כדי למדוד את עוצמת הפלואורסצנטיות של תאי HeLa הנגועים בתוכנת ImageJ, לחץ על קובץ ובחר פתח. בתיבת הדו-שיח, בחרו בקובצי ההדמיה של הניסוי ולחצו על הלחצן 'אשר'. לאחר שחלון אפשרויות הייבוא של התבניות הביולוגיות מופיע, בחר ערוצים מפוצלים ולחץ על אישור.
בניסויי טטרמתילרודמין, אתיל אסטר, פרכלורט או TMRE, YFP הוא הערוץ הראשון, MitoTracker הוא הערוץ השני ו-TMRE הוא הערוץ השלישי. התאם את הבהירות על-ידי בחירת תמונה, לאחר מכן התאם ולאחר מכן את הבהירות. לאחר מכן, טען את האזור השמור של עניין או החזר השקעה על ידי לחיצה על ניתוח, לאחר מכן כלים, ולאחר מכן מנהל ROI.
במנהל החזר ההשקעה, לחץ על עוד, ולאחר מכן פתח מהרשימה ובחר את החזר ההשקעה שנשמר. לאחר מכן מדוד את עוצמת הפלואורסצנט של חמישה אזורים אקראיים בתא בודד על-ידי בחירת החזר ההשקעה שנשמר ממנהל החזר ההשקעה והעברת החזר ההשקעה למיקום אקראי בתוך תא. כדי למדוד את עוצמת הפלואורסצנטיות, הקש M במקלדת וחזור על פעולה זו עם ארבעה אזורים נוספים שאינם חופפים.
כאשר מופיעה תיבת דו-שיח עם האזור והערכים האפורים הממוצעים, העתק והדבק את הערכים בגיליון אלקטרוני לצורך ניתוח. התוצאות עבור עוצמות הפלואורסצנטיות TMRE ו- MitoSOX הראו כי הטיפול שלהם בסוכן הבלתי צימוד הידוע CCCP הפחית את עוצמת הפלואורסצנטיות של TMRE בהשוואה לתנאי הביקורת. בנוסף, טיפול CCCP של 20 מיקרומולרים גרם לייצור סופראוקסיד והגביר את עוצמת הפלואורסצנטיות של MitoSOX.
בתנאי עקה קלים או חמישה מיקרו-מולאריים של CCCP, הביטוי של פרקין פראי מסוג פרקין ו-Parkin T240R הביא לעוצמת TMRE גבוהה יותר בהשוואה לווקטור הבקרה YFP הריק. עוצמת המיטו-SOX הייתה נמוכה יותר בתאים המבטאים פרקין מסוג פרא ופרקין T240R בהשוואה לתאים המבטאים את וקטור הבקרה YFP, דבר המצביע על כך שביטוי חניה מסייע בשמירה על בריאות הרשת המיטוכונדריאלית על ידי שימור פוטנציאלים גבוהים יותר של קרום המיטוכונדריה ורמות סופראוקסיד נמוכות.
