Synteza rybosomów to bardzo złożony i skoordynowany proces obejmujący ponad 200 czynników składania. Synteza i przetwarzanie składników rybosomalnych zachodzi nie tylko w jąderku, ale także w nukleoplazmie i cytoplazmie komórek eukariotycznych.

Biogeneza rybosomów rozpoczyna się od syntezy pre-rRNA 5S i 45S przez odrębne polimerazy RNA. Pierwotne transkrypty są intensywnie przetwarzane i modyfikowane, zanim zostaną związane i złożone przez białka rybosomalne i czynniki składania, które są importowane z cytoplazmy. Rozległa modyfikacja rybosomalnych RNA przez snoRNP jest kolejną wyraźną cechą rybosomów eukariotycznych. Pojedynczo zmodyfikowane zasady mogą nie wydawać się mieć określonej funkcji łącznie, wszystkie modyfikacje stabilizują określone konformacje rybosomalnego RNA. Ponadto te zmodyfikowane zasady są bardziej skoncentrowane w funkcjonalnych regionach rRNA i regulują aktywność rybosomalną podczas translacji.

Zarówno modyfikacje rRNA, jak i przetwarzanie pre-rRNA zachodzą w jąderku, ponieważ oba te etapy wymagają składników, które znajdują się tylko w jąderku. Podczas gdy snoRNP przeprowadzają chemiczną modyfikację rRNA, inne "białka jąderkowe" hydrolizują transkrybowany "dystansowy RNA" w prekursorowym RNA, tworząc rozszczepione 18S, 5,8S i 28S rRNA. Wraz z wytwarzaniem dojrzałych rRNA, wolne białka jąderkowe wracają do puli jąderek i są ponownie wykorzystywane.

Kationy, takie jak jony magnezu (Mg²⁺), odgrywają ważną rolę w utrzymaniu struktury rybosomu. Podczas eksperymentów rybosom dysocjuje na podjednostki po usunięciu Mg²⁺. Chociaż dokładna rola Mg²⁺ pozostaje niepewna, prawdopodobne jest, że kationy oddziałują ze zjonizowanymi fosforanami RNA, aby połączyć dwie podjednostki rybosomalne.

Po zakończeniu składania rybosomów niektóre rybosomy łączą się z błonami wewnątrzkomórkowymi, głównie retikulum endoplazmatyczne, podczas gdy wolne rybosomy są rozprowadzane przez cytoplazmę.