Para empezar, registre la actividad neuronal espaciotemporal de cortes agudos de cerebro de ratón ex vivo y redes neuronales humanas derivadas de IPSC in vitro. Abra un archivo de datos sin procesar grabado en el software BrainWave. Seleccione análisis y haga clic en Detección de LFP o Detección de picos.
Para las grabaciones del hipocampo y del circuito del bulbo olfatorio, integre la opción de espacio de trabajo avanzado para la importación de imágenes de luz estructural desde el microscopio estereoscópico en el archivo de eventos detectado. Cree capas estructurales para examinar los circuitos corticales del hipocampo a gran escala. Utilice un script de Python escrito a medida para leer el archivo BXR.
Extraiga trenes de picos de las grabaciones de la red IPSC y trenes de eventos LFP de las grabaciones del circuito de corte cerebral del hipocampo y el bulbo olfatorio. Guarde los datos del tren de eventos resultante con información espaciotemporal en formato de archivo NPY. Calcule la covarianza cruzada entre pares de electrodos activos en la matriz de 64 por 64 utilizando datos de series temporales del archivo BRW.
Transforme cada matriz de conectividad en un archivo de gráfico dinámico. En el caso de los mapas de conectividad de red, aplique el diseño geográfico para la representación cartográfica espacial y establezca restricciones de parámetros en el rango de grados y el peso del borde para la comparación. Asigne el color de los nodos, el tamaño de los bordes y el tamaño de los grados para mejorar la visualización.
La cartografía espacial topográfica de la media a gran escala de LFP o de los patrones de disparo de la espiga se superpone a las respectivas imágenes ópticas capturadas por el microscopio. Los gráficos de rástergrama muestran eventos LFP o picos detectados sincrónicamente en una banda de tiempo especificada. Los rastros de eventos representativos de los electrodos de registro de HDME mostraron un rango de frecuencias oscilatorias registradas en los circuitos del hipocampo, la cortical y el bulbo olfatorio y una actividad de estallido de picos de varias unidades en la red IPSC humana.
Los mapas del conectoma del circuito cortical y del bulbo olfativo del hipocampo revelaron varios nodos que representaban diferentes capas, en los que el tamaño indicaba el grado de fuerza y el color denotaba la capa. En las redes IPSC humanas, la identificación de la conexión se refinó utilizando filtros espaciotemporales y umbrales de latencia, donde el color nodal indicaba si la entrada era excitatoria o inhibitoria.
