Method Article
הפרוטוקול הנוכחי מתאר התגבשות של גבישי קרח מיקרוסקופיים והידרטים של קלתראט בהתקנים מיקרופלואידיים, מה שמאפשר חילופי נוזלים סביב הגבישים שנוצרו. זה מספק אפשרויות שאין שני להן לבחון את תהליך ההתגבשות ומנגנוני הקשירה של המעכבים.
תיאור מכניסטי מדויק של התגבשות מים הוא מאתגר ודורש כמה אלמנטים מרכזיים: בקרת טמפרטורה מעולה המאפשרת היווצרות של גבישים מיקרוסקופיים בודדים ומערכת מיקרוסקופיה מתאימה המוצמדת לשלב הקר. השיטה המתוארת כאן מוסיפה תכונה חשובה נוספת הכוללת החלפת תמיסות סביב קרח וגבישי הידרט קלתראט. המערכת המתוארת כוללת שילוב של מכשירים ייחודיים שפותחו בבית, כולל מיקרופלואידיקה, שלבים קרים ברזולוציה גבוהה ומיקרוסקופיה פלואורסצנטית. השלב הקר תוכנן עבור התקנים מיקרופלואידיים ומאפשר היווצרות גבישי קרח/הידרט בגודל מיקרון בתוך תעלות מיקרופלואידיות והחלפת תמיסות סביבם. רזולוציית הטמפרטורה והיציבות של השלב הקר היא מיליקלווין אחד, שהוא חיוני לשליטה על הצמיחה של גבישים קטנים אלה. מערכת מגוונת זו משמשת לחקר התהליכים השונים של התגבשות קרח והידרטים והמנגנון שבאמצעותו מעוכבת צמיחתם של גבישים אלה. הפרוטוקול מתאר כיצד להכין התקנים מיקרופלואידיים, כיצד לגדל ולשלוט בגבישים מיקרוסקופיים בתעלות המיקרופלואידיות, וכיצד ניצול זרימת הנוזלים סביב גבישי קרח/הידרט מעניק תובנות חדשות על התגבשות המים.
חלבונים נוגדי הקפאה (AFPs) וגליקופרוטאינים נוגדי הקפאה (AFGPs) מגנים על אורגניזמים שונים המותאמים לקור מפני נזקי כפור1. AFPs ו-AFGPs (בהכללה כ-AF(G)Ps) מעכבים את צמיחתם של גבישי קרח על ידי קשירה בלתי הפיכה לפני השטח שלהם ועיכוב צמיחה נוספת עקב אפקט גיבס-תומסון 2,3,4,5. הפער שנוצר בין טמפרטורת ההיתוך, שכמעט ולא השתנתה, לבין טמפרטורת ההקפאה שזה עתה מדוכאת נקרא היסטרזיס תרמי (TH) ומייצג פרמטר מדיד המתאים לפעילות AFP6. לשימוש ב-AFPs לעיכוב צמיחת קרח יש יישומים מרחיקי לכת ומגוונים, המציעים פוטנציאל השבחה בתחומים שונים, כולל שימור בהקפאה, איכות מזון קפוא והגנה על גידולים שנחשפו לקור.
התגבשות המים בטמפרטורות נמוכות ובלחצים גבוהים בנוכחות מולקולות אורגניות קטנות גורמת להיווצרות הידרטים של קלתראט (או הידרטים של גז), כאשר ההידרט הנפוץ ביותר הוא מתאן הידרט7. התגבשות של הידרטים של מתאן בקווי זרימה של גז/נפט עלולה לגרום לתקעים, שעלולים לגרום לפיצוצים עקב הצתת גז 8,9,10. המאמצים הנוכחיים למניעת התגבשות הידרטים בקווי זרימה כוללים שימוש במעכבים תרמודינמיים (אלכוהולים וגליקולים) וקינטיים (בעיקר פולימרים)11,12,13,14. כמו כן, נמצא כי AFPs נקשרים לגבישי הידרט קלתראט ומעכבים את צמיחתם, מה שמצביע על שימוש פוטנציאלי ב-AFPs כדי לעכב את היווצרותם של תקעים, ובכך לספק פתרון ירוק יותר15.
מיקרופלואידיקה היא שיטה נפוצה המשמשת לחקר תכונותיהם של נוזלים בנפחי דגימה זעירים (עד fL) הזורמים דרך רשת של מיקרו-ערוצים16. המיקרו-ערוצים עוקבים אחר תבנית שנוצרה על פרוסת סיליקון (התבנית) באמצעות ליתוגרפיה17. חומר נפוץ לייצור התקנים מיקרופלואידיים הוא פולידימתילסילוקסן (PDMS), שהוא זול ופשוט יחסית לעבוד איתו במעבדות מחקר. עיצוב התכונות (ערוצים) מורכב ביחס למטרה הספציפית של המכשיר; לפיכך, ניתן להשתמש בו למגוון יישומים, כולל חישת DNA18, אבחון רפואי19 ותהליכי התגבשות 3,20,21.
הפרוטוקול הנוכחי מתאר שיטה מיקרופלואידית ייחודית לגידול גבישי קרח והידרט בגודל מיקרון עם מעכבים שונים, כולל AFPs ו-AFGPs. עבור ניסויים אלה, הידרטים של Tetrahydrofuran (THF) שימשו כדי לחקות את התכונות של הידרטים של גז מתאן22, הדורשים ציוד מיוחד לבקרת לחץ וטמפרטורה23. AF(G)Ps עם התווית הפלואורסצנטית שימשו להדמיה ולניתוח של ספיחת החלבונים אל פני השטח של הגביש, ובשילוב עם הדמיה פלואורסצנטית, הגישה המיקרופלואידית אפשרה קבלת תכונות מפתח של תהליך הקשירה של מולקולות אלה למשטחי גבישים.
1. ייצור מכשירים מיקרופלואידיים
2. הגדרת המכשיר המיקרופלואידי
3. היווצרות גבישים בודדים בתעלות המיקרופלואידיות
4. מדידת פעילות בהיסטרזיס תרמי (TH)
הערה: שלב זה הוא אופציונלי.
5. חילופי פתרונות סביב גבישים בודדים
6. ניסויים עם הידרטים clathrate
החלפת פתרונות עם גבישי קרח
חילופי פתרונות מוצלחים סביב גביש קרח מוצגים באיור 3. חותמת הזמן על כל תמונת מצב מצביעה על כך שהחלפת הפתרונות הייתה מהירה יחסית; עם זאת, החלפה איטית יותר אפשרית. עוצמת הפלואורסצנטיות המגיעה ממולקולות ה-AFGP הנספגות בקרח נצפית בבירור לאחר השלמת ההחלפה (איור 3, מימין). ניתוח כמותי של ריכוז AFP על פני הקרח מנוטר באמצעות כלי ייעודי של אזור עניין (ROI) (איור 4). בניסוי זה4, AFP סוג III (איזופורם QAE) מדולל ב 50 mM Tris-HCl (pH 7.8) ו 100 mM NaCl שימש. התמיסה מוחלפת סביב גביש בצורת דו-פירמידל, ועוצמת הפלואורסצנטיות בתמיסה ועל הקרח מנוטרת. החלקה האדומה המציינת את אות הפלואורסצנציה בתמיסה פוחתת בפקטור של 100 במהלך חילופי התמסיסה, בעוד שהאות המחושב (החלקה הירוקה) על פני הקרח נשאר קבוע. האות המחושב של מולקולות ספיחת הקרח התקבל על ידי הפחתת האות המגיע מהתמיסה (כפול קבוע המתייחס לעובי הערוץ המיקרופלואידי) מהאות המגיע מהקרח4.
החלפת תמיסות עם הידרטים של THF
ניסויים מיקרופלואידיים עם הידרטים של THF בוצעו בדומה לניסויים בקרח. לאחר שגבישי ההידרט הורשו לספוח את מולקולות המעכב מהתמיסה, הוזרק תמיסה נטולת מעכבים לתעלות. איור 5 מציג הידרטים של THF לאחר חילופי תמיסות עם שני סוגים של מעכבים: AFGP1-5 המסומן באיזותיוציאנט פלואורסציני (FITC) (איור 5A) וספרנין O (ראו טבלת חומרים), שהוא צבע פלואורסצנטי26 (איור 5B). זהו ההדגמה הראשונה של קשירת AFGP לפני השטח של הידרט קלתרט.
איור 1: ייצוג סכמטי של התעלות המיקרופלואידיות ששימשו במחקר הנוכחי. שני העיצובים כוללים שני פתחים ושקע אחד. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.
איור 2: הידרטים של THF נוצרו בתעלה המיקרופלואידית לאחר שהטמפרטורה התקררה ל~-2 מעלות צלזיוס. המורפולוגיה של כל הגבישים המוצגים היא טטרהדרון; עם זאת, חלק מהגבישים מכוונים אחרת. סרגל קנה מידה = 20 מיקרומטר. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.
איור 3: ניסוי מייצג המציג חילופי תמיסה סביב גביש קרח יחיד בתעלה מיקרופלואידית. בתחילה, הפתרון הכיל AFGP1-5 המסומן ב- FITC, ו- AFGPs ספיחת קרח לא נצפו. לאחר שהתמיסה הוחלפה בתמיסה נטולת AFGP, החלבונים שנספחו קודם לכן על פני הקרח זוהו בבירור (תמונה מימין). סרגל קנה מידה = 25 מיקרומטר. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.
איור 4: ניתוח כמותי ואיכותי של ריכוז AFP על פני הקרח. (A) גביש קרח בריכוז תמיסת AFP גבוה (לפני חילופי תמיסות). (B) אותו גביש לאחר פתרון AFP הוחלף בתמיסת חיץ נטולת AFP. סרגל קנה מידה = 20 מיקרומטר. (C) ניתוח כמותי של עוצמת הפלואורסצנטיות על פני הקרח (שחור) ובתמיסה (אדום) במהלך חילופי תמיסה. העקומה הירוקה מייצגת את העוצמה המחושבת על פני הקרח. האיור מותאם באישור הפניה4. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.
איור 5: גבישי הידרט THF בודדים בתעלות מיקרופלואידיות לאחר שהתמיסה סביבם (A, AFGP1-5) או (B,Safranine O) הוחלפה. התמונה ב-(B) מועתקת מהפניה26. סרגל קנה מידה = 25 מיקרומטר. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.
הפרוטוקול הנוכחי תוכנן להשתמש בשילוב של זרימה מיקרופלואידית עם גבישים מיקרוסקופיים כדי לחשוף תובנות חדשות על צמיחת גבישים ועיכובם. שלב קר27 מבוקר טמפרטורה ברזולוציה של מיליקלווין מאפשר שליטה בגבישים מיקרוסקופיים בודדים הממוקמים בתוך תעלות מיקרופלואידיות, ובכך מאפשר החלפת תמיסות סביבם. בעוד שייצור התקנים מיקרופלואידיים הוא סטנדרטי ודומה לשיטות עבודה נפוצות17,18, השליטה על הצמיחה וההתכה של גבישים בתוך המכשיר היא ייחודית וחדשנית. המרכיב הקריטי ביותר במערכת זו הוא בקרת הטמפרטורה המעולה, המושגת באמצעות מצננים תרמואלקטריים של Peltier, משוב מתרמיסטור הממוקם קרוב לדגימה, ובקר טמפרטורה ברזולוציה גבוהה השולט בלולאת המשוב.
שלב קריטי נוסף הוא החלפת התמיסה עצמה, שכן הגבישים עשויים להתמוסס או לגדול במהלך תהליך זה; לפיכך, יש להתאים את הטמפרטורה במהלך חילופי התמיסה כדי למנוע צמיחה/התכה. היווצרות גבישים בתעלות מיקרופלואידיות מפריעה לזרימת הנוזלים ומציבה את האתגר העיקרי של מערכת זו; לפיכך, יש לשלוט בצמיחתם של גבישים אלה. כאן, לייזר IR (980 ננומטר) הורכב על המיקרוסקופ ההפוך ושימש להמסה מקומית של גבישי קרח/הידרציה לא רצויים28. אם לא ניתן להשתמש בלייזר כזה, ניתן לחמם את המחברים המתכתיים של המכשיר המיקרופלואידי על ידי מצנן תרמואלקטרי נוסף של Peltier, אשר ימיס את הקרח בכניסה/יציאה של המכשיר.
השיטה המתוארת כאן כוללת מכשירים שפותחו בבית (שלב קר) ודורשת אימון, שכן חלק מהצעדים שהוזכרו לעיל מאתגרים. מכיוון שריכוז התמיסה המקיפה את הגבישים עשוי להשתנות גם כאשר הזרימה אינה מיועדת, שלב כיולפשוט 5 יכול לספק הערכה אמינה של הריכוז בהתבסס על אות הפלואורסצנציה. פתרון אפשרי נוסף לזרימה לא רצויה (במהלך מדידות TH, למשל) הוא שסתומים מיקרופלואידיים, המתוארים בהתייחסות4.
מערכת זו שימשה גם כדי לחקור את התנהגות הגדילה שלקרח D 2 O בנוזל H2O, מחקר שחשף תופעה חדשה של משטחי קרח מיקרוסקופיים מסולסלים27. לפיכך, microfluidics יכול לשמש במחקר של מערכות גבישיות שונות המגיבות היטב לשינויי טמפרטורה.
ללא
הוקרה ניתנת לתורמים של קרן מחקר הנפט של האגודה האמריקאית לכימיה על תמיכה במחקר זה (מענק מספר 60191-UNI5). המחברים מבקשים להודות לפרופ' עידו ברסלבסקי על היותו חלוץ השימוש בהתקנים מיקרופלואידיים לחקר חלבונים נוגדי הקפאה וקרח. המחברים מודים לפרופ' ארתור דה-וריס, פרופ' קונרד מייסטר ופרופ' פיטר דייויס על אספקת דגימות חלבון נוגדות הקפאה.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
0.22-micron filters | Fisher Scientific | ||
90-degree bent blunt needles | 18 Gauge | ||
Antifreeze proteins and antifreeze glycoproteins | A gift | See references 5 and 28 | |
Blunt needles | 18 Gauge and 20 Gauge | ||
Bovine Serum Albumin (BSA) | Sigma-Aldrich | ||
Cold stage | Home made | ||
Cover slips | Globe Scientific | 18 X 18 mm, 0.14 mm thickness | |
Glass syringe | |||
Infrared laser 980 nm | Opto Engine LLC | ||
Inverted microscope, Eclipse Ti - S | Nikon | ||
Invisible tape | Staples | ||
lint-free wipe | Kimwipes | ||
Newport 3040 temperature controller | Newport | ||
NIS-Elements Imaging Software | Nikon | ||
Oil vacuum pump | Harrick Plasma | ||
Plasma cleaner | Harrick Plasma | PDC-32G | |
Polydimethylsiloxane (Dow Corning Sylgard 184 Silicone Elastomer kit) | Dow Corning Syglard | ||
Safranine O | Sigma-Aldrich | S2255-25G | |
Sapphire disc | Ted Pella Inc | 16005-1010 | 25.4 mm diameter, 0.3 mm thickness |
sCMOS Camera, Neo 5.5 | Andor | ||
Tetrahydrofuran (THF) | Sigma-Aldrich | 401757-100ML | |
Tygon Microbore tubing for microfluidic device | Cole-Parmer | 0.020" ID, 0.060"OD, 100 ft/roll. | |
Tygon tubing for water circulation and nitrogen gas | Cole-Parmer | 1/8” ID, 3/16” OD |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved