まず、GEOデータベースに移動し、検索ボックスにTMOD3、卵巣がん、薬剤耐性、データアクセッションなどのキーワードを入力します。定義されたグループボックスでデータを異なるグループに分割します。オプションメニューの「Apply adjustment to the P values」ボックスで「Benjamini」と「Hochberg」を選択します。
GEO2Rメニューの「analyze」をクリックし、「download full table」をクリックして結果を取得します。次に、ダウンロードしたデータをグラフ作成および統計ソフトウェアで調査およびプロットします。TNMplotウェブツールに移動し、腫瘍と正常の比較をクリックします。
「遺伝子選択」ボックスに TMOD3 を挿入し、「組織選択」ボックスで卵巣漿液性嚢胞腺癌を選択します。その後、[分析の開始]をクリックして結果を取得します。TMOD3 mRNAの発現レベルは、マイクロアレイデータセットで上昇しました。
GSE51088およびGSE66957は、正常な卵巣組織と比較して卵巣がんで高発現していました。