A subscription to JoVE is required to view this content.

English

RNA-Seq

Overview

בין שיטות שונות להערכת ביטוי גנים, רצף תפוקה גבוהה של RNA, או RNA-seq. הוא אטרקטיבי במיוחד, כפי שניתן לבצע ולנתח מבלי להסתמך על מידע גנומי זמין מראש. במהלך RNA-seq, RNA מבודד מדגימות עניין משמש ליצירת ספריית DNA, אשר לאחר מכן מוגברת ורצף. בסופו של דבר, RNA-seq יכול לקבוע אילו גנים באים לידי ביטוי, את רמות הביטוי שלהם ואת נוכחותם של כל תמלילים שלא היו ידועים קודם לכן.

כאן, JoVE מציג את העקרונות הבסיסיים מאחורי RNA-seq. לאחר מכן אנו דנים בצעדים הניסיוניים והאנליטיים של פרוטוקול RNA-seq כללי. לבסוף, אנו בוחנים כיצד חוקרים משתמשים כיום ב-RNA-seq, למשל, כדי להשוות ביטוי גנים בין דגימות ביולוגיות שונות, או כדי לאפיין אינטראקציות בין חלבון לרנ"א.

Procedure

ריצוף RNA, או RNA-seq, היא טכניקה שיכולה לספק מידע על הרצף והכמות של כל RNA המבוטא, המכונה "שעתוק", באוכלוסיית תאים. שלא כמו שיטות אחרות ליצירת פרופיל ביטוי כגון microarrays, הכוללות בדיקות עבור רצפי RNA ידועים, RNA-seq יכול פרופיל ביטוי גנים של אורגניזמים עם גנומים לא רצפים. בנוסף, RNA-seq יכול למדוד במדויק טווח גדול יותר של רמות ביטוי תעתיק מאשר microarrays, במיוחד ברמות נמוכות מאוד או גבוהות מאוד.

וידאו זה יכסה את העקרונות של RNA-seq, פרוטוקול להכנת ספריית RNA-seq וניתוח הנתונים, וכמה יישומים של טכניקה זו.</

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Tags

We use cookies to enhance your experience on our website.

By continuing to use our website or clicking “Continue”, you are agreeing to accept our cookies.

Learn More