ここでは、ヒトまたはマウスの筋肉から採取した新鮮な透過性骨格筋線維におけるミトコンドリアの酸化的リン酸化を測定するための包括的な方法について説明します。この方法により、ミトコンドリア呼吸のリアルタイム定量化と、既存のミトコンドリアネットワークと膜の完全性を維持しながら、燃料の好みと代謝の柔軟性の評価が可能になります。
細胞エネルギー生産の基礎となるミトコンドリア機能は、代謝の恒常性を維持するために重要です。骨格筋におけるその機能不全は、一般的な代謝障害(例:.、糖尿病および肥満)、筋ジストロフィー、およびサルコペニア。ミトコンドリアの含有量と形態を評価する手法は数多くありますが、ミトコンドリアの機能を評価するための顕著な方法は、呼吸測定によるミトコンドリアの酸化的リン酸化(OXPHOS)の測定です。ミトコンドリアOXPHOSの定量化により、ミトコンドリアの酸化エネルギー生産と細胞生体エネルギーの効率に関する洞察が得られます。高分解能呼吸計は、ミトコンドリアの酸素消費率のリアルタイムな変化を測定することにより、透過性筋線維中のミトコンドリアOXPHOSの高感度で堅牢な測定を提供します。単離されたミトコンドリアとは対照的に、透過処理された筋線維を使用すると、ミトコンドリアネットワークが維持され、ミトコンドリア膜の完全性が維持され、最終的にはより生理学的に関連性のある測定が可能になります。このシステムは、燃料の好みと代謝の柔軟性(筋肉エネルギー代謝のダイナミックな側面)の測定も可能にします。ここでは、高解像度の呼吸計を使用したヒトおよびマウスの骨格筋線維のミトコンドリアOXPHOS測定の包括的なガイドを提供します。骨格筋群は、ミトコンドリアの燃料の好みや生体エネルギーが異なるさまざまな種類の繊維で構成されています。高分解能呼吸計を使用して、好気性解糖基質と脂肪酸基質の両方を評価し、食物繊維の種類に依存する方法で燃料の好みと代謝の柔軟性を評価する方法について説明します。このプロトコルは汎用性が高く、ヒトとげっ歯類の両方の筋線維に適用できます。目標は、ミトコンドリア機能評価の再現性と精度を向上させることであり、これにより、筋肉の健康に重要な細胞小器官の理解が向上します。
ミトコンドリアは細胞エネルギー生産の基盤であり、細胞および生物の恒常性を最適に維持するために不可欠です。これらの二重膜オルガネラは、主に酸化的リン酸化に関与しています。このプロセスにより、糖類や脂肪酸などの栄養素が、細胞のエネルギー通貨であるアデノシン三リン酸(ATP)に効率的に変換されます。ミトコンドリアは、エネルギー代謝における役割だけでなく、アポトーシス、カルシウム恒常性、活性酸素種(ROS)1,2など、さまざまな細胞プロセスの主要な調節因子でもあります。ミトコンドリアの機能は、細胞や生物の恒常性を維持する上で極めて重要な役割を担っているため、ミトコンドリアの機能障害は、しばしば組織や生物の健康に悪影響を及ぼします。骨格筋では、ミトコンドリアの機能障害は、代謝障害(肥満、糖尿病、心血管疾患など)、サルコペニア、筋ジストロフィーなど、多くの病状と関連しています3,4,5,6,7,8。
ミトコンドリアの機能障害は、主にミトコンドリアの内容、数、形態の変化、および代謝の混乱として現れることがあります。したがって、ミトコンドリアの機能障害を包括的に理解するには、統合的かつ全体的なアプローチが必要です。初期の特性評価研究には、ミトコンドリア含有量の読み出しとしての呼吸鎖タンパク質複合体の発現レベルの調査、ミトコンドリア生合成の尺度としてのミトコンドリアDNAと生合成マーカーの定量化、およびミトコンドリアの形態を評価するための高度な電子顕微鏡イメージングが含まれます9,10。ミトコンドリア機能の追加評価には、細胞のROSおよびATP産生、およびミトコンドリア膜電位の評価が含まれます9。
ミトコンドリアは細胞のエネルギー生産と恒常性維持に不可欠であるため、ミトコンドリアの機能を評価するための特徴は、ミトコンドリアの酸化的リン酸化(OXPHOS)を測定することです。透過性筋線維の高解像度呼吸測定は、ミトコンドリアの酸素消費率のリアルタイムな変化の測定を可能にし、ミトコンドリアのOXPHOS呼吸鎖活動の動的変化を読み取ることができる9,11,12。選択的な化学調節剤と阻害剤の適用により、異なる呼吸器複合体の活性を直接かつ連続的に測定することができます。単離されたミトコンドリアは呼吸器法で使用されることもありますが、新鮮で透過処理された筋線維を使用すると、内因性のミトコンドリアネットワークと膜の完全性が維持されるため、より生理学的に関連性のある測定が可能になります。さらに、筋繊維の種類が異なれば、基質の好みや呼吸速度も異なるため、このシステムでは、食物繊維の種類13に基づいて燃料の好みと代謝の柔軟性の変化を測定できます。
ここでは、高分解能呼吸計システムでヒトまたはマウスの骨格筋線維を使用したミトコンドリアOXPHOS測定の包括的なプロトコルについて説明します。ピルビン酸またはパルミトイルカルニチンを基質として使用して、酸化繊維または解糖繊維のミトコンドリア酸素呼吸を定量する方法が含まれます。このプロトコルは、他の燃料基質を使用して、基質の利用と燃料嗜好の欠陥に関連する特定の代謝問題に対処することを可能にします。
すべてのマウス手順は、ワシントン大学の動物管理および使用委員会によって承認されました。これらの実験には、性別、年齢、体重を問わずマウスを使用することができ、対処しようとする実験問題の性質によって異なります。ここで使用するマウスは成体(12-16週齢)の雄性野生型C57BL/6マウスです。すべての人間の手順は、ワシントン大学の治験審査委員会によって承認されました。データの使用に同意した被験者、およびこのプロトコルに含まれる代表的なヒト被験者データは、公開された研究14 からのものです。ここでのデータは、非糖尿病性閉経後(55〜75歳)の女性からのものです。アッセイに必要な試薬の調製に関する詳細は、 表1に示されている。アッセイに使用された特定の試薬、ツール、およびマシンに関する情報は、 材料表に記載されています。プロトコルの概略図の概要を 図1に示します。
図1:透過処理された骨格筋サンプルの高解像度呼吸測定の概略図。 この原稿で詳述されている方法は、1)呼吸緩衝液と試薬の調製、2)アッセイ当日の器具と試薬の準備、3)筋肉サンプルの調製と透過化、4)サンプルと器具の調製、5)呼吸アッセイの実行、6)データ解析の6つのセクションに分かれています。BioRender.com で作成 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
1. アッセイ調製と装置のキャリブレーション
2. 骨格筋線維の採取と透過化
図2:マウス骨格筋線維の分離。 (A)収穫後のマウス腓腹筋の全形態。(B)腓腹筋を赤(左)と白(右)のセグメントに解剖します。(C)機械的に分離された筋繊維。(D)正常に分離された筋線維の10倍画像。スケールバーは1 mmです。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
3. 呼吸計での筋肉サンプルの準備
4.高解像度呼吸測定
5. データ分析
図3 および 図4 は、適切に準備されたマウスの赤および白の腓腹筋線維のための好気性解糖および脂肪酸呼吸器測定プロトコルの酸素プロットをそれぞれ示しています。また、参照用の代表的な定量化された結果も示されています。 図5 は、適切に調製されたヒト筋生検サンプルにおける好気性解糖呼吸器の酸素プロットを示しています。代表的な定量化された結果も示されています。 図3、 図4、 および図5では、ADP添加後にシトクロムCを添加しても酸素フラックスに影響を与えず、サンプルのミトコンドリア外膜が損傷していないことを示しています。 図6 は、ADP後にシトクロムCを追加すると酸素フラックスが急上昇(40%増加)し、ミトコンドリア外膜が損傷しているため、サンプルを呼吸測定に使用すべきではないことを示す好気性解糖呼吸器測定の酸素プロットを示しています。 組織の透過化を延長し、新たに分離された組織を使用しない。
図3:マウスの酸素消費量。 結果は、ピルビン酸プロトコルを使用した(A)赤と(B)白の腓腹筋の酸素消費量を示しています。リンゴ酸、グルタミン酸、およびピルビン酸を添加した後の状態2フラックス(青色の色合い、CI LEAK)。ADP投与後(緑の色合い、CI OXPHOS)にO2 消費の有意な刺激が観察され、コハク酸(紫色の色合い、CI+II OXPHOS)の添加後に呼吸がさらに促進されます。シトクロムCは有意な増加を示さず(<15%)、ミトコンドリア外膜が無傷であることを示しています(オレンジ色、CI+II+Cyt C OXPHOS)。ミトコンドリアは、FCCP(黄色の色合い、MAX ETS)の添加により分離されます。青い線は密閉チャンバー内の酸素濃度を表しています。赤い線は酸素消費量(O2 フラックス)を表しています。添加化合物:リンゴ酸(m)、グルタミン酸(g)、ピルビン酸(p)、アデノシン二リン酸(ADP)、シトクロムC(cyt c)、シアン化カルボニル-p-トリフルオロメトキシフェニルヒドラゾン(FCCP)。 (C) 棒グラフは代表的な結果を反映しています (n=8)。データは SEM ±表されます。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
図4:マウスの酸素消費量。 結果は、パルミトイルカルニチンプロトコルを使用した(A)赤と(B)白の腓腹筋の酸素消費量を示しています。リンゴ酸、グルタミン酸、およびパルミトイルカルニチンを添加した後の状態2フラックス(青色の色合い、CI LEAK)。ADP投与後(緑の色合い、CI OXPHOS)にO2 消費の有意な刺激が観察され、コハク酸(紫色の色合い、CI+II OXPHOS)の添加後に呼吸がさらに促進されます。シトクロムCは有意な増加を示さず(<15%)、ミトコンドリア外膜が無傷であることを示しています(オレンジ色、CI+II+Cyt C OXPHOS)。ミトコンドリアは、FCCP(黄色の色合い、MAX ETS)の添加により分離されます。青い線は密閉チャンバー内の酸素濃度を表しています。赤い線は酸素消費量(O2 フラックス)を表しています。添加化合物:リンゴ酸(m)、グルタミン酸(g)、パルミトイルカルニチン(pc)、アデノシン二リン酸(ADP)、シトクロムC(cyt c)、シアン化カルボニル-p-トリフルオロメトキシフェニルヒドラゾン(FCCP)。 (C) 棒グラフは代表的な結果を反映しています(n = 7)。データは SEM ±表されます。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
図5:ピルビン酸プロトコルを使用したヒト外側広筋の酸素消費量の代表的な結果(A)リンゴ酸、グルタミン酸、およびピルビン酸を添加した後の状態2フラックス(青の色合い、CIリーク)。ADP投与後(緑の色合い、CI OXPHOS)にO2消費の有意な刺激が観察され、コハク酸(紫色の色合い、CI+II OXPHOS)の添加後に呼吸がさらに促進されます。シトクロムCは有意な増加を示さず(<15%)、ミトコンドリア外膜が無傷であることを示しています(オレンジ色、CI+II+Cyt C OXPHOS)。ミトコンドリアは、FCCP(黄色の色合い、MAX ETS)の添加により分離されます。青い線は密閉チャンバー内の酸素濃度を表しています。赤い線は酸素消費量(O2 フラックス)を表しています。添加化合物:リンゴ酸(m)、グルタミン酸(g)、ピルビン酸(p)、アデノシン二リン酸(ADP)、シトクロムC(cyt c)、シアン化カルボニル-p-トリフルオロメトキシフェニルヒドラゾン(FCCP)。(B)棒グラフは、外側広筋生検(n = 24)から得られた代表的な結果を反映しています。データは SEM ±表されます。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
図6:マウスの赤腓腹筋におけるミトコンドリア外膜の完全性の低下を示す代表的な結果。 リンゴ酸、グルタミン酸、およびピルビン酸を添加した後の状態2フラックス(青色の色合い、CI LEAK)。ADP投与後(緑の色合い、CI OXPHOS)にO2 消費の有意な刺激が観察され、コハク酸(紫色の色合い、CI+II OXPHOS)の添加後に呼吸がさらに促進されます。シトクロムCはO2 消費量の有意な増加(>15%)を誘発し、ミトコンドリア外膜の損傷を示しています。青い線は密閉チャンバー内の酸素濃度を表しています。赤い線は酸素消費量(O2 フラックス)を表しています。添加化合物:リンゴ酸(m)、グルタミン酸(g)、ピルビン酸(p)、アデノシン二リン酸(ADP)、シトクロムC(cyt c)、シアン化カルボニル-p-トリフルオロメトキシフェニルヒドラゾン(FCCP)。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
表1:呼吸化合物と呼吸溶液の試薬調製。 アッセイに必要な試薬の調製について、最終ストック濃度や調製・保管方法など、詳細に説明します。 この表をダウンロードするには、ここをクリックしてください。
このプロトコルは、ヒトとマウスの両方のサンプルについて、透過処理された骨格筋線維のミトコンドリア機能を評価するための包括的でわかりやすいテンプレートプロトコルを提供します。単離されたミトコンドリアの代わりに透過処理された繊維を使用することには、いくつかの利点があります。主な利点の1つは、透過性繊維の使用には少量(2〜5 mg)の組織が必要であり、この方法がヒト筋生検サンプルとマウス筋肉の両方に適していることです。単離されたミトコンドリアに対する別の利点は、細胞構造が無傷のままであり、ミトコンドリアと細胞成分との間の構造的および機能的相互作用の保存を確実にすることである12,21,22,23。
当社の好気性解糖プロトコルにおけるピルビン酸、リンゴ酸、およびグルタミン酸の使用は、複合体I 24,25,26,27,28へのNADH供給の包括的で広範な評価を提供します。この包括的なアプローチは、全体的および生理学的に関連する代謝条件下でのコンプレックスI活性の評価を提供しますが、ピルビン酸-リンゴ酸またはグルタミン酸-リンゴ酸の使用がより適切な実験的アプローチである可能性があります。例えば、グルタミン酸-リンゴ酸の使用は、アミノ酸異化作用に関連するミトコンドリア機能の違いを解き明かすかもしれない29。研究者の皆様には、特定の研究モデルに使用する適切なアプローチを慎重に検討することをお勧めします。
このプロトコルは、ミトコンドリアの活性を評価するための基質の使用に焦点を当てていますが、実験目的を達成するためには、特定の阻害剤の使用が必要な場合があります。例えば、ロテノンは複合体I12,21,30を阻害するために、オリゴマイシンは複合体V(ATPシンターゼ)12,21を阻害するために使用し、アンチマイシンAは非ミトコンドリア呼吸の評価のために複合体III12,21を阻害するために使用することができます。上記で提供されたプロトコルは、特定の阻害剤の使用を含むように容易に適合させることができる。重要な点として、阻害剤の使用に関する注意点の1つは、これらの化合物は粘着性があり、装置チャンバーから除去するために広範な洗浄が必要であることです。10% BSAの溶液を60分間使用すれば、残留阻害剤の除去には十分であることがわかりました。
LEAK呼吸とは、ATP合成に依存しない酸素消費率を指します。この速度は、ミトコンドリア内膜を横切ってミトコンドリアマトリックスに戻る陽子の流れを表しています。ATP合成(LEAK)とは無関係に酸素消費量を評価するために、3つの方法が受け入れられています。最初のLEAK(n)は、基質の存在下での酸素消費率を測定するが、アデニル酸塩(ADPまたはATP)31,32,33を添加していない。このLEAK状態は、ミトコンドリア膜の固有の漏れを表しています。2 番目の方法である LEAK(t) は ATP34 の存在下で測定され、3 番目の LEAK(o) は ATP 合成酵素阻害剤であるオリゴマイシン 35,36,37 の存在下で測定されます。このプロトコルでは、この評価にLEAK(n)を使用しますが、実験の目的やモデルによっては、LEAK酸素フラックスを測定するための他の方法が適切な場合があります。
このアッセイでは、MiR05 にクレアチン(3 mg/mL)とブレビスタチン(10 μM)の両方を添加します。ミトコンドリアのADP輸送はクレアチンキナーゼ(CK)によって促進され、クレアチンはCK活性を飽和させるために呼吸溶液に添加される38,39。筋線維は自発的に収縮することができ、ADPによる収縮にも敏感です。収縮の影響を受けずにミトコンドリアの呼吸活動を評価するために、ブレビスタチンが追加されて繊維収縮活性を阻害している38。さらに、ヒトの筋肉に関する研究では、呼吸能力が生検法(マイクロバイオプシー対バーグストロム針)によって影響を受ける可能性があり、この違いは得られた繊維長の違いによるものである可能性があることが示唆されています40,41。繊維が短いと、調製中に損傷を受けやすくなる可能性があり、ブレビスタチンの使用は機能の維持に役立ちます。繊維の緩和が研究目的に適合しない特定の条件がある場合があり、その場合、ブレビスタチンを MiR05 ソリューションから除外できます。
サポニンによる骨格筋線維の透過化により、原形質膜に細孔が生成され、基質と阻害剤が細胞内に自由に侵入できるようになります。サポニンはコレステロールに対して高い親和性を持ち、コレステロールは細胞の原形質膜に豊富に含まれていますが、ミトコンドリアの膜はコレステロールが乏しいです42,43。このプロトコルで繊維調製に使用されるサポニン処理は、ミトコンドリア膜の完全性を維持することが期待されます。ミトコンドリアの損傷は、組織が繊維に機械的に分離することから生じるせん断力によっても発生する可能性があります。組織を繊維束に分離することは、迅速かつ最小限の取り扱いで行うことをお勧めします。ミトコンドリアの損傷の可能性を評価するために、呼吸プロトコルにシトクロムCの滴定を含めました。シトクロムCは、無傷のミトコンドリア外膜12を通過することができないため、シトクロムCの添加後にO2フラックスが増加することは、サンプル調製プロセス中にミトコンドリア外膜への損傷が生じたことを示している。私たちの最近の研究の1つでは、シトクロムCの添加後にO2フラックスが8%15増加したことを発見し、このプロトコルで提案されているサポニンの使用がミトコンドリアの損傷を引き起こさないことを検証しました。我々は、シトクロムCを添加した後にO2フラックスが15%以上増加したことを示すサンプルは、分析から除外すべきであることを提案する44。このステップは、コンプレックスIV活動の評価としてではなく、厳密に品質管理手段として含まれています。
高分解能呼吸測定は、酸素消費量の高感度で信頼性の高い測定を提供する点で優れていますが、装置の顕著な制限は、装置ごとに同時に測定できるサンプルが2つだけであることです。そのため、複数のサンプルを持つコホートを含む研究を設計する際には、慎重な検討が必要です。一日中、さまざまなサンプルセットで測定を行いたいという誘惑に駆られるかもしれませんが、研究者には、概日リズムが代謝に与える影響を考慮することを強くお勧めします。ヒトとげっ歯類の両方の骨格筋に関する研究により、ミトコンドリア機能に対する体内時計の影響が明らかになった45,46。そのため、これらの概日変動を考慮するために、同じ時間帯に数日間にわたって測定を行うことをお勧めします。
最後に、再現性のある堅牢な呼吸測定を確保するために、呼吸計は定期的なクリーニング、メンテナンス、およびキャリブレーションを受ける必要があります。プロトコールに詳述されているように、空気校正は毎日実施する必要があります。また、ポーラログラフ式酸素センサーの月次校正(空気とゼロの両方)も実施することをお勧めします。ユーザーは、この校正方法の詳細と定期的な機器のメンテナンスの手順については、製造元のドキュメントとWebサイトを参照する必要があります。
高解像度呼吸測定は、ミトコンドリア呼吸を測定するためのゴールドスタンダードであり続けています。このプロトコルで詳述されている方法は、げっ歯類とヒトの骨格筋の両方におけるミトコンドリア容量の堅牢な評価を容易にします。このプロトコルは、栄養補助食品投与14,20および運動17,18後の慢性腎臓病19の文脈で、遺伝的マウスモデル15,16に関連するミトコンドリア機能を評価する研究に適用されています。
著者は何も開示していません。
本書で報告された研究は、Nutrition Obesity Research Center、NIH grant P30 DK056341、NIH grant K01 HL145326の支援を受けたものです。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
10 µL Hamilton Syringe (glass syringe) | ThermoFisher | 14-813-125 | For respiration assay titration |
25 µL Hamilton Syringe (glass syringe) | ThermoFisher | 14-813-133 | For respiration assay titration |
ADP | Merck | 117105 | Respirometry Assay |
Black Glass Dissection Dish | Scintica | DD-90-S-BLK | For sample preparation |
Blebbistatin | Sigma | B0560 | Working MiR05 Solution |
BSA, fatty acid free | Sigma | A6003 | MiR05 Solution |
Calcium Carbonate | Sigma | C4830 | BIOPS Solution |
Creatine | Sigma | 27900 | Working MiR05 Solution |
Cytochrome C | Sigma | C7752 | Respirometry Assay |
DatLab | Oroboros Instruments | N/A | Respirometry Software |
Dithiothreitol (DTT) | Sigma | D0632 | BIOPS Solution |
D-Sucrose | Sigma | 84097 | MiR05 Solution |
EGTA | Sigma | E4378 | BIOPS & MiR05 Solution |
FCCP | Sigma | C2920 | Respirometry Assay |
Glutamate | Sigma | G1626 | Respirometry Assay |
HEPES | Sigma | H7523 | MiR05 Solution |
Imidazole | Sigma | 56750 | BIOPS Solution |
KH2PO4 | Sigma | P5379 | MiR05 Solution |
Lactobionic acid | Sigma | 153516 | MiR05 Solution |
Malate | Sigma | M1000 | Respirometry Assay |
MES hydrate | Sigma | M8250 | BIOPS Solution |
MgCl2 - 6 H2O | Sigma | M2670 | BIOPS & MiR05 Solution |
Oroboros Oxygraph-2K (O2K) System | Oroboros Instruments | 10203-03 | High resolution respirometer |
Palmitoyl-Carnitine | Sigma | P4509 | Respirometry Assay |
Potassium Hydroxide | Sigma | P1767 | BIOPS Solution |
Precision Tweezers | Fisher | 17-467-168 | For sample preparation |
Saponin | Sigma | S2149 | For Fiber Permeabilization |
Sodium ATP | Sigma | A2383 | BIOPS Solution |
Sodium Phosphocreatine | Sigma | P7936 | BIOPS Solution |
Sodium Pyruvate | Sigma | P2256 | Respirometry Assay |
Succinate | Sigma | S2378 | Respirometry Assay |
Taurine | Sigma | T0625 | BIOPS & MiR05 Solution |
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