Para comenzar, inicie el software de procesamiento de imágenes, seleccione archivo, luego abra los datos y elija las imágenes escaneadas por micro CT generadas anteriormente en formato BMP de puntos. Cuando se abra la ventana de los parámetros de lectura de la imagen, confirme los parámetros y acepte si son correctos. En el panel principal, haga clic en la vista de proyecto para localizar un nuevo objeto creado con el nombre del archivo BMP de puntos.
Haga clic con el botón derecho en el objeto creado y seleccione la opción corte de ortofotos, luego haga clic en crear. En propiedades, seleccione el plano de orientación y el número de sector que desea ver. Para obtener volúmenes 3D de la cabeza completa en el panel principal, vaya a la vista de proyecto, haga clic con el botón derecho en el objeto de imagen, seleccione la opción de umbral interactivo y haga clic en crear.
En propiedades, cambie los valores de umbral mínimo RGB y umbral máximo RGB hasta que se seleccione la parte de la imagen correspondiente a la cabeza del animal. A continuación, seleccione aplicar. Haga clic con el botón derecho en el objeto de umbral creado en la vista de proyecto.
En propiedades, seleccione isosuperficie, elija un umbral para visualizar la superficie y, a continuación, haga clic en aplicar. Para digitalizar los puntos de referencia, haga clic con el botón derecho en la vista de proyecto, seleccione crear objeto, luego seleccione puntos y líneas seguidos de puntos de referencia, luego haga clic en crear. A continuación, haga clic con el botón derecho en los nuevos puntos de referencia del objeto.
Seleccione la vista de punto de referencia y haga clic en crear. En tamaño, modifique el tamaño del punto. Para agregar puntos de referencia en las propiedades, en el modo de edición, seleccione agregar.
Digitalice cinco puntos distribuidos equitativamente alrededor de las curvas hasta el siguiente punto de referencia en la intersección de la corteza del mesencéfalo, luego digitalice ocho puntos de referencia alrededor de la corteza. Para guardar los puntos digitalizados, haga clic con el botón derecho en los puntos de referencia del objeto y elija guardar datos. Para segmentar el cerebro, haga clic con el botón derecho en la vista del proyecto, luego en crear objeto, seleccione imágenes y campos, y luego etiquete el campo.
Haga clic en crear. Seleccione el objeto de campo de etiqueta y presione la opción del editor de segmentación en propiedades. En materiales, agregue un nuevo material y cámbiele el nombre a cerebro.
En selección, elija el corte actual para segmentar el tejido correspondiente al cerebro en cada corte. En las herramientas, use la varita mágica y el pincel para seleccionar el tejido cerebral en cada corte. Luego, en selección, presione agregar.
Ahora regrese a la vista de proyecto, haga clic con el botón derecho en el campo de etiqueta y seleccione generar superficie, luego haga clic en aplicar. Una vez obtenida la superficie, aplicar extraer superficie para exportarla. Con la microtomografía computarizada, a pesar del pequeño tamaño de los cerebros de ratones neonatos, se pueden distinguir las estructuras anatómicas como los bulbos olfatorios, la corteza, el mesencéfalo, el cerebelo y el cerebro posterior.
La segmentación manual de todo el cerebro dio como resultado la reconstrucción del modelo 3D del cerebro de los recién nacidos.
