Method Article
Here, we present a protocol for determination of dalbavancin susceptibility of clinically relevant Gram-positive bacteria using a broth microdilution reference methodology.
בדיקת רגישות מיקרוביאלית (AST) מתבצעת על מנת להעריך את הפעילות במבחנה של סוכני מיקרוביאלית נגד חיידקים שונים. תוצאות AST, שבאות לידי ביטוי כריכוזים מעכבים מינימליים (מיקרופונים) משמשות במחקר לפיתוח ולניטור מיקרוביאלית של פיתוח עמידות ובהגדרה הקלינית להדרכת טיפול אנטיביוטיה. Dalbavancin הוא סוכן מיקרוביאלית lipoglycopeptide חצי סינטטי שאושר מאי 2014 על ידי מנהל המזון והתרופות אמריקניות (FDA) לטיפול בדלקות עור ומבנה עור חיידקים חריפים הנגרמות על ידי אורגניזמים גרם-חיוביים. היתרון של dalbavancin על טיפולים אנטי-staphylococcal הנוכחיים הוא זמן מחצית החיים הארוכים שלה, המאפשר למינון של פעם בשבוע. יש Dalbavancin פעילות נגד Staphylococcus aureus (כולל שני וmethicillin-רגיש S. aureus [MSSA] methicillin-resistant S. aureus [MRSA]) staphylococci, coagulase-שלילי, סטרפטוקוקוס anginosus, סטרפטוקוקוס β-המוליטית וenterococci רגיש vancomycin. בדומה לסוכנים אחרים האחרונים lipoglycopeptide, אופטימיזציה של שיטות בדיקת רגישות CLSI ומרק ISO כולל את השימוש של sulfoxide דימתיל (DMSO) כממס בעת הכנת פתרונות מניות וpolysorbate 80 (P80) כדי להקל על דבקותו של הסוכן לפלסטיק. לפני המחקרים הקליניים ובפיתוח הראשוני של dalbavancin, מחקרי רגישות לא בוצעו תוך השימוש בP-80 ותוצאות MIC נטו להיות גבוה פי 2-4 ובאופן דומה הגבוה MIC תוצאות שהושגו עם שיטת רגישות הדילול אגר. Dalbavancin נכלל לראשונה בשולחנות מתודולוגיה microdilution מרק CLSI בשנת 2005 ותוקן בשנת 2006 כדי להבהיר שימוש בDMSO ו- P-80. Microdilution מרק ההליך (BMD) מוצג כאן הוא ספציפי לdalbavancin והנו בהתאם לשיטות CLSI ו- ISO, עם פירוט וfoc צעד-אחר-צעדשלנו בשלבים הקריטיים הוסיף לבהירות.
Dalbavancin הוא lipoglycopeptide חצי סינטטי שאושר על ידי ה- FDA מאי 2014 לטיפול בדלקות עור ומבנה עור חיידקים חריפים הנגרמות על ידי אורגניזמים גרם-חיובי 1. המטרה העיקרית של שיטה זו מפרטת בפורמט וידאו היא לספק הדרכה ברורה למדענים במעבדה ומחקרים הקליניים לבדיקה ודיווח של תוצאות רגישות dalbavancin מדויקות ושחזור.
הנחישות של סוכן מיקרוביאלית MIC בשיטות מסחריות מבוצעת באופן שגרתי במעבדות קליניות להערכת הפעילות במבחנה של סוכן נגד חיידקים פתוגניים. השיטה המתוארת כאן היא שיטת microdilution מרק כפי שהומלץ על ידי CLSI וISO 2,3,4. מאז dalbavancin שיטות רגישות מסחריות אינן זמינות כעת (בזמן של פרסום זה) ודיפוזיה דיסק ושיטות דילול אגר אינם מומלצים F כרגעאו dalbavancin, שיטות דילול מרק התייחסות הן האפשרויות הזמינות הנוכחיות 12,14. כשיטת התייחסות זו היא לא מסחרית וFDA פינה במבחנה שיטת אבחון, מעבדות קליניות בארה"ב המשתמשת בהליך זה לבדיקת מטופל חייב לציית לדרישות הרגולטוריות לבדיקת מעבדה פיתחה (LDT). זה צפוי כי ככל שעולה שימוש dalbavancin, תהיה יותר מעבדות צורך לבדוק מתחם זה. בדיקות Vancomycin כתחליף לקביעת רגישות dalbavancin של ס aureus אומת 5. עם זאת, dalbavancin עשוי להיות פעיל נגד ס ביניים vancomycin aureus (ויזה) ולכן, רופאים יכולים לבקש תוצאות MIC dalbavancin. בנוסף, תוצאות MIC למיני חיידקים אחרים ניתן לבקש.
נקודת העצירה רגישה FDA לdalbavancin נגד ס aureus כבר נקבע ב≤0.12 מיקרוגרם / מיליליטר. ה- FDA הוקצה רק susceptiהקטגוריה ble בגלל המחסור בנתונים על בידודים עמידים. הפצת MIC הנורמלית בין הסוג בר ס aureus המבודד הוא בין 0.03-.12 מיקרוגרם / מיליליטר, עם MIC מודאלי ברור של 0.06 מיקרוגרם / מיליליטר. וריאציה קלה בתוצאות MIC בשל הבדל בשיטה, בנוסף לוריאצית BMD הטבועה של ± אחד דילול, עלולה להיות השפעה משמעותית על שיעורי הרגישות. 6 דומים לסוכני lipoglycopeptide אחרים, בדיקת רגישות dalbavancin יכולה להיות מאתגרות כתוצאה של מסיסות והגודל גדול יחסית של המולקולה ומאפייניה מחייבים 7,8,9. שיטת BMD ההתייחסות המתוארת כאן כוללת שני צעדים ספציפיים שהנם ייחודיים לסוכנים מסיסים ו / או סוכני lipoglycopeptide: (1) השימוש בDMSO להכנת פתרונות מניות ו( 2) תוספת של 0.002% P-80 בלוח MIC הסופי דילולים. המטרה של פרסום וידאו זה היא לספק בהירות לשיטת BMD dalbavancin ולspecifically להתמקד בצעדים מפתח אלה, כדי להבטיח תוצאות MIC מדויקות ושחזור.
הערה: עיין במסמכי CLSI M7-A10 וM100-S25 ו / או ISO / FDIS 20,776-1 לפרטים מלאים של שיטת microdilution מרק ההתייחסות לרגישות מיקרוביאלית 2, 3, 4 שיטות ההתייחסות לאפשר לאפשרויות בחלק מ. נהלים ספציפיים לייצור הכנת הבידוד ופנל MIC כדי להשיג את אותה תוצאה סופית. השיטה המפורטת כאן מתייחסת לסוכן, dalbavancin אחד מיקרוביאלית, וחלק מהצעדים מייצג את אחד עלול להיות כמה דרכים הליך ההתייחסות ניתן לעשות. אמצעי בטיחות מתאימה (בקנה אחד עם רמת בטיחות ביולוגית 2) צריך להיות מנוצל 10. פורמט פנל MIC משמש לצורך פרסום וידאו זה מוצג בטבלה 1.
1. חנות Dalbavancin אבקה
2. הכן דילולי MIC לוח
3. להכין פנלי MIC
4. לחסן פנלי MIC, בצע ספירת טהרה ומושבת ההתקנה
5. פנלי דגירה MIC, מושבה רוזן וצלחות טוהר
6. קראו MIC ומושבת רוזן צלחות; בדוק פלייט טוהר
תוצאות בקרת איכות 7. בדוק.
שיטות MIC טופל נחוצות כדי לעקוב אחר התפתחות התנגדות, מטרה חשובה של תוכניות מעקב מיקרוביאלית שונות. תוצאות Dalbavancin MIC עבור מבודדים שנאספו באירופה ובארה"ב ב2011-2013 היו <0.25 מיקרוגרם / מיליליטר ל99.9% מS.aureus ושל סטרפטוקוקוס 100% (לוח 4).
כדי להעריך את החשיבות של שימוש טרי (חתום) DMSO, בדיקות שלושה עותקים של מיקרופוני BMD dalbavancin לQC זני ס aureus ATCC 29,213, וא faecalis ATCC 29,212 ולשכפל בדיקות לס pneumoniae ATCC 49,619 בוצע באמצעות (1) DMSO מampules האטום, (2) DMSO מבקבוק 1 ליטר שהיה בתוך את תאריך התפוגה והיה בשימוש בעבר ל 2 שנים ו( 3) aliquot של DMSO מאותו 1 ליטר בקבוק (מדגם 2) שהורש לשבת בכוס פתוחה במשך 72 שעות לפני השימוש. תוצאות MIC Dalbavancin באמצעות לוחות שנעשו עם כל שלוש דוגמאות DMSO היו דומות וwithin טווחי QC המקובלים (לוח 5).
אובדן פעילות dalbavancin בעקבות חשיפה של מניות הפתרון לפלסטיק וללא תוספת של P-80 תועד היטב 7. ב 2 מחקרים נוספים, התוספת של P-80 לפתרונות מניות הראשוניים ובינוניים (לוח 6) והשימוש בצינורות זכוכית או פלסטיק להכנת פתרונות המניות הראשוניים ובינוניים (לוח 7) לא היה השפעה על תוצאות MIC dalbavancin. הייתה גם לא הייתה השפעה על תוצאות MIC dalbavancin כאשר פוליפרופילן ופוליסטירן צלחות משלושה יצרנים שמשו (לוח 7).
הנוכחות של דם סוס lysed בתקשורת המרק לבדיקה של סטרפטוקוקוס הוכחה לי פעילות כמו שטח-, דומה לP-80 7, 8. שיטת התייחסות dalbavancin לסטרפטוקוקוס אינה כוללת הן דם סוס P-80 וlysed ,עם זאת, בניגוד לstaphylococci וenterococci, תוצאות MIC dalbavancin לסטרפטוקוקוס דומות (בתוך +/- 1 דילול) עם וללא התוספת של P-80.
כפי שכבר הוצג בעבר ושמוצג באיור 1, דילול אגר dalbavancin מיקרופונים (AD) הם בדרך כלל 2-8 לקפל גבוה יותר בהשוואה להתייחסות הנוכחית BMD 12, 13, 14. שלא כמו BMD, התוספת של 0.002% P-80 לא על המודעה dalbavancin MIC תוצאות 12.
משוואת 1: דוגמא לצעדי הכנת Dalbavancin פתרון במלאי ההכנה 25 מיליליטר של 800 מיקרוגרם / מיליליטר פתרון dalbavancin..
איור 1. השוואה של Dalbavancin וVancomycin BMD לספירה. תוצאות של מחקר שהשווה dalbavancin וvancomycin BMD ותוצאות הספירה MIC עבור מבודד חיידקים גראם-חיובי בחר. ממוצע () Dalbavancin ו( ב ') תוצאות Vancomycin מרק Microdilution ואגרו הדילול MIC במיקרוגרם / מיליליטר במשך 15 Staphylococcus aureus, 8 staphylococci שלילי coagulase (CNS), 5 faecalis אנטרוקוקוס ו -14 סטרפטוקוקוס (קבוצות A, B, ו- C). אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | |
DAL 0.002 | DAL 0.004 | DAL 0.008 | DAL 0.015 | 0.03 דאל | DAL; 0.06 | DAL 0.12 | DAL 0.25 | DAL 0.5 | DAL 1 | DAL 2 | קופה Ctrl. | |
B | DAL 0.002 | DAL 0.004 | DAL 0.008 | DAL 0.015 | 0.03 דאל | DAL 0.06 | DAL 0.12 | DAL 0.25 | DAL 0.5 | DAL 1 | DAL 2 | קופה Ctrl. |
ג | DAL 0.002 | DAL 0.004 | DAL 0.008 | DAL 0.015 | 0.03 דאל | DAL 0.06 | DAL0.12 | DAL 0.25 | DAL 0.5 | DAL 1 | DAL 2 | קופה Ctrl. |
D | DAL 0.002 | DAL 0.004 | DAL 0.008 | DAL 0.015 | 0.03 דאל | DAL 0.06 | DAL 0.12 | DAL 0.25 | DAL 0.5 | DAL 1 | DAL 2 | קופה Ctrl. |
E | DAL 0.002 | DAL 0.004 | DAL 0.008 | DAL 0.015 | 0.03 דאל | DAL 0.06 | DAL 0.12 | DAL 0.25 | DAL 0.5 | DAL 1 | DAL 2 | קופה Ctrl. |
F | DAL 0.002 | DAL 0.004 | DAL 0.008 | DAL 0.015 | 0.03 דאל | DAL 0.06 | DAL 0.12 | DAL 0.25 | DAL 0.5 | DAL 1 | DAL 2 | קופה Ctrl. |
G | DAL 0.002 | DAL 0.004 | DAL 0.008 | DAL 0.015 | 0.03 דאל | DAL 0.06 | DAL 0.12 | DAL 0.25 | DAL 0.5 | DAL 1 | DAL 2 | קופה Ctrl. |
H | DAL 0.002 | DAL 0.004 | DAL 0.008 | DAL 0.015 | 0.03 דאל | DAL 0.06 | DAL 0.12 | DAL 0.25 | DAL 0.5 | DAL 1 | DAL 2 | קופה Ctrl. |
DAL | Dalbavancin | |||||||||||
ריכוזים מוצגים במיקרוגרם / מיליליטר לאחר 50 μl / גם חיסון |
פורמט פלייט 1. MIC שולחן. המיקום מציג 96 פורמט צלחת היטב של דילולים dalbavancin ובארות שליטה חיוביות משמש כדוגמא בפרסום וידאו זה
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 |
המקור Conc. (מיקרוגרם / מיליליטר) | מקור נפח (מיליליטר) | DMSO נפח (מיליליטר) | ביניים Conc. בDMSO (מיקרוגרם / מיליליטר) | נפח ביניים Conc. (מיליליטר) | CAMHB נפח 0.004% * + P80 (מיליליטר) | 2X Conc. אחרי 1: בCAMHB 100 דילול (מיקרוגרם / מיליליטר) | סופי לוח Conc. לאחר חיסון (מיקרוגרם / מיליליטר) |
800 | 1.0 | 1.0 | 400 | 0.02 | 1.98 | 4 | 2 |
400 | 0.5 | 0.5 | 200 | 0.02 | 1.98 | 2 | 1 |
400 | 0.5 | 1.5 | 100 | 0.02 | 1.98 | 1 | 0.5 |
400 | 0.5 | 3.5 | 50 | 0.02 | 1.98 | 0.5 | 0.25 |
50 | 0.5 | 0.5 | 25 | 0.02 | 1.98 | 0.25 | 0.125 |
50 | 0.5 | 1.5 | 12.5 | 0.02 | 1.98 | 0.125 | 0.06 |
50 | 0.5 | 3.5 | 6.25 | 0.02 | 1.98 | 0.06 | 0.03 |
6.25 | 0.5 | 0.5 | 3.13 | 0.02 | 1.98 | 0.03 | 0.015 |
6.25 | 0.5 | 1.5 | 1.5 | 0.02 | 1.98 | 0.015 | 0.008 |
6.25 | 0.5 | 3.5 | 0.8 | 0.02 | 1.98 | 0.008 | 0.004 |
0.8 | 0.5 | 0.5 | 0.4 | 0.02 | 1.98 | 0.004 | 0.002 |
טבלה זו שונה מCLSI M100-S25, לוח 8 3 |
שולחן תכנית 2. להכנת דילולים של סוכני מיקרוביאלית אינה מסיסים במים לשימוש במרק דילולי רגישות בדיקה. כרכים של פתרונות עובדים dalbavancin חומר מדלל להכנת MIC הסופיפתרונות dalbavancin של .002-2 מיקרוגרם / מיליליטר.
הזנים בקרת האיכות | צפוי Dalbavancin MIC (מיקרוגרם / מיליליטר) |
S. aureus ATCC 29,213 | 0.03-.12 |
א faecalis ATCC 29,212 | 0.03-.12 |
ס pneumoniae ATCC 49,619 | 0.008-.03 |
טבלת 3. תוצאות צפויות Dalbavancin MIC לבקרת איכות זני 3, 11 תוצאות בקרת איכות. CLSI לזנים הציעו להיבדק יחד עם בידודים קליניים על מנת לוודא המתודולוגיה ראויה
הפצת לוח 4. של Dalbavancin תוצאות MIC (מספר בכל MIC) מארה"ב ואירופה 2,011-2,013 Surveillאהה 15 מחקר. תוצאות Dalbavancin MIC ממחקר שפורסם בבידודים קליניים האחרונים כמדד לdalbavancin הנוכחי בפעילות חוץ גופית.
לבודד # | Dalbavancin MIC (מיקרוגרם / מיליליטר) | ||
DMSO 1 | DMSO 2 | DMSO 3 | |
S. aureus ATCC 29,213 | 0.12 | 0.06 | 0.06 |
0.12 | 0.06 | 0.06 | |
0.06 | 0.06 | 0.06 | |
א faecalis ATCC 29,212 | 0.06 | 0.06 | 0.06 |
0.06 | 0.06 | 0.06 | |
0.06 | 0.06 | 0.06 | |
S. pneumoniae ATCC 49,619 | 0.015 | 0.015 | 0.015 |
0.03 | 0.015 | 0.015 | |
DMSO 1 = להבה שלא נפתחה אטום 10 ampules מיליליטר | |||
DMSO 2 = 1 ליטר בקבוק נפתח ותשובות | |||
DMSO 3 = בקבוק 1 ליטר פתח נפוצות - ישב על ספסל בכוס מכוסה במשך 72 שעות |
לוח 5. תוצאות Dalbavancin MIC (מיקרוגרם / מיליליטר) באמצעות צילומים DMSO וחטיבות ביניים דילולי הכנה עם DMSO ממקורות 3. תוצאותיו של מחקר MIC dalbavancin כי בהשוואה השפעה של שימוש בממסי DMSO שונים בהכנת מניית dalbavancin ודילולי ביניים.
לבודד מספר | לשכפל מספר | Dalbavancin MIC (מיקרוגרם / מיליליטר) | |
DALB w / P80 בDMSO | DALB w / o P80 בDMSO | ||
S. aureus ATCC 29,213 | 1 | 0.06 | 0.06 |
2 | 0.06 | 0.06 | |
3 | 0.06 | 0.06 | |
4 | 0.06 | 0.06 | |
DP80-002SA הקליני S. aureus | 1 | 0.03 | 0.03 |
S. aureus ATCC 700,699 | 1 | 0.5 | 0.5 |
ס pneumoniae ATCC 49,619 | 1 | 0.03 | 0.015 |
2 | 0.03 | 0.015 | |
3 | 0.03 | 0.015 | |
4 | 0.03 | 0.015 | |
pyogenes ס קליני: | |||
DP80-004PY | 1 | 0.015 | 0.015 |
DP80-005PY | 1 | 0.03 | 0.03 |
DP80-006PY | 1 | 0.03 | 0.015 |
DP80-007PY | 1 | 0.06 | 0.03 |
DP80-008PY | 1 | 0.03 | 0.015 |
ס agalactiae קליני: | |||
DP80-009AG | 1 | 0.06 | 0.12 |
DP80-010AG | 1 | 0.06 | 0.03 |
DP80-011AG | 1 | 0.06 | 0.06 |
DP80-012AG | 1 | 0.06 | 0.06 |
clini dysgalactiae סקאל DP80-013DY | 1 | 0.03 | 0.03 |
ס pneumoniae קליני: | |||
DP80-014SP | 1 | 0.06 | 0.06 |
DP80-015SP | 1 | 0.03 | 0.03 |
DP80-016SP | 1 | 0.03 | 0.03 |
DP80-017SP | 1 | 0.06 | 0.06 |
6. תוצאות שולחן Dalbavancin MIC באמצעות צילומים DMSO וחטיבות ביניים דילולי הכנה עם ובלי 0.002% P-80. תוצאותיו של מחקר MIC dalbavancin כי בהשוואה השפעה של הוספת 0.002% P-80 לdalbavancin מניות ודילולי ביניים.
1לבודד | לשכפל מספר | מניית דילול צינורות | צלחת microtiter (סוג פלסטיק) | ||||||
פולי-פרופילן, גריינר | פוליסטירן | ||||||||
זכוכית | פלסטיק | 1 שעות פלסטיק | 1 שעות פלסטיק / 1 שעות ביניים | גריינר | קורנינג | Nunc | |||
S. aureus ATCC 29,213 | 1 | 0.06 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.06 | 0.03 | 0.06 | 0.03 |
2 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.06 | |
3 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | |
א faecalis ATCC 29,212 | 0.06 | 0.06 | 0.06 | 0.06 | 0.03 | 0.03 | 0.06 | 0.03 | |
2 | 0.06 | 0.06 | 0.06 | 0.06 | 0.03 | 0.03 | 0.06 | 0.03 | |
3 | 0.06 | 0.06 | 0.06 | 0.06 | 0.03 | 0.03 | 0.06 | 0.03 | |
ס pneumoniae ATCC 49,619 | 1 | 0.015 | 0.015 | 0.015 | 0.015 | 0.008 | 0.008 | 0.008 | 0.008 |
2 | 0.015 | 0.015 | 0.015 | 0.015 | 0.008 | 0.015 | 0.008 | 0.008 | |
= מניות ראשוניות הזכוכית נעשו בבקבוק זכוכית, המשמשות באופן מיידי כדי להפוך את ריכוז בינייםים בצינורות פלסטיק, המשמשים באופן מיידי כדי להפוך דילולים מרק. | |||||||||
מניית פלסטיק = ראשונית שנעשתה בצינור צנטריפוגות פלסטיק, המשמשת באופן מיידי כדי להפוך את ריכוזי ביניים בצינורות פלסטיק, המשמשים באופן מיידי כדי להפוך דילולים מרק. | |||||||||
שעה 1 = המניה ראשונית פלסטיק בצינור צנטריפוגות פלסטיק, בואו לשבת על ספסל במשך שעה 1 אז נהגה להכין ריכוזי ביניים בצינורות פלסטיק, המשמשים באופן מיידי כדי להפוך את הריכוזים במרק. | |||||||||
1 שעה / שעה 1 = המניה ראשונית פלסטיק ביניים שנעשתה בצינור צנטריפוגות פלסטיק, בואו לשבת על ספסל במשך שעה 1 אז נהגה להכין ריכוזי ביניים בצינורות פלסטיק, בואו לשבת על ספסל במשך שעה 1 אז נהגה להכין ריכוזים במרק. |
7. תוצאות שולחן Dalbavancin MIC באמצעות צילומים דילולי הכנה בצינורות פלסטיק וזכוכית וסוגי פלסטיק פלייט MIC. תוצאות ofa dalbavancin MIC מחקר כי בהשוואה השפעה של שימוש צינורות פלסטיק או זכוכית בעת הכנת פתרונות המניות וגם השפעה של שימוש במקורות וסוגי הפלסטיק שונים לצלחות microtiter.
פרטי השיטה הבאות מוצגים לשיקולים נוספים בעת הכנה לבדיקת MIC dalbavancin. העיצוב של לוח MIC יהיה תלוי במספר סוכני מיקרוביאלית להיבדק (כלומר., Dalbavancin לבד או סוכנים מרובים) והמינים של חיידקים להיבדק. ריכוזי dalbavancin צריכים להקיף את נקודות העצירה הפרשניות לכל מיני החיידקים שנבדקו ואת כל הטווח של דילולים צפויים לפחות אחד זן QC. סדרת דילול מיקרוביאלית יכולה להיות מאורגנת בשורות או עמודות בהתאם למספר סוכני מיקרוביאלית ו / או מבודד / צלחת ושיטה של חיסון. הנפח של אבקת מרק dalbavancin וצריך להיות מחושב כדי להבטיח שכמויות אופטימליות מיוצרות והפסולת היא מינימאלית. לדוגמא בשימוש בפרסום זה, כרכים מבוססים על הכנת שני פנלי MIC. מרק מילר הינטון קטיון הותאם צריך להיות מוכן וautoclaved לפי אדםההוראות ועקרות של התקשורת של ufacturer מאומתים. לוחות MIC יכולים להתבצע ומשמשים באותו יום של הכנה או שהם יכולים להיבדק עם אורגניזמים בקרת האיכות מתאימים ולוחות תוקף מאוחסנים קפוא לשימוש עתידי. חשוב להשתמש בטכניקות סטרילי לאורך כל ההליך.
אין קריטריונים נוקשים לאימות של ריכוז הבידוד עם ספירת מושבה. ספירת מושבה יכולה להיבדק בתחילה לכל מינים נבדקו ו / או מעת לעת כדי לאמת את צעד הדילול מתבצע בשלב 4.2. חשוב שהתוקף של תקן מק 'פרלנד 0.5 גם בדק באופן שיגרתי עם E. coli ATCC 25922 באמצעות הליך דומה לצעד 4.5. אם התוצאות אינן שווה ערך ל1-2 x 10 8 CFU / ml, יש לקבל סטנדרטי מק 'פרלנד 0.5 חדש. אם ספירת המושבה מבארות MIC נמצא מחוץ לטווח המקובל (2-8 10 5 CFU תוצאות x / מיליליטר וMIC לבודד הקליני (ים) משתנות מהדואר צפוי התפלגות נורמלית (לדוגמא. 0.03-.12 UG / מיליליטר לS. aureus) ו / או תוצאות MIC לבודד בקרת איכות (ים) נמצאות מחוץ לטווח צפוי, בדיקות אימות היא הכרחיות ושינוי שיטה עשוי להיות מוצדקים. הוא הציע כי 0.5 סטנדרטי מק 'פרלנד תוקף משמש לחזור על ספירת המושבה (ים), ואם תוצאות הן שוב מחוץ לתוצאות צפויות, דילול הבידוד כפי שבוצע בשלב 4.2 צריך להיות בהתאם וMIC חוזר ונשנה. שים לב שבדיקת טוהר היא הכרחית גם אם ספירת מושבה מתבצעת כי הליך ספירת המושבה משתמש נפח מדולל שלא בהכרח לזהות ריכוזים נמוכים של אורגניזמים מזהמים.
לבדיקת MIC להיחשב חוקית, צמיחה מקובלת חייבת להתרחש בשליטת הצמיחה גם. עבור רוב החיידקים שייבחנו נגד dalbavancin (כלומר., Staphylococci, סטרפטוקוקוס וenterococci, צמיחה שנראה כמו כפתור (בדרך כלל> 2 מ"מ) ופחות frequently, צמיחה עשויה להופיע כעכירות בבאר. בניגוד לכמה סוכני מיקרוביאלית שעשויה להפגין נגררים השפעת הריכוזים להגדיל, נקודות קצה dalbavancin מוגדרות בדרך כלל היטב. ישנם מכשירים שונים שנועדו להקל על הצפייה בדיקות microdilution הקריאה, אשר עשוי לשמש לקריאת צלחות המכילות dalbavancin כל עוד אין פשרה ביכולת להבחין בצמיחת הבארות.
השלבים הקריטיים בפרוטוקול הקשורות לחלקים של ההליך שאינם קשורים למסיסות של dalbavancin ותוספת של P80. חשוב שאת הריכוז המרבי של dalbavancin משמש הוא לא יותר מ -1,600 / מיקרוגרם מיליליטר, DMSO המשמש כממס וכי ריכוזי ביניים ערוכים DMSO לפני ביצוע דילולים המרק כך שהריכוז הסופי של DMSO בMIC פנל הבארות אינן עולים על 1%. DMSO הוא hygroscopic ולכן, השימוש בבקבוקים ישנים יותר של DMSO היה consideratיון ביחס למסיסות dalbavancin. עם זאת, בעוד שמחקר BMD קטן עם זני בקרת האיכות הוכיח את זה לא כדי להיות משתנה חשוב (ראה סעיף תוצאות), זה תרגול טוב להשתמש בבקבוקים חדשים או שנפתחו לאחרונה של DMSO. כמו כן, חשוב שP80 מתווסף המרק בשלב האחרון של הכנת דילול תרופה והוא בריכוז סופי של 0.002% בMIC כן.
הליך BMD כלול כאן מנצל הכנת לוחות MIC באמצעות 50 μl / גם בdalbavancin ו- P-80 ריכוזים שתי פעמים הריכוז הסופי ותוספת של הבידוד עם 50 μl / כל כך טוב שנפח סופי / גם הוא 100 μl. שיטה זו מאפשרת לפורמט פנל MIC אחד להיות מיוצר לבדיקה של שני ס aureus וס pneumoniae כי דם סוס lysed ניתן להוסיף לבידוד. שיטות אלטרנטיביות להכנת לוחות MIC באמצעות 100 μl / גם עם תוספת של עד 10 μl / גם מתוארות בנהלי CLSI ו- ISO.
