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La elongación de la transcripción es un proceso dinámico que se altera en función de la heterogeneidad de la secuencia del ADN que se transcribe. Por lo tanto, no es sorprendente que la composición del complejo de elongación también varíe a lo largo del camino mientras se transcribe un gen.

La elongación de la transcripción se regula mediante la pausa de la ARN polimerasa en varias ocasiones durante la transcripción. En las bacterias, estas detenciones son necesarias porque la transcripción del ADN en ARNm está acoplada a la traducción de ese ARNm en una proteína. Sin embargo, en los eucariotas, la transcripción se combina con el procesamiento del ARNm. Por lo tanto, es necesario hacer una pausa de la ARN polimerasa alrededor de las uniones exón-intrón para aumentar la eficiencia del empalme del ARNm.

Estas interrupciones en la actividad de la ARN polimerasa pueden ser reversibles o irreversibles. En caso de una pausa reversible, proteínas como TFIIF, elonginas, ELL, aseguran que la ARN polimerasa reanude la elongación después de una breve pausa. Sin embargo, si la detención de la actividad de la ARN polimerasa es irreversible, se convierte en una detención transcripcional. Si se detiene la transcripción, entonces la enzima no puede reanudar la elongación por sí sola. En tal situación, los factores de elongación como TFIIS y pTEFb permiten que la ARN polimerasa II lea a través de la plantilla de ADN en los sitios de detención transcripcional.

Además, los factores de remodelación de la cromatina dependientes de ATP y las chaperonas de las histonas también están implicados en la regulación de la elongación de la transcripción. Juntos pueden alterar las posiciones de los nucleosomas a lo largo del ADN, haciéndolo accesible o inaccesible para la maquinaria de transcripción.

Por lo tanto, la ARN polimerasa necesita la ayuda de varios factores para atravesar la cromatina y secuencias específicas que interfieren con la transcripción.

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