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Il presente protocollo descrive le misure di pH in organoidi gastrici derivati da tessuti umani utilizzando microelettrodi per la caratterizzazione spazio-temporale della fisiologia intraluminale.
L'ottimizzazione e la caratterizzazione dettagliata dei modelli di organoidi gastrointestinali richiedono metodi avanzati per l'analisi dei loro ambienti luminali. Questo articolo presenta un metodo altamente riproducibile per la misurazione precisa del pH all'interno della lumina di organoidi gastrici umani 3D tramite microelettrodi controllati da micromanipolatore. I microelettrodi di pH sono disponibili in commercio e sono costituiti da punte di vetro smussate di 25 μm di diametro. Per le misurazioni, il microelettrodo di pH viene fatto avanzare nel lume di un organoide (>200 μm) sospeso in Matrigel, mentre un elettrodo di riferimento rimane immerso nel terreno circostante nella piastra di coltura.
Utilizzando tali microelettrodi per profilare organoidi derivati dal corpo gastrico umano, dimostriamo che il pH luminale è relativamente coerente all'interno di ciascun pozzetto di coltura a ~7,7 ± 0,037 e che le misurazioni continue possono essere ottenute per un minimo di 15 minuti. In alcuni organoidi più grandi, le misurazioni hanno rivelato un gradiente di pH tra la superficie epiteliale e il lume, suggerendo che le misure di pH negli organoidi possono essere ottenute con un'alta risoluzione spaziale. In uno studio precedente, i microelettrodi sono stati utilizzati con successo per misurare le concentrazioni di ossigeno luminale negli organoidi, dimostrando la versatilità di questo metodo per l'analisi degli organoidi. In sintesi, questo protocollo descrive un importante strumento per la caratterizzazione funzionale dello spazio luminale complesso all'interno di organoidi 3D.
Gli organoidi – strutture multicellulari in miniatura derivate da cellule staminali – hanno rivoluzionato la nostra capacità di studiare la fisiologia umana e stanno iniziando a sostituire i modelli animali, anche in contesti normativi1. Dalla descrizione iniziale degli organoidi intestinali da parte di Sato et al. nel 2009, la tecnologia degli organoidi è diventata immensamente popolare2. Un gran numero di studi ha caratterizzato la composizione cellulare e la funzione dei modelli di organoidi in grande dettaglio 3,4,5,6. Tuttavia, lo spazio luminale di queste strutture multicellulari 3D rimane in gran parte indefinito 7,8. Il lume è la cavità centrale degli organoidi derivati dai tessuti mucosi che è circondata dalle porzioni apicali delle cellule epiteliali polarizzate. Poiché la secrezione e l'assorbimento cellulare avvengono prevalentemente sulla superficie epiteliale apicale, il microambiente luminale degli organoidi è controllato da questi importanti processi fisiologici. I modelli di organoidi attualmente utilizzati dimostrano variazioni nei modelli di segnalazione cellulare, nella staminalità complessiva, nei gradienti di concentrazione dei metaboliti e nelle condizioni ambientali9. La comprensione della fisiologia luminale degli organoidi è quindi necessaria per la modellazione accurata della funzione e della patologia degli organi. Purtroppo, la relativa inaccessibilità del lume ostacola significativamente le analisi funzionali della fisiologia luminale negli organoidi 3D10.
