הפקת סוניקציה של סמנים ביולוגיים שומנים ממ משקעים

Overview

מקור: המעבדה של ג'ף סלקופ - אוניברסיטת מסצ'וסטס אמהרסט

החומר הכולל את החלק "האורגני" החי של כל מערכת אקולוגית (עלים, פטריות, קליפה, רקמה; איור 1) שונה ביסודו מהחומר של החלק "הלא אורגני" הלא חי (סלעים והמינרלים המרכיבים שלהם, חמצן, מים, מתכות). חומר אורגני מכיל פחמן המקושר לסדרה של מולקולות פחמן ומימן אחרות (איור 2),המבדילות אותו מחומר אנאורגני. טווח הערך הרחב של Carbon (-4 עד +4) מאפשר לו ליצור עד ארבעה קשרים קוולנטיים נפרדים עם אטומים שכנים, בדרך כלל C, H, O, N, S ו- P. הוא יכול גם לחלוק עד שלושה קשרים קוולנטיים עם אטום אחד אחר, כגון הקשר המשולש בקבוצה ציאניד רעיל לעתים קרובות, או ניטריל. במהלך 4.6 מיליארד השנים האחרונות, גמישות זו הובילה למגוון מדהים של מבנים כימיים, המשתנים בגודלם, במורכבותם, בקוטביות, בצורה ובתפקודם. התחום המדעי של הגיאוכימיה האורגנית עוסק בזיהוי ואפיון של כל מגוון התרכובות האורגניות הניתנות לגילוי, הנקראות סמנים ביולוגיים, המיוצרים על ידי החיים על פני כדור הארץ, כמו גם אחרים, באמצעות זמן גיאולוגי.

Figure 1
איור 1. חומרים אורגניים, כגון עצים, עלים וטחב, נבדלים מבחינה כימית וחזותית מחומר אנאורגני, כגון מדרכה.

Procedure

1. איסוף החומרים הדרושים

  1. דגימות (עלים, לכלוך, פטריות, קליפה, רקמה), בדרך כלל קפוא, מיובש בהקפאה, כתוש, הומוגני לפני החילוץ, מופק בקבוצות כדי למקסם את היעילות. לחלץ שלוש דגימות.
  2. בהתאם לגודל המדגם, בקבוקונים עם נפחים הנעים בין 4-60 מ"ל עשויים לשמש. לניסוי זה, בקבוקוני זכוכית בורוסיליקט (40 מ"ל) וכובעים בטוחים ממס משמשים. בקבוקונים, פיפטות זכוכית בורוסיליקט, ופחיות שקילה צריך להיות בעירה ב 550 °C (6 שעות לפני להבטיח הסרה של מזהמים אורגניים אפשריים.
  3. דיכלורומטן ומתנול נפוצים ברוב המעבדות הגיאוכימ

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Results

בסוף החילוץ, תמצית שומנים הכוללת (TLE) עבור כל מדגם ניכר. כל מקטורן מכיל את החומר האורגני שניתן לחלץ ממ משקעים, אדמה או רקמת צמח. TLEs אלה עכשיו ניתן לנתח ואת המרכיבים הכימיים שלהם מזוהים וכימות.

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Application and Summary

סוגים שונים של סמנים ביולוגיים להקנות מידע על היבטים ספציפיים של מערכת כדור הארץ. לדוגמה, בחיתוליו, גיאוכימיה אורגנית עסקה בעיקר בהיווצרות, הגירה ושינוי של נפט, ורבים מהכלים הכימיים שהגיאוכימאים האורגניים משתמשים בהם כיום מבוססים על אותן חקירות ראשוניות. באמצעות חקירה של סוג של תרכובות ה...

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Tags
Sonication ExtractionLipid BiomarkersSedimentPaleoclimatologyOrganic ComponentsUltrasonic WavesSolvent OptimizationLike Dissolves Like RuleApolar SolventsPolar SolventsSolvent MixturesSonication SystemUltrasound Waves

Skip to...

0:00

Overview

0:59

Principles of Lipid Extraction by Sonication

2:35

Sample Collection and Glassware Preparation

3:26

Sonication

5:13

Applications

6:55

Summary

Videos from this collection:

article

Now Playing

הפקת סוניקציה של סמנים ביולוגיים שומנים ממ משקעים

Earth Science

7.7K Views

article

קביעת אוריינטציה מרחבית של שכבות סלע עם מצפן ברנטון

Earth Science

25.3K Views

article

שימוש במפות טופוגרפיות ליצירת פרופילים טופוגרפיים

Earth Science

31.9K Views

article

ביצוע חתך רוחב גיאולוגי

Earth Science

46.8K Views

article

תכונות פיזיות של מינרלים I: גבישים ומחשוף

Earth Science

51.5K Views

article

תכונות פיזיות של מינרלים II: ניתוח פולימינרלי

Earth Science

37.9K Views

article

סלע וולקני מצית

Earth Science

39.5K Views

article

סלע פולשני

Earth Science

32.3K Views

article

סקירה כללית של ניתוח סמנים ביולוגיים bGDGT עבור פליאוקלימטולוגיה

Earth Science

5.4K Views

article

סקירה כללית של ניתוח סמנים ביולוגיים אלקונון עבור פליאות'רמומטריה

Earth Science

7.2K Views

article

הפקת סוקסילט של סמנים ביולוגיים שומנים ממ משקעים

Earth Science

18.4K Views

article

הפקת סמנים ביולוגיים משקעים - מיצוי ממס מואץ

Earth Science

7.9K Views

article

המרה של חומצת שומן מתיל אסטרים על ידי Saponification עבור Uk '37 פליאותרמיה

Earth Science

10.1K Views

article

טיהור תמצית שומנים כוללת עם כרומטוגרפיה של עמוד

Earth Science

12.3K Views

article

הסרת תרכובות מסועפות ומחזוריות על ידי תוספת אוריאה עבור Uk '37 פליאות'רמומטריה

Earth Science

6.4K Views

JoVE Logo

Privacy

Terms of Use

Policies

Research

Education

ABOUT JoVE

Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved