מיצוי נתונים וניתוח פלואורסצנטיות של כלורופיל בשתילי Arabidopsis

Please note that all translations are AI generated. Click here for the English version.

67 Views

•

03:09 min

•

January 12th, 2024

DOI :

10.3791/201061-v

January 12th, 2024

•

Veronika Balakhonova*¹^,², Nadiia Pushkarova*¹^,³, Jan Skalak¹^,², Tereza Dobisova¹^,²^,⁴, Zuzana Benedikty⁵, Klara Panzarova⁵, Martin Trtilek⁵, Jan Hejátko¹^,²

¹CEITEC - Central European Institute of Technology, Masaryk University, ²National Centre for Biomolecular Research, Faculty of Science, Masaryk University, ³Institute of Food Biotechnology and Genomics, National Academy of Sciences of Ukraine, ⁴Labdeers s.r.o, ⁵Photon Systems Instruments, Prumyslova

* These authors contributed equally

Transcript

לאחר ביצוע כל הסיבובים ולכידת תמונות ניאון של שתילי Arabidopsis, לפתוח את הנתונים הניסיוניים בתוכנת אנלייזר. ליצירת מסיכת מגש, לחץ על האפשרות צור סוג מגש חדש. לאחר מכן בחרו מספר תמונה עגול ולחצו על 'טען תמונה' בחלק העליון של המסך.

לצד כניסה למצב צורה חדש, לחץ על כל אחד מקבוצת הלחצנים המייצגים כלי ציור של צורות שונות. ציירו את אזורי העניין בתמונת הלוח. בחר את הגנוטיפים השונים על הצלחת וספק שמות מתאימים עבורם.

לחץ על Escape כדי לצאת ממצב הצורה. לאחר מכן לחץ על סוג מגש האחסון כדי לשמור את מסיכת המגש שנוצרה. עכשיו עבור אל שינוי לפי סוג מגש אפשרות ובחר את המסיכה שנוצרה.

ליצירת מסיכת צמח בדיוק גבוה, השתמשו בתמונה שהתקבלה לאחר 180 דקות מדידה כדי להגדיר את ערך הסף המינימלי לעוצמת אות פלואורסצנטי, הסירו את הסימון מהסף האוטומטי. הגדר סף ידני על אפס ולחץ על תצוגה מקדימה. לאחר מכן, בחר סיבוב 91.

לחצו על 'רענן תצוגה מקדימה' ובדקו אם מסיכת המערך מכסה את כל הגנוטיפים בתמונת הלוחות. התאימו את רקע התמונה והשתמשו באפשרויות הצבע כדי להדגיש את מסיכת המגש על תמונת הלוח. לחץ על הפעלה, סמן רק בסיבוב 91 והתחל ניתוח.

לאחר שתפריט הסיום מופיע על המסך, בחר את הסיבוב המבוצע ולחץ על מתג מנתח כדי לנתח נתונים לייצוא נתונים עבור נקודת זמן ספציפית זו. לאחר מכן לחץ על סמל חלק הייצוא הפתוח כדי לחלץ את הקבצים מהארכיון המיוצא. במצב הגדרת הניתוח המקומי, לחצו על 'צור סוג מגש חדש' כדי להיכנס לתפריט 'בונה מסיכות'.

לאחר מכן לחצו על 'טען תמונה' ובחרו סיבוב ארבע. בפינה השמאלית העליונה של המסך, לחץ על טען מקובץ וטען את קובץ XSEL. תמונת הצלחת מופיעה עם החלת מסיכת המגש.

ספק שם למסיכת הצמח ולחץ על סוג מגש החנות. החילו את מסיכת הצמח באמצעות בחירת שמה באפשרות 'שינוי לפי סוג מגש'. לאחר מכן בטל את הסימון של הסף האוטומטי כדי לאפשר מניפולציה ידנית בסף.

בתפריט התצוגה המקדימה, שנו את ערך הסף מנמוך לגבוה עד שמסיכת הצמחים שנוצרה תתאים באופן מושלם לאזור העניין בכל אחד מהגנוטיפים. לאחר מכן בחרו את הסבב האחרון כדי לבדוק אם המסכה מתאימה לכל סבבי המדידות. כדי לבצע את הניתוח עבור כל סבבי המדידה, לחץ על הפעל ולאחר מכן התחל ניתוח.

בהשוואה לתנאי הבקרה בנוכחות 6-benzylaminopurine, הבדלים בולטים נצפו במהלך השלב המעריכי של סינתזת כלורופיל בשתילי Arabidopsis מסוג בר.

Explore More Videos

Chlorophyll Fluorescence

Arabidopsis Seedlings