A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Method Article
על ידי שילוב של כל שיטות להר רנ"א באתר הכלאה והיסטולוגיה, ביטוי גנים יכולים להיות מקושרת עם החלטות גורל תא בעובר המתפתח. שיטות אלו הותאמו לelasmobranchs הימי ולהקל על השימוש בבעלי החיים אלה כאורגניזמים מודל למחקרים ביו, רעלים והשוואתיים.
elasmobranchs הימי מוערכים מודלים של בעלי חיים למחקרים ביו וגנומית כפי שהם החוליות הפרימיטיביות ביותר שיש חסינות אדפטיבית ויש מנגנונים ייחודיים לויסות לחץ האוסמוטי 1-3. כאמן חוליות לסת החיים הפרימיטיביים ביותר עם ספיחים לזווג, elasmobranchs הוא מודל אבולוציונית חשוב, במיוחד ללימודים באבולוציה ובהתפתחות. elasmobranchs הימי יש גם שמש ללמוד טוקסיקולוגיה הימית ופיזיולוגיה של לחץ במערכת יחסים עד 4 שינויי האקלים. לפיכך, פיתוח וההתאמה של מתודולוגיות נדרשים כדי להקל ולהרחיב את השימוש בחוליות הפרימיטיביות האלה לתחומים ביולוגיים רבים. כאן אני מציג את ההסתגלות המוצלחת של כל הר רנ"א כלאה באתר וטכניקות היסטולוגית ללמוד ביטוי גנים והיסטולוגיה תא בelasmobranchs.
ניטור ביטוי גנים הוא כלי היכר של Biol התפתחותיתogists, ונמצא בשימוש נרחב כדי לחקור תהליכים התפתחותיים 5. כל הר רנ"א כלאה באתר מאפשר להדמיה והלוקליזציה של תעתיקי גנים ספציפיים ברקמות של העובר המתפתח. דפוס הביטוי של המסר של גן יכול לספק תובנה לגבי מה תהליכים התפתחותיים והחלטות גורל תא גן יכולים לשלוט. על ידי השוואת דפוס הביטוי של גן בשלבי התפתחות שונים, תובנה ניתן להשיג בכמה תפקידים של שינויים גנטיים במהלך התפתחות.
בעוד כל ההר באתר של מספק אמצעים לאיתור ביטוי גנים ברקמות, טכניקות היסטולוגית תאפשרנה זיהוי של סוגי תאים מובחנים ורקמות. כתמי היסטולוגית יש פונקציות מגוונות. כתמים כלליים משמשים כדי להדגיש מורפולוגיה של תאים, למשל hematoxylin וeosin לצביעה כללית של גרעינים וציטופלסמה, בהתאמה. כתמים אחרים יכולים לסמן תאים ספציפייםסוגים. לדוגמה, alcian כתם הכחול דיווח במאמר זה הוא בשימוש נרחב כתם קטיוני לזהות mucosaccharides. הכתמה של מערכת העיכול עם alcian כחול יכולה לזהות את חלוקת תאי גביע המייצרים mucosaccharides. שינויים במרכיבי mucosaccharide על פפטידים קצרים להבחין תאי גביע בתפקידו במסגרת מערכת העיכול 6. באמצעות כל הר RNA בשל אתרו וhistochemical שיטות בו זמנית, החלטות גורל תא יכולות להיות מקושרות לביטוי גנים ספציפיים.
אמנם RNA בים וhistochemistry "אתר נמצאים בשימוש נרחב על ידי חוקרים, ההסתגלות והשימוש בם בelasmobranchs הימי נפגשו הצלחה מוגבלת ומגוונת. כאן אני מציג את הפרוטוקולים שפותח עבור elasmobranchs והשתמשו על בסיס קבוע במעבדה שלי. למרות שינויים נוספים של RNA בשיטת הכלאה של אתר עשויים להיות נחוצים כדי להסתגל למינים שונים, הפרוטוקולים מתוארים כאן עמrovide נקודת התחלה חזקה עבור חוקרים המבקשים להתאים את השימוש בelasmobranchs הימי לשאלות המדעיות שלהם.
הר י רנ"א כל כלאה באתר בElasmobranchs הימי
1. קיבוע עובר והכנה
2. סינתזה של RNA Probe
3. עובר טרום טיפול והכלאה
4. הודעה שוטפת הכלאה והכלאת נוגדן
5. הכלאת נוגדן הודעת שוטף
6. זיהוי של חללית
7. נציג תוצאות להר א רנ"א כל כלאה באתר בelasmobranchs הימי
כל הר RNA בשל אתר ביטוי של סוניק קיפוד מתאר (שש) וHoxa13 בעוברים להחליק מוצגים באיור 1. ביטוי של שישה בחוליות גבוהות יותר נמצא באנדודרם notochord ומעיים ודפוס ביטוי זה ניתן לחסוך בסקייט (האיור 1 א) 8,9. elasmobranchs הימי יש שיטה ייחודית לויסות לחץ האוסמוטי המשתמשת בבלוטה רקטלית למלחים מפרישים. Hoxa13 הביטוי הוא גבוה בבלוטה רקטלית הפיתוח (האיור 1b) 10. תפקיד מוצר הגן Hoxa13 בדפוסי הבלוטה רקטלית נותרת עלומה.
השני. פרפין והטבעה של קטגוריות קיים רקמות Elasmobranch
1. מסיק והכנה של רקמות
2. פרפין והטבעה של קטגוריות קיימים
ג. Alcian כחול / אדום מהיר גרעיני כתם של רקמות Elasmobranch
1. Alcian כתם הכחול לMucins
דוגמאות לכתמים כחולים alcian באזורים שונים של L. מערכת עיכול erinacea מוצגת באיור 2. mucin חומצה המכיל תאי globlet הם נראים בבירור על ידי alcian כתם הכחול לאורך מערכת העיכול. חלוקת mucins חומצה שונה באזורים השונים של מערכת העיכול, ובכך הוא משקפת הבדלים בתפקוד. mucins חומצי...
הפרוטוקולים שהוצגו הם שיטות קלסיות לניטור ביטוי גנים וזיהוי סוגי תאים מובחנים, והותאמו לשימוש בelasmobranchs הימי. שינויים נוספים של פרוטוקולים אלה עשויים להיות נחוצים כדי להסתגל למיני elasmobranch שונים.
הדאגה הנפוצה ביותר לגבי כל הר רנ"...
אין לי מה לחשוף.
אני רוצה להודות לסטודנטים לתואר הראשון הרבים שעבדו במעבדה שלי ותרמו להתפתחות של פרוטוקולים אלה. NAT קבל תמיכה מסקידמור-איחוד הרשת, פרויקט שהוקם עם ADVANCE NSF שולם מענק.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
10 x transcription buffer | Roche | 11-465-384-001 | |
DIG-RNA labeling mix | Roche | 11-277-073-910 | |
RNAse inhibitor | Roche | 03-335-399-001 | |
RNA polymerase - SP6 | Roche | 10-810-274-001 | |
DNAseI, RNAse-free | Roche | 10-776-785-001 | |
Yeast RNA | Invitrogen | 15401-029 | |
CHAPS | EMD-Millipore | 220201 | |
heparin | Sigma-Aldrich | H4784 | |
DEPC (diethyl pyrocarbonate) | Research Organics | 2106D | |
Moria Perforated Spoon | Fine Science Tools | 10370-17 | |
Netwell inserts | Electron Microscopy Sciences | 64713-00 | Netwells for use in 6-well tissue culture dishes |
6-well tissue culture plate | Corning | 3516 | |
Glass scintillation vials with screw-cap lids | Weaton Science Products | 986540 | |
formamide | Fisher | BP227500 | |
Proteinase K | Invitrogen | 59895 (AM2542) | |
NBT | 11585029001 | ||
BCIP | Roche | 11585002001 | |
Hydrogen peroxide, 30% | EMD | HX0635-1 | |
Sheep serum | VWR | 101301-478 | |
glutaraldehyde | Sigma-Aldrich | G5882 | |
tRNA | Roche | 10-109-541-001 | |
Anti-DIG Fab Fragments | Roche | 1137-6623 | |
Table 3. Reagents and equipment for RNA whole mount in situ's. | |||
1% Alcian Blue 8GS, pH 2.5 | Electron Microscopy Sciences | 26323-01 | |
Nuclear Fast Red | Electron Microscopy Sciences | 26078-05 | |
DPX Mountant | Electron Microscopy Sciences | 13510 | |
Paraffin (Paraplast X-tra) | McCormick Scientific | 39503002 | |
10% Formalin, NBF | VWR | 95042-908 | |
Glass scintillation vials with screw-cap lids | Weaton Science Products | 986540 | |
Stainless steal base molds | Tissue-Tek | 4161-4165 | Multiple sizes available. |
Cassettes | Tissue-Tek | 4170 | |
Slide warmer | Fisher-Scientific | 12-594Q | |
Tissue Embedder | Leica Microsystems | EG1160 | |
Microtome, rotary | Leica Microsystems | RM2235 | |
Tissue-Tek Slide Staining Set | Electron Microscopy Sciences | 62540-01 | |
Tissue-Tek 24-Slide Holder | Electron Microscopy Sciences | 62543-06 | |
Superfrost*Plus slides | Fisherbrand | 12-550-17 | |
Table 4. Reagents and equipment for Alcian Blue stain. |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved