プラチナ製剤をベースとした化学療法抵抗性および感受性患者におけるTMOD3発現解析およびmRNA-miRNA解析

まず、ROC Plotter に移動し、[ROC Plotter for Ovarian Cancer] をクリックします。遺伝子シンボルボックスにTMOD3を挿入します。応答ボックスで、6か月での無再発生存期間を選択します。

治療ボックスで、[Platin] を選択します。次に、[計算]をクリックして結果を取得します。TargetScanに移動し、[ヒト遺伝子のシンボルを入力してください]ボックスにTMOD3を挿入します。

その後、cBIOPortalを見に行きます。次に、卵巣漿液性嚢胞腺癌、TCGA Nature 2011データセットを選択します。TMOD3 と miRNA のシンボルを Enter Genes ボックスに挿入します。

「Submit Query」をクリックすると、TCGA卵巣がんデータセットのtmod3とmiRNAとの相関データを取得できます。その後、Nextで結果を視覚化し、LinkedOmicsに移動してTCGA OVサンプルコホートを選択します。次に、[Select Search Dataset] ボックスで [Clinical] を選択します。

[検索データセット属性の選択] ボックスで [Platinum_status] を選択します。次に、[Select Target Dataset]ボックスでmiRNAシーケンシングを選択します。「統計的手法の選択」で「T検定」を選択し、「クエリの送信」をクリックして結果を取得します。

高感度の卵巣がん患者におけるプラチナ製剤ベースの化学療法後、TMOD3の発現は未治療の患者と比較して有意に減少しました。TMOD3の発現は、プラチナ製剤耐性を有する卵巣がん患者において、プラチナ製剤感受性を有する患者と比較して有意に高く、ROC曲線は、プラチナ製剤耐性を決定するためのマーカーとしてTMOD3を示しました。TMOD3を標的とする21のマイクロRNAが同定され、そのほとんどが卵巣がんにおけるシスプラチン耐性と関連しており、has-miR-133a-3pはTMOD3発現と有意に負の相関があり、シスプラチン耐性がんでは発現が低かった。