La capacità di esaminare i profili di pH è particolarmente importante nello stomaco, che è noto per avere il gradiente protonico più ripido nel corpo, che va da circa 1-3 nel lume, a quasi neutro nell'epitelio 11,12,13. Rimane una lacuna significativa nella nostra comprensione del mantenimento su microscala del gradiente di pH gastrico e della rilevanza dei modelli organoidi nel ricapitolare questo ambiente dinamico attraverso lo strato di muco gastrico. Gli approcci tradizionali per l'analisi del pH degli organoidi hanno previsto l'uso di coloranti sensibili al pH, che possono essere indicatori fluorescenti o colorimetrici. McCracken et al. hanno utilizzato un'iniezione luminale di SNARF-5F-un indicatore raziometrico di pH in organoidi per analizzare un calo del pH luminale in risposta al trattamento con istamina. Tali coloranti possono essere incorporati nei terreni di coltura, consentendo un monitoraggio non invasivo e in tempo reale del pH. Non solo i coloranti sensibili al pH richiedono complesse fasi di calibrazione che contribuiscono a una scarsa affidabilità e precisione delle misurazioni, ma tali coloranti tendono anche a funzionare all'interno di intervalli di rilevamento specifici che potrebbero non essere rappresentativi dell'intero intervallo di pH all'interno del microambiente di interesse14,15. Potrebbe essere considerato ragionevole, tuttavia, utilizzare coloranti indicatori per esperimenti di conferma. Sono stati sviluppati anche nanosensori ottici che utilizzano approcci di rilevamento del pH basati su optodi fluorescenti; Tuttavia, tali tecniche di rilevamento richiedono l'imaging microscopico e sono anche suscettibili al fotosbiancamento, alla fototossicità e alla distorsione dell'imaging16,17. Inoltre, Brooks et al. hanno piastre multipozzetto stampate in 3D contenenti microelettrodi su cui gli organoidi possono essere placcati18. Questo approccio, tuttavia, non consente misurazioni direttamente all'interno del lume dell'organoide.
Le misure di pH basate su elettrodi possono ottenere una maggiore precisione rispetto ad altri metodi, oltre a fornire un monitoraggio del pH in tempo reale. Inoltre, gli elettrodi di pH montati sui micromanipolatori consentono una risoluzione spaziale superiore delle misure di pH, in quanto la posizione precisa della punta dell'elettrodo può essere controllata con precisione. Ciò consente la massima flessibilità e riproducibilità possibile nelle analisi dei modelli di organoidi. Gli elettrodi utilizzati qui sono microelettrodi di pH miniaturizzati che funzionano in base alla diffusione di protoni attraverso un vetro di pH selettivo che circonda un sottile filo di platino. Il microelettrodo è collegato a un elettrodo di riferimento Ag-AgCl esterno e quindi collegato a un millivoltmetro ad alta impedenza. Il potenziale elettrico tra le due punte degli elettrodi, quando immerse nella stessa soluzione, rifletterà il pH della soluzione19. Tali sistemi di microprofilazione sono stati utilizzati nell'analisi metabolica di biofilm20,21, alghe planctoniche22, campioni di espettorato umano23 e persino in sferoidi di cellule staminali mesenchimali24. Sia il nostro laboratorio che Murphy et al. hanno precedentemente utilizzato microelettrodi O2 controllati da micromanipolatore per valutare le concentrazioni di ossigeno negli spazi luminali degli organoidi. Murphy et al. hanno abbinato questo metodo con la modellazione matematica per rivelare un gradiente di ossigeno all'interno dei loro sferoidi. Il nostro gruppo è stato in grado di trovare livelli ridotti di ossigeno luminale negli organoidi gastrici derivati dai tessuti rispetto alla matrice extracellulare circostante25.
Qui, forniamo un metodo dettagliato per la profilazione manuale del pH luminale con microelettrodi in organoidi sferici del tratto gastrointestinale che consentirà una migliore comprensione fisiologica del loro complesso microambiente luminale. Prevediamo che questa tecnica aggiungerà una nuova dimensione all'esplorazione della fisiologia degli organoidi attraverso misurazioni in tempo reale e ad alta risoluzione dei livelli di pH su microscala. Inoltre, il seguente protocollo potrebbe essere facilmente adattato per l'analisi di O2, N2O, H2, NO, H2S, redox e temperatura in vari tipi di modelli di organoidi. La profilazione fisiologica funge da strumento prezioso per ottimizzare le condizioni di coltura degli organoidi per imitare meglio gli ambienti in vivo , migliorando così la rilevanza e l'utilità dei modelli di organoidi nella ricerca biomedica.
Questo protocollo richiede organoidi 3D di almeno 200 μm di diametro che abbiano un lume distinto e che siano incorporati in una matrice extracellulare artificiale (ECM, ad es. Matrigel). I tessuti gastrici umani per la derivazione di organoidi sono stati ottenuti con l'approvazione dell'Institutional Review Board della Montana State University e il consenso informato di pazienti sottoposti a endoscopia superiore presso Bozeman Health (protocollo # 2023-48-FCR, a D.B.) o come campioni esenti di gastrectomia a stomaco intero o a manica dal National Disease Research Interchange (protocollo #DB062615-EX). Le informazioni sulle linee degli organoidi e sui numeri di passaggio utilizzati per questo studio sono fornite nella Tabella 1 e la composizione del terreno è elencata nella Tabella 2. Fare riferimento ai protocolli precedentemente pubblicati per la generazione e il mantenimento delle linee di organoidi gastrointestinali 6,26,27.
1. Preparazione di organoidi gastrici umani per il profilo del pH
2. Disimballaggio e calibrazione dei microelettrodi
NOTA: Per consentire le misure su microscala, oltre al microelettrodo del sensore di pH viene utilizzato un elettrodo di riferimento separato anziché un design integrato (e quindi più ingombrante). Sia il microelettrodo pH che l'elettrodo di riferimento devono essere conservati bagnati. Non consentire l'esposizione all'aria per più di 10 minuti alla volta. Determinare la dimensione della punta appropriata per l'applicazione. In questo caso, abbiamo utilizzato un microelettrodo di pH potenziometrico con un diametro della punta smussato di 25 μm.
3. Profilo del pH di organoidi gastrici umani
NOTA: Il seguente protocollo è descritto per un utente destrorso. ATTENZIONE: Disabilitare tutte le opzioni di risparmio energetico sul PC poiché le misurazioni in corso verranno interrotte se il PC entra in modalità di sospensione.
4. Profilatura motorizzata (opzionale)
NOTA: Questa opzione richiede un micromanipolatore montato su uno stadio motore meccanico, che è controllato da un software per computer tramite un controller del motore31.
5. Pulizia degli elettrodi
6. Conservazione degli elettrodi
NOTA: Entrambi gli elettrodi devono essere conservati a temperatura ambiente in un luogo a bassa attività, al riparo da danni accidentali.
7. Iniezione di rosso metile (opzionale)
NOTA: Il rosso metile è un colorante indicatore colorimetrico che può essere utilizzato per convalidare le misurazioni dei microelettrodi.
La secrezione di acido è una funzione cruciale dello stomaco umano. Tuttavia, fino a che punto la secrezione acida possa essere modellata negli organoidi è ancora oggetto di dibattito 6,32,33,34. Abbiamo quindi sviluppato il protocollo sopra descritto per misurare con precisione la produzione di acido negli organoidi gastrici. In particolare, abbiamo utilizzato organoidi derivati da cellule s...
L'accesso limitato allo spazio luminale degli organoidi ha fortemente limitato la nostra comprensione delle dinamiche fisiologiche di questo microambiente. Uno strumento affidabile per le analisi funzionali della fisiologia luminale amplierà la nostra capacità di sfruttare gli organoidi come modelli in vitro per la fisiologia, la farmacologia e la ricerca sulle malattie. Gli organoidi sono modelli altamente sintonizzabili e fisiologicamente rilevanti con il potenziale aggiunto di replicare la variabilità gene...
Gli autori non hanno conflitti di interesse da rivelare.
Gli autori desiderano ringraziare la dott.ssa Ellen Lauchnor, il dott. Phil Stewart e Bengisu Kilic per il loro precedente lavoro e l'assistenza con i microsensori O2 ; Andy Sebrell per la formazione in coltura di organoidi e micromanipolazione; Lexi Burcham per l'assistenza nella coltura degli organoidi, nella preparazione dei terreni, nella registrazione dei dati e nell'organizzazione; e la dottoressa Susy Kohout per consigli generali in elettrofisiologia. Vorremmo ringraziare la dottoressa Heidi Smith per la sua assistenza con l'imaging e riconoscere il Centro per l'ingegneria del biofilm Bioimaging Facility presso la Montana State University, che è supportato da finanziamenti dal National Science Foundation MRI Program (2018562), dal MJ Murdock Charitable Trust (202016116), dal Dipartimento della Difesa degli Stati Uniti (77369LSRIP & W911NF1910288) e dal Montana Nanotechnology Facility (un membro NNCI supportato da NSF Grant ECCS-2025391).
Un ringraziamento speciale a tutto il team Unisense che ha reso possibile questo lavoro, in particolare al Dr. Andrew Cerskus, alla Dr. Laura Woods, al Dr. Lars Larsen, al Dr. Tage Dalsgaard, al Dr. Line Daugaard, alla Dr. Karen Maegaard e a Mette Gammelgaard. Il finanziamento per il nostro studio è stato fornito dalle sovvenzioni R01 GM13140801 (DB, RB) e UL1 TR002319 (DBL) del National Institutes of Health e da un premio per l'espansione della ricerca dall'Ufficio per la ricerca e lo sviluppo economico (DB) della Montana State University. La Figura 1A è stata creata con BioRender.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
3 M KCl | Unisense | ||
5 mL Wobble-not Serological Pipet, Individually Wrapped, Paper/Plastic, Bag, Sterile | CellTreat | 229091B | |
10 mL Wobble-not Serological Pipet, Individually Wrapped, Paper/Plastic, Bag, Sterile | CellTreat | 229092B | |
15 mL Centrifuge Tube - Foam Rack, Sterile | CellTreat | 229412 | |
24 Well Tissue Culture Plate, Sterile | CellTreat | 229124 | |
25 mL Wobble-not Serological Pipet, Individually Wrapped, Paper/Plastic, Bag, Sterile | CellTreat | 229093B | |
35 mm Dish | No. 1.5 Coverslip | 20 mm Glass Diameter | Uncoated | MatTek | P35G-1.5-20-C | |
50 mL Centrifuge Tube - Foam Rack, Sterile | CellTreat | 229422 | |
70% Ethanol | BP82031GAL | BP82031GAL | |
70 μm Cell Strainer, Individually Wrapped, Sterile | CellTreat | 229483 | |
1,000 µL Extended Length Low Retention Pipette Tips, Racked, Sterile | CellTreat | 229037 | |
Amphotericin B (Fungizone) Solution | HyClone Laboratories, Inc | SV30078.01 | |
Biosafety Cabinet | Nuaire | NU-425-600 | Class II Type A/B3 |
Bovine Serum Albumin | Fisher Bioreagents | BP1605-100 | |
Cell recovery solution | Corning | 354253 | Cell dissociation solution |
DMEM/F-12 (Advanced DMEM) | Gibco | 12-491-015 | |
Dulbecco's Modification of Eagles Medium (DMEM) | Fisher Scientific | 15017CV | |
Fetal Bovine Serum | HyClone Laboratories, Inc | SH30088 | |
G418 Sulfate | Corning | 30-234-CR | |
Gentamycin sulfate | IBI Scientific | IB02030 | |
HEPES, Free Acid | Cytiva | SH30237.01 | |
HP Pavillion 2-in-1 14" Laptop Intel Core i3 | HP | M03840-001 | |
Hydrochloric acid | Fisher Scientific | A144C-212 | |
Incubator | Fisher Scientific | 11676604 | |
iPhone 12 camera | Apple | ||
L-glutamine | Cytiva | SH3003401 | |
Large Kimberly-Clark Professional Kimtech Science Kimwipes Delicate Task Wipers, 1-Ply | Fisher Scientific | 34133 | |
M 205 FA Stereomicroscope | Leica | ||
Matrigel Membrane Matrix 354234 | Corning | CB-40234 | |
MC-1 UniMotor Controller | Unisense | ||
Methyl red | |||
MM33 Micromanipulator | Marzhauser Wetzlar | 61-42-113-0000 | Right handed |
MS-15 Motorized Stage | Unisense | ||
Nanoject-II | Drummond | 3-000-204 | nanoliter autoinjector |
Penicillin/Streptomycin (10,000 U/mL) | Gibco | 15-140-148 | |
pH Microelectrodes | Unisense | 50-109158, 25-203452, 25-205272, 25-111626, 25-109160 | SensorTrace software is not compatible with Apple computers |
Reference Electrode | Unisense | REF-RM-001652 | SensorTrace software is not compatible with Apple computers |
SB 431542 | Tocris Bioscience | 16-141-0 | |
Smartphone Camera Adapter | Gosky | ||
Specifications Laboratory Stand LS | Unisense | LS-009238 | |
Trypsin-EDTA 0.025%, phenol red | Gibco | 25-200-056 | |
UniAmp | Unisense | 11632 | |
United Biosystems Inc MINI CELL SCRAPERS 200/PK | Fisher | MCS-200 | |
Y-27632 dihydrochloride | Tocris Bioscience | 12-541-0 | |
µSensor Calibration Kit | Unisense/ Mettler Toledo | 51-305-070, 51-302-069 | pH 4.01 and 9.21, 20 mL packets |
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