Para comenzar, inicie el software 3D Slicer. Para la entrada de imágenes de los sitios de erosión ósea identificados, haga clic en el botón Datos, en la ventana de 3D Slicer. A continuación, pulse Elegir archivos para añadir y localizar imágenes individuales para añadir los archivos.
Para importar un directorio completo de imágenes a la vez, presione la opción Elegir directorio para agregar, luego busque e inserte el directorio preferido. A continuación, haz clic en el menú desplegable de la barra de herramientas de 3D Slicer. Coloque el cursor sobre los módulos de análisis óseo y haga clic en Máscara automática.
En la pestaña Paso 2 Máscara automática, elija un volumen de entrada en el menú desplegable del volumen de entrada. Seleccione Crear nuevo volumen de mapa de etiquetas en el menú desplegable de segmentación de salida. Si se prefiere otra etiqueta de salida, haga clic en Crear nuevo volumen de mapa de etiquetas como y proporcione la etiqueta deseada.
Ingrese el número de huesos que se enmascararán en el cuadro de texto dado, luego seleccione ORMR o Umbral dual en el menú desplegable del algoritmo. Haga clic en Obtener máscara para ejecutar el algoritmo y generar un resultado en el directorio de imágenes correspondiente. Si la imagen contiene varios huesos, se guardará una máscara separada para cada uno.
Para importar una máscara binaria en 3D Slicer, copie los archivos de máscara en el directorio de máscaras de carga ubicado en la carpeta BAM. Vuelve a la ventana de 3D Slicer y haz clic en la pestaña Paso 3 Corrección manual. Para cargar los archivos de máscara y convertirlos automáticamente en segmentaciones de segmentación, haga clic en Cargar.
Para realizar cambios en la máscara, utilice las herramientas proporcionadas en la pestaña de corrección manual. Para iniciar el análisis estadístico, haga clic en el módulo de volumen de erosión en el menú desplegable de la barra de herramientas. Cargue una imagen y su máscara correspondiente.
Seleccione la imagen y la máscara de entrada, cree una segmentación de salida y coloque los puntos de inicialización en la erosión. Haga clic en el botón Obtener erosiones para iniciar el algoritmo de medición de erosión. Si el tamaño y la forma de los volúmenes de erosión detectados automáticamente no son satisfactorios, edítelos manualmente en la pestaña Paso 5 Corrección manual.
Ahora haga clic en la pestaña etiquetada Paso 6 Estadísticas para exportar los datos de la computadora a un archivo de hoja de cálculo. A continuación, introduzca el volumen de erosión en el menú desplegable denominado Erosiones de entrada. Ahora proporcione la imagen en escala de grises y su ancho de vóxel en milímetros en el cuadro de texto debajo del menú de volumen maestro.
Haga clic en Obtener estadísticas para generar un archivo de hoja de cálculo en el directorio de datos de salida de erosiones ubicado en la carpeta BAM.
