A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Method Article
מוצג כאן פרוטוקול להנדס מערכת איבר-על-שבב מותאמת אישית המשחזרת את המבנה והתפקוד של מחסום הסינון הגלומרולרי בכליות על ידי שילוב תאי אפיתל וכלי דם מותאמים גנטית המובחנים מתאי גזע פלוריפוטנטיים המושרים על ידי בני אדם. מערכת מהונדסת ביולוגית זו יכולה לקדם את רפואת דיוק הכליות ואת היישומים הקשורים אליה.
מחלת כליות כרונית (CKD) משפיעה על 15% מהאוכלוסייה הבוגרת בארה"ב, אך הקמת טיפולים ממוקדי מטרה הוגבלה על ידי היעדר מודלים פונקציונליים שיכולים לחזות במדויק תגובות ביולוגיות אנושיות ונפרוטוקסיות. ההתקדמות ברפואה המדויקת של הכליות עשויה לסייע להתגבר על מגבלות אלה. עם זאת, מודלים שהוקמו בעבר במבחנה של גלומרולוס הכליות האנושיות - האתר העיקרי לסינון דם ויעד מרכזי למחלות רבות ורעילות לתרופות - משתמשים בדרך כלל באוכלוסיות תאים הטרוגניות עם מאפיינים תפקודיים מוגבלים ורקע גנטי שאין שני לו. מאפיינים אלה מגבילים באופן משמעותי את היישום שלהם עבור מודלים ספציפיים למחלה וגילוי טיפולי.
מאמר זה מציג פרוטוקול המשלב אפיתל גלומרולרי (פודוציטים) המושרה על ידי האדם ואנדותל כלי דם מחולה יחיד כדי להנדס שבב גלומרולוס כליות איזוגני וסקולרי. שבב הגלומרולוס המתקבל מורכב משכבות תאי אנדותל ותאי אפיתל שמקורם בתאי גזע, המבטאות סמנים ספציפיים לשושלת, מייצרות חלבוני קרום מרתף ויוצרות ממשק רקמה-רקמה הדומה למחסום הסינון הגלומרולרי של הכליה. שבב הגלומרולוס המהונדס מסנן באופן סלקטיבי מולקולות ומשחזר פגיעה בכליות הנגרמת על ידי תרופות. היכולת לשחזר את המבנה והתפקוד של גלומרולוס הכליה באמצעות סוגי תאים איזוגניים יוצרת את ההזדמנות למדל מחלת כליות עם ספציפיות המטופל ולקדם את התועלת של איברים על שבבים לרפואה מדויקת של כליות ויישומים קשורים.
התקני איבר על שבב הם מודלים דינמיים תלת-ממדיים במבחנה המשתמשים בגירוי מולקולרי ומכני, כמו גם בכלי דם, כדי ליצור ממשקי רקמה-רקמה המדגימים את המבנה והתפקוד של איברים ספציפיים. התקנים שהוקמו בעבר איברים על שבב שמטרתם לסכם את הגלומרולוס (שבבי גלומרולוס) של הכליה, כללו קווי תאים של בעלי חיים1 או קווי תאים ראשוניים ואימורטליים אנושיים של מקורות הטרוגניים 2,3. השימוש במקורות תאים הטרוגניים מבחינה גנטית מציג וריאציות המגבילות באופן משמעותי את המחקרים על תגובות ספציפיות לחולה וגנטיקה או מנגנונים של מחלה 4,5. ההתמודדות עם אתגר זה תלויה בזמינותם של קווי תאים איזוגניים שמקורם באנשים ספציפיים בעלי פרופילים מולקולריים וגנטיים משומרים כדי לספק מיקרו-סביבה מדויקת יותר להנדסת מודלים במבחנה 2,3,6. קווי תאים איזוגניים ממוצא אנושי יכולים כעת להיווצר בקלות עקב ההתקדמות בתרבית תאי iPS אנושית. מאחר שתאי iPS אנושיים הם בדרך כלל ממקור לא פולשני, יכולים להתחדש בעצמם ללא הגבלת זמן, ולהתמיין כמעט לכל סוג תא, הם משמשים כמקור אטרקטיבי של תאים להקמת מודלים במבחנה, כגון שבב גלומרולוס 7,8. מחסום הסינון הגלומרולרי הוא האתר העיקרי לסינון דם. הדם מסונן תחילה דרך אנדותל כלי הדם, קרום המרתף הגלומרולרי, ולבסוף דרך אפיתל מיוחד בשם פודוציטים. כל שלושת המרכיבים של מחסום הסינון תורמים לסינון סלקטיבי של מולקולות. מוצג כאן פרוטוקול להקמת התקן איבר-על-שבב המתממשק עם אנדותל וסקולרי ואפיתל גלומרולרי ממקור תאי iPS אנושי יחיד. בעוד שפרוטוקול זה שימושי במיוחד כדי להנדס שבב איזוגני וכלי דם כדי לשחזר את מחסום הסינון הגלומרולרי, הוא גם מספק תוכנית לפיתוח סוגים אחרים של איברים על שבבים מותאמים אישית ופלטפורמות מרובות איברים כגון מערכת איזוגנית 'גוף על שבב'.
