כדי להתחיל, לחנך את המטופלים על התכונות המגנטיות של ההליך ואת הסיכונים עם הגעתם. להנחות את המטופלים להסיר את כל הפריטים המתכתיים האישיים. לאחר מכן לכוון את המטופל במצב שכיבה על מערכת 0.55T 1.5T או 3T.
ספקו הגנה על השמיעה, פעמון חירום, ריפוד ושמיכה לבטיחות ונוחות. לאחר מכן מקם סליל גמיש רב ערוצי ממש מתחת לסנטר המטופל כדי להבטיח רגישות סליל אופטימלית בכל אזורי הריאות, ולאבטח את מיקום הסלילים מבלי להפריע לנשימתו של המטופל. לאחר מכן יש להנחות את המטופל לעצום את עיניו ולסמן את מרכז הריאה בלייזר MR.
לאחר יישור מרכז הריאה באיזוסנטר, סרוק את הלוקליזרים הראשוניים כדי לקבוע כיוון כללי ובצע סריקה מורפולוגית רוחבית כדי לזהות את התפצלות קנה הנשימה. לאחר מכן עגנו את פרוסת העטרה הראשונה בהתפצלות קנה הנשימה כנקודת ציון כדי להבטיח שחזור. בהתאם לפרוטוקול הסריקה, לכדו שלוש פרוסות במרווח של 100% מהפרוסה למרחק הפרוסה, או רכשו פרוסות מרובות המכסות את כל הריאה במרחק של 20% או 33%.
לאחר מכן, אחזר את השלב הנרכש נפתרו תמונות MRI ריאה תפקודית. בחרו בנתיב הראשי ולחצו על תהליך להפרדת תמונות DICOM בהתבסס על מיקום הפרוסה ועל הרצף הזמני בעזרת נתוני כותרת, בחרו בחטא של ANTsPy עם מטריקת מתאם צולב, או בהרחבת פולינום פורסברג עם רגולציה אלסטית ונוזלית כאלגוריתם הרישום. מפות הדמיית הריאות התפקודיות של נקבה בריאה בת 30 הראו התפלגות הומוגנית של הערכים הפרנכימליים ואחוזי פגמים נמוכים, ואילו אלה של חולה COPD זכר בן 60 הראו התפלגות הטרוגנית של הערכים הפרנכימליים ואחוזי פגמים גבוהים.