נקודת העצירה רגישה dalbavancin לס aureus הוא ≤0.12 מיקרוגרם / מיליליטר (עלון FDA). כפי שמוצג במעקב האחרון, רוב מבודדים מעוכבים על ידי dalbavancin ברמות של 0.06 מיקרוגרם / מיליליטר 15. עם נקודת עצירה רגישה קרוב לMIC מודאלית, כל שינוי בMIC כתוצאה מהבדלים בשיטה יכול להשפיע על שיעורי רגישות. בגלל הליך BMD לdalbavancin כולל כמה שלבים ייחודיים (במיוחד, השימוש בDMSO בהכנת מניות ודילולי תרופת ביניים וP80 0.002% בMIC טוב, זה הכרחי כי השיטה המיושמת בדיוק. האורגניזם S. aureus QC (ATCC 29,213) עם MIC מודאלי dalbavancin מאוד ברור של 0.06 מיליליטר מיקרוגרם /, היה אינדיקטור טוב של וריאציה שיטה ויש להשתמש באופן שיגרתי כדי לאמת את שיטת BMD. אם תוצאות MIC הן עם הטווח הצפוי של .03-.12 מיקרוגרם / מיליליטר, אך במגמה לאו נמוך או HIGצד שעות של טווח זה, אימות נוספת של השיטה היא מוצדקת.
התוספת של P80 0.002% מומלצת לכל היצורים גרם-חיובי רלוונטי (staphylococcci, enterococci, וסטרפטוקוקוס.) עם זאת, ראוי לציין כי זה כבר הראה כי lysed דם סוס פועל בדומה לP-80 ביחס לה אנטי-מחייב יכולת וכי התוספת של P-80 לCAMHB + LHB אין כל השפעה נוספת על תוצאות MIC סטרפטוקוקוס dalbavancin.
אין כרגע שיטת דיפוזיה דיסק לdalbavancin בדיקות ובגלל עניי המתאם של BMD ותוצאות הספירה, בדיקת רגישות של dalbavancin בשיטת הספירה אינו מומלצת 12, 14. שיטת BMD צריכה לשמש להערכה העתידית של רגישות dalbavancin וכתקן זהב לפיתוח בדיקות רגישות מיקרוביאלית מסחריות.
סנדרה מק'קרדי הנו עובד Therapeutics Durata; מומחי מעבדה, Inc, מעסיק של לורה Koeth וJeanna פישר, היה חוזה על ידי Therapeutics Durata להכין את כתב היד. עמלות פרסום לכתבה זו שולמו על ידי מומחי מעבדה, Inc.
Prior work with regard to susceptibility testing of dalbavancin has been valuable in development of a standardized methods and acknowledgement for this work is given to JMI Laboratories, Robert Rennie and Beth Goldstein.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Dalbavancin | Metrics, Inc. | Greenville, NC | BI-397 |
Vancomycin | Sigma-Aldrich | St. Louis, MO | C5793 |
Cation Adjusted Mueller Hinton Broth | Becton Dickinson | Sparks, MD | 212322 |
Lysed horse blood | Cleveland Scientific | Bath, OH | |
Dose-it peristaltic pump | Integra Biosciences | Hudson, NH | |
Multi-channel pipet (Viaflo II) | Integra | Hudson, NH | 4164 |
12 channel pipet (Matrix) | ThermoFisher Scientific | Waltham, MA | |
Single channelpPipets (Ovation 10 µl - 100 µl) | VistaLab | Brewster, NY | |
96 well microplate | Greiner Bio-one | Monroe, NC | 650161 |
50 ml flat cap conical bottom centrifuge tubes | ThermoFisher Scientific | Waltham, MA | |
16x125 mm disposable glass tubes | ThermoFisher Scientific | Waltham, MA | |
12x17 mm snap cap, polystyrene tubes | ThermoFisher Scientific | Waltham, MA | |
16 ml centrifuge tubes | BioExpress | Kaysville, UT | C-3394-2 |
Reagent reservoirs | Integra Biosciences | Hudson, NH | 4312 |
Disposable sterilelLoops (1 µl & 10 µl) | Biologix | Lenexa, KA | 65-0001,65-0010 |
Tryptic soy agar + 5% sheep blood | Becton Dickinson | Sparks, MD | |
Incubator (ambient) | Sanyo | ||
Incubator (5% CO2) | Sanyo | ||
Analytical balance | ThermoFisher Scientific | Waltham, MA | |
Gloves | Kimberly-Clark | 52817 | |
Lab coats |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved