacute;n de mRNA y prote&iacute;na de PBX1 fueron reguladas durante la diferenciaci&oacute;n de c&eacute;lulas. Adem&aacute;s, la sobreexpresi&oacute;n de la actividad de promotor NANOG de alza de KLF4 y PBX1 y tambi&eacute;n la expresi&oacute;n de prote&iacute;na NANOG end&oacute;gena en hESCs. Atascamiento directo del KLF4 promotor proximal NANOG y PBX1 en un nuevo potenciador de aguas arriba y promotor proximal fueron confirmados por inmunoprecipitaci&oacute;n de cromatina y an&aacute;lisis del cambio de movilidad electrofor&eacute;tica. Precipitaci&oacute;n de KLF4/PBX1 o mutaci&oacute;n de los motivos de Uni&oacute;n KLF4/PBX1 significativamente o actividad NANOG promotor. Tambi&eacute;n mostramos que determinados miembros de la familia de PBX y SP/KLF son funcionalmente redundantes en el promotor NANOG y que KLF4 PBX1 cooper&oacute; con OCT4 y el SOX2 y transactivated sin&eacute;rgicamente la actividad del promotor NANOG. Nuestros resultados muestran dos activadores de la transcripci&oacute;n arriba novela de NANOG que son funcionalmente importantes para la renovaci&oacute;n de c&eacute;lulas y proporcionan nuevas perspectivas sobre los circuitos de regulaci&oacute;n ampliado que mantiene la pluripotencia de c&eacute;lulas.

Klf4 y PBX1 directamente regulan la expresi&oacute;n de NANOG en c&eacute;lulas madre embrionarias humanas.

Toll &#x6837;&#x53D7;&#x4F53;&#x4FE1;&#x53F7;&#x9700;&#x8981;&#x529F;&#x80FD;&#x6536;&#x8D39;/&#x767D;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4ECB;&#x7D20;-1 &#xFF08;IL-1&#xFF09; &#x53D7;&#x4F53; (TIR) &#x57DF;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x5929;&#x7136;&#x514D;&#x75AB;&#x3002;&#x7531;&#x751F;&#x4EA7; TIR &#x540C;&#x6E90;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x3001; &#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x6291;&#x5236;&#x4E3B;&#x673A;&#x54CD;&#x5E94;&#x611F;&#x5E94;&#x548C;&#x6539;&#x5584;&#x81EA;&#x5DF1;&#x7684;&#x751F;&#x5B58;&#x3002;TIR &#x540C;&#x6E90;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28; TcpC &#x6700;&#x8FD1;&#x88AB;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E3A;&#x901A;&#x8FC7;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x5230; MyD88 &#x7684;&#x5148;&#x5929;&#x514D;&#x75AB;&#x6291;&#x5236;&#x6BD2;&#x529B;&#x56E0;&#x5B50;&#x5728;&#x81F4;&#x80BE;&#x76C2;&#x80BE;&#x708E;&#x5927;&#x80A0;&#x6746;&#x83CC; &#xFF08;&#x5927;&#x80A0;&#x6746;&#x83CC;&#xFF09; &#x4E2D;&#x3002;&#x8FD9;&#x9879;&#x7814;&#x7A76;&#x5BA1;&#x67E5;&#x4E86;&#x5982;&#x4F55;&#x4E3B;&#x673A; MyD88 &#x57FA;&#x56E0;&#x578B;&#x4FEE;&#x6539;&#x7684; TcpC &#x4F53;&#x5185;&#x5F71;&#x54CD;&#x548C;&#x662F;&#x5426;&#x9644;&#x52A0;&#xFF0C;TIR &#x57DF;&#x5305;&#x542B;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x53EF;&#x80FD;&#x88AD;&#x51FB;&#x7684; TcpC&#x3002;&#x91CE;&#x751F;&#x578B;&#x5C0F;&#x9F20; (wt)&#xFF0C;TcpC &#x7EC6;&#x83CC;&#x6BD2;&#x529B;&#x589E;&#x5F3A;&#xFF0C;&#x589E;&#x52A0;&#x6025;&#x6027;&#x6B7B;&#x4EA1;&#x7387;&#x3001; &#x7EC6;&#x83CC;&#x7684;&#x6301;&#x4E45;&#x6027;&#x548C;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x635F;&#x4F24;&#x540E;&#x611F;&#x67D3;&#x5927;&#x80A0;&#x6746;&#x83CC; CFT073 (TcpC +)&#xFF0C;&#x76F8;&#x6BD4; &Delta;TcpC &#x7F3A;&#x5931;&#x7A81;&#x53D8;&#x4F53;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x6548;&#x679C;&#x662F; Myd88(-/-) &#x548C; Tlr4(-/-) &#x7684;&#x5C0F;&#x9F20;&#x51CF;&#x6BD2;&#x3002;&#x5BBF;&#x4E3B;&#x5206;&#x6790;&#x8BC1;&#x5B9E; TcpC &#x6291;&#x5236; MYD88 CFT073 &#x611F;&#x67D3;&#x4EBA;&#x7C7B; uroepithelial &#x7EC6;&#x80DE;&#x76F8;&#x5173;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#xFF0C;&#x4F46;&#x6B64;&#x5916;&#x7684;&#x6291;&#x5236;&#x4F5C;&#x7528;&#x90FD;&#x5217;&#x5165;&#x7279;&#x91CC;&#x592B;&#x548C;&#x767D;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4ECB;&#x7D20;-6/IL 1 &#x7684;&#x4FE1;&#x53F7;&#x4F20;&#x5BFC;&#x901A;&#x8DEF;&#xFF0C;&#x8854;&#x63A5; MYD88 &#x4ECE;&#x5C5E;&#x548C;&#x72EC;&#x7ACB;&#x4FE1;&#x53F7;&#x53EF;&#x80FD;&#x7684;&#x76EE;&#x6807;&#x3002;&#x5BF9;&#x7EC6;&#x83CC;&#x6301;&#x4E45;&#x6027;&#x7684; TcpC &#x5F71;&#x54CD;&#x4E86;&#x7279;&#x91CC;&#x592B; (-/-) &#x5728;&#x51CF;&#x6BD2;&#x6216; Il 1&beta; (-/-) &#x5C0F;&#x9F20;&#x548C;&#x56FA;&#x6709;&#x514D;&#x75AB;&#x53CD;&#x5E94;&#x5230; &Delta;TcpC &#x589E;&#x52A0;&#xFF0C;&#x8BC1;&#x5B9E;&#x7279;&#x91CC;&#x592B;&#x548C; Il 1&beta; &#x4F9D;&#x8D56;&#x76EE;&#x6807;&#x53EF;&#x80FD;&#x4F1A;&#x6D89;&#x53CA;&#x4F53;&#x5185;&#xFF0C;&#x9664;&#x4E86; Myd88&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;&#x53EF;&#x6EB6;&#x6027; TcpC &#x6291;&#x5236; Myd88 &#x548C;&#x7279;&#x91CC;&#x592B;&#x4F9D;&#x8D56;&#x5355;&#x53CD;&#x5728;&#x5C0F;&#x9F20;&#x5DE8;&#x566C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4FE1;&#x53F7;&#x8F6C;&#x5BFC;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x7ED3;&#x679C;&#x8868;&#x660E;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x5730;&#x8BF4;&#xFF0C;TcpC &#x53EF;&#x80FD;&#x901A;&#x8FC7; TIR &#x57DF;&#x4FE1;&#x53F7;&#x548C;&#x4E0B;&#x6E38;&#x901A;&#x8DEF;&#x7684;&#x6291;&#x5236;&#x4F5C;&#x7528;&#x4FC3;&#x8FDB; UTI &#x5173;&#x8054;&#x7684;&#x75C5;&#x7406;&#x3002;&#x7531;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269; TcpC &#x4E3B;&#x673A;&#x54CD;&#x5E94;&#x7684;&#x65F6;&#x5F02;&#x5E38;&#x56E0;&#x6B64;&#x4F3C;&#x4E4E;&#x635F;&#x5BB3;&#x4FDD;&#x62A4;&#x4F5C;&#x7528;&#x7684;&#x5148;&#x5929;&#x514D;&#x75AB;&#x529B;&#xFF0C;&#x540C;&#x65F6;&#x4FC3;&#x8FDB;&#x708E;&#x75C7;&#x548C;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x635F;&#x4F24;&#x3002;

TIR &#x57DF;&#x7531; TcpC &#x4FE1;&#x53F7;&#x7684;&#x6291;&#x5236;&#x4F5C;&#x7528;&#xFF1A; MyD88 &#x4F9D;&#x8D56;&#x548C;&#x72EC;&#x7ACB;&#x5BF9;&#x5927;&#x80A0;&#x57C3;&#x5E0C;&#x6C0F;&#x5927;&#x80A0;&#x6746;&#x83CC;&#x6BD2;&#x529B;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x3002;

Toll-like receptor signaling requires functional Toll/interleukin-1 (IL-1) receptor (TIR) domains to activate innate immunity. By producing TIR homologous proteins, microbes inhibit host response induction and improve their own survival. The TIR homologous protein TcpC was recently identified as a virulence factor in uropathogenic Escherichia coli (E. coli), suppressing innate immunity by binding to MyD88. This study examined how the host MyD88 genotype modifies the in vivo effects of TcpC and whether additional, TIR-domain containing proteins might be targeted by TcpC. In wild type mice (wt), TcpC enhanced bacterial virulence, increased acute mortality, bacterial persistence and tissue damage after infection with E. coli CFT073 (TcpC+), compared to a Î”TcpC deletion mutant. These effects were attenuated in Myd88(-/-) and Tlr4(-/-) mice. Transcriptomic analysis confirmed that TcpC inhibits MYD88 dependent gene expression in CFT073 infected human uroepithelial cells but in addition the inhibitory effect included targets in the TRIF and IL-6/IL-1 signaling pathways, where MYD88 dependent and independent signaling may converge. The effects of TcpC on bacterial persistence were attenuated in Trif (-/-) or Il-1Î² (-/-) mice and innate immune responses to Î”TcpC were increased, confirming that Trif and Il-1Î² dependent targets might be involved in vivo, in addition to Myd88. Furthermore, soluble TcpC inhibited Myd88 and Trif dependent TLR signaling in murine macrophages. Our results suggest that TcpC may promote UTI-associated pathology broadly, through inhibition of TIR domain signaling and downstream pathways. Dysregulation of the host response by microbial TcpC thus appears to impair the protective effects of innate immunity, while promoting inflammation and tissue damage.

Inhibition of TIR domain signaling by TcpC: MyD88-dependent and independent effects on Escherichia coli virulence.

Signalisation Toll-like receptor exige sans frais/interleukin-1 (il-1) r&eacute;cepteur (TIR) domaines fonctionnels pour activer l&#39;immunit&eacute; inn&eacute;e. En produisant des prot&eacute;ines homologues de TIR, les microbes inhibent l&#39;induction de r&eacute;ponse h&ocirc;te et am&eacute;liorer leur propre survie. La prot&eacute;ine homologue de TIR TcpC a &eacute;t&eacute; r&eacute;cemment identifi&eacute;e comme un facteur de virulence chez uropathog&egrave;nes Escherichia coli (e. coli), suppression de l&#39;immunit&eacute; inn&eacute;e en se liant &agrave; MyD88. Cette &eacute;tude examine comment le g&eacute;notype de l&#39;h&ocirc;te MyD88 modifie les effets in vivo du TcpC et si suppl&eacute;mentaires, prot&eacute;ines contenant de TIR-domaine pourraient &ecirc;tre cibl&eacute;s par TcpC. Chez les souris de type sauvage (wt), TcpC am&eacute;lior&eacute; la virulence bact&eacute;rienne, a augment&eacute; la mortalit&eacute; aigu&euml;, persistance bact&eacute;rienne et des l&eacute;sions tissulaires apr&egrave;s infection &agrave; E. coli CFT073 (TcpC +), comparativement &agrave; un mutant de d&eacute;l&eacute;tion de &Delta;TcpC. Ces effets ont &eacute;t&eacute; att&eacute;nu&eacute;es chez les souris Myd88(-/-) et Tlr4(-/-). Analyse transcriptomique confirme TcpC inhibe l&#39;expression des g&egrave;nes d&eacute;pendants MYD88 dans les cellules humaines uro&eacute;pith&eacute;liales CFT073 infect&eacute; mais en outre l&#39;effet inhibiteur inclus des cibles dans les voies de signalisation FTBC et IL-6/IL-1, o&ugrave; MYD88 d&eacute;pendantes et ind&eacute;pendantes de la signalisation peut converger. Les effets du TcpC sur la persistance de bact&eacute;ries ont &eacute;t&eacute; att&eacute;nu&eacute;es dans Trif (- / -) ou la souris Il-1&beta; (- / -) et les r&eacute;ponses immunitaires inn&eacute;es &agrave; &Delta;TcpC ont &eacute;t&eacute; augment&eacute;s, confirmant que cibles d&eacute;pendantes FTBC et Il-1&beta; interviendrait in vivo, en plus de Myd88. En outre, soluble TcpC inhib&eacute;e Myd88 et FTBC TLR dependent signaling in macrophages murins. Nos r&eacute;sultats sugg&egrave;rent que le TcpC peut promouvoir pathologie associ&eacute;e &agrave; UTI largement, par inhibition des voies de signalisation et en aval du domaine TIR. Ainsi, le d&eacute;r&egrave;glement de la r&eacute;ponse de l&#39;h&ocirc;te par TcpC microbienne semble alt&eacute;rer les effets protecteurs de l&#39;immunit&eacute; inn&eacute;e, tout en favorisant l&#39;inflammation et les tissus des dommages.

Inhibition du domaine TIR signalisation par TcpC : MyD88-d&eacute;pendante et ind&eacute;pendantes des effets sur la virulence de Escherichia coli.

Toll-Like-Rezeptor Signalgebung erfordert funktionelle Toll/interleukin-1 (Il-1) Rezeptor (TIR) Dom&auml;nen, Angeborene Immunit&auml;t zu aktivieren. Durch die Herstellung von TIR homologe Proteine, Mikroben hemmen Host Reaktion Induktion und verbessern ihr eigenes &Uuml;berleben. Das TIR-homologe Protein TcpC wurde vor kurzem als Virulenzfaktoren Uropathogenic Escherichia coli (E. Coli), Unterdr&uuml;ckung der angeborenen Immunit&auml;t durch Bindung an MyD88 identifiziert. Diese Studie untersucht, wie der Host MyD88-Genotyp &auml;ndert die in-vivo Effekte der TcpC und ob zus&auml;tzliche, m&ouml;glicherweise TIR-Dom&auml;ne enthaltenden Proteine durch TcpC ausgerichtet werden. Wildtyp-M&auml;usen (wt) TcpC verst&auml;rkter bakterielle Virulenz, erh&ouml;hte akute Mortalit&auml;t, bakteriellen Persistenz und Gewebesch&auml;den nach Infektionen mit E. coli CFT073 (TcpC +), im Vergleich zu &Delta;TcpC L&ouml;schung Mutanten. Diese Effekte wurden in Myd88(-/-) und Tlr4(-/-) M&auml;use abgeschw&auml;cht. Transcriptomic-Analyse best&auml;tigt, dass die TcpC hemmt MYD88 abh&auml;ngigen Genexpression in CFT073 infiziert menschliche Uroepithelial Zellen jedoch dar&uuml;ber hinaus die hemmende Wirkung Ziele in der TRIF und IL-6/IL-1 Signalwege, wo MYD88 abh&auml;ngigen und unabh&auml;ngigen Signalisierung zusammenlaufen kann. Die Auswirkungen der TcpC auf bakteriellen Persistenz waren in Trif (- / -) abgeschw&auml;cht oder Il-1&beta; (- / -) M&auml;use und angeborene Immune Antworten zu &Delta;TcpC wurden erh&ouml;ht, best&auml;tigt, dass Trif und Il-1&beta; abh&auml;ngige Ziele in-vivo, neben Myd88 beteiligt sein k&ouml;nnte. Au&szlig;erdem hemmte l&ouml;slichen TcpC Myd88 und Trif abh&auml;ngige TLR-Signalisierung in murinen Makrophagen. Unsere Ergebnisse legen nahe, dass die TcpC UTI-assoziierte Pathologie im gro&szlig;en und ganzen durch Hemmung der TIR Dom&auml;ne Signalisierung und nachgeschalteten Bahnen f&ouml;rdern kann. Dysregulation der Wirtsantwort durch mikrobielle TcpC scheint daher die sch&uuml;tzende Wirkung der angeborenen Immunit&auml;t, w&auml;hrend die F&ouml;rderung von Entz&uuml;ndung und Gewebe Schaden zu beeintr&auml;chtigen.

Hemmung der TIR-Dom&auml;ne, die Signalisierung durch TcpC: MyD88-abh&auml;ngige und unabh&auml;ngige Effekte auf Escherichia coli Virulenz.

Toll-like receptor signaling richiede funzionali pedaggio/interleukin-1 (il-1) recettore (TIR) domini per attivare l&#39;immunit&agrave; innata. Producendo proteine omologhe TIR, microbi inibiscono l&#39;induzione di risposta host e migliorare la propria sopravvivenza. La proteina omologa TIR TcpC recentemente &egrave; stata identificata come un fattore di virulenza in uropathogenic Escherichia coli (e. coli), sopprimere l&#39;immunit&agrave; innata legandosi a MyD88. Questo studio ha esaminato come il genotipo host MyD88 modifica gli effetti in vivo di TcpC e se supplementari, le proteine TIR-dominio potrebbero essere preso di mira da TcpC. Nei topi wild type (wt), TcpC una maggiore virulenza batterica, aumento della mortalit&agrave; acuta, persistenza batterica e danni ai tessuti dopo un&#39;infezione da E. coli CFT073 (TcpC +), rispetto ad un mutante di delezione di &Delta;TcpC. Questi effetti sono stati attenuati nei topi Myd88(-/-) e Tlr4(-/-). Analisi trascrittomica ha confermato che TcpC inibisce la espressione genica dipendente MYD88 nelle cellule uroepithelial umano CFT073 infettata ma inoltre l&#39;effetto inibitorio inclusi obiettivi nelle vie segnalazione TRIF e IL-6/IL-1, dove MYD88 dipendenti e indipendenti di segnalazione potrebbero convergere. Gli effetti del TcpC sulla persistenza batterica sono stati attenuati in Trif (- / -) o Il-1 &beta; (- / -) topi e risposta immunitaria innata di &Delta;TcpC sono stati aumentati, confermando che Trif e Il-1 &beta; dipendenti obiettivi potrebbero essere coinvolti in vivo, oltre a Myd88. Inoltre, solubile TcpC inibito Myd88 e Trif dipendente TLR segnalazione in macrofagi murini. I nostri risultati suggeriscono che TcpC pu&ograve; promuovere UTI-associata patologia largamente, attraverso l&#39;inibizione delle vie di segnalazione e a valle di dominio TIR. Disregolazione della risposta dell&#39;ospite da TcpC microbica appare cos&igrave; a compromettere gli effetti protettivi dell&#39;immunit&agrave; innata, promuovendo nel contempo l&#39;infiammazione e tessuto danni.

Inibizione del dominio TIR segnalazione da TcpC: effetti MyD88-dipendente e indipendenti sulla virulenza di Escherichia coli.

Toll &#x69D8;&#x53D7;&#x5BB9;&#x4F53;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x4F1D;&#x9054;&#x306E;&#x81EA;&#x7136;&#x514D;&#x75AB;&#x3092;&#x30A2;&#x30AF;&#x30C6;&#x30A3;&#x30D6;&#x306B;&#x3059;&#x308B;&#x6A5F;&#x80FD;&#x901A;&#x884C;&#x6599;/&#x30A4;&#x30F3;&#x30BF;&#x30FC;&#x30ED;&#x30A4;&#x30AD;&#x30F3;-1 (IL-1) &#x53D7;&#x5BB9;&#x4F53; (TIR) &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x304C;&#x5FC5;&#x8981;&#x3067;&#x3059;&#x3002;TIR &#x76F8;&#x540C;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3092;&#x751F;&#x7523;&#x3001;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x306F;&#x30DB;&#x30B9;&#x30C8;&#x5FDC;&#x7B54;&#x8A98;&#x5C0E;&#x3092;&#x963B;&#x5BB3;&#x3057;&#x3066;&#x72EC;&#x81EA;&#x306E;&#x751F;&#x5B58;&#x3092;&#x6539;&#x5584;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;TIR &#x76F8;&#x540C;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA; TcpC &#x306F;&#x6700;&#x8FD1; MyD88 &#x3078;&#x306E;&#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x81EA;&#x7136;&#x514D;&#x75AB;&#x3092;&#x6291;&#x5236;&#x3059;&#x308B;&#x5C3F;&#x8DEF;&#x75C5;&#x539F;&#x6027;&#x5927;&#x8178;&#x83CC; &#xFF08;&#x5927;&#x8178;&#x83CC;&#xFF09; &#x306E;&#x75C5;&#x539F;&#x6027;&#x8981;&#x56E0;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x540C;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3069;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x30DB;&#x30B9;&#x30C8; MyD88 &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50; TcpC &#x306E;&#x30A4;&#x30F3;&#x30D3;&#x30DC;&#x52B9;&#x679C;&#x3092;&#x5909;&#x66F4;&#x3057;&#x3001;&#x8FFD;&#x52A0;&#x3059;&#x308B;&#x304B;&#x3069;&#x3046;&#x304B;&#x306F;&#x3001;TIR &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x542B;&#x6709;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA; TcpC &#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x304B;&#x3082;&#x3057;&#x308C;&#x306A;&#x3044;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x691C;&#x8A0E;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x91CE;&#x751F;&#x578B;&#x30DE;&#x30A6;&#x30B9; (wt)&#x3001;TcpC&#x3001;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E;&#x75C5;&#x539F;&#x6027;&#x5F37;&#x5316;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x6025;&#x6027;&#x6B7B;&#x4EA1;&#x3001;&#x30D0;&#x30AF;&#x30C6;&#x30EA;&#x30A2;&#x306E;&#x30D1;&#x30FC;&#x30B7; &#x30B9;&#x30BF;&#x30F3;&#x30B9;&#x3068;&#x306F; &Delta;TcpC &#x6B20;&#x5931;&#x5909;&#x7570;&#x306B;&#x6BD4;&#x8F03;&#x3057;&#x3066;&#x7D44;&#x7E54;&#x306E;&#x640D;&#x50B7;&#x5927;&#x8178;&#x83CC; CFT073 &#x3068;&#x611F;&#x67D3;&#x5F8C;&#x306F; (TcpC +) &#x5897;&#x52A0;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x52B9;&#x679C;&#x306F; Myd88(-/-) &#x3068; Tlr4(-/-) &#x306E;&#x30DE;&#x30A6;&#x30B9;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x5F31;&#x6BD2;&#x3044;&#x305F;&#x3002;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x30FC;&#x30E0;&#x89E3;&#x6790; TcpC CFT073 &#x611F;&#x67D3;&#x4EBA;&#x9593;&#x306E;&#x6027;&#x7D30;&#x80DE;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B; MYD88 &#x4F9D;&#x5B58;&#x3057;&#x3066;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x963B;&#x5BB3;&#x3059;&#x308B;&#x304C;&#x3001;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x6291;&#x5236;&#x52B9;&#x679C;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8; MYD88 &#x4F9D;&#x5B58;&#x30FB;&#x975E;&#x4F9D;&#x5B58;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x4F1D;&#x9054;&#x304C;&#x53CE;&#x675F;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3068; TRIF&#x3001;IL 6/IL 1 &#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x4F1D;&#x9054;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x3067;&#x3001;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x3066;&#x3092;&#x78BA;&#x8A8D;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;Il-1 (-/-) &#x30DE;&#x30A6;&#x30B9;&#x3068;&#x751F;&#x6765;&#x306E;&#x514D;&#x75AB;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3092; &Delta;TcpC Trif &#x3068; il-1 &#x4F9D;&#x5B58;&#x3057;&#x305F;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8; &#x30A4;&#x30F3;&#x30D3;&#x30DC;&#x3001;Myd88 &#x306B;&#x52A0;&#x3048;&#x3066;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x78BA;&#x8A8D;&#x3059;&#x308B;&#x3001;&#x5897;&#x52A0;&#x3057;&#x305F;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E;&#x6C38;&#x7D9A;&#x6027;&#x306B;&#x53CA;&#x307C;&#x3059; TcpC Trif (-/-) &#x6E1B;&#x8870;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x3001;&#x53EF;&#x6EB6;&#x6027; TcpC Myd88 &#x3068; Trif &#x4F9D;&#x5B58; TLR &#x30DE;&#x30A6;&#x30B9;&#x30DE;&#x30AF;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30FC;&#x30B8; &#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x4F1D;&#x9054;&#x3092;&#x963B;&#x5BB3;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;TcpC &#x5C3F;&#x8DEF;&#x611F;&#x67D3;&#x75C7;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x3059;&#x308B;&#x75C5;&#x7406;&#x5E83;&#x304F;&#x3001;TIR &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3; &#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x3068;&#x4E0B;&#x6D41;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x306E;&#x963B;&#x5BB3;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x4FC3;&#x9032;&#x3059;&#x308B;&#x304B;&#x3082;&#x3057;&#x308C;&#x306A;&#x3044;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x793A;&#x5506;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269; TcpC &#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x30DB;&#x30B9;&#x30C8;&#x5FDC;&#x7B54;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x4E0D;&#x5168;&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x3046;&#x3057;&#x3066;&#x708E;&#x75C7;&#x3084;&#x7D44;&#x7E54;&#x306E;&#x640D;&#x50B7;&#x3092;&#x63A8;&#x9032;&#x3057;&#x306A;&#x304C;&#x3089;&#x81EA;&#x7136;&#x514D;&#x75AB;&#x306E;&#x4FDD;&#x8B77;&#x52B9;&#x679C;&#x3092;&#x640D;&#x306A;&#x3046;&#x304C;&#x8868;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

TIR &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066; TcpC &#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x4F1D;&#x9054;&#x306E;&#x963B;&#x5BB3;&#xFF1A; &#x5927;&#x8178;&#x83CC;&#x5927;&#x8178;&#x83CC;&#x306E;&#x75C5;&#x539F;&#x6027;&#x306B;&#x53CA;&#x307C;&#x3059; MyD88 &#x306B;&#x4F9D;&#x5B58;&#x3057;&#x3001;&#x72EC;&#x7ACB;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

&#xC218;&#xC2E0;&#xC790; &#xAC19;&#xC740; &#xC218;&#xC6A9; &#xCCB4; &#xC2E0;&#xD638; &#xAE30;&#xB2A5; &#xC218;&#xC2E0;&#xC790;/interleukin-1 (&#xC77C;&#xB9AC;&#xB178;&#xC774;) &#xC218;&#xC6A9; &#xCCB4; (&#xC0AC;&#xACA9;) &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;&#xC744; &#xD0C0;&#xACE0; &#xB09C; &#xBA74;&#xC5ED;&#xC744; &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xD574;&#xC57C; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC0AC;&#xACA9; &#xB3D9;&#xC885; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC744; &#xC0DD;&#xC0B0; &#xD558; &#xC5EC; &#xBBF8;&#xC0DD;&#xBB3C; &#xC5B5;&#xC81C; &#xD638;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xC751;&#xB2F5; &#xC720;&#xB3C4; &#xD558; &#xACE0; &#xC790;&#xC2E0;&#xC758; &#xC0DD;&#xC874;&#xC744; &#xD5A5;&#xC0C1;. &#xC0AC;&#xACA9; &#xB3D9;&#xC885; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; TcpC &#xCD5C;&#xADFC; MyD88 &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xD558;&#xC5EC; &#xD0C0;&#xACE0; &#xB09C; &#xBA74;&#xC5ED; &#xC5B5;&#xC81C; uropathogenic &#xB300;&#xC7A5;&#xADE0; (&#xB300;&#xC7A5;&#xADE0;)&#xC758; &#xB3C5;&#xC131; &#xC694;&#xC778;&#xC73C;&#xB85C; &#xD655;&#xC778; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xC870;&#xC0AC; &#xD638;&#xC2A4;&#xD2B8; MyD88 &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD615; Tcpc&#xC758; in vivo &#xD6A8;&#xACFC; &#xC218;&#xC815; &#xBC29;&#xBC95;&#xACFC; &#xC5EC;&#xBD80; &#xCD94;&#xAC00;, &#xC0AC;&#xACA9; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778; &#xD3EC;&#xD568; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; TcpC &#xB300;&#xC0C1;&#xC774; &#xB420; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC57C;&#xC0DD; &#xD0C0;&#xC785; &#xB9C8;&#xC6B0;&#xC2A4; (wt), TcpC &#xC138;&#xADE0; &#xB3C5;&#xC131;&#xC744; &#xAC15;&#xD654;, &#xAE09;&#xC131; &#xC0AC;&#xB9DD;&#xB960;, &#xC138;&#xADE0; &#xC9C0; &#xC18D;&#xC131; &#xBC0F; &#xC870;&#xC9C1; &#xC190;&#xC0C1;&#xC744; E. &#xB300;&#xC7A5;&#xADE0; CFT073 &#xAC10;&#xC5FC; &#xD6C4; (TcpC +) &Delta;TcpC &#xC0AD;&#xC81C; &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774;&#xC5D0; &#xBE44;&#xD574; &#xC99D;&#xAC00; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xD6A8;&#xACFC; Myd88(-/-) &#xBC0F; Tlr4(-/-) &#xB9C8;&#xC6B0;&#xC2A4;&#xC5D0; &#xAC10;&#xC1E0; &#xD588;&#xB2E4;. Transcriptomic &#xBD84;&#xC11D; TcpC CFT073 &#xAC10;&#xC5FC; &#xB41C; &#xC778;&#xAC04; uroepithelial &#xC140;&#xC5D0;&#xC11C; MYD88 &#xC885;&#xC18D; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC744; &#xC5B5;&#xC81C; &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xC5B5;&#xC81C; &#xD6A8;&#xACFC; &#xB300;&#xC0C1; TRIF &#xBC0F; IL-6/IL 1 &#xC2E0;&#xD638; &#xACBD;&#xB85C;, MYD88 &#xC885;&#xC18D; &#xBC0F; &#xB3C5;&#xB9BD; &#xC2E0;&#xD638;&#xB97C; &#xC218;&#xB834; &#xC218;&#xC5D0; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558;&#xB294; &#xB610;&#xD55C; &#xD655;&#xC778; &#xD588;&#xB2E4;. TcpC &#xC138;&#xADE0; &#xC9C0; &#xC18D;&#xC131;&#xC5D0; &#xBBF8;&#xCE58;&#xB294; &#xC601;&#xD5A5; (-/-) Trif&#xC5D0;&#xC11C; &#xAC10;&#xC1E0; &#xD588;&#xB2E4; &#xB610;&#xB294; Il-1&beta; (-/-) &#xB9C8;&#xC6B0;&#xC2A4; &#xBC0F; &Delta;tcpc&#xB97C; &#xD0C0;&#xACE0; &#xB09C; &#xBA74;&#xC5ED; &#xBC18;&#xC751; &#xC99D;&#xAC00; &#xD588;&#xB2E4;, Trif &#xBC0F; Il 1&beta; &#xC885;&#xC18D; &#xB300;&#xC0C1; &#xC0DD;&#xCCB4; &#xC870;&#xAC74;, Myd88 &#xC774;&#xC678;&#xC5D0; &#xC5F0;&#xB8E8; &#xB420; &#xC218;&#xB3C4; &#xD655;&#xC778; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB610;&#xD55C;, &#xC218;&#xC6A9; &#xC131; TcpC &#xC800;&#xD574; Myd88 &#xBC0F; Trif &#xC885;&#xC18D; TLR murine &#xB300; &#xC2DD; &#xC138;&#xD3EC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC2E0;&#xD638;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xACB0;&#xACFC; TcpC &#xD64D;&#xBCF4; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xC694;&#xB85C; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xBCD1; &#xB9AC; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD558; &#xAC8C;, &#xC0AC;&#xACA9; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778; &#xC2E0;&#xD638; &#xBC0F; &#xB2E4;&#xC6B4;&#xC2A4;&#xD2B8;&#xB9BC; &#xD1B5;&#xB85C;&#xC758; &#xC5B5;&#xC81C;&#xB97C; &#xD1B5;&#xD574; &#xAC83;&#xC774; &#xC88B;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C; &#xBBF8;&#xC0DD;&#xBB3C; Tcpc&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xD638;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xC751;&#xB2F5; Dysregulation &#xC5FC;&#xC99D;&#xACFC; &#xC870;&#xC9C1; &#xC190;&#xC0C1;&#xC744; &#xCD94;&#xC9C4; &#xD558;&#xBA74;&#xC11C; &#xD0C0;&#xACE0; &#xB09C; &#xBA74;&#xC81C;&#xC758; &#xBCF4;&#xD638; &#xD6A8;&#xACFC; &#xC190;&#xC0C1; &#xC2DC;&#xD0AC; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0A9;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xC0AC;&#xACA9; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778; Tcpc&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC2E0;&#xD638; &#xC5B5;&#xC81C;: &#xBCD1;&#xC6D0; &#xC131; &#xB300;&#xC7A5;&#xADE0;&#xC758; &#xB3C5;&#xC131;&#xC5D0; MyD88 &#xC885;&#xC18D; &#xBC0F; &#xB3C5;&#xB9BD; &#xD6A8;&#xACFC;.

Toll-like receptor se&ntilde;alizaci&oacute;n requiere dominios peaje/interleukin-1 (IL-1) funcionales de la del receptor (TIR) para activar la inmunidad innata. Mediante la producci&oacute;n de prote&iacute;nas hom&oacute;logas de TIR, microbios inhiben la inducci&oacute;n de respuesta del host y mejoran su propia supervivencia. La prote&iacute;na hom&oacute;loga TIR TcpC fue identificada recientemente como un factor de virulencia en uropat&oacute;genos Escherichia coli (e. coli), supresi&oacute;n de la inmunidad innata atando a MyD88. Este estudio examin&oacute; c&oacute;mo el genotipo del anfitri&oacute;n MyD88 modifica los efectos in vivo de TcpC y si adicional, prote&iacute;nas que contienen TIR-dominio podr&iacute;an ser objetivo de TcpC. En ratones de tipo salvaje (wt), TcpC mayor virulencia bacteriana, mayor mortalidad aguda, persistencia bacteriana y da&ntilde;o a los tejidos despu&eacute;s de la infecci&oacute;n con E. coli CFT073 (TcpC +), en comparaci&oacute;n con un mutante de eliminaci&oacute;n de &Delta;TcpC. Estos efectos fueron atenuados en ratones Myd88(-/-) y Tlr4(-/-). An&aacute;lisis transcript&oacute;mico confirman que TcpC inhibe MYD88 dependiente de genes en las c&eacute;lulas uroepiteliales humanas CFT073 infectados pero adem&aacute;s el efecto inhibitorio incluy&oacute; blancos en las v&iacute;as de se&ntilde;alizaci&oacute;n TRIF y IL-6/IL-1, donde MYD88 dependientes e independientes de se&ntilde;alizaci&oacute;n puede converger. Los efectos de TcpC persistencia bacteriana se aten&uacute;an en Trif (- / -) o Il-1&beta; (- / -) ratones e innatas inmunorespuestas a &Delta;TcpC fueron aumentados, confirmando que objetivos dependientes Trif y Il-1&beta; involucrarnos en vivo, adem&aacute;s de Myd88. Adem&aacute;s, TcpC soluble hab&iacute;a inhibida Myd88 y Trif dependiente TLR se&ntilde;alizaci&oacute;n en macr&oacute;fagos murinos. Nuestros resultados sugieren que la TcpC puede promover patolog&iacute;a asociada a IU en t&eacute;rminos generales, mediante la inhibici&oacute;n de las v&iacute;as de se&ntilde;alizaci&oacute;n y aguas abajo de dominio TIR. Desregulaci&oacute;n de la respuesta del hu&eacute;sped por TcpC microbiana as&iacute; parece afectar los efectos protectores de la inmunidad innata, promoviendo da&ntilde;os inflamaci&oacute;n y tejido.

Inhibici&oacute;n de dominio TIR por TcpC: efectos MyD88 dependiente e independientes en la virulencia de Escherichia coli.

DNA &#x30EF;&#x30AF;&#x30C1;&#x30F3;&#x306F;&#x5206;&#x5B50;&#x6A19;&#x7684;&#x306B;&#x5BFE;&#x3059;&#x308B;&#x514D;&#x75AB;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3092;&#x8A98;&#x5C0E;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x5E83;&#x304F;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x6211;&#x3005; &#x3068;&#x514D;&#x75AB;&#x6291;&#x5236;&#x5264; FK506 &#x7D50;&#x5408; DNA &#x30EF;&#x30AF;&#x30C1;&#x30F3;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x306E;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x3092;&#x63A2;&#x3063;&#x305F; &#xFF08;&#x30BF;&#x30AF;&#x30ED;&#x30EA;&#x30E0;&#x30B9;&#xFF09; &#x6297;&#x539F;&#x5177;&#x4F53;&#x7684;&#x306B;&#x4E0D;&#x8981;&#x306A;&#x514D;&#x75AB;&#x53CD;&#x5FDC;&#x3092;&#x6291;&#x5236;&#x3057;&#x3001;&#x81EA;&#x5DF1;&#x514D;&#x75AB;&#x306E;&#x5375;&#x5DE3;&#x306E;&#x75C5;&#x6C17;&#x3092;&#x9632;&#x3050;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x3002;&#x305D;&#x306E;&#x7D42;&#x308F;&#x308A;&#x306B;, c57bl/6 &#x30DE;&#x30A6;&#x30B9;&#x3092;&#x514D;&#x75AB;&#x3057;&#x305F;&#x30DE;&#x30A6;&#x30B9;&#x80DA; 3 (ZP3) &#x3068;&#x5171;&#x306B; FK506 &#x30A8;&#x30F3;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0; DNA &#x30EF;&#x30AF;&#x30C1;&#x30F3;&#x3002;&#x4E88;&#x9632;&#x63A5;&#x7A2E; ZP3 &#x56FA;&#x6709;&#x9045;&#x5EF6;&#x578B;&#x904E;&#x654F;&#x75C7;&#x53CD;&#x5FDC;&#x306E;&#x52D5;&#x7269;&#x306E;&#x8A98;&#x5C0E;&#x3092;&#x6291;&#x5236;&#x3057;&#x305F; ZP3 &#x56FA;&#x6709; CD4(+)CD25(+)Foxp3(+) &#x898F;&#x5236;&#x306E; T &#x7D30;&#x80DE; &#xFF08;Treg&#xFF09; &#x8A98;&#x767A;&#x3002;&#x5927;&#x5E45;&#x306B;&#x3001;&#x4E88;&#x9632;&#x63A5;&#x7A2E;&#x306F;&#x307E;&#x305F;&#x52D5;&#x7269;&#x5B9F;&#x9A13;&#x7684;&#x81EA;&#x5DF1;&#x514D;&#x75AB;&#x6027;&#x5375;&#x5DE3;&#x75BE;&#x60A3;&#x304B;&#x3089;&#x4FDD;&#x8B77;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3002;FK506 &#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x4E0B;&#x3067;&#x306E; DNA &#x30EF;&#x30AF;&#x30C1;&#x30F3; Treg &#x7D30;&#x80DE;&#x3092;&#x8A98;&#x5C0E;&#x3057;&#x3001;AOD &#x3092;&#x9632;&#x3050;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x304C;&#x793A;&#x5506;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

&#x81EA;&#x5DF1;&#x514D;&#x75AB;&#x6027;&#x5375;&#x5DE3;&#x75BE;&#x60A3;&#x306E;&#x4E88;&#x9632;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x514D;&#x75AB;&#x5BDB;&#x5BB9; DNA &#x30EF;&#x30AF;&#x30C1;&#x30F3;&#x3002;

DNA &#x75AB;&#x82D7;&#x5DF2;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x7528;&#x4E8E;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x514D;&#x75AB;&#x5E94;&#x7B54;&#x5BF9;&#x5206;&#x5B50;&#x7684;&#x76EE;&#x6807;&#x3002;&#x5728;&#x6B64;&#x7814;&#x7A76;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x63A2;&#x8BA8;&#x4E86;&#x4F7F;&#x7528; DNA &#x75AB;&#x82D7;&#x8054;&#x5408;&#x514D;&#x75AB;&#x6291;&#x5236;&#x5242; FK506 &#x7684;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027; (&#x83AB;) &#x6297;&#x539F;&#x4E13;&#x95E8;&#x5236;&#x6B62;&#x6709;&#x5BB3;&#x7684;&#x514D;&#x75AB;&#x53CD;&#x5E94;&#x548C;&#x9632;&#x6B62;&#x81EA;&#x8EAB;&#x514D;&#x75AB;&#x6027;&#x5375;&#x5DE2;&#x75BE;&#x75C5;&#x3002;&#x4E3A;&#x6B64;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x4E0E; FK506 &#x7F16;&#x7801;&#x5C0F;&#x9F20;&#x5375;&#x900F;&#x660E;&#x5E26; 3 (ZP3) DNA &#x75AB;&#x82D7;&#x514D;&#x75AB; C57BL/6 &#x5C0F;&#x9F20;&#x3002;&#x514D;&#x75AB;&#x8BF1;&#x5BFC; ZP3 &#x7279;&#x5B9A; CD4(+)CD25(+)Foxp3(+) &#x76D1;&#x7BA1; T &#x7EC6;&#x80DE; &#xFF08;Treg&#xFF09;&#xFF0C;&#x5176;&#x4E2D;&#x9690;&#x542B;&#x7684; ZP3 &#x7279;&#x5B9A;&#x8D85;&#x654F;&#x52A8;&#x7269;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x3002;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x662F;&#xFF0C;&#x514D;&#x75AB;&#x63A5;&#x79CD;&#x8FD8;&#x4FDD;&#x62A4;&#x52A8;&#x7269;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x81EA;&#x8EAB;&#x514D;&#x75AB;&#x6027;&#x5375;&#x5DE2;&#x75BE;&#x75C5;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7ED3;&#x679C;&#x8868;&#x660E;&#x5B58;&#x5728; FK506 &#x7684; DNA &#x75AB;&#x82D7;&#x63A5;&#x79CD;&#x53EF;&#x80FD;&#x7528;&#x4E8E;&#x8BF1;&#x4F7F; Treg &#x7EC6;&#x80DE;&#xFF0C;&#x9632;&#x6B62;&#x6C14;&#x6EB6;&#x80F6;&#x5149;&#x5B66;&#x539A;&#x5EA6;&#x3002;

&#x9884;&#x9632;&#x81EA;&#x8EAB;&#x514D;&#x75AB;&#x6027;&#x5375;&#x5DE2;&#x75BE;&#x75C5;&#x7684;&#x8010;&#x53D7; DNA &#x75AB;&#x82D7;&#x3002;

DNA vaccines have been widely used to induce immune responses against molecular targets. In this study, we explored the possibility of using DNA vaccine combined with the immunosuppressant FK506 (tacrolimus) to antigen-specifically suppress unwanted immune responses and prevent autoimmune ovarian disease. To that end, we immunized C57BL/6 mice with a DNA vaccine encoding mouse zona pellucida 3 (ZP3) together with FK506. The immunization induced ZP3-specific CD4(+)CD25(+)Foxp3(+) regulatory T cells (Treg), which suppressed the induction of ZP3-specific delayed-type hypersensitivity in the animals. Significantly, the immunization also protected the animals from experimentally induced autoimmune ovarian disease. These results suggest that DNA vaccination in the presence of FK506 may be used to induce Treg cells and prevent AOD.

Tolerogenic DNA vaccine for prevention of autoimmune ovarian disease.

Vaccins &agrave; ADN ont &eacute;t&eacute; largement utilis&eacute;es pour induire des r&eacute;ponses immunitaires contre des cibles mol&eacute;culaires. Dans cette &eacute;tude, nous avons explor&eacute; la possibilit&eacute; d&#39;utiliser le vaccin &agrave; ADN combin&eacute; avec les immunosuppresseurs FK506 (tacrolimus) antig&egrave;ne sp&eacute;cifique supprimer des r&eacute;ponses immunitaires ind&eacute;sirables et pr&eacute;venir les maladies auto-immunes ovarienne. &Agrave; cette fin, nous avons vaccin&eacute; souris C57BL/6 avec un vaccin &agrave; ADN codant la souris zone pellucide 3 (ZP3) avec FK506. La vaccination a induit des lymphocytes T r&eacute;gulateurs sp&eacute;cifiques ZP3 CD4(+)CD25(+)Foxp3(+) (Treg), qui a supprim&eacute; l&#39;induction de ZP3 sp&eacute;cifiques hypersensibilit&eacute; retard&eacute;e chez les animaux. Significativement, la vaccination &eacute;galement prot&eacute;g&eacute; les animaux de la maladie ovarienne auto-immune induite exp&eacute;rimentalement. Ces r&eacute;sultats sugg&egrave;rent que la vaccination ADN en pr&eacute;sence de FK506 peut servir &agrave; induire les cellules Treg et emp&ecirc;cher l&#39;AOD.

Vaccin ADN tol&eacute;rog&egrave;ne pour pr&eacute;venir la maladie ovarienne auto-immune.

DNA-Impfstoffe haben allgemein verwendet worden, um Immunantworten gegen Molekulare hervorzurufen. In dieser Studie haben wir die M&ouml;glichkeit der Verwendung von DNA-Impfstoff in Kombination mit dem Immunsuppressivum FK506 untersucht (Tacrolimus) Antigen-spezifisch unerw&uuml;nschte Immunantworten zu unterdr&uuml;cken und verhindern, dass Eierstock Autoimmunerkrankung. Zu diesem Zweck geimpft wir C57BL/6 M&auml;usen mit einem DNA-Impfstoff Codierung Maus Zona Pellucida 3 (ZP3) zusammen mit FK506. Die Immunisierung induzierte ZP3-spezifische CD4(+)CD25(+)Foxp3(+) regulatorische T-Zellen (Treg), die die Induktion von ZP3-spezifische verz&ouml;gerten Typ &Uuml;berempfindlichkeit in den Tieren unterdr&uuml;ckt. Deutlich, die Immunisierung gesch&uuml;tzt auch die Tiere experimentell induzierten ovariellen Autoimmunerkrankung. Diese Resultate schlagen vor, da&szlig; DNA-Impfung in Anwesenheit von FK506 Treg-Zellen induzieren und verhindern AOD verwendet werden kann.

Tolerogenic DNA-Impfstoff zur Pr&auml;vention von Eierstock-Autoimmunerkrankung.

Vaccini a DNA sono stati ampiamente utilizzati per indurre la risposta immunitaria contro bersagli molecolari. In questo studio, abbiamo esplorato la possibilit&agrave; di utilizzare vaccini DNA combinato con l&#39;immunosoppressore FK506 (tacrolimus) di antigene-specifico sopprimere risposte immunitarie indesiderate e prevenire la malattia ovarica autoimmune. A tal fine, abbiamo immunizzato topi C57BL/6 con un vaccino a DNA codifica mouse pellucida di zona 3 (ZP3) insieme con FK506. L&#39;immunizzazione indotta CD4(+)CD25(+)Foxp3(+) ZP3 specifiche cellule T regolatorie (Treg), che soppresse l&#39;induzione dell&#39;ipersensibilit&agrave; ritardata di tipo specifico ZP3 negli animali. Significativamente, l&#39;immunizzazione protetti anche gli animali da malattia ovarica autoimmune indotta sperimentalmente. Questi risultati indicano che la vaccinazione del DNA in presenza di FK506 pu&ograve; essere utilizzato per indurre le cellule Treg e prevenire AOD.

Vaccino tollerogeniche DNA per la prevenzione di malattia ovarica autoimmune.

DNA &#xBC31;&#xC2E0; &#xBD84;&#xC790; &#xD45C;&#xC801;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xBA74;&#xC5ED; &#xBC18;&#xC751;&#xC744; &#xC720;&#xB3C4; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xB110;&#xB9AC; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xB418;&#xACE0;&#xC788;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xAE30;&#xC804;&#xC744; FK506 &#xACB0;&#xD569; &#xD558;&#xB294; DNA &#xBC31;&#xC2E0;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xAC00;&#xB2A5;&#xC131; &#xD0D0;&#xD5D8; (tacrolimus) &#xD56D; &#xC6D0; &#xD2B9;&#xD788; &#xC6D0;&#xCE58; &#xC54A;&#xB294; &#xBA74;&#xC5ED; &#xBC18;&#xC751;&#xC744; &#xC5B5;&#xC81C; &#xD558; &#xACE0; &#xBA74;&#xC5ED; &#xB09C;&#xC18C; &#xC9C8;&#xD658;&#xC744; &#xC608;&#xBC29; &#xD558;. &#xC774; &#xC704;&#xD574;, &#xC6B0;&#xB9AC; DNA &#xBC31;&#xC2E0; FK506 &#xD568;&#xAED8; &#xB9C8;&#xC6B0;&#xC2A4; zona pellucida 3 (ZP3) &#xC778;&#xCF54;&#xB529; C57BL/6 &#xB9C8;&#xC6B0;&#xC2A4; &#xC811;&#xC885;. &#xC608;&#xBC29; &#xC811;&#xC885; ZP3 &#xD2B9;&#xC815; CD4(+)CD25(+)Foxp3(+) &#xADDC;&#xC81C; T &#xC138;&#xD3EC; (Treg) &#xB3D9;&#xBB3C;&#xC5D0;&#xC11C; ZP3 &#xAD00;&#xB828; &#xC9C0;&#xC5F0; &#xD615; &#xACFC;&#xBBFC; &#xC99D;&#xC758; &#xC720;&#xB3C4; &#xC5B5;&#xC81C;&#xB97C; &#xC720;&#xB3C4;. &#xD06C;&#xAC8C;, &#xC608;&#xBC29; &#xC811;&#xC885; &#xB610;&#xD55C; &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC720;&#xB3C4; &#xB41C; &#xBA74;&#xC5ED; &#xB09C;&#xC18C; &#xC9C8;&#xD658;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB3D9;&#xBB3C; &#xBCF4;&#xD638;. &#xC774; &#xACB0;&#xACFC; DNA &#xBC31;&#xC2E0; &#xC811;&#xC885; FK506 &#xC874;&#xC7AC; Treg &#xC138;&#xD3EC; &#xC720;&#xB3C4; &#xBC0F; AOD &#xBC29;&#xC9C0;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xAC83;&#xC774; &#xC88B;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Tolerogenic DNA &#xBC31;&#xC2E0; &#xBA74;&#xC5ED; &#xB09C;&#xC18C; &#xC9C8;&#xD658;&#xC758; &#xC608;&#xBC29;&#xC744; &#xC704;&#xD55C;.

Las vacunas de ADN han sido ampliamente utilizadas para inducir respuestas inmunitarias contra dianas moleculares. En este estudio, se analiz&oacute; la posibilidad de utilizar la vacuna de ADN combinada con el inmunosupresor FK506 (tacrolimus) ant&iacute;geno-espec&iacute;ficamente suprimir inmunorespuestas no deseados y prevenir enfermedad ov&aacute;rica autoinmune. Para ello, estamos inmunizados ratones C57BL/6 con una vacuna de ADN codificaci&oacute;n rat&oacute;n zona pel&uacute;cida 3 (ZP3) junto con FK506. La inmunizaci&oacute;n hab&iacute;a inducida ZP3 espec&iacute;ficos CD4(+)CD25(+)Foxp3(+) c&eacute;lulas T reguladoras (Treg), que suprimieron la inducci&oacute;n de ZP3 espec&iacute;ficos retrasar-tipo hipersensibilidad en los animales. Significativamente, la inmunizaci&oacute;n tambi&eacute;n proteg&iacute;a a los animales de la enfermedad ov&aacute;rica autoinmune inducida experimentalmente. Estos resultados sugieren que vacuna de ADN en presencia de FK506 puede usarse para inducir c&eacute;lulas Treg y evitar que la AOD.

Vacuna de ADN de tolerog&eacute;nicas para la prevenci&oacute;n de la enfermedad ov&aacute;rica autoinmune.

&#x9AD8;&#x9636;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8C03;&#x63A7;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x6240;&#x77E5;&#x751A;&#x5728;&#x771F;&#x6838;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4E2D;&#x3002;&#x5229;&#x7528;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x5206;&#x6790;&#x4E0E;&#x914D;&#x5BF9;&#x7ED3;&#x675F;&#x6807;&#x8BB0;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x6CD5; (&#x90C1;&#x90C1;&#x8471;&#x8471;) &#x6211;&#x4EEC;&#x6620;&#x5C04;&#x8FDC;&#x7A0B;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x4E0E; RNA &#x805A;&#x5408;&#x9176; II &#x5728;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x7EC6;&#x80DE;&#x548C;&#x53D1;&#x73B0;&#x666E;&#x904D;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x533A;&#x5C45;&#x4E2D;&#x57FA;&#x56E0;&#x5185;&#x6291;&#x5236;&#x3001; extragenic&#x3001; &#x548C;&#x57FA;&#x56E0;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x4EA4;&#x4E92;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x805A;&#x5408;&#x5230;&#x9AD8;&#x9636;&#x96C6;&#x7FA4;&#xFF0C;&#x5176;&#x4E2D;&#x8FD1;&#x7AEF;&#x548C;&#x8FDC;&#x7AEF;&#x57FA;&#x56E0;&#x6B63;&#x5728;&#x901A;&#x8FC7;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;-&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x533A;&#x7684;&#x4E92;&#x52A8;&#x3002;&#x5927;&#x591A;&#x6570;&#x57FA;&#x56E0;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;-&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x533A;&#x7684;&#x4E92;&#x52A8;&#x4E0E;&#x5408;&#x4F5C;&#xFF0C;&#x662F;&#x79EF;&#x6781;&#x548C;&#x8F6C;&#x5F55;&#x548C;&#x4E00;&#x4E9B;&#x4E92;&#x52A8;&#x4FC3;&#x8FDB;&#x8005;&#x53EF;&#x4EE5;&#x5F71;&#x54CD;&#x5BF9;&#x65B9;&#x6697;&#x793A;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x63A7;&#x4EF6;&#x7EC4;&#x5408;&#x7684;&#x590D;&#x6742;&#x6027;&#x3002;&#x4E0D;&#x540C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7CFB;&#x7684;&#x6BD4;&#x8F83;&#x5206;&#x6790;&#x8868;&#x660E;&#x7279;&#x5B9A;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x53EF;&#x4EE5;&#x4E3A;&#x7279;&#x5B9A;&#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#xFF0C;&#x63D0;&#x4F9B;&#x7ED3;&#x6784;&#x6846;&#x67B6;&#xFF0C;&#x5E76;&#x5EFA;&#x8BAE;&#x91CD;&#x5927;&#x6D53;&#x7F29;&#x4E3A;&#x7279;&#x5B9A;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#x589E;&#x5F3A;&#x5B50;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;&#x57FA;&#x56E0;&#x786E;&#x5B9A;&#x75BE;&#x75C5;&#x5173;&#x8054;&#x7684;&#x975E;&#x7F16;&#x7801;&#x5143;&#x7D20;&#x88AB;&#x53D1;&#x73B0;&#x7A7A;&#x95F4;&#x4ECE;&#x4E8B;&#x4E0E;&#x76F8;&#x5E94;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x901A;&#x8FC7;&#x8FDC;&#x7A0B;&#x4EA4;&#x4E92;&#x3002;&#x603B;&#x4F53;&#x800C;&#x8A00;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x63D0;&#x4F9B;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8C03;&#x63A7;&#x623F;&#x52A1;&#x548C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7279;&#x5F02;&#x6027;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x4E09;&#x7EF4;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x4EA4;&#x4E92;&#x3002;

&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x4E3A;&#x4E2D;&#x5FC3;&#x7684;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x4E3A;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8C03;&#x63A7;&#x63D0;&#x4F9B;&#x62D3;&#x6251;&#x7684;&#x57FA;&#x7840;&#x3002;

Higher-order chromosomal organization for transcription regulation is poorly understood in eukaryotes. Using genome-wide Chromatin Interaction Analysis with Paired-End-Tag sequencing (ChIA-PET), we mapped long-range chromatin interactions associated with RNA polymerase II in human cells and uncovered widespread promoter-centered intragenic, extragenic, and intergenic interactions. These interactions further aggregated into higher-order clusters, wherein proximal and distal genes were engaged through promoter-promoter interactions. Most genes with promoter-promoter interactions were active and transcribed cooperatively, and some interacting promoters could influence each other implying combinatorial complexity of transcriptional controls. Comparative analyses of different cell lines showed that cell-specific chromatin interactions could provide structural frameworks for cell-specific transcription, and suggested significant enrichment of enhancer-promoter interactions for cell-specific functions. Furthermore, genetically-identified disease-associated noncoding elements were found to be spatially engaged with corresponding genes through long-range interactions. Overall, our study provides insights into transcription regulation by three-dimensional chromatin interactions for both housekeeping and cell-specific genes in human cells.

Extensive promoter-centered chromatin interactions provide a topological basis for transcription regulation.

D&#x26;#39;ordre sup&#xE9;rieur pour l&#x26;#39;organisation chromosomique r&#xE9;gulation de la transcription est mal comprise chez les eucaryotes. En utilisant l&#x26;#39;&#xE9;chelle du g&#xE9;nome analyse de l&#x26;#39;interaction avec la chromatine appari&#xE9;s balise de fin de s&#xE9;quen&#xE7;age (Chia-PET), nous avons cartographi&#xE9; les interactions &#xE0; longue port&#xE9;e chromatine associ&#xE9;s &#xE0; l&#x26;#39;ARN polym&#xE9;rase II dans les cellules humaines et d&#xE9;couvert r&#xE9;pandues interactions promoteur-centr&#xE9;e intrag&#xE9;niques, extrag&#xE9;nique, et interg&#xE9;nique. Ces interactions en outre agr&#xE9;g&#xE9;s en un ordre sup&#xE9;rieur grappes, dans lequel les g&#xE8;nes proximale et distale ont &#xE9;t&#xE9; engag&#xE9;s &#xE0; travers promoteur-promoteur interactions. La plupart des g&#xE8;nes avec le promoteur-promoteur interactions ont &#xE9;t&#xE9; actifs et transcrite en collaboration, et certains promoteurs qui interagissent les uns des autres pourrait influer sur ce qui implique la complexit&#xE9; combinatoire des contr&#xF4;les transcriptionnels. Des analyses comparatives des diff&#xE9;rentes lign&#xE9;es cellulaires ont montr&#xE9; que les interactions chromatine cellulaire sp&#xE9;cifiques pourraient fournir des cadres structurels pour la cellule transcription sp&#xE9;cifique, et a sugg&#xE9;r&#xE9; l&#x26;#39;enrichissement significatif de enhancer-promoteur interactions cellule pour des fonctions sp&#xE9;cifiques. En outre, g&#xE9;n&#xE9;tiquement identifi&#xE9; les &#xE9;l&#xE9;ments non codants associ&#xE9;s &#xE0; la maladie ont &#xE9;t&#xE9; trouv&#xE9;s &#xE0; &#xEA;tre spatialement engag&#xE9; avec les g&#xE8;nes correspondants par le biais interactions &#xE0; longue port&#xE9;e. Dans l&#x26;#39;ensemble, notre &#xE9;tude fournit un aper&#xE7;u de r&#xE9;gulation de la transcription par la chromatine interactions en trois dimensions &#xE0; la fois pour l&#x26;#39;entretien m&#xE9;nager et la cellule des g&#xE8;nes sp&#xE9;cifiques dans les cellules humaines.

De vastes interactions chromatine promoteur centr&#xE9;es Fournir une base topologique pour le r&#xE8;glement de transcription

H&ouml;herer Ordnung chromosomale Organisation f&uuml;r Transkription Verordnung ist bei Eukaryoten oft missverstanden. Mit genomweiten Chromatin Interaktionsanalyse mit Paired-End-Tag-Sequenzierung (ChIA-PET), wir zugeordnet Langstrecken Chromatin-Interaktionen, die RNS-Polymerase II in menschlichen Zellen und ungedeckten weit verbreitete Projekttr&auml;ger-zentrierte intragenic, extragenic und intergenetischer Interaktionen zugeordnet. Diese Interaktionen aggregiert weiter in h&ouml;herer Ordnung Cluster aufgeteilt, wobei proximalen und distalen Gene durch Projekttr&auml;ger-Projekttr&auml;ger Interaktionen involviert waren. Die meisten Gene mit Projekttr&auml;ger-Projekttr&auml;ger Interaktionen waren aktiv und transkribierte kooperativ, und einige interagierende F&ouml;rderer konnte beeinflussen sich gegenseitig was bedeutet kombinatorischen Komplexit&auml;t transkriptionelle Steuerelemente. Vergleichende Analysen der verschiedenen Zelllinien zeigte, dass zellspezifische Chromatin Interaktionen k&ouml;nnte die strukturelle Rahmenbedingungen f&uuml;r zellspezifische Transkription bieten erhebliche Bereicherung der Vergr&ouml;&szlig;erer-Projekttr&auml;ger Interaktionen f&uuml;r zellspezifische Funktionen vorgeschlagen. Dar&uuml;ber hinaus wurden genetisch identifiziert Krankheit-verbundenen nichtkodierende Elemente gefunden, r&auml;umlich mit entsprechenden Gene durch weitr&auml;umige Interaktionen eingebunden werden. Insgesamt bietet unsere Studie Einblicke in Transkription Verordnung von dreidimensionalen Chromatin Interaktionen f&uuml;r Hauswirtschaft sowohl zellspezifische Gene in menschliche Zellen.

Umfangreiche Projekttr&auml;ger-zentrierte Chromatin Interaktionen bieten eine topologische Basis f&uuml;r Transkription-Verordnung.

Ordine superiore organizzazione cromosomica per regolazione trascrizione mal inteso negli eucarioti. Utilizzando l&#39;analisi di interazione della cromatina genome-wide con sequenziamento associati-fine-Tag (ChIA-PET), abbiamo mappato le interazioni a lungo raggio della cromatina associate con la RNA polimerasi II in cellule umane e scoperte diffuse promotore-centrato intragenic, extragenic e intergenic interazioni. Queste interazioni ulteriormente aggregate in ammassi di ordine superiore, in cui geni prossimali e distali sono stati impegnati attraverso interazioni Promotore-Organizzatore. La maggior parte dei geni con interazioni promoter-promotore erano attivi e trascritto in modo cooperativo, e alcuni promotori interagenti potrebbero influenzare l&#39;altro implicando complessit&agrave; combinatoria di transcriptional controlli. Analisi comparative di diverse variet&agrave; di cellula ha mostrato interazioni cellula-specifico della cromatina potrebbero fornire quadri strutturali per la trascrizione delle cellule specifiche che ha suggerito significativo arricchimento delle interazioni enhancer-promotore per funzioni specifiche di cella. Inoltre, identificati geneticamente associata a malattia non codificante elementi sono stati trovati per essere spazialmente impegnati con i geni corrispondenti attraverso interazioni a lungo raggio. Nel complesso, il nostro studio fornisce intuizioni nella regolazione della trascrizione di interazioni di cromatina tridimensionale per pulizia e cella specifici geni nelle cellule umane.

Interazioni estese della cromatina promotore-centrato forniscono una base topologica per la regolazione della trascrizione.

&#x8EE2;&#x5199;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x9AD8;&#x6B21;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x306E;&#x7D44;&#x7E54;&#x304C;&#x4E0D;&#x5341;&#x5206;&#x306A;&#x771F;&#x6838;&#x751F;&#x7269;&#x306B;&#x7406;&#x89E3;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x5BFE;&#x306E;&#x7D42;&#x4E86;&#x30BF;&#x30B0;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#xFF08;CHIA-PET&#xFF09;&#x3067;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30EF;&#x30A4;&#x30C9;&#x306A;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x89E3;&#x6790;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x5E83;&#x7BC4;&#x306A;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x3092;&#x4E2D;&#x5FC3;&#x3068;&#x3057;&#x305F;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x5185;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x5916;&#x3068;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x9593;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x30D2;&#x30C8;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x3067;RNA&#x30DD;&#x30EA;&#x30E1;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;II&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x9577;&#x8DDD;&#x96E2;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x30DE;&#x30C3;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x767A;&#x898B;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306F;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x8FD1;&#x4F4D;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x9060;&#x4F4D;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x304C;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066;&#x5F93;&#x4E8B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3001;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x3001;&#x9AD8;&#x6B21;&#x306E;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF;&#x30FC;&#x306B;&#x96C6;&#x7D04;&#x3002;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x6301;&#x3064;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306F;&#x3001;&#x30A2;&#x30AF;&#x30C6;&#x30A3;&#x30D6;&#x3068;&#x5354;&#x529B;&#x3057;&#x3066;&#x8EE2;&#x5199;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3001;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306F;&#x3001;&#x8EE2;&#x5199;&#x5236;&#x5FA1;&#x306E;&#x7D44;&#x307F;&#x5408;&#x308F;&#x305B;&#x306E;&#x8907;&#x96D1;&#x3055;&#x3092;&#x610F;&#x5473;&#x304A;&#x4E92;&#x3044;&#x306B;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x4E0E;&#x3048;&#x308B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x7D30;&#x80DE;&#x682A;&#x306E;&#x6BD4;&#x8F03;&#x5206;&#x6790;&#x306F;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x306A;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x304C;&#x7D30;&#x80DE;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x306A;&#x8EE2;&#x5199;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x7684;&#x67A0;&#x7D44;&#x307F;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x56FA;&#x6709;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30A8;&#x30F3;&#x30CF;&#x30F3;&#x30B5;&#x30FC; - &#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x6FC3;&#x7E2E;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#x306B;&#x540C;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x75BE;&#x60A3;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x3059;&#x308B;&#x975E;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x8981;&#x7D20;&#x306F;&#x3001;&#x7A7A;&#x9593;&#x7684;&#x306B;&#x9577;&#x8DDD;&#x96E2;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066;&#x5BFE;&#x5FDC;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3067;&#x5F93;&#x4E8B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x5224;&#x660E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5168;&#x4F53;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x306F;&#x3001;&#x30D2;&#x30C8;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x30CF;&#x30A6;&#x30B9;&#x30AD;&#x30FC;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x4E09;&#x6B21;&#x5143;&#x306E;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x8EE2;&#x5199;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3078;&#x306E;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x8C4A;&#x5BCC;&#x306A;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x3092;&#x4E2D;&#x5FC3;&#x3068;&#x3057;&#x305F;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306F;&#x3001;&#x8EE2;&#x5199;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30C8;&#x30DD;&#x30ED;&#x30B8;&#x30FC;&#x306E;&#x57FA;&#x790E;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3059;&#x308B;

&#xB179;&#xC74C; &#xBC29;&#xC1A1; &#xADDC;&#xC81C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xB192;&#xC740; &#xC21C;&#xC11C; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xC870;&#xC9C1; &#xC800;&#xC870;&#xD55C; &#xC9C4;&#xD575;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC774;&#xD574; &#xB41C;&#xB2E4;. &#xAC8C;&#xB188; &#xB113;&#xC740; Chromatin &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; &#xBD84;&#xC11D;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC30D; &#xB05D; &#xD0DC;&#xADF8; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1; (ChIA &#xC560;&#xC644; &#xB3D9;&#xBB3C;), &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC7A5;&#xAC70;&#xB9AC; chromatin &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; RNA &#xC911; &#xD569; &#xD6A8;&#xC18C; II &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC138;&#xD3EC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xACAC;&#xB41C; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD55C; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778;&#xC744; &#xC911;&#xC2EC;&#xC73C;&#xB85C; intragenic, extragenic, &#xBC0F; intergenic &#xC0C1;&#xD638; &#xC5F0;&#xAD00; &#xB9E4;&#xD551;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC744; &#xB354; &#xC778;&#xC811; &#xD558; &#xACE0; &#xC6D0;&#xC2EC; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC744; &#xD1B5;&#xD574; &#xC885;&#xC0AC; &#xD588;&#xB2E4;&#xB294; &#xC810;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB192;&#xC740; &#xC21C;&#xC11C; &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130;&#xB85C; &#xC9D1;&#xACC4; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC73C;&#xB85C; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC758; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB294; &#xD611;&#xB825;, &#xC801;&#xADF9;&#xC801;&#xC774; &#xACE0; &#xBCA0;&#xB080; &#xD588;&#xB2E4; &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xBA87; &#xAC00;&#xC9C0; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xC870;&#xD569; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C; transcriptional &#xCEE8;&#xD2B8;&#xB864;&#xC744; &#xC554;&#xC2DC; &#xD558; &#xACE0; &#xC11C;&#xB85C; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xBBF8;&#xCE60; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB2E4;&#xB978; &#xC140; &#xB77C;&#xC778;&#xC758; &#xBE44;&#xAD50; &#xBD84;&#xC11D; &#xC140; &#xD2B9;&#xC815; chromatin &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; &#xC138;&#xD3EC; &#xAD00;&#xB828; &#xC804;&#xC0AC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAD6C;&#xC870;&#xC801; &#xD504;&#xB808;&#xC784; &#xC6CC;&#xD06C;&#xB97C; &#xC81C;&#xACF5;&#xD560; &#xC218; &#xC99D;&#xAC15; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xC140; &#xD2B9;&#xC815; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC758; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xB18D;&#xCD95; &#xC81C;&#xC548; &#xBCF4;&#xC600;&#xB2E4;. &#xB610;&#xD55C;, noncoding &#xC694;&#xC18C; &#xC9C8;&#xBCD1; &#xAD00;&#xB828; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xACF5;&#xAC04;&#xC801; &#xC7A5;&#xAC70;&#xB9AC; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC744; &#xD1B5;&#xD574; &#xD574;&#xB2F9; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC640; &#xC57D;&#xD63C;&#xC744; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC804;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C;, &#xC778;&#xAC04; &#xC138;&#xD3EC;&#xC5D0; &#xC788;&#xB294; &#xAC00;&#xC0AC;&#xC640; &#xC138;&#xD3EC; &#xAD00;&#xB828; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; 3 &#xCC28;&#xC6D0; chromatin &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xD544; &#xC0AC; &#xADDC;&#xC815;&#xC5D0; &#xD1B5;&#xCC30;&#xB825;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5; &#xD558;&#xB294; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xC5F0;&#xAD6C;.

&#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD55C; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778;&#xC744; &#xC911;&#xC2EC;&#xC73C;&#xB85C; chromatin &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9; &#xB179;&#xC74C; &#xBC29;&#xC1A1; &#xADDC;&#xC81C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD1A0;&#xD3F4;&#xB85C;&#xC9C0; &#xAE30;&#xBC18;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

De orden superior la organizaci&#xF3;n cromos&#xF3;mica de regulaci&#xF3;n de la transcripci&#xF3;n es poco conocida en eucariotas. Uso de todo el genoma An&#xE1;lisis de Interacci&#xF3;n de la cromatina con la secuenciaci&#xF3;n pareadas etiqueta final (Chia-PET), que asigna a largo plazo las interacciones asociadas a la cromatina con la RNA polimerasa II en las c&#xE9;lulas humanas y descubrieron amplias interacciones promotor centrado en intrag&#xE9;nicos, extrag&#xE9;nicas y interg&#xE9;nica. Estas interacciones m&#xE1;s agregados en un grupo de orden superior, en el que los genes proximal y distal se dedicaban a trav&#xE9;s de la interacci&#xF3;n del promotor promotor. La mayor&#xED;a de los genes con las interacciones promotor promotor-se mantuvieron activos y transcrita en forma cooperativa, y algunos promotores que interact&#xFA;an entre s&#xED; puede influir en lo que implica la complejidad combinatoria de los controles de la transcripci&#xF3;n. An&#xE1;lisis comparativos de diferentes l&#xED;neas celulares mostraron que las c&#xE9;lulas espec&#xED;ficas de la cromatina interacciones podr&#xED;an proporcionar marcos estructurales de c&#xE9;lulas espec&#xED;ficas de la transcripci&#xF3;n, y sugiri&#xF3; un importante enriquecimiento de las interacciones potenciador-promotor de c&#xE9;lulas espec&#xED;ficas de las funciones. Por otra parte, gen&#xE9;ticamente determinadas enfermedades asociadas a los elementos no codificantes se comprob&#xF3; que estaban espacialmente comprometida con los genes correspondientes a trav&#xE9;s de interacciones de largo alcance. En general, nuestro estudio proporciona informaci&#xF3;n detallada sobre regulaci&#xF3;n de la transcripci&#xF3;n de la cromatina por las interacciones en tres dimensiones tanto para la limpieza y los genes espec&#xED;ficos de la c&#xE9;lula en las c&#xE9;lulas humanas.

Jingyao Zhang

Genome Institute of Singapore

Agency for Science, Technology and Research, Singapore

Chromatin Interaction Analysis with Paired-End Tag Sequencing (ChIA-PET) for Mapping Chromatin Interactions and Understanding Transcription Regulation

Jingyao Zhang

.css-o250i3{font-size:18px;font-family:Open Sans,sans-serif;line-height:21.6px;}Genome Institute of Singapore

Agency for Science, Technology and Research, Singapore

Chromatin Interaction Analysis with Paired-End Tag Sequencing (ChIA-PET) for Mapping Chromatin Interactions and Understanding Transcription Regulation

Genome Institute of Singapore