まず、青いソフトジェルペーストの食品着色料を蒸留水と混ぜます。標準的なコーンミール寒天食品を含む食品バイアルを、食品が液体に溶けるまで電子レンジで加熱します。食品の各バイアルに染料混合物を加え、食品が均一に青くなるまでよく混ぜます。
食品の色を飽和させるために青色染料混合物を一定量加え、バイアル間で色にばらつきがないようにします。乾燥中にバイアルの開口部に薄いペーパータオルを置き、バイアルにハエが入るのを防ぎます。.食品が冷却されて固まったら、ハエをバイアルを含む青い食品に移します。
バイアルをハエと摂氏25度で一晩インキュベートします。翌日、ハエを標準的なショウジョウバエの餌が入ったバイアルに移し、各バイアルに番号を付けます。ハエを摂氏25度で60分間孵化させます。
インキュベーション後、ハエを標準的なショウジョウバエの餌と一緒に新しいバイアルに移します。バイアルの長さに点線を引き、カウントの開始点をマークします。各バイアルの壁にある小さな、丸い、不透明な、無色のドットを手動で数えます。
各バイアルのドットの総数に対する青いドットの比率を記録します。対照のハエでは、青い餌は比較的早く排出されますが、α-シヌクレインのハエでは、青い餌は最大8時間腸内に留まります。閉鎖後10日目に、α-シヌクレインハエが頑健な神経変性表現型を示すとき、対照ハエと比較して腸内通過時間に有意差が観察された。
しかし、腸内輸送に差は、閉鎖後1日目に対照群とα-シヌクレインハエの間で観察されなかった。