כדי להתחיל במיזוג גנים הקשורים למחלה, מקם את קבצי TXT שנשמרו בעבר מחמישה מסדי נתונים המכילים את שם הצמחים, מזהה המרכיב, מזהה הגן והסקריפט מחלה. R באותה תיקיה. פתח את קוד R.
העתק והדבק את הנתיב שבו מאוחסן קובץ ה- TXT בשורה שבה ממוקם ה- setwd בקוד R. פתח את תוכנת R. הפעל את קוד R שהשתנה ושמור.
הגדר את הגן ותן שם לקובץ Disease.txt. פתח את אתר האינטרנט של דיאגרמת חיתוך קבוצות (Venn). במקטע קלט, העתק והדבק את תוכן הטקסט שכבר נשמר ברשימה.
תן שם לתוכן באמצעות מסד הנתונים המתאים. ולחץ על שלח. לחץ על Save Image As PNG מתחת לתמונה ושמור את תוצאת הטקסט באותה תיקייה.
מקם את alltargets.symbol. קובץ TXT והמחלה. קובץ TXT באותה תיקייה.
פתח את קוד R. העתק והדבק את הנתיב שבו מאוחסן קובץ txt בשורה שבה ממוקם ה- setwd בקוד R. פתח את תוכנת R.
הפעל את קוד R שהשתנה ושמור. הגדר את הגן ותן שם לקובץ Drug_Disease.txt. פתח את אתר האינטרנט של דיאגרמת חיתוך קבוצות (Venn).
במקטע קלט, העתק והדבק alltargets.symbol. txt ומחלות. txt לתוך הרשימה ולתת שם לקבצים.
לחץ על Save Image As PNG מתחת לתמונה, ושמור את תוצאות הטקסט באותה תיקייה. פתח את אתר המחרוזות ולחץ על חלבון מרובה. לחץ על עיון והעלה את DrugDisease.
קובץ txt. ולאחר מכן בחר הומו ספיינס באורגניזמים. לחץ על חיפוש ולאחר מכן על המשך.
כעת, לחץ על הגדרות והגדר את ציון האינטראקציה המינימלי הנדרש לביטחון הגבוה ביותר. באפשרות תצוגת רשת, סמן את הסתר צמתים מנותקים ברשת ולאחר מכן לחץ על עדכן>התאם את הצמתים בדיאגרמת הרשת כך שלא תהיה חפיפה או חסימה. לחץ על יצוא, ואחריו הורד כמפת סיביות ברזולוציה גבוהה כדי לקבל את מפת הרשת של Protein Interworking בפורמט PNG, הורד את קובץ TSV כפלט טקסט טבלאי קצר.
שמור קבצי PNG ו- TSV בתיקיה מאוחדת.