הפרוטוקול המתואר כאן מתחיל בהתמיינות מסתעפת של תאי iPS אנושיים לשתי שושלות נפרדות - מזודרם לרוחב ותאי מזודרם, אשר לאחר מכן מתמיינים לאנדותל וסקולרי ואפיתל גלומרולרי, בהתאמה. כדי ליצור תאי מזודרם לרוחב, תאי iPS אנושיים נזרעו על לוחות מצופים 1 של מטריצת ממברנת מרתף וגודלו בתרבית במשך 3 ימים (ללא חילופי מדיה) בתווך N2B27 בתוספת מפעיל Wnt, CHIR 99021, וגורם המזודרם החזק, עצם-מורפוגנטית 4 (BMP4). תאי המזודרם הלטרליים שהתקבלו התאפיינו בעבר בביטוי של ברכיורי (T), תיבת הומיאובוקס דמוית תערובת זוגית (MIXL) ו-eomesodermin (EOMES)9. לאחר מכן, תאי המזודרם הלטרליים עברו תרבית במשך 4 ימים בתווך בתוספת VEGF165 ופורסקולין כדי לגרום לתאי אנדותל וסקולריים שמוינו על בסיס VE-קדהרין ו/או ביטוי PECAM-1 באמצעות מיון תאים המופעל על ידי מגנט (MACS). תאי האנדותל הווסקולריים שנוצרו כתוצאה מכך (viEC) הורחבו על ידי גידולם על צלוחיות ממברנת מרתף 3 מצופות עד שהם מוכנים לזרע במכשיר המיקרופלואידי.
כדי ליצור תאי מזודרם, תאי iPS אנושיים נזרעו על לוחות מצופים 2 ממברנות מרתף וגודלו בתרבית במשך יומיים בתווך המכיל Activin A ו- CHIR99021. תאי המזודרם שהתקבלו התאפיינו בביטוי של HAND1, goosecoid ו-brachury (T) כפי שתואר קודם לכן 2,10,11. כדי לגרום להתמיינות של תאי מזודרם ביניים (IM), תאי המזודרם גודלו בתרבית במשך 14 יום בתווך בתוספת BMP-7 ו-CHIR99021. תאי ה-IM המתקבלים מבטאים את הגידול 1 של וילם (WT1), את גן התיבה הזוגית 2 (PAX2) ואת החלבון הקשור 1 (OSR-1)2,10,11.
שבב מיקרופלואידי דו-ערוצי המבוסס על פולידימתילסילוקסן (PDMS) תוכנן לסכם מחדש את מבנה מחסום הסינון הגלומרולרי במבחנה. תעלת השתן היא 1,000 מיקרומטר x 1,000 מיקרומטר (רוחב x גובה) וממד הערוץ הנימי הוא 1,000 מיקרומטר x 200 מיקרומטר (רוחב x גובה). מחזורי מתיחה והרפיה מחזוריים התאפשרו על ידי התאים החלולים הנמצאים בכל צד של תעלות הנוזלים. התאים נזרעו על קרום PDMS גמיש (בעובי 50 מיקרומטר) המפריד בין תעלות השתן לתעלות הנימים. הממברנה מצוידת בנקבוביות משושה (קוטר 7 מיקרומטר, במרחק של 40 מיקרומטר זו מזו) כדי לסייע בקידום איתות בין-תאי (איור 1A)2,12. יומיים לפני השלמת אינדוקציה של IM, השבבים המיקרופלואידיים היו מצופים במטריצת קרום מרתף 2. viECs נזרעו לתוך הערוץ הנימי של השבב המיקרופלואידי באמצעות מדיום תחזוקה אנדותליאלי יום אחד לפני השלמת אינדוקציה של IM, והשבב התהפך הפוך כדי לאפשר הידבקות תאים בצד הבסיסי של קרום PDMS מצופה ECM. ביום שבו הושלמה אינדוקציה של IM, התאים נזרעו לתעלת השתן של השבב המיקרופלואידי באמצעות מדיום בתוספת BMP7, Activin A, CHIR99021, VEGF165, וכל החומצה הטרנס-רטינואית כדי לגרום להתמיינות פודוציטים בתוך השבב. למחרת, מאגרי המדיה מולאו במדיום אינדוקציה של פודוציטים ובמדיום תחזוקה אנדותליאלי, ומתח מכני של 10% ב-0.4 הרץ וזרימת נוזלים (60 μL/h) הוחלו על השבבים.
השבבים המיקרופלואידיים התאיים גודלו בתרבית במשך 5 ימים נוספים באמצעות מדיום אינדוקציה פודוציטים (בתעלת השתן) ומדיום תחזוקה אנדותליאלי (בתעלת כלי הדם). שבבי גלומרולוס הכליות שהתקבלו גודלו בתרבית במשך עד 7 ימים נוספים באמצעי תחזוקה הן עבור תאי הפודוקיטים והן עבור תאי האנדותל. הפודוקיטים המובחנים ביטאו באופן חיובי חלבונים ספציפיים לשושלת, כולל פודוצין ונפרין 13,14, בעוד ש- viECs ביטאו באופן חיובי את חלבוני זיהוי השושלת PECAM-1 ו- VE-Cadherin, כולם מולקולות חיוניות לשמירה על שלמות מחסום הסינון הגלומרולרי 15,16 . נמצא כי הפודוקיטים וה-viECs מפרישים את חלבון קרום המרתף הגלומרולרי הנפוץ ביותר, קולגן IV, החשוב גם להבשלת רקמות ולתפקודן.
המערכת התלת-מרכיבית של מחסום הסינון - אנדותל, קרום מרתף ואפיתל - בשבבי הגלומרולוס נמצאה כמסננת מולקולות באופן סלקטיבי ומגיבה לטיפול תרופתי כימותרפי ונפרוטוקסי. תוצאות הטיפול התרופתי הצביעו על כך שניתן להשתמש בשבב הגלומרולוס למחקרי נפרוטוקסיות ולמודלים של מחלות. פרוטוקול זה מספק את ההנחיה הכללית להנדסת שבב גלומרולוס כליות מיקרופלואידי פונקציונלי מנגזרות תאי iPS איזוגניים. ניתוחים במורד הזרם של השבב המהונדס יכולים להתבצע לפי רצונו של החוקר. למידע נוסף על השימוש בשבב הגלומרולוס למודל של פגיעה גלומרולרית הנגרמת על ידי תרופות, עיין בפרסומים קודמים 2,12.
1. הכן פתרונות מטריצת ממברנות מרתף ומצעים מצופים
2. תרבית תאי iPS אנושית
הערה: קו DU11 המשמש בפרוטוקול זה נבדק ונמצא נקי מהפרעות מיקופלסמה וקריוטיפ.
3. ימים 0-16: התמיינות של iPSCs אנושיים לתאי מזודרם ביניים
4. ימים 0-15: התמיינות והרחבה של תאי גזע פלוריפוטנטיים אנושיים לתאי אנדותל וסקולריים
5. יום 14: הכנת מכשירי שבבי איברים מיקרופלואידיים לתרבית תאים
6. זריעה של viECs ותאי מזודרם ביניים לתוך התקנים microfluidic
7. ימים 17-21 ואילך: אינדוקציה פודוציטים ותחזוקת שבבים
8. בדיקה תפקודית והדמיית אימונופלואורסצנציה
הערה: ראה קובץ משלים 1 לקבלת פרטים על ניתוח ציטומטריה של זרימה, ELISA עבור שפכי שבב ובידוד mRNA.
כאן אנו מראים כי מודל תלת-ממדי פונקציונלי במבחנה של הגלומרולוס יכול לעבור כלי דם ואפיתל ממקור איזוגני של תאי iPS אנושיים. באופן ספציפי, פרוטוקול זה מספק הוראות כיצד ליישם את טכנולוגיית תאי ה- iPS האנושיים, במיוחד את יכולתם להתמיין לסוגי תאים מיוחדים, כדי ליצור אפיתל גלומרולרי בכליות (פוד?...
בדו"ח זה, אנו מתארים פרוטוקול לגזירת אנדותל וסקולרי ואפיתל גלומרולרי (פודוציטים) מקו תאי iPS אנושי איזוגני ואת השימוש בתאים אלה כדי להנדס מערכת תלת-ממדית של איבר על שבב המחקה את המבנה, ממשק הרקמה-רקמה ותפקוד הסינון המולקולרי של גלומרולוס הכליה. שבב גלומרולוס זה מצויד באנדותל ובאפיתל גלומרול...
S.M. הוא ממציא על פטנט הקשור להתמיינות פודוציטים מתאי iPS אנושיים. למחבר השני אין מה לחשוף.
עבודה זו נתמכה על ידי בית הספר להנדסה ע"ש פראט באוניברסיטת דיוק, המחלקה לנפרולוגיה במחלקה לרפואה של דיוק, מלגת וייטהד במחקר ביו-רפואי ופרס מחקר ג'ננטק עבור ס. מוסא. י. רוי זכה במלגת קרן אוניברסיטת דיוק-אלפרד פ. סלואן ובמלגת ויליאם מ. "מונטי" רייכרט מהמחלקה להנדסה ביו-רפואית באוניברסיטת דיוק. קו תאי ה-iPS של DU11 (שיבוט #11) של אוניברסיטת דיוק נוצר במתקן הליבה של Duke iPSC וסופק לנו על ידי מעבדת בורסאק באוניברסיטת דיוק. המחברים מודים לנ 'אבוטאלב, ג'יי הולמס, ר 'בהאטצ'אריה וי' ג'ואו על סיוע טכני ודיונים מועילים. המחברים רוצים גם להודות לחברי מעבדת מוסח על הערות מועילות על כתב היד. המחברים מודים למעבדת סגורה על המתנה של ציטומטר זרימה Acuri C6.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Antibodies | |||
Alexa Fluor 488- and Alexa Fluor 594-conjugated secondary antibodies | Thermo/Life Technologies | A32744; A32754; A-11076; A32790; A21203; A11015 | |
Collagen IV | Thermo/Life Technologies | 14-9871-82 | |
Nephrin | Progen | GP-N2 | |
PECAM-1 | R&D Systems | AF806 | |
Podocin | Abcam | ab50339 | |
VE-Cadherin | Santa Cruz | sc-9989 | |
Basement membrane matrices | |||
Corning Fibronectin, Human | Corning | 356008 | Basement membrane (3) |
iMatrix-511 Laminin-E8 (LM-E8) fragment | Iwai North America | N8922012 | Basement membrane matrix (2) |
Matrigel hESC-qualified matrix, 5-mL vial | BD Biosciences | 354277 | Basement membrane matrix (1); may show lot-to-lot variation |
Cells | |||
DU11 human iPS cells | The DU11 (Duke University clone #11) iPS cell line was generated at the Duke iPSC Core Facility and provided to us by the Bursac Lab at Duke University. The line has been tested and found to be free of mycoplasma (last test in November 2021) and karyotype abnormalities (July 2019) | ||
Culture medium growth factors and media supplements | |||
0.5M EDTA, pH 8.0 | Invitrogen | 15575020 | |
2-Mercaptoethanol | Thermo/Life Technologies | 21985023 | |
Albumin from Bovine serum, Texas Red conjugate | Thermo/Life Technologies | A23017 | |
All-trans retinoic acid (500 mg) | Stem Cell Technologies | 72262 | |
B27 serum-free supplement | Thermo/Life Technologies | 17504044 | |
B-27 supplement (50x) without Vitamin A | Thermo/Life Technologies | 12587010 | |
Bovine serum albumin | Sigma-Aldrich | A9418 | |
CHIR99021 | Stemgent | 04-0004 | May show lot-to-lot variation |
Complete medium kit with CultureBoost-R | Cell Systems | 4Z0-500-R | Podocyte maintenance media |
DMEM/F12 | Thermo/Life Technologies | 12634028 | |
DMEM/F12 with GlutaMAX supplement | Thermo/Life Technologies | 10565042 | DMEM/F12 with glutamine |
Forskolin (Adenylyl cyclase activator) | Abcam | ab120058 | |
GlutaMAX supplement | Thermo/Life Technologies | 35050061 | glutamine supplement |
Heat-inactivated FBS | Thermo/Life Technologies | 10082147 | |
Heparin solution | Stem Cell Technologies | 7980 | |
Human Activin A | Thermo/Life Technologies | PHC9544 | |
Human BMP4 | Preprotech | 120-05ET | |
Human BMP7 | Thermo/Life Technologies | PHC9544 | |
Human VEGF | Thermo/Life Technologies | PHC9394 | |
Inulin-FITC | Sigma-Aldrich | F3272 | |
mTeSR1 medium | Stem Cell Technologies | 05850 | Human iPS cell culture media (CCM). Add 5x supplement according to the manufacturer. Human iPS CCM can be stored for up to 6 months at -20 °C. |
N-2 Supplement (100x) | Thermo/Life Technologies | 17502048 | |
Neurobasal media | Thermo/Life Technologies | 21103049 | Lateral mesoderm basal media |
PBS (Phosphate-buffered saline) | Thermo/Life Technologies | 14190-250 | |
Penicillin-streptomycin, liquid (100x) | Thermo/Life Technologies | 15140-163 | |
ROCK inhibitor (Y27632) | Tocris | 1254 | |
StemPro-34 SFM | Thermo/Life Technologies | 10639011 | Endothelial cell culture medium (CCM). Add supplement according to manufacturer. Endothelial CCM can be stored for up to two weeks at 4 °C or -20 °C for up to 6 months. |
TGF-Beta inhibitor (SB431542) | Stem Cell Technologies | 72234 | |
Enzymes and other reagents | |||
Accutase | Thermo/Life Technologies | A1110501 | Cell detachment buffer |
Dimethyl Suloxide (DMSO) | Sigma-Aldrich | D2438 | |
Ethanol solution, 70% (vol/vol), biotechnology grade | VWR | 97065-058 | |
Paraformaldehyde (PFA) | Thermo/Life Technologies | 28906 | |
Sterile distilled water | Thermo/Life Technologies | 15230162 | |
Triton X-100 | VWR | 97062-208 | |
Equipment | |||
Trypsin EDTA, 0.05% | Thermo/Life Technologies | 25300-120 | |
(Orb) Hub module | Emulate | ORB-HM1 | |
100mm x 15 mm round petri dish | Fisherbrand | FB087579B | |
120 x 120 mm square cell culture dish | VWR | 688161 | |
Accuri C6 | BD Biosciences | ||
Aspirating pipettes, individually wrapped | Corning | 29442-462 | |
Aspirating Unit | SP Bel-Art | F19917-0150 | |
Avanti J-15R Centrifuge | Beckman Coulter | B99516 | |
Conical centrifuge tube, 15 mL | Corning | 352097 | |
Conical centrifuge tube, 50 mL | Corning | 352098 | |
EVOS M7000 | Thermo/Life Technologies | AMF7000 | Fluorescent microscope to take images of fixed and stained cells. |
Hemocytometer | VWR | 100503-092 | |
Heracell VIOS 160i CO2 incubator | Thermo/Life Technologies | 51030403 | |
Inverted Zeiss Axio Observer equipeed with AxioCam 503 camera | Carl Zeiss Micrscopy | 491916-0001-000(microscope) ; 426558-0000-000(camera) | |
Kimberly-Clark nitrile gloves | VWR | 40101-346 | |
Kimwipes, large | VWR | 21905-049 | |
Leoca SP8 Upright Confocal Microscope | |||
Media reservoir (POD Portable Module) | Emulate | POD-1 | |
Microplate shaker | VWR | 12620-926 | |
Organ-chip | Emulate | S-1 Chip | |
Organ-chip holder | Emulate | AK-CCR | |
P10 precision barrier pipette tips | Denville Scientific | P1096-FR | |
P100 barrier pipette tips | Denville Scientific | P1125 | |
P1000 barrier pipette tips | Denville Scientific | P1121 | |
P20 barrier pipette tips | Denville Scientific | P1122 | |
P200 barrier pipette tips | Denville Scientific | P1122 | |
Plasma Asher | Quorum tech | K1050X RF | This Plasma Etcher/Asher/Cleaner was used as a part of Duke University's Shared Materials Instrumentation Facility (SMiF). |
Round bottom polystyrene test tube with cell strainer snap cap | Corning | 352235 | |
Serological pipette, 10 mL, indivdually wrapped | Corning | 356551 | |
Serological pipette, 25 mL, indivdually wrapped | Corning | 356525 | |
Serological pipette, 5 mL, indivdually wrapped | Corning | 356543 | |
Steriflip, 0.22 µm, PES | EMD Millipore | SCGP00525 | |
Sterile Microcentrifuge tubes | Thomas Scientific | 1138W14 | |
T75cm2 cell culture flask with vent cap | Corning | 430641U | |
Tissue culture-treated 12 well plates | Corning | 353043 | |
Tissue culture-treated 6 well plates | Corning | 353046 | |
Vacuum modulator and perstaltic pump (Zoe Culture Module) | Emulate | ZOE-CM1 | Organ Chip Bioreactor |
VE-Cadherin CD144 anti-human antibody - APC conjugated | Miltenyi Biotec | 130-126-010 | |
Wide-beveled cell lifter | Corning | 3008 | |
MACS | |||
CD144 MicroBeads, human | Miltenyi Biotec | 130-097-857 | |
CD31 MicroBead Kit, human | Miltenyi Biotec | 130-091-935 | |
LS columns | Miltenyi Biotec | 130-042-401 |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved