精製されたDNAオリガミナノアンテナ、またはDONA上で共局在AFMイメージングおよびラマン測定を行うため。まず、シリコンチップをプラズマで10分間処理します。10マイクロリットルの精製DONA溶液と10マイクロリットルの100ミリモル塩化マグネシウムをチップ上で3時間インキュベートします。
次に、チップをエタノールと水の混合物で2回洗浄し、圧縮空気でブロードライします。乾燥したチップを磁気ディスクにテープで固定し、原子間力顕微鏡またはAFMイメージング用の装置に挿入します。次に、ラマン測定に必要なレーザー波長、出力、および蓄積時間を選択します。
TAMRAで完全にコーティングされた金ナノ粒子の場合は、633ナノメートルのレーザー、100マイクロワットの出力、および1秒の積分時間を選択します。1回のTAMRA測定の場合は、400マイクロワットの電力と4秒の積分時間に変更します。パラメータを調整した後、AFM画像内の目的のDONAの上にカーソルを置きます。
その後、ラマン測定を開始します。共局在測定のために、サンプルのAFMイメージングを実施して、DONAの位置を特定しました。その後、単一のDONAからのラマンスペクトルを収集し、得られたスペクトルがTAMRA分子からのものであることを確認するために比較されました。
主なTAMRAピークは、完全にコーティングされたTAMRA金ナノ粒子で見られましたが、単一分子TAMRAスペクトルの信号対雑音比は低かったが、主要なピークは識別可能でした。
