W przeciwieństwie do mitozy, w której pęknięcia dwuniciowe są przypadkowe, w mejozie są one tworzone przez enzym zwany Spo11, który rozszczepia szkielet fosfodiestru. Złamane spiralne końce są przycinane przez kompleks białkowy o nazwie MRX, a uszkodzenia są naprawiane w procesie zwanym konwersją genów.

W tym przypadku uszkodzona nić DNA "akceptora" atakuje homologiczny dupleks DNA "dawcy", tworząc pętlę przemieszczenia. W ten sposób powstają regiony heterodupleksowego DNA, w których nić z DNA dawcy łączy się z komplementarną nicią z DNA akceptora.

Polimeraza DNA wydłuża inwazyjną nić, a przedłużona pętla D następnie łączy się z wolnym ogonem 3′. Synteza DNA w nowo wychwyconej nici powoduje powstanie produktu pośredniego z dwiema czteroniciowymi strukturami zwanymi połączeniami Holliday'a.

Ten podwójny łącznik Hollidaya jest rozwiązywany przez enzymy naprawy DNA zwane resollawazami i istnieją dwie orientacje, w których połączenia mogą zostać rozszczepione. W pierwszym resolwaza nacina każde połączenie poziomo, tak aby nici rodzicielskie były nadal nienaruszone.

Powoduje to powstanie produktu bez krzyżowania, nazwanego tak dlatego, że nici po zerwaniu pozostają ze swoim pierwotnym partnerem i nie ma poważnego skrzyżowania nici dawcy i akceptora.

Alternatywnie, jeśli rozszczepienie następuje pionowo, obszary otaczające uszkodzenie są zamieniane, co prowadzi do produktu krzyżowego, w którym nić donorowa po zerwaniu rekombinuje się z nicią akceptorową.

Konwersja genów ma znaczący wpływ na różnorodność genomu. W organizmach rozmnażających się płciowo potomstwo dziedziczy jeden zestaw genów od ojca i jeden zestaw genów od matki.
Rodzicielskie zestawy DNA rekombinują, a chromatydy siostrzane ulegają konwersji genów. Powoduje to, że potomstwo ma nowe chromosomy w porównaniu z chromosomami rodziców.