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본 프로토콜은 내강 내 생리학의 시공간 특성 분석을 위해 미세전극을 사용하는 인체 조직 유래 위 오가노이드의 pH 측정에 대해 설명합니다.
위장관 오가노이드 모델의 최적화와 상세한 특성 분석을 위해서는 발광 환경을 분석하기 위한 고급 방법이 필요합니다. 이 논문은 미세조작기 제어 미세전극을 통해 3D 인간 위 오가노이드의 루미나 내에서 pH를 정밀하게 측정하기 위한 재현성이 높은 방법을 제시합니다. pH 미세전극은 상업적으로 이용 가능하며 직경이 25μm인 비스듬한 유리 팁으로 구성됩니다. 측정을 위해 pH 미세전극은 Matrigel에 현탁된 오가노이드(>200μm)의 루멘으로 이동하고, 기준 전극은 배양 플레이트의 주변 매체에 잠겨 있습니다.
이러한 미세 전극을 사용하여 인간 위체에서 유래한 오가노이드를 프로파일링함으로써 루미날 pH가 ~7.7 ± 0.037로 각 배양유 내에서 비교적 일관되며 최소 15분 동안 연속 측정을 얻을 수 있음을 입증합니다. 일부 대형 오가노이드에서는 측정 결과 상피 표면과 내강 사이의 pH 구배가 나타났으며, 이는 오가노이드의 pH 측정이 높은 공간 분해능으로 달성될 수 있음을 시사합니다. 이전 연구에서는 미세전극을 사용하여 오가노이드의 발광 산소 농도를 측정하는 데 성공했으며, 이는 오가노이드 분석을 위한 이 방법의 다양성을 입증했습니다. 요약하면, 이 프로토콜은 3D 오가노이드 내 복잡한 발광 공간의 기능적 특성화를 위한 중요한 도구를 설명합니다.
줄기 세포에서 유래한 오가노이드(organoid)는 인간 생리학을 연구하는 우리의 능력에 혁명을 일으켰으며, 규제 환경에서도 동물 모델을 대체하기 시작했습니다1. 2009년 Sato et al.이 장내 오가노이드를 처음 설명한 이후 오가노이드 기술은 엄청난 인기를 얻었습니다2. 많은 연구에서 오가노이드 모델의 세포 구성과 기능을 매우 상세하게 특성화했습니다 3,4,5,6. 그러나, 이러한 3D 다세포 구조의 발광 공간은 대체로 정의되지 않은 채로 남아 있다 7,8. 내강(元腺)은 점막 조직에서 유래한 오가노이드의 중심 구멍으로, 분극화된 상피 세포의 정점 부분으로 둘러싸여 있습니다. 세포 분비와 흡수는 주로 정점 상피 표면에서 발생하기 때문에 오가노이드의 발광 미세환경은 이러한 중요한 생리학적 과정에 의해 제어됩니다. 현재 사용되는 오가노이드 모델은 세포 신호 전달 패턴, 전반적인 줄기 농도, 대사 산물 농도 구배 및 환경 조건의 변화를 보여줍니다9. 따라서 장기 기능 및 병리학의 정확한 모델링을 위해서는 오가노이드 발광 생리학을 이해하는 것이 필요합니다. 불행히도, 루멘의 상대적 접근성은 3D 오가노이드10에서 발광 생리학의 기능적 분석을 크게 방해합니다.
