Method Article
Opisano metody generowania dużych ilości rekombinowanych adenowirusów, które następnie mogą być użyte do transdukcji rodzimego nabłonka dróg moczowych gryzoni, co pozwala na ekspresję transgenów lub regulację w dół produktów genów endogennych.
Oprócz tworzenia bariery o wysokim oporze, przypuszcza się, że naczyn dróg moczowych wyściełający miedniczkę nerkową, moczowody, pęcherz moczowy i bliższą cewkę moczową wyczuwa i przekazuje informacje o swoim otoczeniu do tkanek leżących poniżej, promując funkcję i zachowanie mikcji. Przerwanie bariery urotelialnej lub jej funkcji czuciowej/przetwornikowej może prowadzić do choroby. Badanie tych złożonych zdarzeń jest utrudnione przez brak prostych strategii zmiany ekspresji genów i białek w nabłonku dróg moczowych. Opisano tutaj metody, które pozwalają badaczom generować duże ilości adenowirusa o wysokim mianie, który można następnie wykorzystać do transdukcji nabłonka dróg ciężkich gryzoni z wysoką wydajnością i w stosunkowo prosty sposób. Zarówno cDNA, jak i małe interferujące RNA mogą być wyrażane za pomocą transdukcji adenowirusowej, a wpływ ekspresji transgenu na funkcję urotelialną można ocenić od 12 godzin do kilku dni później. Metody te mają szerokie zastosowanie w badaniach prawidłowej i nieprawidłowej biologii urotelialnej z wykorzystaniem mysich lub szczurzych modeli zwierzęcych.
Nabłonek dróg moczowych to wyspecjalizowany nabłonek, który wyściela miedniczkę nerkową, moczowody, pęcherz moczowy i bliższą cewkę moczową1. Składa się z trzech warstw: warstwy wysoce zróżnicowanych i spolaryzowanych, często dwujądrowych komórek parasolowych, których wierzchołkowe powierzchnie są skąpane w moczu; pośrednia warstwa komórkowa z populacją dwujądrowych komórek wzmacniających tranzyt, które mogą dać początek powierzchownym komórkom parasolowym w odpowiedzi na ich ostrą utratę; oraz pojedyncza warstwa komórek podstawnych, których podzbiór funkcjonuje jako komórki macierzyste, które mogą regenerować cały nabłonek dróg moczowych w odpowiedzi na przewlekłe uszkodzenie. Komórki parasolowe są głównie odpowiedzialne za tworzenie bariery urotelialnej o wysokiej odporności, której składniki obejmują błonę wierzchołkową (bogatą w cholesterol i cerebrozydy) o niskiej przepuszczalności dla wody i substancji rozpuszczonych oraz kompleks połączeń wierzchołkowych o wysokiej odporności (składający się z połączeń ścisłych, połączeń adherens, desmosomów i związanego z nimi pierścienia aktomiozyny)1. Zarówno wierzchołkowa powierzchnia komórki parasolowej, jak i jej pierścień łączący rozszerzają się podczas napełniania pęcherza i szybko wracają do stanu wstępnie napełnionego po mikcji1,2,3,4,5. Oprócz roli w funkcji bariery, przypuszcza się również, że nabłonek dróg moczowych pełni funkcje sensoryczne i przetwornikowe, które pozwalają mu wyczuwać zmiany w środowisku zewnątrzkomórkowym (np. rozciąganie) i przekazywać te informacje poprzez uwalnianie mediatorów (w tym ATP, adenozyny i acetylocholiny) do leżących poniżej tkanek, w tym suburotelialnych procesów nerwowych aferentnych6,7,8. Niedawne dowody na tę rolę znaleziono u myszy pozbawionych urotelialnej ekspresji zarówno Piezo1, jak i Piezo2, co powoduje zmienioną funkcję mikcji9. Dodatkowo, u szczurów występuje nadekspresja białka CLDN2 tworzącego pory o ścisłym połączeniu w warstwie komórek parasolowych, u których występuje stan zapalny i ból analogiczny do obserwowanego u pacjentów ze śródmiąższowym zapaleniem pęcherza moczowego10. Przypuszcza się, że zaburzenie funkcji czuciowo-czuciowej/przetwornika urotelialnego lub bariery może przyczyniać się do kilku zaburzeń pęcherza moczowego6,11.
Lepsze zrozumienie biologii nabłonka dróg moczowych w stanach normalnych i chorobowych zależy od dostępności narzędzi, które pozwolą badaczom łatwo obniżyć ekspresję genów endogennych lub umożliwić ekspresję transgenów w tkance natywnej. Podczas gdy jednym z podejść do obniżenia ekspresji genów jest wygenerowanie myszy z warunkowym nokautem urotelialnym, podejście to zależy od dostępności myszy z floksowanymi allelami, jest pracochłonne i może zająć miesiące lub lata, aby je ukończyć12. Nic więc dziwnego, że badacze opracowali techniki transfekcji lub transdukcji nabłonka dróg moczowych, co może prowadzić do wyników w krótszej skali czasowej. Opublikowane metody transfekcji obejmują użycie lipidów kationowych13, antysensownych fosforydowanych oligodeoksynukleotydów14, lub antysensownych kwasów nukleinowych związanych z 11-merowym peptydem penetrującym białko HIV TAT15. Jednak w tym protokole skupiono się na wykorzystaniu transdukcji za pośrednictwem adenowirusa, dobrze zbadanej metodologii, która jest skuteczna w dostarczaniu genów do szerokiego zakresu komórek, została przetestowana w licznych badaniach klinicznych, a ostatnio została wykorzystana do dostarczenia cDNA kodującego białko kapsydu COVID-19 do biorców jednego wariantu szczepionki COVID-1916, 17. W celu uzyskania bardziej szczegółowego opisu cyklu życiowego adenowirusa, wektorów adenowirusowych i klinicznych zastosowań adenowirusów, czytelnik jest kierowany do reference17.
Ważnym kamieniem milowym w użyciu adenowirusów do transdukcji nabłonka dróg moczowych, był raport Ramesha i wsp., który wykazał, że krótkie wstępne leczenie detergentami, w tym N-dodecyl-β-D-maltozydem (DDM), znacznie zwiększyło transdukcję nabłonka dróg moczowych przez adenowirusa kodującego β-galaktozydazę18. Korzystając z tego badania potwierdzającego zasadność jako przewodnika, transdukcja nabłonka dróg moczowych za pośrednictwem adenowirusa została teraz wykorzystana do ekspresji różnych białek, w tym GTPaz rodziny Rab, czynników wymiany guaniny-nukleotydów, fragmentów motorycznych miozyny, tworzących pory klaudyny związanych ze ścisłymi połączeniami i ADAM1710,19,20,21,22. To samo podejście zaadaptowano do ekspresji małych interferujących RNA (siRNA), których efekty zostały uratowane przez koekspresję opornych na siRNA wariantów transgene22. Opisany tutaj protokół obejmuje ogólne metody generowania dużych ilości wysoce skoncentrowanego adenowirusa, co jest wymogiem dla tych technik, a także adaptacje metod Ramesh et al.18 do ekspresji transgenów w nabłonku dróg moczowych z wysoką wydajnością.
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Eksperymenty związane z generowaniem adenowirusów, które wymagają certyfikatu BSL2, zostały przeprowadzone za zgodą biur ds. zdrowia i bezpieczeństwa środowiskowego Uniwersytetu w Pittsburghu oraz Instytucjonalnego Komitetu ds. Bezpieczeństwa Biologicznego. Wszystkie przeprowadzone eksperymenty na zwierzętach, w tym transdukcja adenowirusowa (która wymaga certyfikacji ABSL2), zostały przeprowadzone zgodnie z odpowiednimi wytycznymi/przepisami Polityki Publicznej Służby Zdrowia w zakresie humanitarnej opieki i wykorzystania zwierząt laboratoryjnych oraz Ustawy o dobrostanie zwierząt, a także za zgodą Komitetu ds. Opieki i Wykorzystania Zwierząt Uniwersytetu w Pittsburghu. Rękawice, okulary ochronne i odpowiedni ubiór są noszone podczas wszystkich zabiegów z udziałem rekombinowanych wirusów. Wszelkie odpady płynne lub stałe należy utylizować w sposób opisany poniżej. Ściółka zwierząt po transdukcji oraz wszelkie powstałe w ten sposób tusze zwierzęce powinny być traktowane jako materiały niebezpieczne biologicznie i unieszkodliwiane zgodnie z polityką instytucjonalną.
1. Przygotowanie zapasów adenowirusów o wysokim mianie
UWAGA: Skuteczna transdukcja pęcherzy gryzoni zależy od użycia oczyszczonych i skoncentrowanych zapasów wirusów, zazwyczaj 1 x 107 do 1 x 108 zakaźnych cząstek wirusa (IVP) na μL. Ta część protokołu koncentruje się na generowaniu zapasów adenowirusa o wysokim mianie z istniejących preparatów wirusowych. Wszystkie kroki należy wykonywać w kapturze do hodowli komórkowych przy użyciu sterylnych odczynników i narzędzi. Chociaż dostępne obecnie szczepy adenowirusa są wadliwe w replikacji, większość instytucji wymaga zgody na stosowanie adenowirusów i rekombinowanego DNA. Często obejmuje to wyznaczenie pomieszczenia do hodowli komórkowych jako zakładu zatwierdzonego przez BSL2 do produkcji i amplifikacji adenowirusów. Niektóre ogólne względy obejmują stosowanie masek, ochrony oczu, rękawiczek i odpowiedniego ubioru na wszystkich etapach produkcji i oczyszczania wirusa. Podczas wirowania zaleca się stosowanie nasadek zabezpieczających, jeśli probówki wirówkowe nie mają szczelnie dopasowanych nasadek. Wszystkie materiały jednorazowego użytku, w tym potencjalnie zanieczyszczone nasadki zabezpieczające wirówki, butelki i wirniki, są traktowane roztworem antywirusowym (patrz Tabela materiałów), a następnie spłukiwane wodą lub 70% etanolem. Odpady płynne są oczyszczane przez dodanie wybielacza do końcowego stężenia 10% (v/v). Utylizacja tych płynnych odpadów będzie zależała od polityki instytucjonalnej. Odpady stałe są zwykle utylizowane wraz z odpadami niebezpiecznymi biologicznie.
2. Transdukcja pęcherza gryzonia
UWAGA: Jeśli nie znasz tej techniki, zaleca się, aby liczba zwierząt transdukowanych jednocześnie była ograniczona do 2-4. Można to osiągnąć poprzez rozłożenie w czasie czasu rozpoczęcia leczenia dla każdego zwierzęcia, szczególnie podczas leczenia detergentem w kroku 2.2, a następnie inkubacji wirusa w kroku 2.3. Doświadczeni badacze mogą transdukować do sześciu zwierząt jednocześnie.
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Przygotowanie wirusa
Przykład oczyszczania wirusa przez wirowanie w gradionym gradiacji gęstości jest pokazany na Rysunek 1A. Jasnoróżowy pasek, znajdujący się na granicy załadowanego materiału komórkowego i warstwy CsCl o gramaturze 1,25 g / ml, składa się głównie z uszkodzonych komórek i ich szczątków (patrz purpurowa strzałka w Rysunek 1A). Swój różowawy kolor zawdzięcza niewielkiej ilości pożywki hodowlanej, kt...
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Podczas gdy Ramesh i in. koncentrowali się na opracowywaniu strategii wykorzystania transdukcji adenowirusowej w leczeniu raka pęcherza moczowego18, nowsze doniesienia wykazały użyteczność tych technik w badaniu prawidłowej biologii/fizjologii i patofizjologii uroteliów 10,18,19,20,21. Do ważnych cech tego podejścia należą: ...
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Autorzy nie mają nic do ujawnienia.
Ta praca została wsparta nagrodą za projekt pilotażowy przez P30DK079307 (dla M.G.D.), R01DK119183 grantu NIH (dla G.A. i M.D.C.), R01DK129473 grantu NIH (dla G.A.), nagrodę American Urology Association Career Development oraz grant Fundacji Winters (dla N.M.), przez Cell Physiology and Model Organisms Kidney Imaging Cores z Pittsburgh Center for Kidney Research (P30DK079307), oraz przez S10OD028596 (do G.A.), który sfinansował zakup systemu konfokalnego używanego do uchwycenia niektórych obrazów przedstawionych w tym rękopisie.
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
|---|---|---|---|
| Pipeta 10 ml | Corning Costar (Millipore Sigma) | CLS4488 | sterylna, serologiczna pipeta, indywidualnie pakowana |
| 12 ml probówka do ultrawirówek | ThermoFisher | 06-752 | Cienkościenna ultrawirówka PET |
| stożkowa probówka wirówkowa 15 ml | Falcon (Corning) | 352097 | sterylna |
| igła 18 G | BD | 305196 | Igła 18 G x 1,5 cala |
| Pipeta 20 ml | Corning Costar (Millipore Sigma) | CLS4489 | sterylna, serologiczna pipeta, pakowana pojedynczo |
| Stożkowa probówka wirówkowa 50 ml | Falcon (Corning) | 352098 | sterylna |
| pipeta 5 ml | Corning Costar (Millipore Sigma) | CLS4487 | sterylna, serologiczna pipeta, pakowana pojedynczo |
| Cavicide | Henry Schein | 6400012 | Roztwór przeciwwirusowy |
| Naczynie do hodowli komórkowych - 15 cm | Falcon (Corning) | 353025 | sterylne, poddane działaniu hodowli tkankowej (czasza 150 mm x 25 mm) |
| Skrobak | do komórek Sarstedt | 893.1832 | długość rączki 24 cm, długość ostrza 1,7 cm |
| CsCl | Millipore Sigma | C-4306 | Biologia molekularna klasa ≥ 98% |
| Pożywka hodowlana DMEM (wysoka glukoza) | Gibco (ThermoFisher) | 11965092 | z 4,5 g/L glukozy + L-glutamina + czerwień fenolowa |
| EDTA | Millipore Sigma | EDS | Bioiultra klasa ≥ 99% |
| Surowica bydlęca płodu | Hyclon (Cytiva) | SH30070.03 | zdefiniowana surowica |
| Szklana pipeta | Fisher Scientific | 13-678-20A | 5,75 cala szklana pipeta, autoklawizowana |
| glicerol | Millipore Sigma | G-5516 | Biologia molekularna klasy ≥ 99% |
| komórek HEK293 | HEK293T ATCC | CRL-3216 | są wariantem komórek HEK293, które wyrażają duży antygen T SV40 |
| Izofluran | Cewnik dożylny Covetrus | 29405 | |
| - mysz | Smith Medical Jelco | 3063 | 24 G x 3/4 cala Bezpieczny cewnik dożylny Nieprzepuszczalny dla promieni rentgenowskich |
| cewnik dożylny - szczur | Smith Medical Jelco | 3060 | 22 G x 1 cal Bezpieczny cewnik dożylny nieprzepuszczający promieni rentgenowskich |
| KCl | Millipore Sigma | P-9541 | Biologia molekularna klasa ≥ 99% |
| KH2PO4 | Millipore Sigma | P5655 | Klasa hodowli komórkowej ≥ 99% |
| Na2HPO4• 7 H2O | Millipore Sigma | 431478 | ≥ 99,99% |
| NaCl | Millipore Sigma | S3014 | Biologia molekularna klasa ≥ 99% |
| N-dodecyl-β-D-maltozyd | Millipore Sigma | D4641 | ≥ 98% |
| Stożek nosowy dla wielu zwierząt | specjalnie zaprojektowane | opcje komercyjne, w tym jeden z kolumny Parkland Scientific (RES3200) | |
| PD-10 | GE Healthcare | 17-085-01 | Fabrycznie zapakowane kolumny wypełnione antybiotykiem Sephadex G-25M |
| Penicylina/streptomycyna (100x) | Gibco (ThermoFisher) | 15070063 | 100x stężony roztwór |
| Spektrofotometr | Eppendorf | BioPhotometer | |
| Statyw i zacisk | Fisher Scientific | 14-679Q i 05-769-8FQ | dostępne u wielu dostawców |
| Sterylna jednostka filtrująca | Fisher Scientific (Nalgene) | 09-740-65B | 0,2 i mikro; m Filtr o szybkim przepływie (150 ml) |
| Sterylny filtr 0,2 i mikro; m (strzykawka) | Fisher Scientific | SLGV004SL | Millipore Sigma Milex 0,22 & mikro; m jednostka filtrująca, którą podłącza się do strzykawki |
| Wirówka superszybka | Eppendorf | 5810R | z wirnikiem o stałym kącie nachylenia Eppendorf F34-6-38 (12 000 obr./min) |
| Strzykawka (1 mL) | BD | 309628 | Strzykawka 1 ml końcówka Luer-lok - sterylna |
| strzykawka (3 ml) | BD | 309656 | 3-mL końcówka strzykawki - sterylna |
| Wirówka stołowa (niska prędkość) | Eppendorf | 5702 | z wahliwym wirnikiem kubełkowym |
| Pipety transferowe | Fisher Scientific | 13-711-9AM | polietylenowa pipeta transferowa 3,4 ml |
| Tris-base | Millipore Sigma | 648310-M | Biologia molekularna klasa |
| TrypLE select roztwór proteazy | Gibco (ThermoFisher) | 12604013 | Enzym ekspresyjny TrypLE (1x), bez czerwieni fenolowej |
| Ultrawirówka | Beckman Coulter | Optima L-80 XP | z wirnikiem Beckman SW41 (41 000 obr./min) |
| Waporyzator | Usługi w zakresie znieczulenia ogólnego, Inc. | Waporyzator Tec 3 | Isoflurane |
| Vortex Mixer | VWR | 10153-838 | analogowy mikser wirowy |
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request Permission