まず、NC2プレート内に結晶を生成します。次に、提供されたDiamond Fed IDを使用してI-SPY Bシステムにログインし、[プロポーザル]を選択します。リストをスクロールするか、検索バーに提案番号を入力して、目的の提案を見つけます。
プロポーザルが見つかったら、プロポーザル番号の下にあるドロップダウンメニューから[発送]を選択します。納品のウィンドウが開き、プロポーザルに関連するすべての納品が表示されます。新しい納品を作成するには、画面右上の納品プランを追加をクリックし、納品の名前を入力します。
次に、自動イメージャーを選択し、画面の左下にある出荷の追加ボタンをクリックして出荷を確定します。納品ウィンドウに移動し、プラスコンテナ追加をクリックすると、コンテナ追加ページが表示されます。次に、コンテナタイプのドロップダウンメニューから適切なプレートタイプを選択します。
実験プレートのビームラインスタッフの指示に従って、バーコードと容器名を入力してください。要求されたイメージャーのドロップダウン メニューから VMXi 20 °C イメージャーを選択し、イメージング スケジュールのドロップダウン メニューから [フィボナッチ イメージング スケジュール] を選択します。結晶化画面のドロップダウンメニューから、結晶化画面を選択します。
次に、所有者のドロップダウンメニューから正しいユーザー名を選択します。[表示] をクリックし、メールボックスに正確な連絡先アドレスを入力します。コメントボックスにプレートの詳細を入力します。
タンパク質のドロップダウンメニューから関連するサンプルを選択し、UASに登録され、Diamond社が承認した頭字語を実験提案書に使用します。サンプル名ボックスに同じ名前を入力し、残りのボックスは空のままにします。プラスプレートアイコンをクリックすると、プレート全体にサンプルが複製され、コンテナ全体に緑色の四角が入ります。
ページ下部の [プラス コンテナーの追加] をクリックして、プレートを登録します。プレートを適切なイメージャーに移し、そこで保存してイメージングします。容器がイメージャーに保存されると訪問が生成され、ユーザーはプレートとその画像へのリンクが記載された電子メールを受信します。
イメージング結果を表示するには、目的のプロポーザルに移動します。プロポーザル番号の下のドロップダウンメニューからコンテナを選択し、利用可能なコンテナのリストを表示します。フィルター、プレート(他のサンプルホルダータイプがある場合)を選択します。
検索を絞り込むには、「マイ・コンテナー」のオプションを使用して、現在のユーザー ID に関連付けられている関連コンテナーのみを表示します。線の上にカーソルを置き、左クリックして目的のコンテナを選択します。次に、プレートの概要を示す新しいウィンドウが表示されます。
プレート表示の左側にあるドロップを選択して、最近のイメージを表示します。矢印キーを使用してドロップ間を移動するか、マウスまたはカーソルを使用してドロップを個別に選択します。データ収集用のポイントを手動で追加するには、プラスマークポイントボタンを押します。
目的の目標点の上にカーソルを置きます。選択を行い、赤い十字が表示されるのを待ちます。すべてのポイントがマークされたら、プラスの[終了]ボタンをクリックします。
プラスマーク領域ボタンをクリックして、グリッドスキャンでデータ収集する領域を追加します。左上のポイントをクリックし、右下にドラッグして、ビームライン上でスキャンする領域を作成します。クリック プラス 終了 必要なすべての領域が確立されたら、ボタンをクリックします。
水滴画像の青い十字は、CHIMPによって自動的に位置特定される結晶物体を表しています。結晶化滴のCHINP評価を表示するには、自動スコアを表示にチェックを入れ、クラスドロップダウンで結晶を選択します。すべてのポイントと領域がドロップに関してマークされたら、ページ下部の [データ収集の準備] ボタンをクリックします。
事前に選択されたサンプルまたは自動的に同定されたサンプルのリストを確認します。個々のポイントまたはリージョンを追加するには、プラスボタンを押すか、現在のページをキューに追加ボタンをクリックして、表示されているすべてのサンプルを追加します。次に、ポイントフィルターをクリックし、[すべて選択]チェックボックスにチェックを入れて、現在キューに入っているサンプルリスト内のすべてのサンプルに同じパラメーターを適用します。
ポイント、領域、手動、自動のフィルターを使用します。領域については、グリッドスキャン、DMM 10ミクロンステップ、100%透過率を選択します。その他の点実験の場合は、ドロップダウンメニューから適切なオプションを選択します。
発振データ収集には、データ収集を最大化するために、オメガスキャンDMM10度、10%透過を選択します。すべてのサンプルに対して正しい実験パラメータを選択したら、キューコンテナボタンをクリックします。プレートがキューの一番上に到達すると、ビームラインに提示されてデータ収集され、サンプル保管庫に戻されます。
次に、関連データにアクセスするためのリンクが記載されたメールを探します。プロポーザル番号の下のドロップダウンメニューから[サンプルグループ管理]を選択し、他のユーザーがすでに作成している場合は、グループのリストを探します。新しいグループを生成するには、プラスの [サンプル グループの作成] ボタンをクリックします。
サンプルグループの作成ページのドロップダウンメニューから納品をクリックして、サンプルビューアを表示します。コンテナをクリックしたら、プレートの概要を示すグラフィックを探します。個々のドロップ、または関連する行、文字、または列番号をクリックします。
個々のグループに関連付けられているすべてのウェルを選択した後、サンプルグループ名ボックスにグループの名前を入力し、[サンプルグループの保存]ボタンをクリックします。このページの [サンプルグループを表示] ボタンをクリックすると、プロポーザルに関連付けられている生成済みのサンプルグループの一覧に戻り、データ処理を続行できます。