pH 프로파일을 검사할 수 있는 능력은 위에서 특히 중요한데, 위장은 내강에서 약 1-3에 이르는 신체에서 가장 가파른 양성자 구배에서 상피11,12,13에 이르는 거의 중성으로 유명합니다. 위 pH 구배의 미시적 유지에 대한 이해와 위 점액층 전반에 걸쳐 이러한 동적 환경을 요약하는 데 있어 오가노이드 모델의 관련성에 대한 이해에는 상당한 격차가 남아 있습니다. 오가노이드 pH 분석을 위한 기존 접근법에는 형광 또는 비색 지시약일 수 있는 pH에 민감한 염료의 사용이 포함되었습니다. McCracken et al.은 히스타민 처리에 대한 반응으로 루미날 pH의 강하를 분석하기 위해 SNARF-5F-a 비율계량 pH 지시약을 오가노이드에 루미날 주입했습니다. 이러한 염료는 배양 배지에 통합될 수 있으므로 pH를 실시간으로 비침습적으로 모니터링할 수 있습니다. pH에 민감한 염료는 측정의 신뢰성과 정확도가 떨어지는 복잡한 보정 단계를 필요로 할 뿐만 아니라, 이러한 염료는 관심 미세환경 내에서 전체 pH 범위를 대표하지 않을 수 있는 특정 검출 범위 내에서 작동하는 경향이 있습니다14,15. 그러나 확증 실험을 위해 지시자 염료를 사용하는 것이 합리적인 것으로 간주 될 수 있습니다. 형광 optode 기반의 pH 감지 방식을 사용하는 광학 나노 센서도 개발되었습니다. 그러나 이러한 감지 기술은 현미경 이미징이 필요하며 광표백, 광독성 및 이미징 바이어스(imaging bias)에 취약합니다16,17. 또한, Brooks et al.은 미세전극을 포함하는 3D 프린팅된 멀티웰 플레이트를 가지고 있으며, 그 위에 오가노이드가 도금될 수 있습니다18. 그러나 이 접근 방식은 오가노이드 루멘 내부에서 직접 측정할 수 없습니다.
전극 기반 pH 측정은 다른 방법에 비해 향상된 정확도를 달성할 수 있을 뿐만 아니라 실시간 pH 모니터링을 제공할 수 있습니다. 또한 마이크로 매니퓰레이터에 장착된 pH 전극은 전극 팁의 정확한 위치를 미세하게 제어할 수 있으므로 pH 측정의 우수한 공간 분해능을 허용합니다. 이를 통해 오가노이드 모델 분석에서 최고의 유연성과 재현성을 얻을 수 있습니다. 여기에 사용된 전극은 얇은 백금 와이어를 둘러싸고 있는 선택적 pH 유리를 통한 양성자의 확산을 기반으로 작동하는 소형 pH 미세 전극입니다. 미세 전극은 외부 Ag-AgCl 기준 전극에 연결된 다음 고임피던스 밀리볼트 미터에 연결됩니다. 동일한 용액에 담갔을 때 두 전극 팁 사이의 전위는 용액(19)의 pH를 반영합니다. 이러한 미세프로파일링 시스템은 생물막(20,21), 플랑크톤 조류(22), 인간 객담 샘플(23), 심지어 중간엽 줄기세포 스페로이드(24)의 대사 분석에 사용되어 왔다. 우리 연구실과 Murphy 등은 이전에 미세조작기 제어 O2 미세전극을 사용하여 오가노이드의 발광 공간에서 산소 농도를 평가했습니다. Murphy et al.은 이 방법을 수학적 모델링과 결합하여 스페로이드 내의 산소 구배를 밝혔습니다. 우리 그룹은 조직 유래 위 오가노이드에서 주변의 세포외 기질에 비해 감소된 내강 산소 농도를 확인할 수 있었습니다25.
여기에서는 구형 위장관 오가노이드에서 루미날 pH를 수동으로 프로파일링하는 자세한 방법을 제공하여 복잡한 내강 미세환경에 대한 생리학적 이해를 높일 수 있습니다. 우리는 이 기술이 마이크로 스케일에서 pH 수준의 실시간 고분해능 측정을 통해 오가노이드 생리학 탐구에 새로운 차원을 추가할 것으로 기대합니다. 또한, 다음 프로토콜은 다양한 유형의 오가노이드 모델에서O2,N2O,H2, NO,H2S, 산화 환원 및 온도 분석에 쉽게 적용할 수 있습니다. 생리학적 프로파일링은 생체 내 환경을 더 잘 모방하기 위해 오가노이드 배양 조건을 최적화하는 데 유용한 도구 역할을 하며, 이를 통해 생물의학 연구에서 오가노이드 모델의 관련성과 유용성을 향상시킵니다.
이 프로토콜에는 고유한 내강이 있고 인공 세포외 기질(ECM, 예: Matrigel)에 내장된 직경이 최소 200μm인 3D 오가노이드가 필요합니다. 오가노이드 유도를 위한 인체 위 조직은 몬태나 주립대학교 기관 검토 위원회(Institutional Review Board)의 승인과 Bozeman Health(프로토콜 # 2023-48-FCR, D.B.)에서 상부 내시경을 받는 환자의 정보에 입각한 동의를 얻어 획득했으며, 미국 국립질병연구교환지(National Disease Research Interchange, 프로토콜 #DB062615-EX)에서 면제된 위 전체 또는 소매 절제술 검체로 획득했습니다. 본 연구에 사용된 오가노이드 라인 및 통로 번호에 대한 정보는 표 1에 제공되었으며, 매체 조성은 표 2에 기재되어 있다. 위장관 오가노이드 라인의 생성 및 유지를 위해 이전에 발표된 프로토콜 6,26,27을 참조하십시오.
1. pH 프로파일링을 위한 인간 위 오가노이드 준비
2. 미세전극의 포장 풀기 및 교정
참고: 마이크로 스케일 측정을 가능하게 하려면 통합된(따라서 더 부피가 큰) 설계를 사용하는 대신 pH 센서 마이크로 전극 외에 별도의 기준 전극이 사용됩니다. pH 미세 전극과 기준 전극은 모두 젖은 상태로 보관해야 합니다. 한 번에 10분 이상 공기에 노출시키지 마십시오. 응용 분야에 적합한 팁 크기를 결정하십시오. 여기에서는 베벨 팁 직경이 25μm인 전위차 pH 미세전극을 사용했습니다.
3. 인간 위 오가노이드의 pH 프로파일링
참고: 다음 프로토콜은 오른손잡이 사용자를 위해 설명됩니다. 주의: PC가 절전 모드로 전환되면 진행 중인 측정이 중단되므로 PC의 모든 절전 옵션을 비활성화하십시오.
4. 전동 프로파일링(선택 사항)
참고: 이 옵션은 기계식 모터 스테이지에 장착된 마이크로 매니퓰레이터를 필요로 하며, 이는 궁극적으로 모터 컨트롤러(31)를 통해 컴퓨터 소프트웨어에 의해 제어됩니다.
5. 전극 청소
6. 전극의 보관
알림: 두 전극 모두 우발적인 손상으로부터 안전한 활동이 적은 장소의 실온에서 보관해야 합니다.
7. (선택) 메틸 빨강 주입
알림: 메틸 레드는 미세 전극 측정을 검증하는 데 사용할 수 있는 비색 지시약 염료입니다.
위산 분비는 인간의 위장에서 중요한 기능을 합니다. 그러나 오가노이드에서 산 분비를 어느 정도까지 모델링할 수 있는지는 여전히 논쟁의 여지가 있습니다 6,32,33,34. 따라서 우리는 위 오가노이드의 산 생성을 정확하게 측정하기 위해 위에서 설명한 프로토콜을 개발했습니다. 특히, 표준 팽창 조건?...
오가노이드의 발광 공간에 대한 제한된 접근은 이 미세환경의 생리학적 역학에 대한 우리의 이해를 심각하게 제한했습니다. 루미날 생리학의 기능 분석을 위한 신뢰할 수 있는 도구는 생리학, 약리학 및 질병 연구를 위한 체외 모델처럼 오가노이드를 활용할 수 있는 능력을 확장할 것입니다. 오가노이드는 조정 가능성이 높고 생리학적으로 관련성이 높은 모델로, 인간 집단 내에서 유전적 ...
저자는 공개할 이해 상충이 없습니다.
저자는 Ellen Lauchnor 박사, Phil Stewart 박사 및 Bengisu Kilic의 이전 작업과 O2 마이크로 센서에 대한 도움에 감사드립니다. Andy Sebrell은 오가노이드 배양 및 미세 조작 교육을 제공합니다. Lexi Burcham은 오가노이드 배양, 배지 준비, 데이터 기록 및 조직에 대한 지원을 제공합니다. Susy Kohout 박사는 전기 생리학에 대한 일반적인 조언을 제공합니다. 우리는 이미징에 도움을 준 Heidi Smith 박사에게 감사드리며, National Science Foundation MRI Program (2018562), M.J. Murdock Charitable Trust (202016116), US Department of Defense (77369LSRIP & W911NF1910288) 및 Montana Nanotechnology Facility (NSF Grant ECCS-2025391에 의해 지원되는 NNCI 회원)의 자금 지원으로 지원되는 몬태나 주립 대학의 Biofilm Engineering Bioimaging Facility 센터를 인정합니다.
