JoVE Logo

Sign In

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

In This Article

  • Summary
  • Abstract
  • Introduction
  • Protocol
  • תוצאות
  • Discussion
  • Disclosures
  • Acknowledgements
  • Materials
  • References
  • Reprints and Permissions

Summary

2-azido-1-חנקת-אסתר ניתן להמיר את המקביל 2-azido-1-trichloroacetimidate בהליך סיר אחד. המטרה של כתב היד היא להדגים את השירות של הכור מיקרוגל בסינתזה של פחמימות.

Abstract

מטרת ההליך הבא נועד לספק הפגנה של ההמרה סיר אחד של 2-azido-1-חנקת-אסתר תורם glycosyl trichloroacetimidate. בעקבות azido-ניטרציה של glycal, אסתר 2-azido-1-ניטראט מוצר יכול להיות הידרוליזה תחת הקרנה בסיוע מיקרוגל. שינוי זה מושגת בדרך כלל בעזרת ריאגנטים חריפה נוקלאופילי, זמני תגובה ארוכים. הקרנה במיקרוגל גורם הידרוליזה, בהיעדרו של ריאגנטים, עם זמני תגובה קצרים. בעקבות denitration, מומר האלכוהול anomeric ביניים, בסיר אותה המקביל 2-azido-1-trichloroacetimidate.

Introduction

עקב המצאות שלהם בכל מקום ב ביולוגיה מולקולרית, פחמימות היו מטרות ארוכת שנים עבור סינתזה. 1 , 2 , 3 -הליבה של כל קמפיין מוצלח סינתטי הוא פריסה נכונה של גליקוזילציה תגובות לבנות את השרשרת פחמימה # מיון הפחמימות. 4 , 5 , 6 , 7 , 8 , 9 , 10 , 11 , 12 . באופן לא מפתיע, ישנם מספר רב של שיטות כדי להתקין את glycosidic אגרות חוב. 13 , 14 בשיטה Koenigs-קנור הוא אחד מההליכים הידוע המוקדם, כרוך צימוד של כלוריד glycosyl או ברומיד עם מרכיב אלכוהולי, בדרך כלל תחת הפעלת מתכות כבדות (כספית או כסף). 15 ופלואורידים glycosyl קשורים הוכנסו הראשון בתור תורמים בשנת 1981 על ידי קבוצת Mukaiyama, מצאו יישום נרחב עקב יציבות מוגברת שלהם תרמי וכימיים. 16 בקצה השני של הספקטרום תגובתיות הם glycosyl iodides, אשר מגיב הרבה יותר מאשר הלידים אחרים. תגובתיות מוגברת מלווה stereocontrol מוגברת, במיוחד כאשר ויוצרים מקושרים-α oligosaccharides. 17 בנוסף "haloglycosides", thioglycosides מצאו כלי רחב, בין השאר, הודות לקלות שלהם היווצרות, יציבות כדי שפע של תנאי ריאקציה, והפעלה עם ריאגנטים electrophilic. 18

השיטות המתוארות לעיל פוקוס על המרת anomeric אלכוהול כדי, המכילים "-חמצן" החבויים עוזב קבוצה מופעל, בסופו של דבר שנעקרו על ידי אלכוהול מ מולקולה מקבל. Anomeric חמצן הפעלה כפי שתואר על ידי בית הספר שמידט, מתמקד המרת החמצן C1 עצמו, קבוצה עוזבת. 19 בשיטה זו היא החזקה ביותר, בשימוש נרחב תגובות כימיות גליקוזילציה. Trichloroacetimidate תורמים מוכנים ברצון הפחתת סוכר, trichloroacetonitrile בנוכחות בסיס כגון אשלגן פחמתי (K2CO3) או 1, 8-diazabicyclo [5.4.0] undec-7-ene (DBU). מינים אלה מופעלים באמצעות חומצות לואיס. 20

לאחרונה, אנחנו דיווחו על כך להיות מוכן ישירות תורמים 2-azido-1-trichloroacetimidate מ- glycals. התהליך כרוך ריאקציה שני, נוהל סיר אחד מ- 2-azido-1-ניטראט אסטרים. 21 פרוטוקול מפורט זה נועד לסייע למטפלים בהצלחה להשלים את השינוי בתשואה גבוהה. עניין מיוחד הוא הצעד הראשון של הרצף, אשר מתמקדת denitration תרמי תחת מיקרוגל - בסיוע חימום. אנו גם מקווים לספק מדריך חזותי על העסקת מיקרוגל כורים ב סינתזה אורגנית.

Protocol

1. נציג מיקרוגל-בסיוע Denitration

  1. במקום אסתר חנקת azido (1.0 equiv., 0.2 mmol) בתוך המבחנה התגובה מיקרוגל 8 מ ל. ניתן להגדיל את היקף התגובה ל mmol מספר ללא כל השפעה שלילית על התקדמות התגובה.
  2. להמיס אסתר azido-ניטראט ב 20% aq. אצטון (0.1 M, 2.0 מ"ל). פירידין (5.0 equiv., 0.08 מל ', 1.0 mmol) להוסיף מיכל התגובה. וחוץ את המבחנה הקרנה במיקרוגל ולמקם את מיכל התגובה חור בכור מיקרוגל.
  3. . להאיר את הפתרון ב- 120 מעלות למשך 15 דקות עם ערבוב, עם זמן המתנה קבועה... הזמן מייצג כמה זמן ההקרנות תתרחש ב המיועד טמפרטורה, לחץ תוצאות. מחממים את כל התגובות הטמפרטורה המדווחת ramping במשך 2 דקות. נטר את הטמפרטורה על ידי חיישן מוכלת IR.
  4. לאחר 15 דקות, לנתח את תערובת התגובה באמצעות שכבה דקה כרומטוגרפיה (TLC) כדי לאשר את הצריכה של חומר המוצא. להשתמש אתיל אצטט 1:1 / hexanes eluent.
    1. דמיינו את הצלחת TLC באמצעות הכתם molybate אמוניום ceric. Rf של מגיבים, המוצר עשוי להשתנות, אך האלכוהול תוך צמצום בדרך כלל 0.05 ל 0.1 התחתון Rf מאשר מגיבים.

2. היווצרות trichloroacetimidate

  1. בעקבות צריכת מוחלטת של חומר המוצא, להתנדף הממס לאמצעי אחסון מופחת באמצעות חברת תעופה. לאחר מכן, לדלל עם (דיכלורומתאן) CH2Cl2 (1.0 מ"ל) והשתמש מזרק כדי להסיר את שכבת מים. לאחר הסרת השכבה מים, מגניב את תערובת התגובה עד 0 ° C בעזרת אמבט קרח-מים.
  2. לאחר מכן, להוסיף DBU (10 eq, 0.3 mL, 1.9 mmol) ו- 2,2,2-trichloroacetonitrile (50 eq, 1.0 מ"ל, 10 mmol) מיכל התגובה. ריאגנטים הן מתווספות עודף, מינימום של המקבילה בסיס 1 ו- 1 המקבילה 2,2,2-trichloroacetonitrile יש צורך.
  3. לאפשר את תערובת התגובה לעורר בעת ההתחממות לטמפרטורת הסביבה. נטר את התגובה על ידי TLC לאשר הצריכה של חומר המוצא.
    1. להשתמש אתיל אצטט 1:1 / hexanes eluent. דמיינו את הצלחת TLC באמצעות הכתם molybate אמוניום ceric. Rf של מגיבים ושל המוצר ישתנו.
  4. לאחר צריכת מלאה החל חומר, להעביר את תערובת התגובה בקבוקון שחזור ולרכז את התערובת ב vacuo ב- 30 ° C. אידוי של הממס תספק צהוב חיוור גולמי שמן חום.
  5. לטהר את המוצר גולמי על ידי סיליקה ג'ל עמודה כרומטוגרפיה ועם לעמודה כרומטוגרפיה 1.5 ס מ 1:4 אתיל אצטט/hexanes כמו eluent. הצורה הפיזי של imidate ישתנו מולקולה מולקולה.

figure-protocol-2279
איור 1. דוגמאות מייצגות של ההמרה סיר אחד של 2-azido-1-ניטראט אסטרים ל- 2-azido-1-trichloroimidates. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.

תוצאות

הטכנולוגיה המתוארים בזאת הודגם על מאגר של שלושה אסטרים 2-azido-1-חנקתי. בכל מקרה ומקרה הושלם השלב הראשון של התגובה תוך 20 דקות.

figure-results-247
איור 2- נציג דוגמה הידרוליזה (1 ->2), סיר אחד ...

Discussion

הפרוטוקול המתואר במדריך זה מספק שיטה להמרת חנקתי אסטרים פונקציונליות שימושית, תגובתי. במובן רחב יותר, העסקת כור מיקרוגל להשלמת תמרונים ספציפי במהלך סינתזה פחמימות יש פוטנציאל להפוך שינויי צורה קשה נתיישב, שגרתיות. מטרתנו במדריך זה כדי להדגים כיצד להתמודד עם פחמימות בהקשר של הקרנה במיקרו?...

Disclosures

המחברים יש אין אינטרסים כלכליים מתחרים.

Acknowledgements

המחברים רוצה להכיר אוניברסיטת ואנדרבילט ו המכון לביולוגיה כימיים עבור תמיכה כספית. מר ברקלי אליס, פרופסור ג'ון מקלין הם הכירו עבור ניתוח ספקטרלי של מסה להדפסה ברזולוציה גבוהה.
 

Materials

NameCompanyCatalog NumberComments
230 400 mesh silica gelSiliCycle IncR10030B
TLC platesSiliCycle IncTLG-R10014B-527
Ceric ammonium molybdateSigma-AldrichA1343
Solvent StillMbraunMB-SPS-800
Infared spectrometerThermoThermo Electron IR100
Nuclear Magnetic ResonanceBruker400, 600 MHz
LC/MSThermo/DionexSingle quad, ESI
HRMSAgilentSynapt G2 S HDMS
Microwave reactorAnton ParrAnton Parr G10 Monowave 200
DBUSigma-Aldrich139009
CCl3CNSigma-AldrichT53805
PyridineSigma-Aldrich270970
AcetoneFisher ScientificA18-20Tech. grade
Phase separatorBiotage120-1901-A
Rotary evaporatorBuchiR-100

References

  1. Nicolaou, K. C., Mitchell, H. J. Adventures in Carbohydrate Chemistry: New Synthetic Technologies, Chemical Synthesis, Molecular Design, and Chemical Biology A list of abbreviations can be found at the end of this article. Telemachos Charalambous was an inspiring teacher at the Pancyprian Gymnasium, Nicosia, Cyprus. Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 40 (9), 1576-1624 (2001).
  2. Danishefsky, S. J., Allen, J. R. From the laboratory to the clinic: A retrospective on fully synthetic carbohydrate-based anticancer vaccines. Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 39 (5), 836-863 (2000).
  3. Nicolaou, K. C., Hale, C. R. H., Nilewski, C., Ioannidou, H. A. Constructing molecular complexity and diversity: total synthesis of natural products of biological and medicinal importance. Chemical Society Reviews. 41 (15), 5185-5238 (2012).
  4. Zhu, X., Schmidt, R. R. New principles for glycoside-bond formation. Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 48 (11), 1900-1934 (2009).
  5. Danishefsky, S. J., Bilodeau, M. T. Glycals in organic synthesis: The evolution of comprehensive strategies for the assembly of oligosaccharides and glycoconjugates of biological consequence. Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 35 (13-14), 1380-1419 (1996).
  6. Bongat, A. F., Demchenko, A. V. Recent trends in the synthesis of O-glycosides of 2-amino-2-deoxysugars. Carbohydr. Res. 342 (3-4), 374-406 (2007).
  7. Feizi, T., Fazio, F., Chai, W. C., Wong, C. H. Carbohydrate microarrays - a new set of technologies at the frontiers of glycomics. Curr. Opin. Struct. Biol. 13 (5), 637-645 (2003).
  8. Palmacci, E. R., Plante, O. J., Seeberger, P. H. Oligosaccharide synthesis in solution and on solid support with glycosyl phosphates. Eur. J. Org. Chem. (4), 595-606 (2002).
  9. Stallforth, P., Lepenies, B., Adibekian, A., Seeberger, P. H. 2009 Claude S. Hudson Award in Carbohydrate Chemistry. Carbohydrates: a frontier in medicinal chemistry. J. Med. Chem. 52 (18), 5561-5577 (2009).
  10. Danishefsky, S. J., Mcclure, K. F., Randolph, J. T., Ruggeri, R. B. A Strategy for the Solid-Phase Synthesis of Oligosaccharides. Science. 260 (5112), 1307-1309 (1993).
  11. Demchenko, A. V. Stereoselective chemical 1,2-cis O-glycosylation: From 'sugar ray' to modern techniques of the 21st century. Synlett. (9), 1225-1240 (2003).
  12. Fraserreid, B., Wu, Z. F., Udodong, U. E., Ottosson, H. Armed-Disarmed Effects in Glycosyl Donors - Rationalization and Sidetracking. J. Org. Chem. 55 (25), 6068-6070 (1990).
  13. Bohe, L., Crich, D. A propos of glycosyl cations and the mechanism of chemical glycosylation; the current state of the art. Carbohydr. Res. 403, 48-59 (2015).
  14. Toshima, K., Tatsuta, K. Recent Progress in O-Glycosylation Methods and Its Application to Natural-Products Synthesis. Chem. Rev. 93 (4), 1503-1531 (1993).
  15. Koenigs, W., Knorr, E. Ueber einige Derivate des Traubenzuckers und der Galactose. Chem. Ber. 34 (1), 957-981 (1901).
  16. Mukaiyama, T., Murai, Y., Shoda, S. An Efficient Method for Glucosylation of Hydroxy Compounds Using Glucopyranosyl Fluoride. Chem. Lett. (3), 431-432 (1981).
  17. Meloncelli, P. J., Martin, A. D., Lowary, T. L. Glycosyl iodides. History and recent advances. Carbohydrate Research. 344 (9), 1110-1122 (2009).
  18. Lian, G., Zhang, X., Yu, B. Thioglycosides in carbohydrate research. Carbohydr. Res. 403, 13-22 (2015).
  19. Schmidt, R. R., Kinzy, W. Anomeric-Oxygen Activation for Glycoside Synthesis - the Trichloroacetimidate Method. Advances in Carbohydrate Chemistry and Biochemistry. 50, 21-123 (1994).
  20. Schmidt, R. R., Toepfer, A. Glycosylation with highly reactive glycosyl donors: efficiency of the inverse procedure. Tetrahedron Lett. 32 (28), 3353-3356 (1991).
  21. Keith, D. J., Townsend, S. D. Direct, microwave-assisted substitution of anomeric nitrate-esters. Carbohydr. Res. 442, 20-24 (2017).
  22. Bukowski, R., et al. Synthesis and Conformational Analysis of the T-Antigen Disaccharide(B-D-Gal-(1->3)-a-D-GalNAc-OMe). Eur. J. Org. Chem. 14, 2697-2705 (2001).

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Explore More Articles

131glycalazidonitrationtrichloroacetimidate

This article has been published

Video Coming Soon

JoVE Logo

Privacy

Terms of Use

Policies

Research

Education

ABOUT JoVE

Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved