高解像度磁気共鳴イメージングを行った後、dcm2niixツールを使用して、T1 weighted、T2 weighted、およびzero time echo DICOMスキャンファイルをDICOMからNIfTI形式に変換します。SimNIBS Charmツールを使用して、共レジストレーションとティッシュマスク抽出を実行します。次に、Brainsightを開きます。
[New Empty Project] をクリックし、参加者の T1 ウェイト NIfTI イメージを読み込みます。「Reconstructions」タブをクリックし、「New Reconstruction」ドロップダウンメニューをクリックします。[スキン] をクリックし、新しいウィンドウで [スキンの計算] をクリックします。
完了したら、ウィンドウの左上隅にある[閉じる]ボタンをクリックします。[Reconstructions] タブで、[New Reconstruction] ドロップダウン メニューをクリックし、[Full Brain Curvilinear] をクリックします。次に、矢状面、冠状面、および横方向の平面上の緑色のボックスの位置を、その端をドラッグして脳をしっかりと囲むように調整します。
すべてのスライスをスクロールして、組織の端が重ならないようにします。Compute Curvilinearをクリックし、剥離の深さを4ミリメートルに調整します。次に、Brainsightの[ランドマーク]タブをクリックし、続いて[ランドマークの構成]をクリックします。
鼻の先端に十字線を配置し、名前フィールドにランドマークの Nose というラベルを付けます。次に、鼻梁の上の目の間に十字線を配置し、ランドマークにNasionのラベルを付けます。次に、十字線を左耳に置き、ランドマークのL耳にラベルを付けます。
次に、十字線を右耳に置き、ランドマークの R Ear にラベルを付けます。その後、[ターゲット] タブをクリックし、[ターゲットの構成] をクリックします。目的のターゲットの位置に十字線を配置し、画面の右側にある角度トグルを使用して軌道角度を設定します。
目的のターゲットと軌道を選択したら、新しいドロップダウンメニューをクリックして[軌道]を選択します。ターゲットに名前を付けるには、名前の横のテキストボックスに入力します。「エクスポート」をクリックしてターゲットをエクスポートし、適切な件名フォルダーに保存します。
BabelBrainを開き、音響シミュレーションと熱シミュレーションに必要なファイルを選択します。以前にBrainsiteからエクスポートしたテキストファイルを選択するには、[軌道の選択]をクリックし、適切な参加者ファイルを選択します。「SimNIBSを選択」をクリックすると、先ほど作成したSimNIBSファイルを選択できます。
Select T1W をクリックし、以前に作成され、ターゲットと軌道のマッピングに使用された T1 重み付け画像を選択します。次に、CTスキャンの場合はReal CT、CTEスキャンの場合はCTE、またはチャームツールによって生成された簡略化されたマスクを使用するためにnoを選択します。CTまたはCTE画像を使用する場合は、Coregドロップダウンメニューをクリックし、次にCTからMRをクリックします。[選択]をクリックし、適切な参加者ファイルから対応する画像を選択します。
「温度プロファイルの選択」をクリックし、実験の超音波処理パラメータをオン、オフの期間、およびデューティサイクルで説明する温度プロファイルファイルを選択します。次に、[トランスデューサー]の横にあるドロップダウンメニューをクリックし、実験に使用するトランスデューサーを選択します。[コンピューティングバックエンド]の横にあるドロップダウンメニューをクリックし、シミュレーションを実行しているコンピューターの計算バックエンドを選択します。
すべての情報を入力したら、[続行]をクリックして残りのシミュレーションを完了します。次に、トランスデューサの超音波周波数と、波長ごとに適切なポイントを選択します。「計画マスクの計算」をクリックします。
画像を調べて、皮膚、頭蓋骨、脳の境界が正確に認識されたことを確認します。音響シミュレーションの場合は、Step 2 AC Sim タブをクリックして開きます。コーンから焦点スポットまでの距離を調整するには、適切な距離を入力します。
シミュレーションを実行するには、[フィールドの計算] ボタンをクリックします。十字線が焦点の中心にくるように ZSteering 値を調整します。上矢印または下矢印を押すか、必要な値を手動で入力します。
次に、[フィールドの計算]をクリックします。熱シミュレーションの場合は、Step 3 Thermal Simタブをクリックし、次にCalculate Thermal Fieldsをクリックします。