이 작업을 가능하게 해준 Unisense 팀 전체, 특히 Andrew Cerskus 박사, Laura Woods 박사, Lars Larsen 박사, Tage Dalsgaard 박사, Line Daugaard 박사, Karen Maegaard 박사 및 Mette Gammelgaard 박사에게 특별한 감사를 드립니다. 이 연구를 위한 자금은 미국 국립보건원(National Institutes of Health)의 보조금 R01 GM13140801(D.B., R.B.) 및 UL1 TR002319(K.N.L)과 몬태나 주립대학교 연구 및 경제 개발 사무국(D.B.)의 연구 확장상(Research Expansion Award)에서 제공되었습니다. 그림 1A 는 BioRender로 만든 것입니다.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
3 M KCl | Unisense | ||
5 mL Wobble-not Serological Pipet, Individually Wrapped, Paper/Plastic, Bag, Sterile | CellTreat | 229091B | |
10 mL Wobble-not Serological Pipet, Individually Wrapped, Paper/Plastic, Bag, Sterile | CellTreat | 229092B | |
15 mL Centrifuge Tube - Foam Rack, Sterile | CellTreat | 229412 | |
24 Well Tissue Culture Plate, Sterile | CellTreat | 229124 | |
25 mL Wobble-not Serological Pipet, Individually Wrapped, Paper/Plastic, Bag, Sterile | CellTreat | 229093B | |
35 mm Dish | No. 1.5 Coverslip | 20 mm Glass Diameter | Uncoated | MatTek | P35G-1.5-20-C | |
50 mL Centrifuge Tube - Foam Rack, Sterile | CellTreat | 229422 | |
70% Ethanol | BP82031GAL | BP82031GAL | |
70 μm Cell Strainer, Individually Wrapped, Sterile | CellTreat | 229483 | |
1,000 µL Extended Length Low Retention Pipette Tips, Racked, Sterile | CellTreat | 229037 | |
Amphotericin B (Fungizone) Solution | HyClone Laboratories, Inc | SV30078.01 | |
Biosafety Cabinet | Nuaire | NU-425-600 | Class II Type A/B3 |
Bovine Serum Albumin | Fisher Bioreagents | BP1605-100 | |
Cell recovery solution | Corning | 354253 | Cell dissociation solution |
DMEM/F-12 (Advanced DMEM) | Gibco | 12-491-015 | |
Dulbecco's Modification of Eagles Medium (DMEM) | Fisher Scientific | 15017CV | |
Fetal Bovine Serum | HyClone Laboratories, Inc | SH30088 | |
G418 Sulfate | Corning | 30-234-CR | |
Gentamycin sulfate | IBI Scientific | IB02030 | |
HEPES, Free Acid | Cytiva | SH30237.01 | |
HP Pavillion 2-in-1 14" Laptop Intel Core i3 | HP | M03840-001 | |
Hydrochloric acid | Fisher Scientific | A144C-212 | |
Incubator | Fisher Scientific | 11676604 | |
iPhone 12 camera | Apple | ||
L-glutamine | Cytiva | SH3003401 | |
Large Kimberly-Clark Professional Kimtech Science Kimwipes Delicate Task Wipers, 1-Ply | Fisher Scientific | 34133 | |
M 205 FA Stereomicroscope | Leica | ||
Matrigel Membrane Matrix 354234 | Corning | CB-40234 | |
MC-1 UniMotor Controller | Unisense | ||
Methyl red | |||
MM33 Micromanipulator | Marzhauser Wetzlar | 61-42-113-0000 | Right handed |
MS-15 Motorized Stage | Unisense | ||
Nanoject-II | Drummond | 3-000-204 | nanoliter autoinjector |
Penicillin/Streptomycin (10,000 U/mL) | Gibco | 15-140-148 | |
pH Microelectrodes | Unisense | 50-109158, 25-203452, 25-205272, 25-111626, 25-109160 | SensorTrace software is not compatible with Apple computers |
Reference Electrode | Unisense | REF-RM-001652 | SensorTrace software is not compatible with Apple computers |
SB 431542 | Tocris Bioscience | 16-141-0 | |
Smartphone Camera Adapter | Gosky | ||
Specifications Laboratory Stand LS | Unisense | LS-009238 | |
Trypsin-EDTA 0.025%, phenol red | Gibco | 25-200-056 | |
UniAmp | Unisense | 11632 | |
United Biosystems Inc MINI CELL SCRAPERS 200/PK | Fisher | MCS-200 | |
Y-27632 dihydrochloride | Tocris Bioscience | 12-541-0 | |
µSensor Calibration Kit | Unisense/ Mettler Toledo | 51-305-070, 51-302-069 | pH 4.01 and 9.21, 20 mL packets |
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