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El presente protocolo describe el método para analizar la flora intestinal utilizando la secuenciación del gen 16S rRNA basado en Illumina y proporciona un marco para evaluar la eficacia de las decocciones herbales.
Con el fin de explorar preliminarmente los efectos de Desmodium caudatum sobre la gastritis y la flora intestinal en ratas, se estableció un modelo de rata con gastritis crónica utilizando el método clásico de salicilato de sodio. Dieciocho ratas SPF se dividieron en tres grupos: el grupo de control (Grupo C), el grupo modelo (Grupo M) y el grupo de tratamiento (Grupo T). Se tomaron secciones patológicas de la pared gástrica de ratas de cada grupo. Además, las concentraciones de gastrina y malondialdehído en el suero de ratas de cada grupo se determinaron mediante ELISA. Además, se exploraron los efectos de D. caudatum en la flora intestinal de ratas con gastritis a través de una comparación detallada de las comunidades bacterianas intestinales en los tres grupos, empleando la secuenciación del gen 16S rRNA basado en Illumina. Los resultados indicaron que la decocción de D. caudatum podría reducir el contenido de malondialdehído y aumentar el contenido de gastrina. Además, se encontró que la decocción de D. caudatum mejora la diversidad y abundancia de la flora intestinal, ejerciendo un impacto positivo en el tratamiento de la gastritis al regular y restaurar la flora intestinal.
La gastritis crónica (GC), una de las enfermedades clínicas más comunes, se caracteriza por cambios inflamatorios crónicos y persistentes en el epitelio de la mucosa gástrica, que es frecuente y repetidamente atacado por diversos factores patogénicos1. La tasa de incidencia de GC ocupa el primer lugar entre todos los tipos de enfermedades estomacales, representando entre el 40% y el 60% de la tasa de atención ambulatoria en el Servicio de Gastroenterología2. Además, la tasa de incidencia generalmente aumenta con la edad, especialmente en individuos de mediana edad y mayores3. Sin lugar a dudas, la....
Los procedimientos para el cuidado y uso de los animales fueron aprobados por el Comité de Ética de la Universidad Normal de Mianyang, y se siguieron estrictamente todas las regulaciones institucionales y gubernamentales relevantes relacionadas con el uso ético de los animales. Para el presente estudio, se utilizaron ratas SPF (especies Kunming, tanto machos como hembras, con un peso de 180-220 g). Los animales se obtuvieron de una fuente comercial (ver Tabla de Materiales). Todos los animales fueron alojados en un ambiente libre de patógenos y se les proporcionó acceso ad libitum a los alimentos.
1. Preparac....
Los resultados de la sección patológica de la pared del estómago se muestran en la Figura 1. En comparación con el grupo C, el grupo M presentó atrofia leve de la pared gástrica e inflamación leve. Sin embargo, en comparación con el grupo M, el grupo T no mostró inflamación, metaplasia intestinal o atrofia evidentes. Esto sugiere que la decocción de D. caudatum puede mejorar eficazmente la gastritis.
Los resultados de la prueba de hormonas gast.......
D. caudatum, una medicina popular comúnmente utilizada por la nacionalidad Qiang12, ha demostrado una eficacia significativa en el tratamiento de enfermedades gastrointestinales. Con el avance de la investigación farmacológica moderna, el desequilibrio de la flora resultante del desequilibrio de la microecología gastrointestinal se identifica como un factor clave en las enfermedades gastrointestinales agudas y crónicas22,23. .......
Los autores no tienen nada que revelar.
Este trabajo fue financiado por los proyectos clave de investigación y desarrollo del Departamento de Ciencia y Tecnología de la provincia de Sichuan (2020YFS0539).
....Name | Company | Catalog Number | Comments |
Alpha diversity analysis | Mothur 1.30.2 | ||
AxyPrep deoxyribonucleic acid (DNA) gel extraction kit | Axygen Biosciences | AP-GX-50 | |
Beta diversity analysis | Qiime 1.9.1 | ||
Cryogenic refrigerator | Forma-86C ULT freezer | ||
Desmodium caudatum | The Traditional Chinese Medicine Hospital of Beichuan Qiang Autonomous County | ||
E.Z.N.A. soil kit | Omega Bio-tek | D5625-01 | |
Illumina MiSeq Platform | Illumina Miseq PE300/NovaSeq PE250 | ||
Multiskan Spectrum | spectraMax i3 | ||
OTU clustering | Uparse 7.0.1090 | ||
OTU statistics | Usearch 7.0 | ||
PCR instrument | TransGen AP221-02 | ||
PCR instrument | ABI GeneAmp 9700 | ||
QuantiFluor-ST double-stranded DNA (dsDNA) system | Promega Corp. | ||
Sequence classification annotation | RDP Classifier 2.11 | ||
Sodium salicylate | Sichuan Xilong Chemical Co., Ltd | 54-21-7 | |
SPF rats | Chengdu Dashuo Experimental Animal Co., Ltd | ||
SPSS 18.0 | IBM |
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