1 Para comenzar, inicie el software Cytoscape 3.9.12 en el escritorio e importe el archivo tsv 3 que contiene las proteínas centrales del eccema del ano. 4 Haga clic en la barra de estilo en el panel de control 5 para optimizar el color, la fuente y el tamaño de los nodos de red. 6 Para el análisis de la topología de la red, 7 emplee la función de análisis de red.
8 Para obtener genes hub, utilice CytoHubba 9 y establezca la red diana de la enfermedad componente del fármaco. 10 Abre el sitio web de Metascape. 11 Seleccione un archivo o pegue una lista de genes en el cuadro de diálogo 12 y haga clic en el botón Enviar.
13 A continuación, seleccione H. sapiens tanto en la entrada como especie 14 como en el análisis como especie, 15 y habilite la función de análisis personalizada. 16 En la opción de enriquecimiento, 17 seleccionan las funciones moleculares de GO, los procesos biológicos de GO, 18 los componentes celulares de GO y la base de datos de KEGG Pathway. 19 Marque seleccionar clústeres GO selectivos, 20 y haga clic en el botón análisis de enriquecimiento.
21 Una vez finalizada la barra de progreso, 22 inicie una página de informe de análisis y haga clic en 23 para recuperar los resultados del enriquecimiento. 24 Abra la herramienta GEO2R para buscar 25 y analizar la base de datos de chips genéticos GEO. 26 Abra el sitio web de la base de datos GEO.
27 A continuación, introduzca la palabra clave o la adhesión GEO 28 y haga clic en el botón de búsqueda. 29 Seleccione el resultado que mejor coincida, 30 y encuentre la serie de referencia. 31 Ahora, en el sitio web de la herramienta GEO2R, 32 introduzca la serie de referencia en la casilla de acceso GEO 33 y haga clic en el botón establecer.
34 Seleccione la dermatitis atópica como grupo experimental 35 y el control no atópico como grupo control. 36 Haga clic en el botón analizar y espere a que aparezcan los resultados. 37 análisis de enriquecimiento de KEGG y GO de 59 objetivos clave, 38 identificaron 218 vías y más de 3.000 procesos biológicos, 39 destacando vías significativas en los ODS y el eczema anal.
40 El análisis de GO sobre los procesos biológicos, la composición celular, 41 y la función molecular 42 enfatizó los objetivos comunes en los ODS y el eczema anal. 43 Las funciones biológicas relevantes incluyeron la fosforilación de peptidil-tirosina 44 y la regulación de la adhesión célula-célula.
